MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 374

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018722	AACAAA	2	12	3231	3242	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	408501915
2	NC_018722	TTTGAC	2	12	5642	5653	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408501917
3	NC_018722	GCAGGC	2	12	5659	5670	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	408501917
4	NC_018722	GTGTAT	2	12	6685	6696	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	408501917
5	NC_018722	TTAAAT	2	12	7965	7976	50 %	50 %	0 %	0 %	408501918
6	NC_018722	ATTGAA	2	12	8548	8559	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018722	TTGAGA	2	12	27320	27331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408501927
8	NC_018722	GAACAG	2	12	31304	31315	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	408501930
9	NC_018722	GTCTGG	2	12	31539	31550	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	408501930
10	NC_018722	TTTCCG	2	12	34172	34183	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018722	TTGACG	2	12	38835	38846	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408501935
12	NC_018722	TGCATG	2	12	42337	42348	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408501939
13	NC_018722	CCTCCC	2	12	49439	49450	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
14	NC_018722	CGTGCG	2	12	49794	49805	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	408501946
15	NC_018722	GTCTGG	2	12	50264	50275	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	408501946
16	NC_018722	GCACGA	2	12	59449	59460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018722	TGTAAC	2	12	62402	62413	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408501957
18	NC_018722	AGGGGC	2	12	65737	65748	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	408501960
19	NC_018722	GCCATT	2	12	66857	66868	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408501961
20	NC_018722	TCTTGC	2	12	67086	67097	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	408501961
21	NC_018722	TGAGCA	2	12	80024	80035	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	408501976
22	NC_018722	CACTTT	2	12	84084	84095	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	408501979
23	NC_018722	GGAGTA	2	12	85486	85497	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	408501980
24	NC_018722	CGTGAA	2	12	85705	85716	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	408501980
25	NC_018722	ATTTGT	2	12	86826	86837	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	408501981
26	NC_018722	ACGCTT	2	12	87014	87025	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408501981
27	NC_018722	CGCTTG	2	12	92933	92944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018722	AGGGGA	2	12	97326	97337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408501991
29	NC_018722	CGCACG	2	12	104090	104101	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	408501998
30	NC_018722	GTCGGT	2	12	107692	107703	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	408502002
31	NC_018722	ATCTGC	2	12	117198	117209	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408502008
32	NC_018722	TCTCAA	2	12	125132	125143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018722	TTTTAA	2	12	127474	127485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502014
34	NC_018722	TTGTCG	2	12	131514	131525	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	408502017
35	NC_018722	TCTTGA	2	12	133369	133380	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408502019
36	NC_018722	GCAGAC	2	12	134720	134731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502019
37	NC_018722	CCGGAG	2	12	136216	136227	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	408502020
38	NC_018722	CAGCTG	2	12	136440	136451	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	408502020
39	NC_018722	CCGTGC	2	12	147409	147420	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	408502028
40	NC_018722	CGGCTG	2	12	148599	148610	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	408502030
41	NC_018722	GGCTGG	2	12	150592	150603	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018722	TCGGGC	2	12	150607	150618	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018722	CGGCTC	2	12	151295	151306	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	408502034
44	NC_018722	CTGCGG	4	24	151811	151834	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018722	CGGCTC	2	12	152316	152327	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018722	TGGTTG	2	12	152570	152581	0 %	50 %	50 %	0 %	408502036
47	NC_018722	CCGGAG	2	12	153668	153679	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	408502036
48	NC_018722	CAGCTG	2	12	153892	153903	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	408502036
49	NC_018722	TAAAAA	2	12	154223	154234	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018722	GCAAGC	2	12	156015	156026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502038
51	NC_018722	GGGGGT	2	12	158798	158809	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	408502040
52	NC_018722	GTGTGC	2	12	174233	174244	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	408502053
53	NC_018722	ACTGTT	2	12	178389	178400	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408502057
54	NC_018722	TGCGTA	2	12	179414	179425	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408502057
55	NC_018722	TTGGGT	2	12	187969	187980	0 %	50 %	50 %	0 %	408502066
56	NC_018722	GGAAGA	2	12	193175	193186	50 %	0 %	50 %	0 %	408502072
57	NC_018722	GACACT	2	12	193336	193347	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408502072
58	NC_018722	GGTGAG	2	12	193499	193510	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	408502072
59	NC_018722	GAGAAA	2	12	197692	197703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502075
60	NC_018722	CGGTGA	2	12	206256	206267	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	408502085
61	NC_018722	AAAAGG	2	12	206521	206532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502085
62	NC_018722	TAAGGG	2	12	213308	213319	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	408502100
63	NC_018722	TTTGGT	2	12	213916	213927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502102
64	NC_018722	GTGTTT	2	12	222866	222877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502113
65	NC_018722	TGCGCT	2	12	223614	223625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502114
66	NC_018722	TCTTGT	2	12	225440	225451	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	408502115
67	NC_018722	GTGTTT	2	12	225469	225480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502115
68	NC_018722	TATGCT	2	12	229471	229482	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408502119
69	NC_018722	GTGCGA	2	12	234732	234743	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_018722	TCCTTC	2	12	236113	236124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018722	AGGAGA	2	12	236875	236886	50 %	0 %	50 %	0 %	408502121
72	NC_018722	GCAGAC	2	12	238960	238971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502124
73	NC_018722	GCGGGT	2	12	241601	241612	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	408502126
74	NC_018722	GGAAAC	2	12	248152	248163	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	408502135
75	NC_018722	TTTCTG	2	12	248688	248699	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	408502135
76	NC_018722	GGAATG	2	12	250510	250521	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	408502136
77	NC_018722	ACCTTG	2	12	250884	250895	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408502136
78	NC_018722	GTTTGT	2	12	259162	259173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018722	AACGCA	2	12	263031	263042	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	408502142
80	NC_018722	CATGCG	2	12	265954	265965	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	408502146
81	NC_018722	TTTTTC	2	12	268949	268960	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	408502150
82	NC_018722	TACAAT	2	12	270145	270156	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408502151
83	NC_018722	CCCTGC	2	12	272314	272325	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	408502154
84	NC_018722	GTGCGA	2	12	283167	283178	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018722	TCCTTC	2	12	284548	284559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_018722	TCATTT	2	12	286710	286721	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	408502162
87	NC_018722	GGGTGA	2	12	294690	294701	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	408502170
88	NC_018722	CTGCCG	2	12	302937	302948	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	408502176
89	NC_018722	ATGCGT	2	12	303075	303086	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408502176
90	NC_018722	GCTGCA	2	12	303785	303796	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	408502176
91	NC_018722	TGATGT	2	12	305007	305018	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	408502177
92	NC_018722	GCAGTT	2	12	305188	305199	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408502177
93	NC_018722	TGCGCT	2	12	306842	306853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502179
94	NC_018722	GGCTGC	2	12	310957	310968	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	408502183
95	NC_018722	CTCCGT	2	12	315091	315102	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	408502186
96	NC_018722	GAAATC	2	12	317473	317484	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	408502189
97	NC_018722	GTATGG	2	12	317715	317726	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	408502189
98	NC_018722	GTGAAA	2	12	318278	318289	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	408502189
99	NC_018722	ACGGTC	2	12	321194	321205	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	408502190
100	NC_018722	TGAGCG	2	12	323215	323226	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	408502191
101	NC_018722	CGGCAC	2	12	323667	323678	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	408502191
102	NC_018722	TGCAGG	2	12	325526	325537	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	408502193
103	NC_018722	GCACCG	2	12	331667	331678	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_018722	CCGGAG	2	12	333041	333052	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018722	CAGCTG	2	12	333265	333276	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018722	TGGCAT	2	12	337561	337572	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408502204
107	NC_018722	GCTGTG	2	12	341086	341097	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	408502207
108	NC_018722	GTGCTC	2	12	341137	341148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502207
109	NC_018722	TGTTCG	2	12	341307	341318	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	408502207
110	NC_018722	TTCATG	2	12	341423	341434	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408502207
111	NC_018722	ACCGTC	2	12	341459	341470	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	408502207
112	NC_018722	TTTGGA	2	12	345120	345131	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	408502207
113	NC_018722	GAGCGC	2	12	346581	346592	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	408502208
114	NC_018722	CTTTGA	2	12	347024	347035	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408502208
115	NC_018722	AATATA	2	12	355156	355167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018722	GTGTTG	2	12	372050	372061	0 %	50 %	50 %	0 %	408502226
117	NC_018722	TTTCCG	2	12	372419	372430	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018722	CAGGAG	2	12	374428	374439	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	408502228
119	NC_018722	TGGGAG	2	12	374600	374611	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	408502228
120	NC_018722	CTTTTG	2	12	377704	377715	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	408502231
121	NC_018722	CGTGGT	2	12	380908	380919	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	408502237
122	NC_018722	TCGCGT	2	12	390846	390857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502247
123	NC_018722	CTGAGC	2	12	394470	394481	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	408502249
124	NC_018722	GTCATC	2	12	395631	395642	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408502250
125	NC_018722	GTGCGC	2	12	396213	396224	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	408502251
126	NC_018722	TGCGAA	2	12	397262	397273	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	408502252
127	NC_018722	CCGCGT	2	12	398086	398097	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	408502253
128	NC_018722	TGCAGA	2	12	399465	399476	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	408502254
129	NC_018722	GCAGGA	2	12	399669	399680	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	408502254
130	NC_018722	CAGGGG	2	12	403628	403639	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	408502257
131	NC_018722	GTACTG	2	12	406946	406957	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408502258
132	NC_018722	GGGGCG	2	12	409970	409981	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	408502261
133	NC_018722	TGTAGG	2	12	414734	414745	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	408502266
134	NC_018722	AAGGGG	2	12	414933	414944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502266
135	NC_018722	ATTAAA	2	12	415413	415424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502266
136	NC_018722	GGGAGA	2	12	416636	416647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502267
137	NC_018722	TATTGA	2	12	419958	419969	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408502271
138	NC_018722	GAAGAT	2	12	426866	426877	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	408502277
139	NC_018722	ACGCGC	2	12	429894	429905	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	408502280
140	NC_018722	TGCTCG	2	12	431762	431773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502283
141	NC_018722	TTTTTG	2	12	436358	436369	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	408502286
142	NC_018722	TGACCG	2	12	437294	437305	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	408502288
143	NC_018722	ACGCTT	2	12	438024	438035	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408502288
144	NC_018722	TCCGAC	2	12	441620	441631	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	408502291
145	NC_018722	GCGATT	2	12	442316	442327	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408502292
146	NC_018722	GGCCCT	2	12	445713	445724	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	408502295
147	NC_018722	GTTGCC	2	12	448841	448852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502297
148	NC_018722	GCGTGT	2	12	451396	451407	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	408502299
149	NC_018722	TGTGCA	2	12	457973	457984	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408502306
150	NC_018722	CGTGCG	2	12	470501	470512	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	408502318
151	NC_018722	CGTGCC	2	12	472589	472600	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	408502320
152	NC_018722	ACGTGT	2	12	472887	472898	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408502320
153	NC_018722	CGCGTA	2	12	477656	477667	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	408502325
154	NC_018722	ACAGGA	2	12	478227	478238	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	408502326
155	NC_018722	ACTGCA	2	12	480233	480244	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408502327
156	NC_018722	GTGCGC	2	12	488282	488293	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	408502333
157	NC_018722	ACGTGC	2	12	488951	488962	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	408502333
158	NC_018722	GGCAGC	2	12	489441	489452	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	408502333
159	NC_018722	GGTGCG	2	12	489924	489935	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	408502333
160	NC_018722	GGGGAA	2	12	492452	492463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502337
161	NC_018722	GTGTGC	2	12	495009	495020	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	408502340
162	NC_018722	GAGGGC	2	12	499799	499810	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	408502344
163	NC_018722	TTTGAG	2	12	517314	517325	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	408502357
164	NC_018722	GTGACG	2	12	519418	519429	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	408502359
165	NC_018722	GCACCG	2	12	522108	522119	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
166	NC_018722	CGTGCG	2	12	525756	525767	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_018722	TGGAGA	2	12	525998	526009	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	408502362
168	NC_018722	CGATGG	2	12	530074	530085	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	408502366
169	NC_018722	CTGACG	2	12	531402	531413	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	408502366
170	NC_018722	CTGTAT	2	12	533539	533550	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408502368
171	NC_018722	GAATGG	2	12	537976	537987	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	408502372
172	NC_018722	ATATTG	2	12	539906	539917	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408502374
173	NC_018722	TCACCG	2	12	541880	541891	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	408502376
174	NC_018722	CGTGTA	2	12	542321	542332	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408502376
175	NC_018722	AGCAGG	2	12	544165	544176	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	408502377
176	NC_018722	GAAATG	2	12	554279	554290	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	408502385
177	NC_018722	TTTCCA	2	12	555496	555507	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	408502386
178	NC_018722	ATGTGC	2	12	556372	556383	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408502386
179	NC_018722	AAAGGT	2	12	556974	556985	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	408502386
180	NC_018722	TCAGTA	2	12	560871	560882	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408502389
181	NC_018722	TAACCC	2	12	562663	562674	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
182	NC_018722	ATACTG	2	12	562757	562768	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
183	NC_018722	CGCGTG	2	12	564326	564337	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	408502391
184	NC_018722	TCTTTT	2	12	568383	568394	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	408502394
185	NC_018722	TCAGTA	2	12	569590	569601	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408502395
186	NC_018722	ATACCC	2	12	573753	573764	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	408502398
187	NC_018722	AGCACC	2	12	580531	580542	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	408502405
188	NC_018722	AGCAGA	2	12	585715	585726	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	408502411
189	NC_018722	GCGCTC	2	12	587514	587525	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	408502412
190	NC_018722	TGTTCC	2	12	588182	588193	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	408502413
191	NC_018722	AGACAT	2	12	597992	598003	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	408502419
192	NC_018722	ACTACC	2	12	598020	598031	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	408502419
193	NC_018722	ATATCG	2	12	598434	598445	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408502419
194	NC_018722	GCGCGA	2	12	607577	607588	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	408502428
195	NC_018722	GCCCCT	2	12	607878	607889	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	408502428
196	NC_018722	CACACG	2	12	608611	608622	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	408502429
197	NC_018722	ACGGCC	2	12	615755	615766	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	408502434
198	NC_018722	AAAGAA	2	12	616226	616237	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	408502435
199	NC_018722	AAATAC	2	12	616731	616742	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408502435
200	NC_018722	TCCTTT	2	12	618022	618033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502436
201	NC_018722	ACGCAC	2	12	620331	620342	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	408502438
202	NC_018722	CGGTTG	2	12	623048	623059	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	408502441
203	NC_018722	TCCGCG	2	12	624418	624429	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	408502442
204	NC_018722	TTTCAC	2	12	625530	625541	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	408502442
205	NC_018722	AGCGCG	2	12	629286	629297	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	408502445
206	NC_018722	ACGCGC	2	12	632069	632080	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	408502447
207	NC_018722	GTTATT	2	12	635218	635229	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	408502450
208	NC_018722	GCACAC	2	12	641339	641350	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	408502453
209	NC_018722	AGCCAT	2	12	642783	642794	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408502455
210	NC_018722	TCAGAT	2	12	652708	652719	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408502462
211	NC_018722	CTCGCT	2	12	652962	652973	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	408502463
212	NC_018722	CACGCC	2	12	658941	658952	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	408502469
213	NC_018722	CTCATC	2	12	659215	659226	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	408502470
214	NC_018722	CAAAAG	2	12	661118	661129	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408502471
215	NC_018722	CTGCTC	2	12	664113	664124	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	408502473
216	NC_018722	ACCTAC	2	12	666403	666414	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	408502475
217	NC_018722	GGCGCA	2	12	670428	670439	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	408502478
218	NC_018722	GCACCG	2	12	671575	671586	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	408502480
219	NC_018722	GCACCG	2	12	672363	672374	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	408502482
220	NC_018722	CAAAAT	2	12	673514	673525	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408502483
221	NC_018722	CCGGAG	2	12	674371	674382	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	408502483
222	NC_018722	CAGCTG	2	12	674595	674606	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	408502483
223	NC_018722	TGCACG	2	12	681056	681067	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	408502487
224	NC_018722	CGGTGT	2	12	681854	681865	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	408502487
225	NC_018722	TGAGCG	2	12	685808	685819	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	408502490
226	NC_018722	TGCAAT	2	12	688003	688014	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408502491
227	NC_018722	TGTTTT	2	12	689238	689249	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	408502492
228	NC_018722	CGGCCG	2	12	694936	694947	0 %	0 %	50 %	50 %	408502497
229	NC_018722	ATTGAG	2	12	695726	695737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502497
230	NC_018722	GCTTCT	2	12	696606	696617	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	408502497
231	NC_018722	ATACCC	2	12	697436	697447	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	408502498
232	NC_018722	GAAAGA	2	12	697582	697593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502498
233	NC_018722	TTCTCC	2	12	699571	699582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
234	NC_018722	CAGGAT	2	12	712525	712536	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	408502510
235	NC_018722	CCTCCG	2	12	717140	717151	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
236	NC_018722	CCTGTA	2	12	720665	720676	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408502516
237	NC_018722	TGCATT	2	12	723221	723232	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408502519
238	NC_018722	CCCATC	2	12	724475	724486	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	408502520
239	NC_018722	CTCATC	2	12	724826	724837	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	408502520
240	NC_018722	GTGTGG	2	12	727911	727922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502523
241	NC_018722	CCGGGC	2	12	729003	729014	0 %	0 %	50 %	50 %	408502525
242	NC_018722	CAGCAT	2	12	732282	732293	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408502528
243	NC_018722	AAGCGC	2	12	735971	735982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502529
244	NC_018722	TGCATA	2	12	736938	736949	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408502530
245	NC_018722	GCCAAT	2	12	737465	737476	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408502531
246	NC_018722	ACCGTA	2	12	738598	738609	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408502532
247	NC_018722	AACCGC	2	12	740403	740414	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	408502533
248	NC_018722	ATACAT	2	12	755313	755324	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408502547
249	NC_018722	TCTTGC	2	12	756617	756628	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	408502547
250	NC_018722	ATCTAG	2	12	760408	760419	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408502551
251	NC_018722	CCACAC	2	12	763476	763487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502553
252	NC_018722	GCCCCT	2	12	763814	763825	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	408502554
253	NC_018722	TTTCCG	2	12	764668	764679	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	408502555
254	NC_018722	ACGCGC	2	12	767069	767080	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
255	NC_018722	GACACC	2	12	768633	768644	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	408502558
256	NC_018722	GGCACA	2	12	772908	772919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502562
257	NC_018722	TTAAAG	2	12	778604	778615	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408502566
258	NC_018722	ATTCCC	2	12	781256	781267	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	408502569
259	NC_018722	AGTCCA	2	12	785376	785387	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408502571
260	NC_018722	CCTGCG	2	12	789767	789778	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	408502577
261	NC_018722	ACGTGC	2	12	791225	791236	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	408502578
262	NC_018722	CTGCGC	2	12	796520	796531	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	408502585
263	NC_018722	GGGCAG	2	12	796906	796917	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	408502585
264	NC_018722	TGTGAC	2	12	799690	799701	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408502588
265	NC_018722	AACGGC	2	12	800614	800625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502589
266	NC_018722	CGGGGG	2	12	800634	800645	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	408502589
267	NC_018722	TTTCCA	2	12	801221	801232	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	408502590
268	NC_018722	GCATAC	2	12	803207	803218	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408502591
269	NC_018722	TTGGAA	2	12	804661	804672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502593
270	NC_018722	TAACGT	2	12	807562	807573	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408502596
271	NC_018722	GCACTT	2	12	808590	808601	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408502597
272	NC_018722	GAGCAA	2	12	810063	810074	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	408502599
273	NC_018722	ACGCAG	2	12	810976	810987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_018722	GCGAGC	2	12	812133	812144	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	408502602
275	NC_018722	CATCTT	2	12	816096	816107	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	408502604
276	NC_018722	AGAGCG	2	12	819571	819582	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	408502608
277	NC_018722	ACACGC	2	12	819811	819822	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
278	NC_018722	AACTCA	2	12	826144	826155	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	408502615
279	NC_018722	GCACAC	2	12	828141	828152	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	408502617
280	NC_018722	GCAGGG	2	12	828263	828274	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
281	NC_018722	CCAGTC	2	12	834011	834022	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	408502622
282	NC_018722	GCAAGC	2	12	850289	850300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502635
283	NC_018722	ACCCCT	2	12	851622	851633	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	408502637
284	NC_018722	CAGAGA	2	12	854008	854019	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
285	NC_018722	GCATCT	2	12	864224	864235	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408502650
286	NC_018722	GTGCAC	2	12	870289	870300	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_018722	GGTATC	2	12	874113	874124	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408502657
288	NC_018722	CACGCG	2	12	877610	877621	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	408502659
289	NC_018722	AAAGAC	2	12	882848	882859	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
290	NC_018722	TGCTCC	2	12	883985	883996	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	408502665
291	NC_018722	AAAACT	2	12	885581	885592	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408502666
292	NC_018722	CAAACA	2	12	886065	886076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502667
293	NC_018722	CCATCC	2	12	890797	890808	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
294	NC_018722	CACCTT	2	12	892940	892951	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	408502675
295	NC_018722	CAGGTG	2	12	897144	897155	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	408502679
296	NC_018722	AAAGAC	2	12	899852	899863	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408502683
297	NC_018722	TATCAG	2	12	902287	902298	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408502685
298	NC_018722	CTGCGC	2	12	905930	905941	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	408502687
299	NC_018722	GGCGCA	2	12	908093	908104	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
300	NC_018722	GCGATA	2	12	911466	911477	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	408502690
301	NC_018722	TTTTCA	2	12	924614	924625	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	408502704
302	NC_018722	CTTCTG	3	18	925942	925959	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	408502705
303	NC_018722	CAAGCT	2	12	928909	928920	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408502706
304	NC_018722	ACAGGC	2	12	930816	930827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502706
305	NC_018722	GAGTGG	2	12	937455	937466	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	408502710
306	NC_018722	CTTGCG	2	12	938654	938665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502711
307	NC_018722	TCGTAT	2	12	938891	938902	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408502711
308	NC_018722	GCGCAA	2	12	940566	940577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502712
309	NC_018722	GCTCCT	2	12	942014	942025	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	408502713
310	NC_018722	GCGCTC	2	12	943136	943147	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	408502714
311	NC_018722	AAATGC	2	12	943723	943734	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	408502715
312	NC_018722	GCAGGA	2	12	945734	945745	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	408502716
313	NC_018722	AAGCTC	2	12	948441	948452	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408502717
314	NC_018722	CTGCGC	2	12	952011	952022	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	408502723
315	NC_018722	CAACAT	2	12	957002	957013	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	408502729
316	NC_018722	CAAAAA	2	12	962337	962348	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	408502734
317	NC_018722	TTCTCC	2	12	967451	967462	0 %	50 %	0 %	50 %	408502738
318	NC_018722	ACTCGA	2	12	967469	967480	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408502739
319	NC_018722	AGATCA	2	12	968857	968868	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	408502740
320	NC_018722	CTGATA	2	12	971619	971630	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408502742
321	NC_018722	CCGGAG	2	12	978382	978393	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	408502749
322	NC_018722	GCAGGA	2	12	978729	978740	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	408502749
323	NC_018722	CAGCTC	2	12	979064	979075	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	408502749
324	NC_018722	CCGGCT	2	12	981277	981288	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	408502749
325	NC_018722	ACCTGC	2	12	981455	981466	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	408502749
326	NC_018722	TCTTCA	2	12	982850	982861	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	408502750
327	NC_018722	TCTGCG	2	12	989259	989270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502756
328	NC_018722	GGACGT	2	12	989842	989853	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	408502757
329	NC_018722	ACAAAC	2	12	990026	990037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502758
330	NC_018722	CCACGG	2	12	993356	993367	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	408502762
331	NC_018722	GAGCAG	2	12	995921	995932	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
332	NC_018722	CTTGCA	2	12	999891	999902	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408502769
333	NC_018722	CAGCGC	2	12	1000596	1000607	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	408502769
334	NC_018722	GCTAAC	2	12	1004165	1004176	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408502772
335	NC_018722	TACCGT	2	12	1004282	1004293	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408502772
336	NC_018722	TGGCGG	2	12	1010675	1010686	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	408502777
337	NC_018722	ACGCTG	2	12	1010999	1011010	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	408502777
338	NC_018722	ACTGAC	2	12	1017907	1017918	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408502781
339	NC_018722	GCGCGT	2	12	1020554	1020565	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	408502783
340	NC_018722	AAAAGA	3	18	1032021	1032038	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	408502795
341	NC_018722	TGCCTC	2	12	1037979	1037990	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	408502801
342	NC_018722	CGGTTA	2	12	1045596	1045607	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408502809
343	NC_018722	CTCGCC	2	12	1046356	1046367	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	408502809
344	NC_018722	TTGATC	2	12	1050616	1050627	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408502813
345	NC_018722	CATGTT	2	12	1051220	1051231	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408502814
346	NC_018722	TTCGCC	2	12	1051292	1051303	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	408502814
347	NC_018722	CCCGCT	2	12	1051986	1051997	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	408502814
348	NC_018722	TCTTGC	2	12	1053091	1053102	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	408502815
349	NC_018722	GCCACC	2	12	1060558	1060569	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	408502821
350	NC_018722	GGAGCC	2	12	1065399	1065410	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	408502826
351	NC_018722	GGTGCG	2	12	1067615	1067626	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	408502828
352	NC_018722	AGAGGA	2	12	1068402	1068413	50 %	0 %	50 %	0 %	408502829
353	NC_018722	GAGGTG	2	12	1071049	1071060	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	408502831
354	NC_018722	TCTTTT	2	12	1073130	1073141	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	408502832
355	NC_018722	ACGCAG	2	12	1076390	1076401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502836
356	NC_018722	TATGAG	2	12	1081524	1081535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502841
357	NC_018722	TGACGA	2	12	1090243	1090254	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	408502845
358	NC_018722	ATCTGC	2	12	1096389	1096400	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408502851
359	NC_018722	AACTCC	2	12	1098591	1098602	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	408502852
360	NC_018722	AAAGCG	2	12	1099352	1099363	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	408502853
361	NC_018722	ACTGCA	2	12	1101397	1101408	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408502854
362	NC_018722	TAATTC	2	12	1104734	1104745	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408502857
363	NC_018722	CATGCA	2	12	1105849	1105860	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408502858
364	NC_018722	TTGCCA	2	12	1112975	1112986	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408502864
365	NC_018722	GCCCTC	2	12	1114654	1114665	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	408502866
366	NC_018722	CTGTGC	2	12	1115578	1115589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502867
367	NC_018722	CGCCTT	2	12	1117072	1117083	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	408502868
368	NC_018722	TCTGCA	2	12	1118661	1118672	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408502869
369	NC_018722	ATGCGT	2	12	1120477	1120488	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408502872
370	NC_018722	GCTGAC	2	12	1126908	1126919	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	408502877
371	NC_018722	TGCACG	2	12	1127306	1127317	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	408502877
372	NC_018722	AATTTC	2	12	1128161	1128172	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408502878
373	NC_018722	AGCCCC	2	12	1129034	1129045	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	408502879
374	NC_018722	TCCTCG	2	12	1130049	1130060	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	408502880

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.