MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 4076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018722	TC	3	6	795	800	0 %	50 %	0 %	50 %	408501913
2	NC_018722	CT	3	6	1062	1067	0 %	50 %	0 %	50 %	408501913
3	NC_018722	CT	3	6	1084	1089	0 %	50 %	0 %	50 %	408501913
4	NC_018722	TC	3	6	1221	1226	0 %	50 %	0 %	50 %	408501913
5	NC_018722	TC	3	6	2017	2022	0 %	50 %	0 %	50 %	408501914
6	NC_018722	TA	3	6	2175	2180	50 %	50 %	0 %	0 %	408501914
7	NC_018722	AT	3	6	2819	2824	50 %	50 %	0 %	0 %	408501915
8	NC_018722	CG	3	6	2952	2957	0 %	0 %	50 %	50 %	408501915
9	NC_018722	CA	3	6	3004	3009	50 %	0 %	0 %	50 %	408501915
10	NC_018722	AG	3	6	3247	3252	50 %	0 %	50 %	0 %	408501915
11	NC_018722	AT	3	6	3877	3882	50 %	50 %	0 %	0 %	408501916
12	NC_018722	GT	3	6	3929	3934	0 %	50 %	50 %	0 %	408501916
13	NC_018722	GA	3	6	6214	6219	50 %	0 %	50 %	0 %	408501917
14	NC_018722	CG	3	6	6306	6311	0 %	0 %	50 %	50 %	408501917
15	NC_018722	AC	3	6	6624	6629	50 %	0 %	0 %	50 %	408501917
16	NC_018722	GT	3	6	6728	6733	0 %	50 %	50 %	0 %	408501917
17	NC_018722	GT	3	6	6771	6776	0 %	50 %	50 %	0 %	408501917
18	NC_018722	GC	3	6	7548	7553	0 %	0 %	50 %	50 %	408501918
19	NC_018722	GA	3	6	7912	7917	50 %	0 %	50 %	0 %	408501918
20	NC_018722	GC	3	6	8016	8021	0 %	0 %	50 %	50 %	408501918
21	NC_018722	TC	3	6	10700	10705	0 %	50 %	0 %	50 %	408501919
22	NC_018722	GC	3	6	11289	11294	0 %	0 %	50 %	50 %	408501919
23	NC_018722	GT	3	6	11330	11335	0 %	50 %	50 %	0 %	408501919
24	NC_018722	GT	3	6	11520	11525	0 %	50 %	50 %	0 %	408501919
25	NC_018722	TA	3	6	11907	11912	50 %	50 %	0 %	0 %	408501919
26	NC_018722	CA	3	6	12027	12032	50 %	0 %	0 %	50 %	408501919
27	NC_018722	GT	3	6	12353	12358	0 %	50 %	50 %	0 %	408501919
28	NC_018722	GC	3	6	12612	12617	0 %	0 %	50 %	50 %	408501920
29	NC_018722	GC	3	6	13059	13064	0 %	0 %	50 %	50 %	408501920
30	NC_018722	GT	3	6	13142	13147	0 %	50 %	50 %	0 %	408501920
31	NC_018722	CA	4	8	13234	13241	50 %	0 %	0 %	50 %	408501920
32	NC_018722	GA	3	6	13318	13323	50 %	0 %	50 %	0 %	408501920
33	NC_018722	GC	3	6	13529	13534	0 %	0 %	50 %	50 %	408501920
34	NC_018722	CT	4	8	13578	13585	0 %	50 %	0 %	50 %	408501920
35	NC_018722	GC	3	6	14265	14270	0 %	0 %	50 %	50 %	408501921
36	NC_018722	CG	3	6	14299	14304	0 %	0 %	50 %	50 %	408501921
37	NC_018722	AT	3	6	14542	14547	50 %	50 %	0 %	0 %	408501921
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39	NC_018722	CG	3	6	16387	16392	0 %	0 %	50 %	50 %	408501922
40	NC_018722	CG	3	6	16494	16499	0 %	0 %	50 %	50 %	408501922
41	NC_018722	GT	4	8	16825	16832	0 %	50 %	50 %	0 %	408501922
42	NC_018722	CA	3	6	16834	16839	50 %	0 %	0 %	50 %	408501922
43	NC_018722	GT	3	6	17215	17220	0 %	50 %	50 %	0 %	408501922
44	NC_018722	CG	3	6	17334	17339	0 %	0 %	50 %	50 %	408501922
45	NC_018722	AG	3	6	17367	17372	50 %	0 %	50 %	0 %	408501922
46	NC_018722	GT	3	6	17512	17517	0 %	50 %	50 %	0 %	408501922
47	NC_018722	CG	4	8	17521	17528	0 %	0 %	50 %	50 %	408501922
48	NC_018722	GT	3	6	18261	18266	0 %	50 %	50 %	0 %	408501922
49	NC_018722	AT	3	6	18648	18653	50 %	50 %	0 %	0 %	408501923
50	NC_018722	GT	3	6	18704	18709	0 %	50 %	50 %	0 %	408501923
51	NC_018722	GC	3	6	18754	18759	0 %	0 %	50 %	50 %	408501923
52	NC_018722	CG	3	6	19427	19432	0 %	0 %	50 %	50 %	408501924
53	NC_018722	CG	3	6	19909	19914	0 %	0 %	50 %	50 %	408501924
54	NC_018722	GT	3	6	20342	20347	0 %	50 %	50 %	0 %	408501924
55	NC_018722	CG	3	6	20761	20766	0 %	0 %	50 %	50 %	408501924
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59	NC_018722	CA	3	6	21857	21862	50 %	0 %	0 %	50 %	408501924
60	NC_018722	CG	3	6	22422	22427	0 %	0 %	50 %	50 %	408501925
61	NC_018722	AC	3	6	22429	22434	50 %	0 %	0 %	50 %	408501925
62	NC_018722	GT	3	6	22592	22597	0 %	50 %	50 %	0 %	408501925
63	NC_018722	CG	3	6	23212	23217	0 %	0 %	50 %	50 %	408501925
64	NC_018722	GA	3	6	23680	23685	50 %	0 %	50 %	0 %	408501925
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67	NC_018722	GT	3	6	26253	26258	0 %	50 %	50 %	0 %	408501927
68	NC_018722	GC	3	6	26470	26475	0 %	0 %	50 %	50 %	408501927
69	NC_018722	CG	3	6	26739	26744	0 %	0 %	50 %	50 %	408501927
70	NC_018722	GA	3	6	27241	27246	50 %	0 %	50 %	0 %	408501927
71	NC_018722	GT	4	8	27412	27419	0 %	50 %	50 %	0 %	408501927
72	NC_018722	GC	4	8	27454	27461	0 %	0 %	50 %	50 %	408501927
73	NC_018722	GT	4	8	27806	27813	0 %	50 %	50 %	0 %	408501928
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82	NC_018722	TG	3	6	30633	30638	0 %	50 %	50 %	0 %	408501930
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91	NC_018722	AG	3	6	33106	33111	50 %	0 %	50 %	0 %	408501931
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93	NC_018722	AC	3	6	33732	33737	50 %	0 %	0 %	50 %	408501931
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104	NC_018722	CA	4	8	36068	36075	50 %	0 %	0 %	50 %	408501933
105	NC_018722	AC	3	6	36096	36101	50 %	0 %	0 %	50 %	408501933
106	NC_018722	TG	3	6	36112	36117	0 %	50 %	50 %	0 %	408501933
107	NC_018722	CG	3	6	36639	36644	0 %	0 %	50 %	50 %	408501933
108	NC_018722	GT	3	6	36970	36975	0 %	50 %	50 %	0 %	408501934
109	NC_018722	CA	3	6	37020	37025	50 %	0 %	0 %	50 %	408501934
110	NC_018722	GC	3	6	37525	37530	0 %	0 %	50 %	50 %	408501934
111	NC_018722	TG	3	6	37979	37984	0 %	50 %	50 %	0 %	408501934
112	NC_018722	GC	3	6	38089	38094	0 %	0 %	50 %	50 %	408501934
113	NC_018722	CT	3	6	39425	39430	0 %	50 %	0 %	50 %	408501935
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115	NC_018722	GT	3	6	40604	40609	0 %	50 %	50 %	0 %	408501937
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118	NC_018722	CA	3	6	41620	41625	50 %	0 %	0 %	50 %	408501938
119	NC_018722	CA	3	6	41652	41657	50 %	0 %	0 %	50 %	408501938
120	NC_018722	GT	3	6	42372	42377	0 %	50 %	50 %	0 %	408501939
121	NC_018722	CG	3	6	43010	43015	0 %	0 %	50 %	50 %	408501940
122	NC_018722	CT	3	6	43335	43340	0 %	50 %	0 %	50 %	408501940
123	NC_018722	GC	3	6	43888	43893	0 %	0 %	50 %	50 %	408501941
124	NC_018722	CG	3	6	44134	44139	0 %	0 %	50 %	50 %	408501941
125	NC_018722	CA	3	6	44434	44439	50 %	0 %	0 %	50 %	408501941
126	NC_018722	GA	3	6	45144	45149	50 %	0 %	50 %	0 %	408501942
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129	NC_018722	CG	3	6	45782	45787	0 %	0 %	50 %	50 %	408501943
130	NC_018722	CT	3	6	49558	49563	0 %	50 %	0 %	50 %	408501946
131	NC_018722	GA	3	6	49854	49859	50 %	0 %	50 %	0 %	408501946
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134	NC_018722	TG	3	6	50547	50552	0 %	50 %	50 %	0 %	408501947
135	NC_018722	CG	4	8	50553	50560	0 %	0 %	50 %	50 %	408501947
136	NC_018722	GA	3	6	50592	50597	50 %	0 %	50 %	0 %	408501947
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138	NC_018722	GA	3	6	51103	51108	50 %	0 %	50 %	0 %	408501947
139	NC_018722	TC	3	6	51165	51170	0 %	50 %	0 %	50 %	408501947
140	NC_018722	CG	4	8	51627	51634	0 %	0 %	50 %	50 %	408501947
141	NC_018722	GC	3	6	51679	51684	0 %	0 %	50 %	50 %	408501947
142	NC_018722	CA	3	6	51947	51952	50 %	0 %	0 %	50 %	408501947
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