MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL01

Total Repeats: 277

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018742	TAT	2	6	3146	3151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018742	ATA	2	6	3155	3160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018742	ATT	2	6	8825	8830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018742	AAC	2	6	9340	9345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018742	CTT	2	6	12130	12135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018742	TGA	2	6	12342	12347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018742	AGG	2	6	12359	12364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018742	ATA	2	6	12367	12372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018742	GAA	2	6	12550	12555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018742	ATA	2	6	12666	12671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018742	CTT	2	6	12672	12677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018742	ATA	2	6	12704	12709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018742	ATA	2	6	18926	18931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018742	TAA	2	6	18944	18949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018742	TCA	2	6	18995	19000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018742	AGC	2	6	19090	19095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018742	TTG	2	6	20081	20086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018742	CCA	2	6	20091	20096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_018742	ATA	2	6	20130	20135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018742	CCA	2	6	20152	20157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_018742	TTA	2	6	25542	25547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018742	TGT	2	6	25581	25586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018742	ATA	2	6	25635	25640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018742	TGT	2	6	25679	25684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018742	AAT	2	6	25711	25716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018742	TTG	2	6	25764	25769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018742	ATT	2	6	25778	25783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018742	TCA	2	6	25791	25796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018742	AGA	2	6	25817	25822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018742	TCG	2	6	29459	29464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018742	CCG	2	6	29467	29472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_018742	TAT	2	6	31550	31555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018742	TGT	2	6	31556	31561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018742	CAA	2	6	32679	32684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018742	TAT	2	6	33465	33470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018742	ATG	2	6	33572	33577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018742	ATT	2	6	34078	34083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018742	TAT	2	6	34120	34125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018742	TTC	2	6	35536	35541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018742	AAT	2	6	35573	35578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018742	AGA	2	6	35762	35767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018742	ATG	2	6	35885	35890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018742	ACA	2	6	35948	35953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018742	TCA	2	6	35982	35987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018742	ATG	2	6	36001	36006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018742	AAT	2	6	36050	36055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018742	ATA	2	6	36080	36085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018742	TAT	2	6	36162	36167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018742	AGT	2	6	36217	36222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018742	ATA	2	6	36329	36334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018742	ACA	2	6	36366	36371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018742	TTG	2	6	36391	36396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018742	TAA	2	6	39870	39875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018742	GTT	2	6	40635	40640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018742	ATA	2	6	40780	40785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018742	ACC	2	6	40803	40808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_018742	TTC	2	6	40953	40958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018742	CTA	2	6	41199	41204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018742	TAC	2	6	43392	43397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018742	AAT	2	6	47671	47676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018742	AGC	2	6	47763	47768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018742	AAG	2	6	48732	48737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018742	GAT	2	6	48763	48768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018742	GAG	2	6	48773	48778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018742	CCA	2	6	48865	48870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_018742	TTG	2	6	49035	49040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018742	TTG	2	6	49143	49148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018742	TTG	2	6	49175	49180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018742	AGT	2	6	49929	49934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018742	TAT	2	6	49953	49958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018742	GAT	2	6	49986	49991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018742	GAG	2	6	49996	50001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018742	CCA	2	6	50088	50093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_018742	TCA	2	6	50356	50361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018742	AGT	2	6	50510	50515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018742	ATT	2	6	52013	52018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018742	GAT	2	6	52054	52059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018742	TAA	2	6	52091	52096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018742	CCA	2	6	52156	52161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_018742	TCA	2	6	52219	52224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018742	ATA	2	6	52542	52547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018742	TGC	2	6	52724	52729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018742	ATT	2	6	52758	52763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018742	CAA	2	6	52831	52836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018742	AAT	2	6	52848	52853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018742	ATG	2	6	52971	52976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018742	CAA	2	6	53044	53049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018742	TTG	2	6	53094	53099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018742	ATG	2	6	53119	53124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018742	TAA	2	6	55347	55352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018742	TAT	2	6	55428	55433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018742	TTG	2	6	55458	55463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018742	TGG	2	6	55512	55517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018742	GAA	2	6	55537	55542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018742	TGA	2	6	57480	57485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018742	TAA	2	6	57573	57578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018742	AAT	2	6	58858	58863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018742	TTA	2	6	58874	58879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018742	AAT	2	6	58889	58894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018742	TGG	2	6	60664	60669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018742	ATT	2	6	66122	66127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018742	GCA	2	6	66142	66147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018742	ATT	2	6	66182	66187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018742	ATT	2	6	66313	66318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018742	ATT	2	6	66436	66441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018742	ATT	2	6	66534	66539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018742	TAT	2	6	66628	66633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018742	CAT	2	6	66766	66771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018742	CAG	2	6	66881	66886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018742	TAT	2	6	66892	66897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018742	TAA	3	9	66970	66978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018742	ATT	2	6	68184	68189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018742	TGA	2	6	68421	68426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018742	AGA	2	6	68493	68498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018742	TAT	2	6	68504	68509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018742	AGT	2	6	68578	68583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018742	GTT	2	6	68640	68645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018742	TGA	2	6	68730	68735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018742	TAG	2	6	68738	68743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018742	TAT	2	6	68805	68810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018742	ACG	2	6	68813	68818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018742	TAT	2	6	68819	68824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018742	AGA	2	6	69854	69859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018742	TGT	2	6	69885	69890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018742	TTG	2	6	69917	69922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018742	GTT	2	6	69946	69951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018742	ATG	2	6	69965	69970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018742	GTT	2	6	70018	70023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018742	CTA	2	6	71999	72004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018742	GGC	2	6	72067	72072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018742	GTA	2	6	72130	72135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018742	TGA	2	6	72158	72163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018742	TAA	2	6	72188	72193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018742	ACA	2	6	72295	72300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018742	TTA	2	6	73963	73968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018742	TCA	2	6	74262	74267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018742	TAT	2	6	74553	74558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018742	TTG	2	6	74718	74723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018742	CTG	2	6	82965	82970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018742	TAA	2	6	83011	83016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_018742	TAA	2	6	185759	185764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_018742	TAA	2	6	185873	185878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_018742	AAG	2	6	185984	185989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.