MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL01

Total Repeats: 210

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018742	AT	5	10	653	662	50 %	50 %	0 %	0 %	408671449
2	NC_018742	CA	3	6	1775	1780	50 %	0 %	0 %	50 %	408671450
3	NC_018742	AT	3	6	2980	2985	50 %	50 %	0 %	0 %	408671450
4	NC_018742	TA	3	6	4598	4603	50 %	50 %	0 %	0 %	408671451
5	NC_018742	AT	4	8	4780	4787	50 %	50 %	0 %	0 %	408671451
6	NC_018742	GT	3	6	5558	5563	0 %	50 %	50 %	0 %	408671452
7	NC_018742	TC	3	6	6546	6551	0 %	50 %	0 %	50 %	408671453
8	NC_018742	GA	3	6	7505	7510	50 %	0 %	50 %	0 %	408671454
9	NC_018742	AC	3	6	10080	10085	50 %	0 %	0 %	50 %	408671458
10	NC_018742	GT	3	6	11150	11155	0 %	50 %	50 %	0 %	408671459
11	NC_018742	CA	3	6	11704	11709	50 %	0 %	0 %	50 %	408671460
12	NC_018742	TC	3	6	11756	11761	0 %	50 %	0 %	50 %	408671460
13	NC_018742	AT	3	6	12726	12731	50 %	50 %	0 %	0 %	408671461
14	NC_018742	AT	3	6	13826	13831	50 %	50 %	0 %	0 %	408671462
15	NC_018742	GA	3	6	14544	14549	50 %	0 %	50 %	0 %	408671463
16	NC_018742	TA	3	6	15736	15741	50 %	50 %	0 %	0 %	408671464
17	NC_018742	GT	3	6	16403	16408	0 %	50 %	50 %	0 %	408671464
18	NC_018742	AT	4	8	16582	16589	50 %	50 %	0 %	0 %	408671464
19	NC_018742	AT	3	6	16653	16658	50 %	50 %	0 %	0 %	408671464
20	NC_018742	AG	3	6	16752	16757	50 %	0 %	50 %	0 %	408671464
21	NC_018742	TA	3	6	18069	18074	50 %	50 %	0 %	0 %	408671466
22	NC_018742	GT	3	6	21374	21379	0 %	50 %	50 %	0 %	408671469
23	NC_018742	TA	3	6	22437	22442	50 %	50 %	0 %	0 %	408671470
24	NC_018742	TA	3	6	23055	23060	50 %	50 %	0 %	0 %	408671470
25	NC_018742	TA	3	6	23424	23429	50 %	50 %	0 %	0 %	408671470
26	NC_018742	CA	4	8	23583	23590	50 %	0 %	0 %	50 %	408671470
27	NC_018742	TG	4	8	24635	24642	0 %	50 %	50 %	0 %	408671470
28	NC_018742	GT	3	6	25190	25195	0 %	50 %	50 %	0 %	408671470
29	NC_018742	TG	3	6	25484	25489	0 %	50 %	50 %	0 %	408671470
30	NC_018742	AT	3	6	26123	26128	50 %	50 %	0 %	0 %	408671471
31	NC_018742	CA	3	6	26212	26217	50 %	0 %	0 %	50 %	408671472
32	NC_018742	TA	3	6	27303	27308	50 %	50 %	0 %	0 %	408671472
33	NC_018742	AG	3	6	27485	27490	50 %	0 %	50 %	0 %	408671473
34	NC_018742	TA	3	6	27632	27637	50 %	50 %	0 %	0 %	408671473
35	NC_018742	CT	3	6	28004	28009	0 %	50 %	0 %	50 %	408671474
36	NC_018742	GT	3	6	28736	28741	0 %	50 %	50 %	0 %	408671474
37	NC_018742	AT	3	6	28811	28816	50 %	50 %	0 %	0 %	408671474
38	NC_018742	CA	3	6	30387	30392	50 %	0 %	0 %	50 %	408671475
39	NC_018742	AC	3	6	31802	31807	50 %	0 %	0 %	50 %	408671476
40	NC_018742	AG	3	6	32896	32901	50 %	0 %	50 %	0 %	408671477
41	NC_018742	AC	3	6	32979	32984	50 %	0 %	0 %	50 %	408671477
42	NC_018742	AT	3	6	34233	34238	50 %	50 %	0 %	0 %	408671479
43	NC_018742	TA	3	6	35048	35053	50 %	50 %	0 %	0 %	408671479
44	NC_018742	AC	4	8	35107	35114	50 %	0 %	0 %	50 %	408671479
45	NC_018742	AC	3	6	36614	36619	50 %	0 %	0 %	50 %	408671480
46	NC_018742	TG	3	6	37720	37725	0 %	50 %	50 %	0 %	408671481
47	NC_018742	AT	3	6	38267	38272	50 %	50 %	0 %	0 %	408671481
48	NC_018742	TA	3	6	38330	38335	50 %	50 %	0 %	0 %	408671481
49	NC_018742	AG	3	6	38669	38674	50 %	0 %	50 %	0 %	408671481
50	NC_018742	TC	3	6	39003	39008	0 %	50 %	0 %	50 %	408671481
51	NC_018742	AC	3	6	39323	39328	50 %	0 %	0 %	50 %	408671481
52	NC_018742	CA	3	6	40286	40291	50 %	0 %	0 %	50 %	408671482
53	NC_018742	AG	3	6	40564	40569	50 %	0 %	50 %	0 %	408671482
54	NC_018742	GA	3	6	44112	44117	50 %	0 %	50 %	0 %	408671486
55	NC_018742	AT	3	6	44872	44877	50 %	50 %	0 %	0 %	408671487
56	NC_018742	TA	3	6	48193	48198	50 %	50 %	0 %	0 %	408671488
57	NC_018742	AC	3	6	48644	48649	50 %	0 %	0 %	50 %	408671488
58	NC_018742	TA	3	6	51469	51474	50 %	50 %	0 %	0 %	408671490
59	NC_018742	AG	3	6	53968	53973	50 %	0 %	50 %	0 %	408671492
60	NC_018742	GA	3	6	55946	55951	50 %	0 %	50 %	0 %	408671494
61	NC_018742	TA	3	6	56101	56106	50 %	50 %	0 %	0 %	408671494
62	NC_018742	GA	3	6	56657	56662	50 %	0 %	50 %	0 %	408671494
63	NC_018742	TA	5	10	56728	56737	50 %	50 %	0 %	0 %	408671494
64	NC_018742	AT	3	6	56793	56798	50 %	50 %	0 %	0 %	408671494
65	NC_018742	AT	3	6	59109	59114	50 %	50 %	0 %	0 %	408671496
66	NC_018742	AT	3	6	60610	60615	50 %	50 %	0 %	0 %	408671498
67	NC_018742	AT	3	6	61165	61170	50 %	50 %	0 %	0 %	408671499
68	NC_018742	AG	3	6	63993	63998	50 %	0 %	50 %	0 %	408671503
69	NC_018742	TG	3	6	65075	65080	0 %	50 %	50 %	0 %	408671506
70	NC_018742	CA	3	6	65873	65878	50 %	0 %	0 %	50 %	408671507
71	NC_018742	TC	3	6	67214	67219	0 %	50 %	0 %	50 %	408671508
72	NC_018742	AT	3	6	69062	69067	50 %	50 %	0 %	0 %	408671510
73	NC_018742	GA	3	6	69137	69142	50 %	0 %	50 %	0 %	408671510
74	NC_018742	TA	3	6	70810	70815	50 %	50 %	0 %	0 %	408671511
75	NC_018742	TC	3	6	70851	70856	0 %	50 %	0 %	50 %	408671511
76	NC_018742	AT	3	6	71245	71250	50 %	50 %	0 %	0 %	408671512
77	NC_018742	TA	3	6	71663	71668	50 %	50 %	0 %	0 %	408671512
78	NC_018742	AG	3	6	72652	72657	50 %	0 %	50 %	0 %	408671513
79	NC_018742	TG	3	6	74370	74375	0 %	50 %	50 %	0 %	408671515
80	NC_018742	CA	3	6	75452	75457	50 %	0 %	0 %	50 %	408671516
81	NC_018742	AT	3	6	75788	75793	50 %	50 %	0 %	0 %	408671516
82	NC_018742	CA	3	6	77812	77817	50 %	0 %	0 %	50 %	408671517
83	NC_018742	AG	3	6	79029	79034	50 %	0 %	50 %	0 %	408671518
84	NC_018742	AG	3	6	79983	79988	50 %	0 %	50 %	0 %	408671518
85	NC_018742	TC	3	6	80154	80159	0 %	50 %	0 %	50 %	408671519
86	NC_018742	GA	3	6	82051	82056	50 %	0 %	50 %	0 %	408671521
87	NC_018742	AT	3	6	82121	82126	50 %	50 %	0 %	0 %	408671521
88	NC_018742	TC	3	6	82843	82848	0 %	50 %	0 %	50 %	408671521
89	NC_018742	GA	3	6	84630	84635	50 %	0 %	50 %	0 %	408671522
90	NC_018742	GT	3	6	86598	86603	0 %	50 %	50 %	0 %	408671524
91	NC_018742	TC	3	6	88070	88075	0 %	50 %	0 %	50 %	408671527
92	NC_018742	AC	4	8	88384	88391	50 %	0 %	0 %	50 %	408671527
93	NC_018742	GT	3	6	88899	88904	0 %	50 %	50 %	0 %	408671528
94	NC_018742	CT	3	6	89895	89900	0 %	50 %	0 %	50 %	408671528
95	NC_018742	TC	3	6	91237	91242	0 %	50 %	0 %	50 %	408671529
96	NC_018742	TA	3	6	92896	92901	50 %	50 %	0 %	0 %	408671530
97	NC_018742	TG	3	6	93378	93383	0 %	50 %	50 %	0 %	408671530
98	NC_018742	AG	3	6	93899	93904	50 %	0 %	50 %	0 %	408671531
99	NC_018742	GA	3	6	94472	94477	50 %	0 %	50 %	0 %	408671531
100	NC_018742	GA	3	6	95014	95019	50 %	0 %	50 %	0 %	408671532
101	NC_018742	GA	3	6	96622	96627	50 %	0 %	50 %	0 %	408671533
102	NC_018742	TA	3	6	98820	98825	50 %	50 %	0 %	0 %	408671535
103	NC_018742	TA	3	6	102401	102406	50 %	50 %	0 %	0 %	408671537
104	NC_018742	AC	3	6	102503	102508	50 %	0 %	0 %	50 %	408671538
105	NC_018742	CA	3	6	102738	102743	50 %	0 %	0 %	50 %	408671538
106	NC_018742	AC	3	6	103789	103794	50 %	0 %	0 %	50 %	408671539
107	NC_018742	AT	3	6	104715	104720	50 %	50 %	0 %	0 %	408671539
108	NC_018742	AT	3	6	106880	106885	50 %	50 %	0 %	0 %	408671541
109	NC_018742	TA	3	6	107452	107457	50 %	50 %	0 %	0 %	408671541
110	NC_018742	AT	3	6	107851	107856	50 %	50 %	0 %	0 %	408671541
111	NC_018742	TG	3	6	108712	108717	0 %	50 %	50 %	0 %	408671542
112	NC_018742	AT	3	6	109524	109529	50 %	50 %	0 %	0 %	408671543
113	NC_018742	GA	3	6	111080	111085	50 %	0 %	50 %	0 %	408671544
114	NC_018742	TA	3	6	111130	111135	50 %	50 %	0 %	0 %	408671544
115	NC_018742	AT	3	6	113081	113086	50 %	50 %	0 %	0 %	408671546
116	NC_018742	TA	3	6	113285	113290	50 %	50 %	0 %	0 %	408671547
117	NC_018742	CT	3	6	113712	113717	0 %	50 %	0 %	50 %	408671547
118	NC_018742	TC	4	8	113971	113978	0 %	50 %	0 %	50 %	408671547
119	NC_018742	TG	4	8	114041	114048	0 %	50 %	50 %	0 %	408671547
120	NC_018742	TG	3	6	114555	114560	0 %	50 %	50 %	0 %	408671548
121	NC_018742	AT	3	6	115013	115018	50 %	50 %	0 %	0 %	408671548
122	NC_018742	AG	3	6	117126	117131	50 %	0 %	50 %	0 %	408671551
123	NC_018742	TG	3	6	118599	118604	0 %	50 %	50 %	0 %	408671551
124	NC_018742	TA	3	6	119078	119083	50 %	50 %	0 %	0 %	408671552
125	NC_018742	CA	3	6	119197	119202	50 %	0 %	0 %	50 %	408671552
126	NC_018742	TA	3	6	119336	119341	50 %	50 %	0 %	0 %	408671552
127	NC_018742	TA	3	6	119862	119867	50 %	50 %	0 %	0 %	408671553
128	NC_018742	AG	3	6	120191	120196	50 %	0 %	50 %	0 %	408671553
129	NC_018742	CA	3	6	121194	121199	50 %	0 %	0 %	50 %	408671554
130	NC_018742	GT	3	6	121301	121306	0 %	50 %	50 %	0 %	408671554
131	NC_018742	AT	3	6	121542	121547	50 %	50 %	0 %	0 %	408671554
132	NC_018742	TA	4	8	121619	121626	50 %	50 %	0 %	0 %	408671554
133	NC_018742	TA	3	6	121841	121846	50 %	50 %	0 %	0 %	408671554
134	NC_018742	AG	3	6	121868	121873	50 %	0 %	50 %	0 %	408671554
135	NC_018742	TA	3	6	125789	125794	50 %	50 %	0 %	0 %	408671558
136	NC_018742	AT	3	6	125795	125800	50 %	50 %	0 %	0 %	408671558
137	NC_018742	TG	3	6	127659	127664	0 %	50 %	50 %	0 %	408671560
138	NC_018742	AT	3	6	127905	127910	50 %	50 %	0 %	0 %	408671560
139	NC_018742	TA	3	6	128362	128367	50 %	50 %	0 %	0 %	408671561
140	NC_018742	AG	3	6	129503	129508	50 %	0 %	50 %	0 %	408671562
141	NC_018742	AC	3	6	130228	130233	50 %	0 %	0 %	50 %	408671562
142	NC_018742	AT	3	6	131878	131883	50 %	50 %	0 %	0 %	408671563
143	NC_018742	AG	3	6	133134	133139	50 %	0 %	50 %	0 %	408671565
144	NC_018742	GA	3	6	133282	133287	50 %	0 %	50 %	0 %	408671565
145	NC_018742	CA	3	6	135036	135041	50 %	0 %	0 %	50 %	408671566
146	NC_018742	TA	3	6	136075	136080	50 %	50 %	0 %	0 %	408671567
147	NC_018742	CA	3	6	138813	138818	50 %	0 %	0 %	50 %	408671569
148	NC_018742	GA	3	6	140046	140051	50 %	0 %	50 %	0 %	408671569
149	NC_018742	AC	4	8	141635	141642	50 %	0 %	0 %	50 %	408671571
150	NC_018742	CA	3	6	144438	144443	50 %	0 %	0 %	50 %	408671572
151	NC_018742	TG	3	6	145735	145740	0 %	50 %	50 %	0 %	408671574
152	NC_018742	TA	3	6	145847	145852	50 %	50 %	0 %	0 %	408671574
153	NC_018742	AT	3	6	147288	147293	50 %	50 %	0 %	0 %	408671575
154	NC_018742	AT	3	6	147367	147372	50 %	50 %	0 %	0 %	408671575
155	NC_018742	CA	3	6	149220	149225	50 %	0 %	0 %	50 %	408671576
156	NC_018742	AG	3	6	149455	149460	50 %	0 %	50 %	0 %	408671576
157	NC_018742	GA	3	6	149934	149939	50 %	0 %	50 %	0 %	408671576
158	NC_018742	AC	3	6	151499	151504	50 %	0 %	0 %	50 %	408671576
159	NC_018742	AG	3	6	152396	152401	50 %	0 %	50 %	0 %	408671578
160	NC_018742	AT	3	6	152425	152430	50 %	50 %	0 %	0 %	408671578
161	NC_018742	AT	3	6	153013	153018	50 %	50 %	0 %	0 %	408671578
162	NC_018742	AT	3	6	153250	153255	50 %	50 %	0 %	0 %	408671578
163	NC_018742	TG	4	8	153316	153323	0 %	50 %	50 %	0 %	408671578
164	NC_018742	AT	3	6	154295	154300	50 %	50 %	0 %	0 %	408671578
165	NC_018742	TC	3	6	154546	154551	0 %	50 %	0 %	50 %	408671578
166	NC_018742	AT	3	6	155553	155558	50 %	50 %	0 %	0 %	408671578
167	NC_018742	AC	3	6	155907	155912	50 %	0 %	0 %	50 %	408671578
168	NC_018742	CT	3	6	158704	158709	0 %	50 %	0 %	50 %	408671579
169	NC_018742	CT	3	6	160414	160419	0 %	50 %	0 %	50 %	408671579
170	NC_018742	TG	3	6	162362	162367	0 %	50 %	50 %	0 %	408671580
171	NC_018742	CA	3	6	164365	164370	50 %	0 %	0 %	50 %	408671582
172	NC_018742	AC	3	6	164431	164436	50 %	0 %	0 %	50 %	408671582
173	NC_018742	AT	3	6	164930	164935	50 %	50 %	0 %	0 %	408671582
174	NC_018742	AT	3	6	165522	165527	50 %	50 %	0 %	0 %	408671582
175	NC_018742	AG	3	6	165813	165818	50 %	0 %	50 %	0 %	408671582
176	NC_018742	TG	3	6	166069	166074	0 %	50 %	50 %	0 %	408671582
177	NC_018742	AT	3	6	166531	166536	50 %	50 %	0 %	0 %	408671582
178	NC_018742	TG	3	6	166684	166689	0 %	50 %	50 %	0 %	408671582
179	NC_018742	GT	3	6	168728	168733	0 %	50 %	50 %	0 %	408671583
180	NC_018742	TA	3	6	169181	169186	50 %	50 %	0 %	0 %	408671584
181	NC_018742	TC	3	6	169221	169226	0 %	50 %	0 %	50 %	408671584
182	NC_018742	TG	3	6	169301	169306	0 %	50 %	50 %	0 %	408671584
183	NC_018742	CT	3	6	170194	170199	0 %	50 %	0 %	50 %	408671585
184	NC_018742	AT	3	6	171750	171755	50 %	50 %	0 %	0 %	408671587
185	NC_018742	AC	3	6	171905	171910	50 %	0 %	0 %	50 %	408671587
186	NC_018742	TC	3	6	172286	172291	0 %	50 %	0 %	50 %	408671588
187	NC_018742	TC	4	8	172441	172448	0 %	50 %	0 %	50 %	408671589
188	NC_018742	TC	3	6	174158	174163	0 %	50 %	0 %	50 %	408671591
189	NC_018742	TA	3	6	175533	175538	50 %	50 %	0 %	0 %	408671594
190	NC_018742	AT	3	6	175747	175752	50 %	50 %	0 %	0 %	408671595
191	NC_018742	TA	4	8	175930	175937	50 %	50 %	0 %	0 %	408671596
192	NC_018742	AT	3	6	176073	176078	50 %	50 %	0 %	0 %	408671596
193	NC_018742	TA	3	6	176392	176397	50 %	50 %	0 %	0 %	408671597
194	NC_018742	AG	3	6	176620	176625	50 %	0 %	50 %	0 %	408671597
195	NC_018742	TC	3	6	176736	176741	0 %	50 %	0 %	50 %	408671597
196	NC_018742	GT	3	6	177325	177330	0 %	50 %	50 %	0 %	408671597
197	NC_018742	TC	3	6	178352	178357	0 %	50 %	0 %	50 %	408671597
198	NC_018742	AT	3	6	180720	180725	50 %	50 %	0 %	0 %	408671600
199	NC_018742	TC	4	8	181599	181606	0 %	50 %	0 %	50 %	408671602
200	NC_018742	AT	4	8	181903	181910	50 %	50 %	0 %	0 %	408671602
201	NC_018742	CT	3	6	183713	183718	0 %	50 %	0 %	50 %	408671603
202	NC_018742	TA	3	6	184476	184481	50 %	50 %	0 %	0 %	408671605
203	NC_018742	AC	3	6	185229	185234	50 %	0 %	0 %	50 %	408671606
204	NC_018742	TA	3	6	185322	185327	50 %	50 %	0 %	0 %	408671606
205	NC_018742	AT	3	6	186453	186458	50 %	50 %	0 %	0 %	408671607
206	NC_018742	AT	3	6	186993	186998	50 %	50 %	0 %	0 %	408671607
207	NC_018742	TA	3	6	188756	188761	50 %	50 %	0 %	0 %	408671608
208	NC_018742	TG	3	6	188891	188896	0 %	50 %	50 %	0 %	408671608
209	NC_018742	AT	3	6	189274	189279	50 %	50 %	0 %	0 %	408671608
210	NC_018742	CT	3	6	189947	189952	0 %	50 %	0 %	50 %	408671610

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.