MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 201

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018722	T	7	7	1483	1489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018722	A	6	6	1494	1499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018722	G	6	6	8819	8824	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018722	T	6	6	9669	9674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018722	A	7	7	10331	10337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018722	A	6	6	10352	10357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018722	T	6	6	12435	12440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018722	G	9	9	12477	12485	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018722	T	7	7	13931	13937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018722	G	6	6	24745	24750	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018722	A	6	6	24825	24830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018722	G	6	6	24872	24877	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018722	A	6	6	25010	25015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018722	G	6	6	29057	29062	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018722	C	12	12	34076	34087	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_018722	T	9	9	38247	38255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018722	T	6	6	42896	42901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018722	A	6	6	55537	55542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018722	A	6	6	57927	57932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018722	T	6	6	59481	59486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018722	T	10	10	64082	64091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018722	G	7	7	71777	71783	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018722	T	6	6	72340	72345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018722	G	10	10	72681	72690	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018722	T	6	6	73400	73405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018722	C	6	6	73844	73849	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_018722	T	6	6	78579	78584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018722	T	6	6	78600	78605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018722	T	6	6	90652	90657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018722	T	6	6	91104	91109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018722	G	6	6	91160	91165	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018722	A	6	6	93058	93063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018722	C	9	9	94724	94732	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_018722	A	6	6	111766	111771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018722	T	6	6	113749	113754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018722	G	6	6	121982	121987	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018722	A	6	6	122152	122157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018722	A	6	6	122212	122217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018722	C	9	9	122232	122240	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_018722	T	6	6	132835	132840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018722	C	9	9	136739	136747	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_018722	C	9	9	140952	140960	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43	NC_018722	A	6	6	142976	142981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018722	C	9	9	154191	154199	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45	NC_018722	A	6	6	169728	169733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018722	T	8	8	170151	170158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018722	T	6	6	170297	170302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018722	T	7	7	182520	182526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018722	T	6	6	191221	191226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018722	G	6	6	192132	192137	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018722	T	6	6	195573	195578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018722	A	6	6	196457	196462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018722	G	11	11	199718	199728	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018722	G	8	8	208628	208635	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018722	A	6	6	219147	219152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018722	T	6	6	230250	230255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018722	A	6	6	233957	233962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018722	T	6	6	244345	244350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018722	T	8	8	246539	246546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018722	G	6	6	246783	246788	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018722	T	7	7	254670	254676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018722	T	8	8	259078	259085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018722	G	7	7	275807	275813	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018722	G	6	6	275818	275823	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018722	T	6	6	275868	275873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018722	T	7	7	276898	276904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018722	C	6	6	278080	278085	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
68	NC_018722	A	6	6	282392	282397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018722	A	7	7	287265	287271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018722	T	6	6	299144	299149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018722	T	6	6	304974	304979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018722	T	6	6	305861	305866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018722	G	6	6	312321	312326	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018722	T	6	6	323919	323924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018722	T	6	6	326761	326766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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77	NC_018722	G	7	7	326799	326805	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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112	NC_018722	T	6	6	570044	570049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018722	A	6	6	577123	577128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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119	NC_018722	A	6	6	644552	644557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_018722	T	8	8	882524	882531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018722	A	6	6	883335	883340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.