MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 4504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018722	TC	3	6	795	800	0 %	50 %	0 %	50 %	408501913
2	NC_018722	CT	3	6	1062	1067	0 %	50 %	0 %	50 %	408501913
3	NC_018722	CT	3	6	1084	1089	0 %	50 %	0 %	50 %	408501913
4	NC_018722	TC	3	6	1221	1226	0 %	50 %	0 %	50 %	408501913
5	NC_018722	TG	3	6	1519	1524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018722	TC	3	6	2017	2022	0 %	50 %	0 %	50 %	408501914
7	NC_018722	TA	3	6	2175	2180	50 %	50 %	0 %	0 %	408501914
8	NC_018722	AT	3	6	2819	2824	50 %	50 %	0 %	0 %	408501915
9	NC_018722	CG	3	6	2952	2957	0 %	0 %	50 %	50 %	408501915
10	NC_018722	CA	3	6	3004	3009	50 %	0 %	0 %	50 %	408501915
11	NC_018722	AG	3	6	3247	3252	50 %	0 %	50 %	0 %	408501915
12	NC_018722	AT	3	6	3877	3882	50 %	50 %	0 %	0 %	408501916
13	NC_018722	GT	3	6	3929	3934	0 %	50 %	50 %	0 %	408501916
14	NC_018722	TC	3	6	4346	4351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018722	GA	3	6	6214	6219	50 %	0 %	50 %	0 %	408501917
16	NC_018722	CG	3	6	6306	6311	0 %	0 %	50 %	50 %	408501917
17	NC_018722	AC	3	6	6624	6629	50 %	0 %	0 %	50 %	408501917
18	NC_018722	GT	3	6	6728	6733	0 %	50 %	50 %	0 %	408501917
19	NC_018722	GT	3	6	6771	6776	0 %	50 %	50 %	0 %	408501917
20	NC_018722	GC	3	6	7548	7553	0 %	0 %	50 %	50 %	408501918
21	NC_018722	GA	3	6	7912	7917	50 %	0 %	50 %	0 %	408501918
22	NC_018722	GC	3	6	8016	8021	0 %	0 %	50 %	50 %	408501918
23	NC_018722	AT	4	8	8573	8580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018722	CG	3	6	8707	8712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018722	AG	3	6	9425	9430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018722	AC	3	6	9823	9828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018722	AG	3	6	9886	9891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018722	TC	3	6	9943	9948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018722	GC	3	6	10083	10088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018722	TC	3	6	10700	10705	0 %	50 %	0 %	50 %	408501919
31	NC_018722	GC	3	6	11289	11294	0 %	0 %	50 %	50 %	408501919
32	NC_018722	GT	3	6	11330	11335	0 %	50 %	50 %	0 %	408501919
33	NC_018722	GT	3	6	11520	11525	0 %	50 %	50 %	0 %	408501919
34	NC_018722	TA	3	6	11907	11912	50 %	50 %	0 %	0 %	408501919
35	NC_018722	CA	3	6	12027	12032	50 %	0 %	0 %	50 %	408501919
36	NC_018722	GT	3	6	12353	12358	0 %	50 %	50 %	0 %	408501919
37	NC_018722	GA	3	6	12510	12515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018722	GT	3	6	12518	12523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018722	GC	3	6	12612	12617	0 %	0 %	50 %	50 %	408501920
40	NC_018722	GC	3	6	13059	13064	0 %	0 %	50 %	50 %	408501920
41	NC_018722	GT	3	6	13142	13147	0 %	50 %	50 %	0 %	408501920
42	NC_018722	CA	4	8	13234	13241	50 %	0 %	0 %	50 %	408501920
43	NC_018722	GA	3	6	13318	13323	50 %	0 %	50 %	0 %	408501920
44	NC_018722	GC	3	6	13529	13534	0 %	0 %	50 %	50 %	408501920
45	NC_018722	CT	4	8	13578	13585	0 %	50 %	0 %	50 %	408501920
46	NC_018722	GC	3	6	14265	14270	0 %	0 %	50 %	50 %	408501921
47	NC_018722	CG	3	6	14299	14304	0 %	0 %	50 %	50 %	408501921
48	NC_018722	AT	3	6	14542	14547	50 %	50 %	0 %	0 %	408501921
49	NC_018722	TG	3	6	15952	15957	0 %	50 %	50 %	0 %	408501922
50	NC_018722	CG	3	6	16387	16392	0 %	0 %	50 %	50 %	408501922
51	NC_018722	CG	3	6	16494	16499	0 %	0 %	50 %	50 %	408501922
52	NC_018722	GT	4	8	16825	16832	0 %	50 %	50 %	0 %	408501922
53	NC_018722	CA	3	6	16834	16839	50 %	0 %	0 %	50 %	408501922
54	NC_018722	GT	3	6	17215	17220	0 %	50 %	50 %	0 %	408501922
55	NC_018722	CG	3	6	17334	17339	0 %	0 %	50 %	50 %	408501922
56	NC_018722	AG	3	6	17367	17372	50 %	0 %	50 %	0 %	408501922
57	NC_018722	GT	3	6	17512	17517	0 %	50 %	50 %	0 %	408501922
58	NC_018722	CG	4	8	17521	17528	0 %	0 %	50 %	50 %	408501922
59	NC_018722	GT	3	6	18261	18266	0 %	50 %	50 %	0 %	408501922
60	NC_018722	AT	3	6	18648	18653	50 %	50 %	0 %	0 %	408501923
61	NC_018722	GT	3	6	18704	18709	0 %	50 %	50 %	0 %	408501923
62	NC_018722	GC	3	6	18754	18759	0 %	0 %	50 %	50 %	408501923
63	NC_018722	CG	3	6	19427	19432	0 %	0 %	50 %	50 %	408501924
64	NC_018722	CG	3	6	19909	19914	0 %	0 %	50 %	50 %	408501924
65	NC_018722	GT	3	6	20342	20347	0 %	50 %	50 %	0 %	408501924
66	NC_018722	CG	3	6	20761	20766	0 %	0 %	50 %	50 %	408501924
67	NC_018722	CT	4	8	21104	21111	0 %	50 %	0 %	50 %	408501924
68	NC_018722	GC	3	6	21123	21128	0 %	0 %	50 %	50 %	408501924
69	NC_018722	GA	3	6	21663	21668	50 %	0 %	50 %	0 %	408501924
70	NC_018722	CA	3	6	21857	21862	50 %	0 %	0 %	50 %	408501924
71	NC_018722	CG	3	6	22422	22427	0 %	0 %	50 %	50 %	408501925
72	NC_018722	AC	3	6	22429	22434	50 %	0 %	0 %	50 %	408501925
73	NC_018722	GT	3	6	22592	22597	0 %	50 %	50 %	0 %	408501925
74	NC_018722	CG	3	6	23212	23217	0 %	0 %	50 %	50 %	408501925
75	NC_018722	GA	3	6	23680	23685	50 %	0 %	50 %	0 %	408501925
76	NC_018722	GA	4	8	24345	24352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018722	CA	3	6	24383	24388	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018722	TC	3	6	24424	24429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018722	GA	4	8	24489	24496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018722	TC	3	6	24569	24574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018722	AG	3	6	25790	25795	50 %	0 %	50 %	0 %	408501927
82	NC_018722	TG	3	6	26026	26031	0 %	50 %	50 %	0 %	408501927
83	NC_018722	GT	3	6	26253	26258	0 %	50 %	50 %	0 %	408501927
84	NC_018722	GC	3	6	26470	26475	0 %	0 %	50 %	50 %	408501927
85	NC_018722	CG	3	6	26739	26744	0 %	0 %	50 %	50 %	408501927
86	NC_018722	GA	3	6	27241	27246	50 %	0 %	50 %	0 %	408501927
87	NC_018722	GT	4	8	27412	27419	0 %	50 %	50 %	0 %	408501927
88	NC_018722	GC	4	8	27454	27461	0 %	0 %	50 %	50 %	408501927
89	NC_018722	GT	4	8	27806	27813	0 %	50 %	50 %	0 %	408501928
90	NC_018722	GT	3	6	28047	28052	0 %	50 %	50 %	0 %	408501928
91	NC_018722	AT	4	8	28140	28147	50 %	50 %	0 %	0 %	408501928
92	NC_018722	GT	3	6	28493	28498	0 %	50 %	50 %	0 %	408501928
93	NC_018722	TG	3	6	28508	28513	0 %	50 %	50 %	0 %	408501928
94	NC_018722	AT	3	6	28935	28940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018722	GC	3	6	29213	29218	0 %	0 %	50 %	50 %	408501929
96	NC_018722	TC	3	6	29584	29589	0 %	50 %	0 %	50 %	408501929
97	NC_018722	AG	3	6	29864	29869	50 %	0 %	50 %	0 %	408501930
98	NC_018722	TC	3	6	30393	30398	0 %	50 %	0 %	50 %	408501930
99	NC_018722	TG	3	6	30633	30638	0 %	50 %	50 %	0 %	408501930
100	NC_018722	CA	3	6	30959	30964	50 %	0 %	0 %	50 %	408501930
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102	NC_018722	GC	3	6	31458	31463	0 %	0 %	50 %	50 %	408501930
103	NC_018722	GA	3	6	31731	31736	50 %	0 %	50 %	0 %	408501930
104	NC_018722	GT	3	6	32400	32405	0 %	50 %	50 %	0 %	408501930
105	NC_018722	AC	3	6	32441	32446	50 %	0 %	0 %	50 %	408501930
106	NC_018722	GC	3	6	32985	32990	0 %	0 %	50 %	50 %	408501931
107	NC_018722	AG	3	6	33097	33102	50 %	0 %	50 %	0 %	408501931
108	NC_018722	AG	3	6	33106	33111	50 %	0 %	50 %	0 %	408501931
109	NC_018722	CG	3	6	33307	33312	0 %	0 %	50 %	50 %	408501931
110	NC_018722	AC	3	6	33732	33737	50 %	0 %	0 %	50 %	408501931
111	NC_018722	CG	3	6	33998	34003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018722	GT	3	6	34193	34198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018722	CG	4	8	34817	34824	0 %	0 %	50 %	50 %	408501932
114	NC_018722	GC	3	6	35000	35005	0 %	0 %	50 %	50 %	408501932
115	NC_018722	GC	3	6	35055	35060	0 %	0 %	50 %	50 %	408501932
116	NC_018722	AT	3	6	35129	35134	50 %	50 %	0 %	0 %	408501932
117	NC_018722	TA	3	6	35218	35223	50 %	50 %	0 %	0 %	408501932
118	NC_018722	TG	3	6	35374	35379	0 %	50 %	50 %	0 %	408501932
119	NC_018722	GC	3	6	35444	35449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018722	TG	3	6	35494	35499	0 %	50 %	50 %	0 %	408501933
121	NC_018722	CT	3	6	35672	35677	0 %	50 %	0 %	50 %	408501933
122	NC_018722	GT	4	8	35872	35879	0 %	50 %	50 %	0 %	408501933
123	NC_018722	GC	3	6	36019	36024	0 %	0 %	50 %	50 %	408501933
124	NC_018722	CA	4	8	36068	36075	50 %	0 %	0 %	50 %	408501933
125	NC_018722	AC	3	6	36096	36101	50 %	0 %	0 %	50 %	408501933
126	NC_018722	TG	3	6	36112	36117	0 %	50 %	50 %	0 %	408501933
127	NC_018722	CG	3	6	36639	36644	0 %	0 %	50 %	50 %	408501933
128	NC_018722	TG	3	6	36896	36901	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018722	GT	3	6	36970	36975	0 %	50 %	50 %	0 %	408501934
130	NC_018722	CA	3	6	37020	37025	50 %	0 %	0 %	50 %	408501934
131	NC_018722	GC	3	6	37525	37530	0 %	0 %	50 %	50 %	408501934
132	NC_018722	TG	3	6	37979	37984	0 %	50 %	50 %	0 %	408501934
133	NC_018722	GC	3	6	38089	38094	0 %	0 %	50 %	50 %	408501934
134	NC_018722	CT	3	6	39425	39430	0 %	50 %	0 %	50 %	408501935
135	NC_018722	GT	3	6	40579	40584	0 %	50 %	50 %	0 %	408501937
136	NC_018722	GT	3	6	40604	40609	0 %	50 %	50 %	0 %	408501937
137	NC_018722	TG	3	6	41100	41105	0 %	50 %	50 %	0 %	408501938
138	NC_018722	AT	3	6	41283	41288	50 %	50 %	0 %	0 %	408501938
139	NC_018722	CA	3	6	41620	41625	50 %	0 %	0 %	50 %	408501938
140	NC_018722	CA	3	6	41652	41657	50 %	0 %	0 %	50 %	408501938
141	NC_018722	CA	3	6	41699	41704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_018722	GT	3	6	42372	42377	0 %	50 %	50 %	0 %	408501939
143	NC_018722	CT	3	6	42798	42803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_018722	AG	3	6	42862	42867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018722	CG	3	6	43010	43015	0 %	0 %	50 %	50 %	408501940
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