MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium asteroides PRL2011 chromosome

Total Repeats: 855

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018720	ATCC	2	8	1902	1909	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018720	TTCA	2	8	2133	2140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018720	ATGC	2	8	16389	16396	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018720	TCAT	2	8	19863	19870	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018720	GCCC	2	8	24539	24546	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_018720	GAGT	2	8	25125	25132	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018720	CCGG	2	8	26252	26259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018720	GCCG	2	8	26730	26737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018720	GCGA	2	8	26826	26833	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018720	GCCG	2	8	27887	27894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018720	GGCA	2	8	28249	28256	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018720	CCGG	2	8	28472	28479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018720	CCTG	2	8	29713	29720	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018720	GATG	2	8	29824	29831	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018720	CTGT	2	8	30047	30054	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018720	CAAC	2	8	33249	33256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018720	GGTC	2	8	37109	37116	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_018720	TGAG	2	8	37611	37618	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018720	GGCC	2	8	38540	38547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018720	GGGA	2	8	48680	48687	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018720	TTCT	2	8	52721	52728	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018720	AGTT	2	8	52759	52766	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018720	TATC	2	8	52822	52829	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018720	TAAT	2	8	52960	52967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018720	ACTT	2	8	53034	53041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018720	AAAT	2	8	53266	53273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018720	CAGT	2	8	57735	57742	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018720	TTCT	2	8	58107	58114	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018720	ATAA	2	8	58274	58281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018720	ATGA	2	8	64791	64798	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018720	AATA	2	8	64800	64807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018720	AAAG	2	8	64913	64920	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018720	CATT	2	8	65190	65197	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018720	TTGG	2	8	65276	65283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018720	TTTA	2	8	65383	65390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018720	TGCA	2	8	66453	66460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018720	TCTG	2	8	67772	67779	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018720	ACTG	2	8	67819	67826	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018720	AGGC	2	8	67984	67991	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018720	ATCA	2	8	80199	80206	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018720	GCTG	2	8	84393	84400	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018720	GCGG	2	8	84450	84457	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018720	TTCC	2	8	95410	95417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018720	CGAC	2	8	95702	95709	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018720	CCGG	2	8	95784	95791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018720	TGCC	2	8	96601	96608	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018720	TGAA	2	8	96863	96870	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018720	GCAG	2	8	109884	109891	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_018720	AAGG	2	8	113940	113947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018720	GACA	2	8	114028	114035	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018720	GGTC	2	8	123048	123055	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018720	GGTC	2	8	128162	128169	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018720	TTTC	2	8	128170	128177	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018720	CAAT	2	8	133333	133340	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018720	GGAG	2	8	135870	135877	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018720	ATGC	2	8	137416	137423	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018720	GCAG	2	8	137501	137508	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018720	CTGG	2	8	148200	148207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018720	AGCA	2	8	155778	155785	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018720	TGAT	2	8	157364	157371	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018720	GAGC	2	8	157383	157390	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018720	GTAG	2	8	158122	158129	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018720	ATCC	2	8	158337	158344	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018720	AACC	2	8	159037	159044	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018720	CGGG	2	8	162921	162928	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_018720	GTTC	2	8	162952	162959	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018720	AAGA	2	8	163337	163344	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018720	CTGG	2	8	166215	166222	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_018720	AAAG	2	8	170868	170875	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018720	ACCA	2	8	173423	173430	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018720	GGTC	2	8	173455	173462	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_018720	TTGT	2	8	173568	173575	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018720	TCTG	2	8	173602	173609	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018720	GCCG	2	8	178424	178431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018720	GCAA	2	8	180723	180730	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_018720	CGGG	2	8	187188	187195	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018720	GTCT	2	8	187326	187333	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018720	ACAT	2	8	188269	188276	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_018720	GCCC	2	8	188731	188738	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_018720	GAGT	2	8	189317	189324	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018720	CCGG	2	8	190444	190451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018720	GCCG	2	8	190922	190929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018720	GCGA	2	8	191018	191025	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_018720	GCCG	2	8	192079	192086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018720	GGCA	2	8	192441	192448	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018720	CCGG	2	8	192664	192671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_018720	CCTG	2	8	193905	193912	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018720	TTGG	2	8	203346	203353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018720	ATTT	2	8	203990	203997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018720	GCTG	2	8	204035	204042	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018720	AGGA	2	8	204135	204142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018720	TCAA	2	8	204259	204266	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_018720	TAAT	2	8	204765	204772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018720	AAAG	2	8	204884	204891	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018720	GTAG	2	8	204901	204908	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018720	TCAG	2	8	205120	205127	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_018720	GGCT	2	8	206916	206923	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_018720	GAAA	2	8	207039	207046	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018720	CTGT	2	8	208447	208454	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_018720	TGCC	2	8	208559	208566	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_018720	CGTT	2	8	208587	208594	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_018720	TCCT	2	8	215072	215079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_018720	ACGA	2	8	215402	215409	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018720	TGGG	2	8	218167	218174	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018720	CCCG	2	8	218183	218190	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
106	NC_018720	CGAC	2	8	219990	219997	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_018720	CCTG	2	8	220187	220194	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018720	CTGG	2	8	220200	220207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_018720	GGAA	2	8	224819	224826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018720	TAAA	2	8	226181	226188	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018720	TGGA	2	8	228787	228794	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018720	AGAA	2	8	233581	233588	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018720	CCTT	2	8	233998	234005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018720	CTAC	2	8	234363	234370	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_018720	CGGC	2	8	234515	234522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018720	CGAC	2	8	235446	235453	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_018720	GAAG	2	8	243039	243046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018720	TTCA	2	8	243154	243161	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_018720	ATTT	2	8	243496	243503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018720	CGAA	2	8	244054	244061	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_018720	CTGC	2	8	245546	245553	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_018720	TCCT	2	8	245738	245745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018720	GCAG	2	8	245762	245769	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_018720	TCGG	2	8	245810	245817	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_018720	TCTG	2	8	245853	245860	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_018720	GCTG	2	8	246022	246029	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_018720	CATT	2	8	246088	246095	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018720	GATC	2	8	246551	246558	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_018720	AGCC	2	8	246620	246627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_018720	TATC	2	8	247772	247779	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_018720	GGTC	2	8	248656	248663	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018720	TGCC	2	8	252152	252159	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_018720	CCCA	2	8	252183	252190	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
134	NC_018720	GAAA	2	8	252518	252525	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018720	CCAT	2	8	252813	252820	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_018720	TGAT	2	8	252920	252927	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018720	AAGG	2	8	253150	253157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018720	GACG	2	8	253214	253221	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_018720	AACT	2	8	253282	253289	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_018720	GCAT	2	8	258112	258119	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_018720	CATC	2	8	258475	258482	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_018720	GTCA	2	8	267966	267973	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_018720	CTAG	2	8	271854	271861	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_018720	GGAA	2	8	276204	276211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018720	GGCG	2	8	279711	279718	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
146	NC_018720	GTTC	2	8	287196	287203	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_018720	GGGA	2	8	288190	288197	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018720	GCAG	2	8	288224	288231	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_018720	GACA	2	8	288346	288353	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_018720	CGGA	2	8	289606	289613	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_018720	CCAC	2	8	289699	289706	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
152	NC_018720	CGGG	2	8	289708	289715	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
153	NC_018720	GACG	2	8	290720	290727	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
154	NC_018720	CAAC	2	8	295963	295970	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_018720	CGGA	2	8	296036	296043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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169	NC_018720	AGCC	2	8	342201	342208	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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480	NC_018720	GGCT	2	8	1283191	1283198	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
481	NC_018720	GCAG	2	8	1283239	1283246	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
482	NC_018720	AAAC	2	8	1287161	1287168	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
483	NC_018720	AGGC	2	8	1287357	1287364	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
484	NC_018720	AGGG	2	8	1295160	1295167	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
485	NC_018720	GCAG	2	8	1295236	1295243	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
486	NC_018720	GGCA	2	8	1295252	1295259	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
487	NC_018720	AGCC	2	8	1295329	1295336	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
488	NC_018720	GGCC	2	8	1295580	1295587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
489	NC_018720	GGCA	2	8	1295605	1295612	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
490	NC_018720	CAGA	2	8	1295972	1295979	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
491	NC_018720	GGCA	2	8	1299379	1299386	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
492	NC_018720	CACC	2	8	1302062	1302069	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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500	NC_018720	CTTG	2	8	1328142	1328149	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

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