MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium asteroides PRL2011 chromosome

Total Repeats: 29885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018720	CAG	2	6	75	80	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500254
2	NC_018720	GGA	2	6	111	116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408500254
3	NC_018720	CAC	2	6	141	146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408500254
4	NC_018720	AGG	2	6	179	184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408500254
5	NC_018720	CTC	2	6	211	216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408500254
6	NC_018720	CAG	2	6	307	312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500254
7	NC_018720	GCG	2	6	356	361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408500254
8	NC_018720	CTG	2	6	473	478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408500254
9	NC_018720	TGT	2	6	495	500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408500254
10	NC_018720	CAA	2	6	613	618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408500254
11	NC_018720	GGA	2	6	927	932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408500254
12	NC_018720	CCG	2	6	1002	1007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408500254
13	NC_018720	CTT	2	6	1027	1032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408500254
14	NC_018720	TTC	2	6	1081	1086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408500254
15	NC_018720	ACC	2	6	1218	1223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408500254
16	NC_018720	GAT	2	6	1254	1259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408500254
17	NC_018720	AAT	2	6	1381	1386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408500254
18	NC_018720	CTT	2	6	1428	1433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408500254
19	NC_018720	CAT	2	6	1464	1469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408500254
20	NC_018720	CAC	2	6	1632	1637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408500254
21	NC_018720	AGC	2	6	1727	1732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500254
22	NC_018720	ACC	2	6	2206	2211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408500255
23	NC_018720	CAT	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408500255
24	NC_018720	CGA	2	6	2340	2345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500255
25	NC_018720	TCG	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408500255
26	NC_018720	GGT	2	6	2646	2651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408500255
27	NC_018720	CTC	2	6	2702	2707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408500255
28	NC_018720	CTG	2	6	2749	2754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408500255
29	NC_018720	CAT	2	6	2823	2828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408500255
30	NC_018720	CCA	2	6	2855	2860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408500255
31	NC_018720	TGG	2	6	2975	2980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408500255
32	NC_018720	CAG	2	6	3211	3216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500255
33	NC_018720	GAG	2	6	3229	3234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408500255
34	NC_018720	CTG	2	6	3253	3258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408500255
35	NC_018720	CAA	2	6	3273	3278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408500255
36	NC_018720	TCG	2	6	3307	3312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408500256
37	NC_018720	GGC	2	6	3456	3461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408500256
38	NC_018720	TCC	2	6	3477	3482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408500256
39	NC_018720	CCA	2	6	3514	3519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408500256
40	NC_018720	GCC	2	6	3573	3578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408500256
41	NC_018720	GAA	2	6	3595	3600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408500256
42	NC_018720	CGG	2	6	3605	3610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408500256
43	NC_018720	ACT	2	6	3748	3753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408500256
44	NC_018720	AGC	2	6	3808	3813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500256
45	NC_018720	GCC	2	6	3855	3860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408500256
46	NC_018720	GCC	2	6	3916	3921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408500256
47	NC_018720	GGA	2	6	4025	4030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408500256
48	NC_018720	GAT	2	6	4146	4151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408500256
49	NC_018720	CTG	2	6	4239	4244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408500256
50	NC_018720	GGT	2	6	4247	4252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408500256
51	NC_018720	TCG	2	6	4259	4264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408500256
52	NC_018720	GAT	2	6	4290	4295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408500256
53	NC_018720	CAG	2	6	4350	4355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500256
54	NC_018720	GCC	2	6	4377	4382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408500256
55	NC_018720	TGG	2	6	4417	4422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408500256
56	NC_018720	GCC	2	6	4461	4466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408500256
57	NC_018720	GAC	2	6	4527	4532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500256
58	NC_018720	TCG	2	6	4660	4665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408500257
59	NC_018720	GGA	2	6	4672	4677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408500257
60	NC_018720	AGG	2	6	4735	4740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408500257
61	NC_018720	GTG	2	6	4742	4747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408500257
62	NC_018720	GTG	2	6	4820	4825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408500257
63	NC_018720	CGC	2	6	4837	4842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408500257
64	NC_018720	AGG	2	6	4866	4871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408500257
65	NC_018720	CCG	2	6	5014	5019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408500257
66	NC_018720	GAG	2	6	5334	5339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408500258
67	NC_018720	GAT	2	6	5352	5357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408500258
68	NC_018720	GAC	2	6	5391	5396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500258
69	NC_018720	CAT	2	6	5523	5528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408500258
70	NC_018720	TCG	2	6	5542	5547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408500258
71	NC_018720	CGA	2	6	5558	5563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500258
72	NC_018720	GAC	2	6	5628	5633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500258
73	NC_018720	GCG	2	6	5680	5685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408500258
74	NC_018720	GGT	2	6	5690	5695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408500258
75	NC_018720	GGC	3	9	5730	5738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408500258
76	NC_018720	GGC	2	6	5751	5756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408500258
77	NC_018720	CAG	2	6	5994	5999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500258
78	NC_018720	CAA	2	6	6011	6016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408500258
79	NC_018720	CCG	2	6	6238	6243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408500258
80	NC_018720	ACC	2	6	6261	6266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408500258
81	NC_018720	ACC	2	6	6309	6314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408500258
82	NC_018720	GGC	2	6	6318	6323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408500258
83	NC_018720	GAG	2	6	6330	6335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408500258
84	NC_018720	CGA	2	6	6422	6427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500258
85	NC_018720	CCG	2	6	6445	6450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408500258
86	NC_018720	CAT	2	6	6596	6601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408500258
87	NC_018720	AAG	2	6	6642	6647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408500258
88	NC_018720	GAG	2	6	6732	6737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408500258
89	NC_018720	GGC	2	6	6771	6776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408500258
90	NC_018720	ATG	2	6	6867	6872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408500258
91	NC_018720	GCG	2	6	6910	6915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408500258
92	NC_018720	TCA	3	9	6961	6969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408500258
93	NC_018720	CTT	2	6	7022	7027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408500258
94	NC_018720	ACC	2	6	7251	7256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408500258
95	NC_018720	AAG	2	6	7281	7286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408500258
96	NC_018720	CGA	2	6	7313	7318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500258
97	NC_018720	CGA	2	6	7340	7345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500258
98	NC_018720	ACG	2	6	7384	7389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500258
99	NC_018720	AAC	3	9	7467	7475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408500259
100	NC_018720	ACA	2	6	7477	7482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408500259
101	NC_018720	ACA	2	6	7549	7554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408500259
102	NC_018720	CCT	2	6	7565	7570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408500259
103	NC_018720	CAG	2	6	7602	7607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500259
104	NC_018720	ACA	2	6	7750	7755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408500259
105	NC_018720	ACC	2	6	7792	7797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408500259
106	NC_018720	TGG	2	6	7867	7872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408500259
107	NC_018720	CGA	2	6	7901	7906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500259
108	NC_018720	GCC	2	6	7914	7919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408500259
109	NC_018720	ACG	2	6	8008	8013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500259
110	NC_018720	CTG	2	6	8058	8063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408500259
111	NC_018720	CCA	2	6	8098	8103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408500259
112	NC_018720	TCC	2	6	8108	8113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408500259
113	NC_018720	AGG	2	6	8176	8181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408500259
114	NC_018720	GCT	2	6	8183	8188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408500259
115	NC_018720	CAT	2	6	8204	8209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408500259
116	NC_018720	CCA	2	6	8236	8241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408500259
117	NC_018720	GAG	2	6	8319	8324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408500259
118	NC_018720	TGG	2	6	8344	8349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408500259
119	NC_018720	CGA	2	6	8447	8452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500259
120	NC_018720	GGT	2	6	8513	8518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408500259
121	NC_018720	CAA	2	6	8522	8527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408500259
122	NC_018720	CAG	2	6	8550	8555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500259
123	NC_018720	TGG	2	6	8581	8586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408500259
124	NC_018720	ACC	2	6	8638	8643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408500259
125	NC_018720	GCG	2	6	8660	8665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408500259
126	NC_018720	GCT	2	6	8807	8812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408500259
127	NC_018720	GCC	2	6	8868	8873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408500259
128	NC_018720	AGA	2	6	8884	8889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408500259
129	NC_018720	CGA	2	6	8978	8983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500259
130	NC_018720	TCG	2	6	8995	9000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408500259
131	NC_018720	GCG	2	6	9017	9022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408500259
132	NC_018720	GGA	2	6	9059	9064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408500259
133	NC_018720	CGA	2	6	9074	9079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500259
134	NC_018720	GGT	3	9	9083	9091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408500259
135	NC_018720	CGA	2	6	9131	9136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500259
136	NC_018720	CGG	2	6	9155	9160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408500259
137	NC_018720	GAC	2	6	9192	9197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500259
138	NC_018720	GTG	2	6	9198	9203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408500259
139	NC_018720	CTT	2	6	9209	9214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408500259
140	NC_018720	GCT	2	6	9236	9241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408500259
141	NC_018720	CTT	2	6	9242	9247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408500259
142	NC_018720	CAA	2	6	9251	9256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408500259
143	NC_018720	ACG	2	6	9388	9393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500259
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145	NC_018720	GGC	2	6	9474	9479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408500259
146	NC_018720	CGA	2	6	9518	9523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500259
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148	NC_018720	CGA	2	6	9548	9553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500259
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151	NC_018720	CGA	3	9	9581	9589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500259
152	NC_018720	ATC	2	6	9591	9596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408500259
153	NC_018720	CGG	2	6	9631	9636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408500259
154	NC_018720	CCG	2	6	9670	9675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408500259
155	NC_018720	TGG	2	6	9757	9762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408500259
156	NC_018720	TGG	2	6	9850	9855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408500259
157	NC_018720	TGG	2	6	9883	9888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408500259
158	NC_018720	CAT	2	6	9914	9919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408500259
159	NC_018720	TGA	2	6	10049	10054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408500259
160	NC_018720	CCG	2	6	10090	10095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408500259
161	NC_018720	CCA	2	6	10126	10131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408500259
162	NC_018720	AGG	2	6	10162	10167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408500259
163	NC_018720	GAT	2	6	10287	10292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408500260
164	NC_018720	TGA	2	6	10355	10360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408500260
165	NC_018720	CTG	2	6	10459	10464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408500260
166	NC_018720	CTG	2	6	10608	10613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408500260
167	NC_018720	CAT	2	6	10628	10633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408500260
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170	NC_018720	GGC	2	6	10731	10736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408500260
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172	NC_018720	TAG	2	6	10813	10818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408500260
173	NC_018720	GGC	2	6	10872	10877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408500260
174	NC_018720	CGA	2	6	10895	10900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500260
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234	NC_018720	CTG	2	6	14280	14285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408500264
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238	NC_018720	CAG	2	6	14529	14534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500264
239	NC_018720	AGC	2	6	14536	14541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500264
240	NC_018720	CGC	2	6	14675	14680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408500264
241	NC_018720	GAG	2	6	14724	14729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408500264
242	NC_018720	GCA	3	9	14759	14767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408500264
243	NC_018720	CCA	2	6	14800	14805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408500264
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245	NC_018720	CCG	2	6	14957	14962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408500264
246	NC_018720	GTG	2	6	15000	15005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408500264
247	NC_018720	ACT	2	6	15019	15024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408500264
248	NC_018720	CCA	3	9	15064	15072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408500264
249	NC_018720	CAT	2	6	15168	15173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408500264
250	NC_018720	GGC	2	6	15227	15232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408500264
251	NC_018720	CGG	2	6	15235	15240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408500264
252	NC_018720	GGC	2	6	15265	15270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408500265
253	NC_018720	ATC	2	6	15291	15296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408500265
254	NC_018720	CAC	2	6	15422	15427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408500265
255	NC_018720	GTA	2	6	15668	15673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408500265
256	NC_018720	CCG	2	6	15764	15769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408500265
257	NC_018720	GGT	2	6	15772	15777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408500265
258	NC_018720	TGA	2	6	15820	15825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408500265
259	NC_018720	CCT	2	6	15844	15849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408500265
260	NC_018720	ACC	2	6	15870	15875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408500265
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262	NC_018720	ACC	2	6	15966	15971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408500265
263	NC_018720	GGC	2	6	15989	15994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408500265
264	NC_018720	CGC	2	6	16015	16020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408500265
265	NC_018720	TTG	2	6	16029	16034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408500265
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277	NC_018720	GAG	2	6	16689	16694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408500266
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279	NC_018720	TGA	2	6	16732	16737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408500266
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284	NC_018720	GCC	2	6	16844	16849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408500266
285	NC_018720	CCA	2	6	16885	16890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408500266
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288	NC_018720	CCA	2	6	17018	17023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408500266
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