MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 428

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018722	TG	3	6	1519	1524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018722	TC	3	6	4346	4351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018722	AT	4	8	8573	8580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018722	CG	3	6	8707	8712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018722	AG	3	6	9425	9430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018722	AC	3	6	9823	9828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018722	AG	3	6	9886	9891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018722	TC	3	6	9943	9948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018722	GC	3	6	10083	10088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018722	GA	3	6	12510	12515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018722	GT	3	6	12518	12523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018722	GA	4	8	24345	24352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018722	CA	3	6	24383	24388	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018722	TC	3	6	24424	24429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018722	GA	4	8	24489	24496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018722	TC	3	6	24569	24574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018722	AT	3	6	28935	28940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018722	CG	3	6	33998	34003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018722	GT	3	6	34193	34198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018722	GC	3	6	35444	35449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018722	TG	3	6	36896	36901	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018722	CA	3	6	41699	41704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018722	CT	3	6	42798	42803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018722	AG	3	6	42862	42867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018722	GA	3	6	46730	46735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018722	CA	3	6	47036	47041	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018722	TC	4	8	47125	47132	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018722	CG	3	6	47555	47560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018722	CG	3	6	47567	47572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018722	GT	3	6	55628	55633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018722	AC	3	6	55728	55733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018722	CA	3	6	55783	55788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018722	GT	3	6	55795	55800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018722	GA	3	6	58194	58199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018722	TG	3	6	62907	62912	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018722	CG	3	6	71069	71074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018722	TG	3	6	71100	71105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018722	AG	3	6	72832	72837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018722	CG	3	6	72917	72922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018722	TG	3	6	73950	73955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018722	GT	3	6	79043	79048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018722	GC	3	6	80802	80807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018722	AG	3	6	82376	82381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018722	TG	3	6	90815	90820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018722	GC	3	6	91999	92004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018722	CT	3	6	92485	92490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018722	GA	3	6	92522	92527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018722	CG	3	6	92564	92569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018722	GT	3	6	93080	93085	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018722	GC	3	6	93106	93111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_018722	CA	3	6	94420	94425	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018722	TG	3	6	97426	97431	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018722	CG	3	6	102788	102793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018722	GC	3	6	105856	105861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018722	CT	3	6	106678	106683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018722	GA	3	6	106689	106694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018722	TG	3	6	108194	108199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018722	TA	3	6	113764	113769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018722	GA	3	6	121989	121994	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018722	CA	3	6	122254	122259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018722	GC	3	6	124689	124694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_018722	TG	3	6	124755	124760	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018722	TG	4	8	124951	124958	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018722	GT	3	6	125177	125182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018722	TG	3	6	129820	129825	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018722	GT	3	6	129884	129889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018722	AG	3	6	132793	132798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018722	GT	3	6	139648	139653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018722	CG	3	6	140980	140985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018722	CT	3	6	141025	141030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018722	GC	3	6	142959	142964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018722	CG	3	6	147606	147611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018722	GC	3	6	149105	149110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018722	CG	3	6	149162	149167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018722	CG	3	6	154365	154370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018722	GC	3	6	157698	157703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018722	GC	3	6	157753	157758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018722	CG	4	8	157767	157774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018722	GT	3	6	157959	157964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018722	GA	4	8	163087	163094	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018722	TC	3	6	169280	169285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018722	GC	3	6	169561	169566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018722	TG	3	6	170110	170115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018722	GC	3	6	170173	170178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018722	GC	3	6	170430	170435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_018722	GA	3	6	176487	176492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018722	TG	3	6	176518	176523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018722	CT	3	6	177073	177078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018722	TG	3	6	177100	177105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018722	CG	3	6	184486	184491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018722	GC	3	6	186823	186828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018722	AC	3	6	196198	196203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_018722	CA	4	8	196406	196413	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018722	GC	3	6	196578	196583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018722	GT	3	6	205779	205784	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018722	GT	4	8	206146	206153	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018722	TG	3	6	216368	216373	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018722	TC	3	6	219105	219110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_018722	GC	3	6	219892	219897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018722	TG	3	6	221891	221896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018722	GT	3	6	223281	223286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018722	TG	3	6	228668	228673	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018722	CT	3	6	228754	228759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_018722	GC	3	6	228764	228769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_018722	GC	3	6	228831	228836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018722	TG	3	6	230301	230306	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018722	TG	4	8	231177	231184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018722	GC	3	6	231200	231205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018722	AC	3	6	231613	231618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018722	CA	3	6	232109	232114	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018722	AC	3	6	232527	232532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018722	AC	3	6	232696	232701	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_018722	TC	3	6	232935	232940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018722	AG	3	6	233380	233385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018722	CG	3	6	233452	233457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018722	AG	3	6	233520	233525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018722	AG	3	6	234456	234461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018722	GA	3	6	234869	234874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018722	AC	3	6	234901	234906	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018722	AC	3	6	237820	237825	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018722	GA	3	6	241511	241516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018722	GT	3	6	242201	242206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018722	GT	3	6	242269	242274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018722	TG	3	6	243030	243035	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018722	TG	3	6	246567	246572	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018722	TG	3	6	246717	246722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018722	TG	3	6	254640	254645	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018722	GT	3	6	262143	262148	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018722	CT	3	6	262153	262158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_018722	TG	3	6	262258	262263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018722	TA	3	6	262413	262418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018722	GT	3	6	262527	262532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018722	CG	3	6	262548	262553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_018722	GT	3	6	264123	264128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018722	GT	3	6	266714	266719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018722	GT	3	6	268301	268306	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018722	GT	3	6	271273	271278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018722	GC	3	6	271943	271948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_018722	CA	3	6	271996	272001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_018722	GC	3	6	273455	273460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_018722	GC	3	6	276037	276042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_018722	CG	3	6	276153	276158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018722	GC	3	6	278043	278048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_018722	TG	4	8	279622	279629	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018722	GC	3	6	279645	279650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_018722	AC	3	6	280058	280063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018722	CA	3	6	280554	280559	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018722	AC	3	6	280972	280977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_018722	AC	3	6	281141	281146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_018722	TC	3	6	281380	281385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_018722	AG	3	6	281815	281820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018722	CG	3	6	281887	281892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_018722	AG	3	6	281955	281960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018722	AG	3	6	282891	282896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018722	GA	3	6	283304	283309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_018722	GA	3	6	291397	291402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.