MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis RE378

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018712	TAACTA	2	12	136	147	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018712	GAAGTG	2	12	24022	24033	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018712	ACTAAT	2	12	24052	24063	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018712	TGTAAA	2	12	31654	31665	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018712	AAATTA	2	12	74264	74275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018712	ATTGAA	2	12	77339	77350	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018712	GAAGTG	2	12	87570	87581	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018712	ACTAAT	2	12	87600	87611	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018712	TTCGGG	2	12	88533	88544	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018712	GGCTAT	2	12	127271	127282	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018712	GTAGGT	2	12	183714	183725	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018712	ATTTGA	2	12	184803	184814	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018712	AGAGAA	2	12	189701	189712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018712	CATAAA	2	12	214729	214740	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018712	TCTAGC	2	12	222814	222825	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018712	CAAGAC	2	12	223255	223266	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018712	GTAAAA	2	12	271760	271771	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018712	TTAGAA	2	12	285312	285323	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018712	GAAGTG	2	12	310888	310899	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018712	ACTAAT	2	12	310918	310929	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018712	CTCAGT	2	12	339794	339805	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018712	GAAGTG	2	12	363772	363783	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018712	ACTAAT	2	12	363802	363813	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018712	AAAAAG	2	12	406761	406772	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018712	ATGGGA	2	12	461120	461131	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018712	ATCACT	2	12	461770	461781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018712	CATTGC	2	12	462613	462624	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018712	CTGACA	2	12	462674	462685	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018712	AAAGGA	2	12	512960	512971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018712	AGAAGG	2	12	514956	514967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018712	TTGCGC	2	12	520682	520693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018712	AGAAAT	2	12	520793	520804	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018712	TTGCCA	2	12	554541	554552	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018712	AGGACT	2	12	569040	569051	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018712	GCCAAA	2	12	575380	575391	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018712	CTATTT	2	12	576037	576048	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018712	AATTAA	2	12	583128	583139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018712	GTTTTT	2	12	599798	599809	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018712	GAAAAA	2	12	639608	639619	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018712	GTTTGG	2	12	666761	666772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018712	AAAGCA	2	12	752483	752494	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018712	CAAAGG	2	12	786739	786750	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018712	ATGTCA	2	12	827789	827800	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018712	AGGTAA	2	12	838513	838524	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018712	CCAAAA	2	12	855307	855318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018712	TCTTTT	2	12	993727	993738	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018712	TATTAA	2	12	995868	995879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018712	TCATGT	2	12	996988	996999	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018712	AAACTA	2	12	997095	997106	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018712	AAAGAA	2	12	1015855	1015866	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018712	TATAAC	2	12	1020483	1020494	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018712	TAAATT	2	12	1028420	1028431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018712	CATTAT	2	12	1034950	1034961	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018712	CATTCT	2	12	1034974	1034985	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018712	TTCCTT	2	12	1052093	1052104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018712	ACCTTT	2	12	1070324	1070335	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018712	TTTAAA	2	12	1091054	1091065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018712	AGAGAA	2	12	1113861	1113872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018712	CCCGAA	2	12	1117168	1117179	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018712	CTCCTT	2	12	1166994	1167005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018712	TTTTTC	2	12	1173776	1173787	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018712	AGTTTT	2	12	1192417	1192428	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018712	TAATCC	2	12	1214722	1214733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018712	ATCCTT	2	12	1271572	1271583	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018712	TCTAAT	2	12	1278429	1278440	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018712	ATCTAA	2	12	1289999	1290010	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_018712	GTAAAT	2	12	1291143	1291154	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018712	TTAATT	2	12	1299852	1299863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018712	CTTTAT	2	12	1318479	1318490	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_018712	ATCATT	2	12	1332155	1332166	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_018712	GTTTTG	2	12	1335800	1335811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018712	TTTCAT	2	12	1459589	1459600	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_018712	TGACTT	2	12	1468238	1468249	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_018712	TTTCTT	2	12	1482102	1482113	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_018712	ATAATT	2	12	1500499	1500510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018712	GAGATA	2	12	1518503	1518514	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018712	CAAGTA	2	12	1548226	1548237	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018712	CCTAAA	2	12	1548330	1548341	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018712	ATTAGT	2	12	1548658	1548669	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018712	TGGTAT	2	12	1580574	1580585	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018712	CCTTAT	2	12	1591136	1591147	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018712	ATTTTC	2	12	1592767	1592778	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018712	TATTAG	2	12	1595743	1595754	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018712	AAAAAT	2	12	1620329	1620340	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018712	CAATTC	2	12	1654614	1654625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018712	TATTTT	2	12	1655686	1655697	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018712	ATGATT	2	12	1674135	1674146	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018712	TTGATC	2	12	1683063	1683074	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018712	AACTTC	2	12	1711347	1711358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018712	ATTCCA	2	12	1781742	1781753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018712	TTCCTT	2	12	1790604	1790615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018712	ATCATG	2	12	1815772	1815783	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018712	CTAGTC	2	12	1834386	1834397	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018712	ACAATA	2	12	1836099	1836110	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_018712	ACTAGT	2	12	1838724	1838735	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018712	CTGATA	2	12	1991971	1991982	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_018712	AGTATA	2	12	2020007	2020018	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018712	TATCCT	2	12	2034648	2034659	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018712	CTTTTT	2	12	2034663	2034674	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018712	TTAATA	2	12	2071854	2071865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018712	CTTTCT	2	12	2076172	2076183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018712	TTTTCA	2	12	2089414	2089425	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_018712	GAAAAA	2	12	2146796	2146807	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.