MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Candidatus Nitrososphaera gargensis Ga9.2 chromosome

Total Repeats: 40294

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018719	GGC	2	6	54	59	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018719	TGA	2	6	211	216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402625
3	NC_018719	TGC	2	6	279	284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402625
4	NC_018719	TGT	2	6	328	333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402625
5	NC_018719	CAA	2	6	454	459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402625
6	NC_018719	ATG	2	6	641	646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402625
7	NC_018719	AGC	2	6	725	730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402625
8	NC_018719	GCG	2	6	854	859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402625
9	NC_018719	TGA	2	6	952	957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402625
10	NC_018719	TAA	2	6	1044	1049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402625
11	NC_018719	ACC	2	6	1076	1081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402625
12	NC_018719	GCG	2	6	1144	1149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402625
13	NC_018719	ATA	2	6	1160	1165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402625
14	NC_018719	CTT	2	6	1178	1183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402625
15	NC_018719	ACA	2	6	1259	1264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402625
16	NC_018719	AAG	2	6	1269	1274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402625
17	NC_018719	TTA	2	6	1299	1304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402625
18	NC_018719	CTA	2	6	1311	1316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402625
19	NC_018719	CTG	2	6	1398	1403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402626
20	NC_018719	CAT	2	6	1521	1526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402626
21	NC_018719	TCC	2	6	1528	1533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402626
22	NC_018719	GTG	2	6	1639	1644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402626
23	NC_018719	CAT	2	6	1652	1657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402626
24	NC_018719	CAA	2	6	1680	1685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402626
25	NC_018719	GGT	2	6	1751	1756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402626
26	NC_018719	CCT	2	6	1797	1802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402626
27	NC_018719	CAG	2	6	1860	1865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402626
28	NC_018719	TCA	2	6	2002	2007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402626
29	NC_018719	GAC	2	6	2008	2013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402626
30	NC_018719	GGT	2	6	2120	2125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402626
31	NC_018719	ATG	2	6	2143	2148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402626
32	NC_018719	GCC	2	6	2224	2229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402626
33	NC_018719	GTC	2	6	2280	2285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402626
34	NC_018719	TTC	2	6	2305	2310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402626
35	NC_018719	CAA	2	6	2387	2392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402626
36	NC_018719	CTA	2	6	2398	2403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402626
37	NC_018719	TTA	2	6	2404	2409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402626
38	NC_018719	CGC	2	6	2511	2516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402626
39	NC_018719	GGT	2	6	2538	2543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402626
40	NC_018719	CAG	2	6	2613	2618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402626
41	NC_018719	ATT	2	6	2674	2679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402626
42	NC_018719	ATC	2	6	2895	2900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018719	CTG	2	6	2901	2906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018719	TTG	3	9	2907	2915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018719	AGA	2	6	3005	3010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018719	ACT	2	6	3043	3048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402627
47	NC_018719	GTC	2	6	3096	3101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402627
48	NC_018719	GGC	2	6	3156	3161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402627
49	NC_018719	ATT	2	6	3176	3181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402627
50	NC_018719	ACC	2	6	3240	3245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402627
51	NC_018719	ATA	2	6	3328	3333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402627
52	NC_018719	TTC	2	6	3335	3340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402627
53	NC_018719	CGC	2	6	3386	3391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402627
54	NC_018719	GCG	2	6	3574	3579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402627
55	NC_018719	CAA	2	6	3649	3654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402627
56	NC_018719	CGG	2	6	3713	3718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402627
57	NC_018719	ATC	2	6	3725	3730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402627
58	NC_018719	CAG	2	6	3752	3757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402627
59	NC_018719	GCC	2	6	3779	3784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402627
60	NC_018719	AAT	2	6	3851	3856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402627
61	NC_018719	GTC	2	6	3857	3862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402627
62	NC_018719	AGC	2	6	4043	4048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402627
63	NC_018719	GCT	2	6	4065	4070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402627
64	NC_018719	GCT	2	6	4091	4096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402627
65	NC_018719	TGC	2	6	4099	4104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402627
66	NC_018719	CTT	2	6	4123	4128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402627
67	NC_018719	TTC	2	6	4157	4162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402627
68	NC_018719	GCC	2	6	4185	4190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402627
69	NC_018719	CTG	2	6	4264	4269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402627
70	NC_018719	TGC	2	6	4287	4292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402627
71	NC_018719	GCC	2	6	4370	4375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402627
72	NC_018719	CCT	3	9	4423	4431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402627
73	NC_018719	GCC	2	6	4445	4450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402627
74	NC_018719	TTG	2	6	4575	4580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402627
75	NC_018719	GTA	2	6	4629	4634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402627
76	NC_018719	GCC	2	6	4908	4913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402628
77	NC_018719	GCC	2	6	4960	4965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402628
78	NC_018719	AGC	2	6	5034	5039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402628
79	NC_018719	GTG	2	6	5044	5049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402628
80	NC_018719	TCG	2	6	5075	5080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402628
81	NC_018719	GCT	2	6	5100	5105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402628
82	NC_018719	TGC	2	6	5147	5152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402628
83	NC_018719	CAA	2	6	5210	5215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018719	AAG	2	6	5259	5264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018719	TTC	2	6	5290	5295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402629
86	NC_018719	CGG	2	6	5317	5322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402629
87	NC_018719	TCA	2	6	5425	5430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402629
88	NC_018719	CGA	2	6	5531	5536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402629
89	NC_018719	GAC	2	6	5568	5573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402629
90	NC_018719	TCA	2	6	5724	5729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402630
91	NC_018719	CCA	2	6	5748	5753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402630
92	NC_018719	TTA	3	9	5848	5856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018719	TCT	2	6	5873	5878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018719	ATA	4	12	5887	5898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018719	CAG	3	9	5947	5955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402631
96	NC_018719	CAT	2	6	5994	5999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402631
97	NC_018719	AGG	2	6	6026	6031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402631
98	NC_018719	CTG	2	6	6050	6055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402631
99	NC_018719	ACG	2	6	6076	6081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402631
100	NC_018719	GAG	2	6	6196	6201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402631
101	NC_018719	CGC	2	6	6312	6317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402631
102	NC_018719	ATA	2	6	6319	6324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402631
103	NC_018719	CGG	2	6	6366	6371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402631
104	NC_018719	TTC	2	6	6409	6414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402631
105	NC_018719	ACG	2	6	6422	6427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402631
106	NC_018719	GAT	2	6	6471	6476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402631
107	NC_018719	GTG	3	9	6568	6576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402631
108	NC_018719	CGA	2	6	6662	6667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402631
109	NC_018719	ACG	2	6	6719	6724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402631
110	NC_018719	GAC	2	6	6730	6735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402631
111	NC_018719	GCA	2	6	6843	6848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018719	GAG	2	6	6956	6961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402632
113	NC_018719	CCT	2	6	6982	6987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402632
114	NC_018719	GAG	2	6	7010	7015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402632
115	NC_018719	AAG	2	6	7115	7120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402632
116	NC_018719	AGA	2	6	7182	7187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402632
117	NC_018719	GAA	2	6	7226	7231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402632
118	NC_018719	CGG	2	6	7287	7292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402632
119	NC_018719	TTC	2	6	7301	7306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402632
120	NC_018719	TGG	2	6	7338	7343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402632
121	NC_018719	ACA	2	6	7344	7349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402632
122	NC_018719	TTC	2	6	7402	7407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402632
123	NC_018719	AAT	2	6	7413	7418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402632
124	NC_018719	TGC	2	6	7646	7651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402633
125	NC_018719	TGT	2	6	7698	7703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018719	TCC	3	9	7721	7729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_018719	AGG	2	6	7775	7780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018719	GGT	2	6	7892	7897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402634
129	NC_018719	CAC	2	6	8013	8018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402634
130	NC_018719	TTG	2	6	8092	8097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402634
131	NC_018719	TGG	2	6	8100	8105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402634
132	NC_018719	CGT	2	6	8153	8158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402634
133	NC_018719	GCC	2	6	8262	8267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402634
134	NC_018719	TAT	2	6	8486	8491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018719	TAA	2	6	8494	8499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018719	TAA	3	9	8549	8557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402635
137	NC_018719	CAG	2	6	8616	8621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402635
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162	NC_018719	TGA	2	6	10185	10190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_018719	CAT	2	6	10292	10297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_018719	GGT	2	6	10314	10319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
165	NC_018719	TTA	2	6	10327	10332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_018719	AAG	3	9	16679	16687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
257	NC_018719	AGC	2	6	16717	16722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_018719	ACA	2	6	16739	16744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_018719	GTA	3	9	16777	16785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
260	NC_018719	AAG	2	6	16787	16792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_018719	GTC	2	6	31829	31834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402664

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