MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Nitrososphaera gargensis Ga9.2 chromosome

Total Repeats: 32784

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018719	TGA	2	6	211	216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402625
2	NC_018719	TGC	2	6	279	284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402625
3	NC_018719	TGT	2	6	328	333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402625
4	NC_018719	CAA	2	6	454	459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402625
5	NC_018719	ATG	2	6	641	646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402625
6	NC_018719	AGC	2	6	725	730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402625
7	NC_018719	GCG	2	6	854	859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402625
8	NC_018719	TGA	2	6	952	957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402625
9	NC_018719	TAA	2	6	1044	1049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402625
10	NC_018719	ACC	2	6	1076	1081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402625
11	NC_018719	GCG	2	6	1144	1149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402625
12	NC_018719	ATA	2	6	1160	1165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402625
13	NC_018719	CTT	2	6	1178	1183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402625
14	NC_018719	ACA	2	6	1259	1264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402625
15	NC_018719	AAG	2	6	1269	1274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402625
16	NC_018719	TTA	2	6	1299	1304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402625
17	NC_018719	CTA	2	6	1311	1316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402625
18	NC_018719	CTG	2	6	1398	1403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402626
19	NC_018719	CAT	2	6	1521	1526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402626
20	NC_018719	TCC	2	6	1528	1533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402626
21	NC_018719	GTG	2	6	1639	1644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402626
22	NC_018719	CAT	2	6	1652	1657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402626
23	NC_018719	CAA	2	6	1680	1685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402626
24	NC_018719	GGT	2	6	1751	1756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402626
25	NC_018719	CCT	2	6	1797	1802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402626
26	NC_018719	CAG	2	6	1860	1865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402626
27	NC_018719	TCA	2	6	2002	2007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402626
28	NC_018719	GAC	2	6	2008	2013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402626
29	NC_018719	GGT	2	6	2120	2125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402626
30	NC_018719	ATG	2	6	2143	2148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402626
31	NC_018719	GCC	2	6	2224	2229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402626
32	NC_018719	GTC	2	6	2280	2285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402626
33	NC_018719	TTC	2	6	2305	2310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402626
34	NC_018719	CAA	2	6	2387	2392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402626
35	NC_018719	CTA	2	6	2398	2403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402626
36	NC_018719	TTA	2	6	2404	2409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402626
37	NC_018719	CGC	2	6	2511	2516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402626
38	NC_018719	GGT	2	6	2538	2543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402626
39	NC_018719	CAG	2	6	2613	2618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402626
40	NC_018719	ATT	2	6	2674	2679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402626
41	NC_018719	ACT	2	6	3043	3048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402627
42	NC_018719	GTC	2	6	3096	3101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402627
43	NC_018719	GGC	2	6	3156	3161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402627
44	NC_018719	ATT	2	6	3176	3181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402627
45	NC_018719	ACC	2	6	3240	3245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402627
46	NC_018719	ATA	2	6	3328	3333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402627
47	NC_018719	TTC	2	6	3335	3340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402627
48	NC_018719	CGC	2	6	3386	3391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402627
49	NC_018719	GCG	2	6	3574	3579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402627
50	NC_018719	CAA	2	6	3649	3654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402627
51	NC_018719	CGG	2	6	3713	3718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402627
52	NC_018719	ATC	2	6	3725	3730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402627
53	NC_018719	CAG	2	6	3752	3757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402627
54	NC_018719	GCC	2	6	3779	3784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402627
55	NC_018719	AAT	2	6	3851	3856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402627
56	NC_018719	GTC	2	6	3857	3862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402627
57	NC_018719	AGC	2	6	4043	4048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402627
58	NC_018719	GCT	2	6	4065	4070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402627
59	NC_018719	GCT	2	6	4091	4096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402627
60	NC_018719	TGC	2	6	4099	4104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402627
61	NC_018719	CTT	2	6	4123	4128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402627
62	NC_018719	TTC	2	6	4157	4162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402627
63	NC_018719	GCC	2	6	4185	4190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402627
64	NC_018719	CTG	2	6	4264	4269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402627
65	NC_018719	TGC	2	6	4287	4292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402627
66	NC_018719	GCC	2	6	4370	4375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402627
67	NC_018719	CCT	3	9	4423	4431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402627
68	NC_018719	GCC	2	6	4445	4450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402627
69	NC_018719	TTG	2	6	4575	4580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402627
70	NC_018719	GTA	2	6	4629	4634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402627
71	NC_018719	GCC	2	6	4908	4913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402628
72	NC_018719	GCC	2	6	4960	4965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402628
73	NC_018719	AGC	2	6	5034	5039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402628
74	NC_018719	GTG	2	6	5044	5049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402628
75	NC_018719	TCG	2	6	5075	5080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402628
76	NC_018719	GCT	2	6	5100	5105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402628
77	NC_018719	TGC	2	6	5147	5152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402628
78	NC_018719	TTC	2	6	5290	5295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402629
79	NC_018719	CGG	2	6	5317	5322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402629
80	NC_018719	TCA	2	6	5425	5430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402629
81	NC_018719	CGA	2	6	5531	5536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402629
82	NC_018719	GAC	2	6	5568	5573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402629
83	NC_018719	TCA	2	6	5724	5729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402630
84	NC_018719	CCA	2	6	5748	5753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402630
85	NC_018719	CAG	3	9	5947	5955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402631
86	NC_018719	CAT	2	6	5994	5999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402631
87	NC_018719	AGG	2	6	6026	6031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402631
88	NC_018719	CTG	2	6	6050	6055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402631
89	NC_018719	ACG	2	6	6076	6081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402631
90	NC_018719	GAG	2	6	6196	6201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402631
91	NC_018719	CGC	2	6	6312	6317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402631
92	NC_018719	ATA	2	6	6319	6324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402631
93	NC_018719	CGG	2	6	6366	6371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402631
94	NC_018719	TTC	2	6	6409	6414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402631
95	NC_018719	ACG	2	6	6422	6427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402631
96	NC_018719	GAT	2	6	6471	6476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402631
97	NC_018719	GTG	3	9	6568	6576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402631
98	NC_018719	CGA	2	6	6662	6667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402631
99	NC_018719	ACG	2	6	6719	6724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402631
100	NC_018719	GAC	2	6	6730	6735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402631
101	NC_018719	GAG	2	6	6956	6961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402632
102	NC_018719	CCT	2	6	6982	6987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402632
103	NC_018719	GAG	2	6	7010	7015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402632
104	NC_018719	AAG	2	6	7115	7120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402632
105	NC_018719	AGA	2	6	7182	7187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402632
106	NC_018719	GAA	2	6	7226	7231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402632
107	NC_018719	CGG	2	6	7287	7292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402632
108	NC_018719	TTC	2	6	7301	7306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402632
109	NC_018719	TGG	2	6	7338	7343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402632
110	NC_018719	ACA	2	6	7344	7349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402632
111	NC_018719	TTC	2	6	7402	7407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402632
112	NC_018719	AAT	2	6	7413	7418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402632
113	NC_018719	TGC	2	6	7646	7651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402633
114	NC_018719	GGT	2	6	7892	7897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402634
115	NC_018719	CAC	2	6	8013	8018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402634
116	NC_018719	TTG	2	6	8092	8097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402634
117	NC_018719	TGG	2	6	8100	8105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402634
118	NC_018719	CGT	2	6	8153	8158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402634
119	NC_018719	GCC	2	6	8262	8267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402634
120	NC_018719	TAA	3	9	8549	8557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402635
121	NC_018719	CAG	2	6	8616	8621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402635
122	NC_018719	GGA	2	6	8632	8637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402635
123	NC_018719	CGC	2	6	8795	8800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402635
124	NC_018719	AGA	3	9	8807	8815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402635
125	NC_018719	CGC	2	6	8961	8966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402636
126	NC_018719	GTG	2	6	9004	9009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402636
127	NC_018719	ACG	2	6	9011	9016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402636
128	NC_018719	TGA	2	6	9077	9082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402637
129	NC_018719	ATC	2	6	9111	9116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402637
130	NC_018719	GAG	2	6	9174	9179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402637
131	NC_018719	GGT	2	6	9247	9252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402637
132	NC_018719	AGA	2	6	9352	9357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402638
133	NC_018719	AGA	2	6	9403	9408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402638
134	NC_018719	GCC	2	6	9525	9530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402638
135	NC_018719	ACA	2	6	9592	9597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402638
136	NC_018719	CGA	2	6	9610	9615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402638
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138	NC_018719	TGA	2	6	9661	9666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402638
139	NC_018719	CCG	2	6	9673	9678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402638
140	NC_018719	GTC	2	6	9686	9691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402638
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142	NC_018719	GTG	2	6	10032	10037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402638
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153	NC_018719	GCT	2	6	10797	10802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402639
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215	NC_018719	TGA	2	6	16357	16362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402646
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242	NC_018719	GAT	2	6	18417	18422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402648
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249	NC_018719	CAT	2	6	18779	18784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402648
250	NC_018719	AGT	2	6	18795	18800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402648
251	NC_018719	GCG	3	9	18802	18810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402648
252	NC_018719	GCA	2	6	18849	18854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402648
253	NC_018719	GCA	2	6	18966	18971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402648
254	NC_018719	ACA	2	6	19108	19113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402648
255	NC_018719	TCT	2	6	19125	19130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402648
256	NC_018719	GGC	2	6	19175	19180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402648
257	NC_018719	AGC	2	6	19192	19197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402648
258	NC_018719	GAG	2	6	19203	19208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402648
259	NC_018719	GCT	2	6	19397	19402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402648
260	NC_018719	GCA	2	6	19482	19487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402648
261	NC_018719	ACG	2	6	19530	19535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402648
262	NC_018719	CGC	2	6	19585	19590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402648
263	NC_018719	TGG	2	6	19994	19999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402649
264	NC_018719	GTT	2	6	20047	20052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402649
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267	NC_018719	TGA	2	6	20232	20237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402649
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269	NC_018719	CTG	2	6	20290	20295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402649
270	NC_018719	CGG	2	6	20406	20411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402649
271	NC_018719	CTA	2	6	20442	20447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402649
272	NC_018719	GAC	2	6	20458	20463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402649
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275	NC_018719	GAT	2	6	20589	20594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402649
276	NC_018719	TTA	2	6	20637	20642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402649
277	NC_018719	GAC	2	6	20746	20751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402649
278	NC_018719	CAT	2	6	20760	20765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402649
279	NC_018719	GGC	2	6	20803	20808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402649
280	NC_018719	ACT	2	6	20822	20827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402649
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282	NC_018719	CAT	2	6	20901	20906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402649
283	NC_018719	CAG	2	6	21157	21162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402649
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285	NC_018719	ACA	2	6	21224	21229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402649
286	NC_018719	CAA	2	6	21278	21283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402649
287	NC_018719	GCG	2	6	21290	21295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402649
288	NC_018719	CGA	2	6	21422	21427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402649
289	NC_018719	ACA	2	6	21437	21442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402649
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292	NC_018719	CTG	2	6	21535	21540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402649
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328	NC_018719	TCT	2	6	24587	24592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402652
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343	NC_018719	ATC	2	6	25518	25523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402653
344	NC_018719	TGA	2	6	25550	25555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402653
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351	NC_018719	CGA	2	6	26130	26135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402654
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353	NC_018719	ACA	2	6	26189	26194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402654
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357	NC_018719	TAC	2	6	26550	26555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402655
358	NC_018719	CGA	2	6	26615	26620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402655
359	NC_018719	TCA	2	6	26776	26781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402655
360	NC_018719	CGG	2	6	26909	26914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402655
361	NC_018719	TTG	2	6	27247	27252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402655
362	NC_018719	GCC	2	6	27265	27270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402655
363	NC_018719	AAT	3	9	27276	27284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402655
364	NC_018719	CGG	2	6	27299	27304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402655
365	NC_018719	CAG	2	6	27443	27448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402656
366	NC_018719	GCC	2	6	27451	27456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402656
367	NC_018719	CTG	2	6	27512	27517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402656
368	NC_018719	ATA	2	6	27604	27609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402656
369	NC_018719	GGA	2	6	27610	27615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402656
370	NC_018719	GCG	2	6	27721	27726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402656
371	NC_018719	GGC	2	6	27754	27759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402656
372	NC_018719	CTG	2	6	27790	27795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402656
373	NC_018719	GCC	2	6	27928	27933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402656
374	NC_018719	CGC	2	6	28001	28006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402656
375	NC_018719	GGA	2	6	28051	28056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402656
376	NC_018719	GTC	2	6	28071	28076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402656
377	NC_018719	GAT	2	6	28102	28107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402656
378	NC_018719	TGC	2	6	28161	28166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402656
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383	NC_018719	GCG	2	6	28309	28314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402656
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498	NC_018719	TTC	2	6	39201	39206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402676
499	NC_018719	ACT	2	6	39207	39212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402676
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