MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium asteroides PRL2011 chromosome

Total Repeats: 1323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018720	GACAC	2	10	1742	1751	40 %	0 %	20 %	40 %	408500254
2	NC_018720	AACGC	2	10	2984	2993	40 %	0 %	20 %	40 %	408500255
3	NC_018720	ATCCG	2	10	4451	4460	20 %	20 %	20 %	40 %	408500256
4	NC_018720	CCGGC	2	10	9695	9704	0 %	0 %	40 %	60 %	408500259
5	NC_018720	CCGGT	2	10	10465	10474	0 %	20 %	40 %	40 %	408500260
6	NC_018720	CGTCC	2	10	10486	10495	0 %	20 %	20 %	60 %	408500260
7	NC_018720	CCCTG	2	10	13490	13499	0 %	20 %	20 %	60 %	408500263
8	NC_018720	GGTCG	2	10	14457	14466	0 %	20 %	60 %	20 %	408500264
9	NC_018720	CAGGG	2	10	15633	15642	20 %	0 %	60 %	20 %	408500265
10	NC_018720	TCCAG	2	10	15778	15787	20 %	20 %	20 %	40 %	408500265
11	NC_018720	AGGCC	2	10	16777	16786	20 %	0 %	40 %	40 %	408500266
12	NC_018720	TCCGG	2	10	17118	17127	0 %	20 %	40 %	40 %	408500267
13	NC_018720	CAGGG	2	10	17514	17523	20 %	0 %	60 %	20 %	408500267
14	NC_018720	TTCTG	2	10	20664	20673	0 %	60 %	20 %	20 %	408500268
15	NC_018720	TCGAT	2	10	23491	23500	20 %	40 %	20 %	20 %	408500269
16	NC_018720	GGCCA	2	10	30687	30696	20 %	0 %	40 %	40 %	408500270
17	NC_018720	TGGGC	2	10	31694	31703	0 %	20 %	60 %	20 %	408500270
18	NC_018720	GGCGT	2	10	34744	34753	0 %	20 %	60 %	20 %	408500275
19	NC_018720	CGTTA	2	10	35152	35161	20 %	40 %	20 %	20 %	408500275
20	NC_018720	CCAGA	2	10	36056	36065	40 %	0 %	20 %	40 %	408500277
21	NC_018720	GCCAC	2	10	38698	38707	20 %	0 %	20 %	60 %	408500280
22	NC_018720	GTGGC	2	10	39629	39638	0 %	20 %	60 %	20 %	408500280
23	NC_018720	GCCCT	2	10	43437	43446	0 %	20 %	20 %	60 %	408500281
24	NC_018720	CCGGT	2	10	45176	45185	0 %	20 %	40 %	40 %	408500282
25	NC_018720	AGGTC	2	10	47435	47444	20 %	20 %	40 %	20 %	408500284
26	NC_018720	TGGTT	2	10	49029	49038	0 %	60 %	40 %	0 %	408500286
27	NC_018720	GATGG	2	10	49082	49091	20 %	20 %	60 %	0 %	408500286
28	NC_018720	AATCC	2	10	53419	53428	40 %	20 %	0 %	40 %	408500288
29	NC_018720	GCTGG	2	10	54996	55005	0 %	20 %	60 %	20 %	408500289
30	NC_018720	TTTGG	2	10	59385	59394	0 %	60 %	40 %	0 %	408500291
31	NC_018720	ACAGT	2	10	60613	60622	40 %	20 %	20 %	20 %	408500292
32	NC_018720	GGGAT	2	10	61461	61470	20 %	20 %	60 %	0 %	408500292
33	NC_018720	AGGAA	2	10	62133	62142	60 %	0 %	40 %	0 %	408500292
34	NC_018720	GCTGA	2	10	64276	64285	20 %	20 %	40 %	20 %	408500295
35	NC_018720	TGGCT	2	10	67419	67428	0 %	40 %	40 %	20 %	408500298
36	NC_018720	TGGCC	2	10	68164	68173	0 %	20 %	40 %	40 %	408500299
37	NC_018720	CAGCC	2	10	69955	69964	20 %	0 %	20 %	60 %	408500300
38	NC_018720	CCGCC	2	10	70374	70383	0 %	0 %	20 %	80 %	408500300
39	NC_018720	CGGTA	2	10	71258	71267	20 %	20 %	40 %	20 %	408500301
40	NC_018720	ATGCC	2	10	72937	72946	20 %	20 %	20 %	40 %	408500302
41	NC_018720	CTGCC	2	10	73596	73605	0 %	20 %	20 %	60 %	408500303
42	NC_018720	TCGGT	2	10	76098	76107	0 %	40 %	40 %	20 %	408500305
43	NC_018720	GCGAA	2	10	76295	76304	40 %	0 %	40 %	20 %	408500305
44	NC_018720	CCCTT	2	10	79067	79076	0 %	40 %	0 %	60 %	408500307
45	NC_018720	GTGTT	2	10	79100	79109	0 %	60 %	40 %	0 %	408500307
46	NC_018720	CATGG	2	10	81108	81117	20 %	20 %	40 %	20 %	408500309
47	NC_018720	GCCAG	2	10	82006	82015	20 %	0 %	40 %	40 %	408500309
48	NC_018720	GCGCT	2	10	82650	82659	0 %	20 %	40 %	40 %	408500310
49	NC_018720	CGGTC	2	10	82973	82982	0 %	20 %	40 %	40 %	408500310
50	NC_018720	AACCG	2	10	83670	83679	40 %	0 %	20 %	40 %	408500310
51	NC_018720	CGGGG	2	10	86203	86212	0 %	0 %	80 %	20 %	408500311
52	NC_018720	GGCCG	2	10	86502	86511	0 %	0 %	60 %	40 %	408500311
53	NC_018720	GGCGG	2	10	87758	87767	0 %	0 %	80 %	20 %	408500311
54	NC_018720	GCTGC	2	10	87803	87812	0 %	20 %	40 %	40 %	408500311
55	NC_018720	TGGCC	2	10	88448	88457	0 %	20 %	40 %	40 %	408500312
56	NC_018720	CAGAT	2	10	89740	89749	40 %	20 %	20 %	20 %	408500312
57	NC_018720	GCGCC	2	10	90468	90477	0 %	0 %	40 %	60 %	408500312
58	NC_018720	GGTGG	2	10	90480	90489	0 %	20 %	80 %	0 %	408500312
59	NC_018720	GCCTG	2	10	93696	93705	0 %	20 %	40 %	40 %	408500314
60	NC_018720	AGACC	2	10	104617	104626	40 %	0 %	20 %	40 %	408500325
61	NC_018720	TCAGT	2	10	107841	107850	20 %	40 %	20 %	20 %	408500327
62	NC_018720	GGACT	2	10	112093	112102	20 %	20 %	40 %	20 %	408500331
63	NC_018720	GTCTG	2	10	115037	115046	0 %	40 %	40 %	20 %	408500333
64	NC_018720	GCATC	2	10	116461	116470	20 %	20 %	20 %	40 %	408500333
65	NC_018720	CTGGA	2	10	116951	116960	20 %	20 %	40 %	20 %	408500334
66	NC_018720	ACCAG	2	10	119829	119838	40 %	0 %	20 %	40 %	408500335
67	NC_018720	CGACC	2	10	119894	119903	20 %	0 %	20 %	60 %	408500335
68	NC_018720	GCCTT	2	10	120451	120460	0 %	40 %	20 %	40 %	408500336
69	NC_018720	GTCCT	2	10	121793	121802	0 %	40 %	20 %	40 %	408500336
70	NC_018720	CGGTG	2	10	122314	122323	0 %	20 %	60 %	20 %	408500336
71	NC_018720	GCCAT	2	10	127387	127396	20 %	20 %	20 %	40 %	408500341
72	NC_018720	GACGA	2	10	129588	129597	40 %	0 %	40 %	20 %	408500342
73	NC_018720	GGTTC	2	10	133701	133710	0 %	40 %	40 %	20 %	408500346
74	NC_018720	CCATC	2	10	133844	133853	20 %	20 %	0 %	60 %	408500346
75	NC_018720	CCGGG	2	10	133973	133982	0 %	0 %	60 %	40 %	408500346
76	NC_018720	AGGTA	2	10	134320	134329	40 %	20 %	40 %	0 %	408500347
77	NC_018720	CCACA	2	10	134871	134880	40 %	0 %	0 %	60 %	408500347
78	NC_018720	AGCCA	2	10	137591	137600	40 %	0 %	20 %	40 %	408500350
79	NC_018720	GGCAA	2	10	138985	138994	40 %	0 %	40 %	20 %	408500350
80	NC_018720	GGCTG	2	10	140475	140484	0 %	20 %	60 %	20 %	408500351
81	NC_018720	GTACC	2	10	143540	143549	20 %	20 %	20 %	40 %	408500353
82	NC_018720	GGTCG	2	10	143669	143678	0 %	20 %	60 %	20 %	408500353
83	NC_018720	GGAGG	2	10	149655	149664	20 %	0 %	80 %	0 %	408500358
84	NC_018720	GTCTG	2	10	150031	150040	0 %	40 %	40 %	20 %	408500358
85	NC_018720	TTTCC	2	10	153164	153173	0 %	60 %	0 %	40 %	408500362
86	NC_018720	TCAGG	2	10	153497	153506	20 %	20 %	40 %	20 %	408500362
87	NC_018720	CTGGG	2	10	156371	156380	0 %	20 %	60 %	20 %	408500364
88	NC_018720	TTCGG	2	10	160478	160487	0 %	40 %	40 %	20 %	408500368
89	NC_018720	GACGA	2	10	162081	162090	40 %	0 %	40 %	20 %	408500369
90	NC_018720	GGAAG	2	10	162211	162220	40 %	0 %	60 %	0 %	408500369
91	NC_018720	CCCAG	2	10	162256	162265	20 %	0 %	20 %	60 %	408500369
92	NC_018720	CACCG	2	10	164189	164198	20 %	0 %	20 %	60 %	408500370
93	NC_018720	CCGGG	2	10	164596	164605	0 %	0 %	60 %	40 %	408500370
94	NC_018720	GCCCT	2	10	166479	166488	0 %	20 %	20 %	60 %	408500371
95	NC_018720	TGCCC	2	10	170487	170496	0 %	20 %	20 %	60 %	408500374
96	NC_018720	GGCCA	2	10	173047	173056	20 %	0 %	40 %	40 %	408500375
97	NC_018720	ATCAC	2	10	175007	175016	40 %	20 %	0 %	40 %	408500376
98	NC_018720	CGGAA	2	10	176055	176064	40 %	0 %	40 %	20 %	408500377
99	NC_018720	AGCCG	2	10	178822	178831	20 %	0 %	40 %	40 %	408500379
100	NC_018720	CGCGC	2	10	179627	179636	0 %	0 %	40 %	60 %	408500381
101	NC_018720	GCAAC	2	10	180022	180031	40 %	0 %	20 %	40 %	408500381
102	NC_018720	CCGAC	2	10	180039	180048	20 %	0 %	20 %	60 %	408500381
103	NC_018720	TCAAT	2	10	184463	184472	40 %	40 %	0 %	20 %	408500385
104	NC_018720	GATTG	2	10	185209	185218	20 %	40 %	40 %	0 %	408500385
105	NC_018720	GCATG	2	10	187748	187757	20 %	20 %	40 %	20 %	408500388
106	NC_018720	CTTCC	2	10	198276	198285	0 %	40 %	0 %	60 %	408500391
107	NC_018720	GGGAT	2	10	199090	199099	20 %	20 %	60 %	0 %	408500391
108	NC_018720	CCGGC	2	10	199204	199213	0 %	0 %	40 %	60 %	408500391
109	NC_018720	TCCGA	2	10	199739	199748	20 %	20 %	20 %	40 %	408500391
110	NC_018720	CATTG	2	10	205989	205998	20 %	40 %	20 %	20 %	408500396
111	NC_018720	CTTCT	2	10	206805	206814	0 %	60 %	0 %	40 %	408500397
112	NC_018720	TCATC	2	10	210978	210987	20 %	40 %	0 %	40 %	408500399
113	NC_018720	AGTCG	2	10	211069	211078	20 %	20 %	40 %	20 %	408500399
114	NC_018720	GGACC	2	10	215669	215678	20 %	0 %	40 %	40 %	408500403
115	NC_018720	CCTGC	2	10	215833	215842	0 %	20 %	20 %	60 %	408500403
116	NC_018720	GAGCT	2	10	216228	216237	20 %	20 %	40 %	20 %	408500403
117	NC_018720	ATCGG	2	10	218048	218057	20 %	20 %	40 %	20 %	408500404
118	NC_018720	CCAGC	2	10	218925	218934	20 %	0 %	20 %	60 %	408500405
119	NC_018720	CGAAA	2	10	224571	224580	60 %	0 %	20 %	20 %	408500409
120	NC_018720	AACAT	2	10	226935	226944	60 %	20 %	0 %	20 %	408500411
121	NC_018720	GTTGC	2	10	232173	232182	0 %	40 %	40 %	20 %	408500415
122	NC_018720	CGCAC	2	10	232879	232888	20 %	0 %	20 %	60 %	408500416
123	NC_018720	GGTGA	2	10	236457	236466	20 %	20 %	60 %	0 %	408500418
124	NC_018720	TGAGC	2	10	240760	240769	20 %	20 %	40 %	20 %	408500421
125	NC_018720	ACCTG	2	10	240783	240792	20 %	20 %	20 %	40 %	408500421
126	NC_018720	AGGGC	2	10	249281	249290	20 %	0 %	60 %	20 %	408500427
127	NC_018720	ACCCC	2	10	250907	250916	20 %	0 %	0 %	80 %	408500429
128	NC_018720	GGGGA	2	10	251134	251143	20 %	0 %	80 %	0 %	408500429
129	NC_018720	CCCGA	2	10	254769	254778	20 %	0 %	20 %	60 %	408500433
130	NC_018720	GGGGT	2	10	254999	255008	0 %	20 %	80 %	0 %	408500433
131	NC_018720	ACCGG	2	10	255753	255762	20 %	0 %	40 %	40 %	408500434
132	NC_018720	CCTGC	3	15	255998	256012	0 %	20 %	20 %	60 %	408500434
133	NC_018720	GACCA	2	10	257642	257651	40 %	0 %	20 %	40 %	408500435
134	NC_018720	GACCG	2	10	260343	260352	20 %	0 %	40 %	40 %	408500436
135	NC_018720	GGCCA	2	10	261878	261887	20 %	0 %	40 %	40 %	408500439
136	NC_018720	TGGCT	2	10	263303	263312	0 %	40 %	40 %	20 %	408500440
137	NC_018720	CCGGA	2	10	263834	263843	20 %	0 %	40 %	40 %	408500440
138	NC_018720	CAGCA	2	10	268073	268082	40 %	0 %	20 %	40 %	408500442
139	NC_018720	CAGGA	2	10	271775	271784	40 %	0 %	40 %	20 %	408500443
140	NC_018720	CGACC	2	10	273190	273199	20 %	0 %	20 %	60 %	408500445
141	NC_018720	TCCGG	2	10	273268	273277	0 %	20 %	40 %	40 %	408500445
142	NC_018720	GCGGG	2	10	273877	273886	0 %	0 %	80 %	20 %	408500445
143	NC_018720	CAAGA	2	10	274097	274106	60 %	0 %	20 %	20 %	408500445
144	NC_018720	GAACC	2	10	274303	274312	40 %	0 %	20 %	40 %	408500445
145	NC_018720	GCGCT	2	10	276343	276352	0 %	20 %	40 %	40 %	408500447
146	NC_018720	CTGGA	2	10	276512	276521	20 %	20 %	40 %	20 %	408500447
147	NC_018720	ACTGG	2	10	278056	278065	20 %	20 %	40 %	20 %	408500447
148	NC_018720	GGCCC	2	10	279880	279889	0 %	0 %	40 %	60 %	408500449
149	NC_018720	CCGTC	2	10	283323	283332	0 %	20 %	20 %	60 %	408500450
150	NC_018720	CCATG	2	10	287837	287846	20 %	20 %	20 %	40 %	408500454
151	NC_018720	GGCCC	2	10	289268	289277	0 %	0 %	40 %	60 %	408500455
152	NC_018720	GTGAT	2	10	293311	293320	20 %	40 %	40 %	0 %	408500458
153	NC_018720	GGCAC	2	10	293390	293399	20 %	0 %	40 %	40 %	408500458
154	NC_018720	CGGCT	2	10	295440	295449	0 %	20 %	40 %	40 %	408500459
155	NC_018720	GTATG	2	10	296919	296928	20 %	40 %	40 %	0 %	408500460
156	NC_018720	CTGTG	2	10	298359	298368	0 %	40 %	40 %	20 %	408500462
157	NC_018720	GGGCG	2	10	298731	298740	0 %	0 %	80 %	20 %	408500462
158	NC_018720	GCCGG	2	10	299954	299963	0 %	0 %	60 %	40 %	408500463
159	NC_018720	CCCGG	2	10	300107	300116	0 %	0 %	40 %	60 %	408500463
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161	NC_018720	ACCCA	2	10	302116	302125	40 %	0 %	0 %	60 %	408500466
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164	NC_018720	ATCAG	2	10	306199	306208	40 %	20 %	20 %	20 %	408500470
165	NC_018720	CCGAT	2	10	308734	308743	20 %	20 %	20 %	40 %	408500472
166	NC_018720	CCAGC	2	10	310768	310777	20 %	0 %	20 %	60 %	408500474
167	NC_018720	CGGTC	2	10	314040	314049	0 %	20 %	40 %	40 %	408500476
168	NC_018720	CTGGT	2	10	315218	315227	0 %	40 %	40 %	20 %	408500476
169	NC_018720	CGGCG	2	10	316438	316447	0 %	0 %	60 %	40 %	408500476
170	NC_018720	AATGG	2	10	317126	317135	40 %	20 %	40 %	0 %	408500477
171	NC_018720	GAAGA	2	10	317330	317339	60 %	0 %	40 %	0 %	408500477
172	NC_018720	TTGTC	2	10	319696	319705	0 %	60 %	20 %	20 %	408500478
173	NC_018720	TCTGC	2	10	322008	322017	0 %	40 %	20 %	40 %	408500480
174	NC_018720	GACCC	2	10	323483	323492	20 %	0 %	20 %	60 %	408500481
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176	NC_018720	CTTCG	2	10	325623	325632	0 %	40 %	20 %	40 %	408500483
177	NC_018720	CGGGC	2	10	330768	330777	0 %	0 %	60 %	40 %	408500487
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181	NC_018720	CGCTG	2	10	333879	333888	0 %	20 %	40 %	40 %	408500487
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187	NC_018720	CCCAG	2	10	339290	339299	20 %	0 %	20 %	60 %	408500492
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194	NC_018720	TCTGG	2	10	355679	355688	0 %	40 %	40 %	20 %	408500503
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199	NC_018720	CCGGC	2	10	361424	361433	0 %	0 %	40 %	60 %	408500507
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202	NC_018720	CAATA	2	10	364467	364476	60 %	20 %	0 %	20 %	408500509
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211	NC_018720	CAAGC	2	10	379782	379791	40 %	0 %	20 %	40 %	408500525
212	NC_018720	TGGCC	2	10	380345	380354	0 %	20 %	40 %	40 %	408500525
213	NC_018720	TCTGC	2	10	381681	381690	0 %	40 %	20 %	40 %	408500526
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217	NC_018720	GTCCA	2	10	382629	382638	20 %	20 %	20 %	40 %	408500527
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220	NC_018720	GAGAG	2	10	391247	391256	40 %	0 %	60 %	0 %	408500533
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224	NC_018720	GGCTC	2	10	393556	393565	0 %	20 %	40 %	40 %	408500535
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230	NC_018720	CTGGT	2	10	404797	404806	0 %	40 %	40 %	20 %	408500543
231	NC_018720	GCCAG	2	10	405540	405549	20 %	0 %	40 %	40 %	408500544
232	NC_018720	TGAAC	2	10	407348	407357	40 %	20 %	20 %	20 %	408500544
233	NC_018720	TGGAC	2	10	408515	408524	20 %	20 %	40 %	20 %	408500545
234	NC_018720	CTGCC	2	10	410345	410354	0 %	20 %	20 %	60 %	408500546
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240	NC_018720	CTGCC	2	10	416908	416917	0 %	20 %	20 %	60 %	408500553
241	NC_018720	GCCTG	2	10	418006	418015	0 %	20 %	40 %	40 %	408500554
242	NC_018720	ACCCT	2	10	421369	421378	20 %	20 %	0 %	60 %	408500556
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246	NC_018720	GAAAC	2	10	425655	425664	60 %	0 %	20 %	20 %	408500561
247	NC_018720	CCTTG	2	10	429959	429968	0 %	40 %	20 %	40 %	408500564
248	NC_018720	GCCCA	2	10	432107	432116	20 %	0 %	20 %	60 %	408500566
249	NC_018720	CAGTC	2	10	435110	435119	20 %	20 %	20 %	40 %	408500569
250	NC_018720	ACGCA	2	10	437227	437236	40 %	0 %	20 %	40 %	408500572
251	NC_018720	CCGGT	2	10	437314	437323	0 %	20 %	40 %	40 %	408500572
252	NC_018720	GGTCC	2	10	438048	438057	0 %	20 %	40 %	40 %	408500573
253	NC_018720	GCCGC	2	10	438394	438403	0 %	0 %	40 %	60 %	408500573
254	NC_018720	TGGCC	2	10	441447	441456	0 %	20 %	40 %	40 %	408500575
255	NC_018720	TTCCA	2	10	443757	443766	20 %	40 %	0 %	40 %	408500577
256	NC_018720	GAGGG	2	10	448463	448472	20 %	0 %	80 %	0 %	408500581
257	NC_018720	GCCAG	2	10	448688	448697	20 %	0 %	40 %	40 %	408500581
258	NC_018720	TGCCG	2	10	451296	451305	0 %	20 %	40 %	40 %	408500584
259	NC_018720	GGGCT	2	10	451495	451504	0 %	20 %	60 %	20 %	408500584
260	NC_018720	CCGTG	2	10	451811	451820	0 %	20 %	40 %	40 %	408500584
261	NC_018720	CCGGG	2	10	452126	452135	0 %	0 %	60 %	40 %	408500584
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263	NC_018720	CAGCT	2	10	453037	453046	20 %	20 %	20 %	40 %	408500585
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