MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL01

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018742	ATAA	2	8	20	27	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018742	AGAT	2	8	12064	12071	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018742	GTCA	2	8	12286	12293	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018742	TGTA	2	8	12418	12425	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018742	TTCA	2	8	12483	12490	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018742	TAAT	2	8	12595	12602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018742	TTTC	2	8	12603	12610	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018742	TGAT	2	8	18977	18984	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018742	AAGC	2	8	19077	19084	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018742	TGTA	2	8	29403	29410	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018742	TAAA	2	8	31506	31513	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018742	TAAT	2	8	33530	33537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018742	AATT	2	8	33588	33595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018742	ACAT	2	8	33662	33669	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018742	AATT	2	8	34094	34101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018742	CATT	2	8	35782	35789	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018742	TAAT	2	8	36375	36382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018742	TAAA	2	8	36407	36414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018742	TAAA	2	8	40656	40663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018742	TAAA	2	8	40711	40718	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018742	AAAG	2	8	41772	41779	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018742	AAAT	2	8	41822	41829	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018742	TAAT	2	8	48796	48803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018742	TTAT	2	8	49844	49851	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018742	CCAA	2	8	50150	50157	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018742	ATTT	2	8	50202	50209	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018742	TTAT	2	8	50425	50432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018742	GATT	2	8	55181	55188	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018742	ATCA	2	8	55202	55209	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018742	TATT	2	8	55252	55259	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018742	AAAG	2	8	55281	55288	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018742	ATTT	2	8	55615	55622	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018742	TACA	2	8	55705	55712	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018742	CCAA	2	8	57464	57471	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018742	TCAC	2	8	60652	60659	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018742	AAAC	2	8	62143	62150	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018742	TCAC	2	8	64254	64261	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018742	GCAA	2	8	66062	66069	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018742	TGAT	2	8	66155	66162	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018742	AAAT	2	8	66278	66285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018742	TTTG	2	8	66451	66458	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018742	CCTA	2	8	66676	66683	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018742	GTTT	2	8	66736	66743	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018742	TTTG	2	8	66815	66822	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018742	ATAG	2	8	68374	68381	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018742	TATT	2	8	72091	72098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018742	TATT	2	8	72199	72206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018742	AGAA	2	8	74207	74214	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018742	TTTA	2	8	74219	74226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018742	ATAA	2	8	74622	74629	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018742	TTGC	2	8	74759	74766	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018742	GTTT	2	8	80062	80069	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018742	CGGG	2	8	86693	86700	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018742	TAAA	2	8	90288	90295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018742	TTTA	2	8	90340	90347	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018742	GTAA	2	8	91843	91850	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018742	AGAA	2	8	91889	91896	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018742	AAAT	2	8	91944	91951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018742	ATCA	2	8	105413	105420	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018742	TTTG	2	8	108999	109006	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018742	AATG	2	8	109070	109077	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018742	GAAA	2	8	109078	109085	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018742	AATT	2	8	109200	109207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018742	AGGT	2	8	109252	109259	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018742	AATA	2	8	109312	109319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018742	TAAA	2	8	126923	126930	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018742	AATC	2	8	128517	128524	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018742	TTGA	2	8	135210	135217	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018742	AATC	2	8	142700	142707	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_018742	TAAA	2	8	147572	147579	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018742	ATCC	2	8	147776	147783	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018742	ATCA	2	8	147965	147972	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_018742	ATAC	2	8	148049	148056	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018742	CAAA	2	8	151819	151826	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018742	TACA	2	8	152206	152213	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_018742	GTCA	2	8	152233	152240	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018742	ACCT	2	8	156158	156165	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018742	GATG	2	8	156531	156538	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018742	GATG	2	8	156963	156970	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018742	GAAA	2	8	157035	157042	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018742	CTAA	2	8	157220	157227	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018742	GATG	2	8	157539	157546	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018742	TAAT	2	8	157914	157921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018742	TATT	2	8	157945	157952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018742	TTTG	2	8	158439	158446	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018742	AATA	2	8	161214	161221	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018742	AAAT	2	8	163128	163135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018742	TCAT	2	8	170655	170662	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_018742	AGCA	2	8	170683	170690	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_018742	TTTA	2	8	170820	170827	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018742	ATTA	2	8	172296	172303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018742	TATG	2	8	172315	172322	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018742	AATA	2	8	174832	174839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018742	CCGC	2	8	185550	185557	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.