MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis RE378

Total Repeats: 1658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018712	AAATC	2	10	488	497	60 %	20 %	0 %	20 %	408400747
2	NC_018712	AAAAG	2	10	830	839	80 %	0 %	20 %	0 %	408400747
3	NC_018712	ATTTT	2	10	1111	1120	20 %	80 %	0 %	0 %	408400747
4	NC_018712	AAAAT	2	10	1564	1573	80 %	20 %	0 %	0 %	408400747
5	NC_018712	GTAAA	2	10	2659	2668	60 %	20 %	20 %	0 %	408400748
6	NC_018712	AAAAG	2	10	2870	2879	80 %	0 %	20 %	0 %	408400748
7	NC_018712	GATTT	2	10	6453	6462	20 %	60 %	20 %	0 %	408400752
8	NC_018712	AAGAA	2	10	12026	12035	80 %	0 %	20 %	0 %	408400755
9	NC_018712	AAGAT	2	10	16373	16382	60 %	20 %	20 %	0 %	408400758
10	NC_018712	AAACT	2	10	18378	18387	60 %	20 %	0 %	20 %	408400760
11	NC_018712	ATATA	2	10	18599	18608	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018712	TCGTG	2	10	20424	20433	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018712	GTTAA	2	10	21185	21194	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018712	GGGAG	2	10	21704	21713	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018712	AGGGA	2	10	23913	23922	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018712	GCTTA	2	10	24285	24294	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018712	TTAAT	2	10	24922	24931	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018712	TAAAA	2	10	26196	26205	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018712	GTTCT	2	10	28133	28142	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018712	AGTGA	2	10	28881	28890	40 %	20 %	40 %	0 %	408400762
21	NC_018712	GAAAA	2	10	30094	30103	80 %	0 %	20 %	0 %	408400763
22	NC_018712	TTATT	2	10	30109	30118	20 %	80 %	0 %	0 %	408400763
23	NC_018712	ATGAA	2	10	30299	30308	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018712	TGACT	2	10	36698	36707	20 %	40 %	20 %	20 %	408400768
25	NC_018712	AAATG	2	10	37421	37430	60 %	20 %	20 %	0 %	408400768
26	NC_018712	TTGAT	2	10	39343	39352	20 %	60 %	20 %	0 %	408400770
27	NC_018712	TATTT	2	10	39812	39821	20 %	80 %	0 %	0 %	408400771
28	NC_018712	ATTTA	2	10	39972	39981	40 %	60 %	0 %	0 %	408400771
29	NC_018712	CCTCA	2	10	44245	44254	20 %	20 %	0 %	60 %	408400774
30	NC_018712	TCGTT	2	10	44618	44627	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018712	AAAAG	2	10	45215	45224	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018712	ATTGA	2	10	48738	48747	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018712	TGTTT	2	10	53909	53918	0 %	80 %	20 %	0 %	408400782
34	NC_018712	ATTTG	2	10	55182	55191	20 %	60 %	20 %	0 %	408400784
35	NC_018712	ATTCA	2	10	58283	58292	40 %	40 %	0 %	20 %	408400785
36	NC_018712	CCATG	2	10	58341	58350	20 %	20 %	20 %	40 %	408400785
37	NC_018712	TCAGC	2	10	61222	61231	20 %	20 %	20 %	40 %	408400787
38	NC_018712	TTATG	2	10	62171	62180	20 %	60 %	20 %	0 %	408400787
39	NC_018712	GTCAA	2	10	63833	63842	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018712	ATTGA	2	10	67607	67616	40 %	40 %	20 %	0 %	408400794
41	NC_018712	TTTGG	2	10	68639	68648	0 %	60 %	40 %	0 %	408400796
42	NC_018712	TTCAC	2	10	68995	69004	20 %	40 %	0 %	40 %	408400797
43	NC_018712	TGAAA	2	10	70075	70084	60 %	20 %	20 %	0 %	408400799
44	NC_018712	AAGGA	2	10	71163	71172	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018712	AGCAT	2	10	71940	71949	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018712	TCCAA	2	10	75839	75848	40 %	20 %	0 %	40 %	408400809
47	NC_018712	GTTTC	2	10	78488	78497	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018712	AGTTT	2	10	82286	82295	20 %	60 %	20 %	0 %	408400816
49	NC_018712	ACTTG	2	10	82568	82577	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018712	TCGTG	2	10	83968	83977	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018712	GTTAA	2	10	84729	84738	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018712	GGGAG	2	10	85248	85257	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018712	AGGGA	2	10	87459	87468	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018712	GCTTA	2	10	87833	87842	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018712	TATAT	2	10	88192	88201	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018712	ATATT	2	10	88812	88821	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018712	TTGGA	2	10	89080	89089	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018712	TTGTT	2	10	90094	90103	0 %	80 %	20 %	0 %	408400818
59	NC_018712	CTTTA	2	10	90437	90446	20 %	60 %	0 %	20 %	408400818
60	NC_018712	GAATT	2	10	91215	91224	40 %	40 %	20 %	0 %	408400819
61	NC_018712	TTTGG	2	10	91799	91808	0 %	60 %	40 %	0 %	408400819
62	NC_018712	TCTGC	2	10	91945	91954	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_018712	GCCAA	2	10	97049	97058	40 %	0 %	20 %	40 %	408400823
64	NC_018712	CAACA	2	10	97491	97500	60 %	0 %	0 %	40 %	408400823
65	NC_018712	TCTGT	2	10	101850	101859	0 %	60 %	20 %	20 %	408400828
66	NC_018712	CATGA	2	10	102795	102804	40 %	20 %	20 %	20 %	408400829
67	NC_018712	AAAAG	2	10	103576	103585	80 %	0 %	20 %	0 %	408400830
68	NC_018712	CTATT	2	10	105120	105129	20 %	60 %	0 %	20 %	408400830
69	NC_018712	ACTCA	2	10	114888	114897	40 %	20 %	0 %	40 %	408400834
70	NC_018712	ACCAA	2	10	114919	114928	60 %	0 %	0 %	40 %	408400834
71	NC_018712	TTATG	2	10	115370	115379	20 %	60 %	20 %	0 %	408400835
72	NC_018712	AGCAG	2	10	117294	117303	40 %	0 %	40 %	20 %	408400839
73	NC_018712	TGATA	2	10	117781	117790	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018712	ACTAT	2	10	120261	120270	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_018712	GTTTT	2	10	124684	124693	0 %	80 %	20 %	0 %	408400849
76	NC_018712	TGCGA	2	10	126842	126851	20 %	20 %	40 %	20 %	408400852
77	NC_018712	ACGTT	2	10	127250	127259	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018712	CTGTT	2	10	128190	128199	0 %	60 %	20 %	20 %	408400853
79	NC_018712	TGATT	2	10	128694	128703	20 %	60 %	20 %	0 %	408400854
80	NC_018712	GCGCT	2	10	129887	129896	0 %	20 %	40 %	40 %	408400855
81	NC_018712	TAGGA	2	10	130293	130302	40 %	20 %	40 %	0 %	408400855
82	NC_018712	GAAAA	2	10	132639	132648	80 %	0 %	20 %	0 %	408400857
83	NC_018712	GTGTT	2	10	135264	135273	0 %	60 %	40 %	0 %	408400860
84	NC_018712	TTAAG	2	10	135464	135473	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018712	TAGGT	2	10	136087	136096	20 %	40 %	40 %	0 %	408400861
86	NC_018712	TAAAT	2	10	136220	136229	60 %	40 %	0 %	0 %	408400861
87	NC_018712	AAATC	2	10	137096	137105	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_018712	GAGAG	2	10	137259	137268	40 %	0 %	60 %	0 %	408400862
89	NC_018712	TAAAT	2	10	137967	137976	60 %	40 %	0 %	0 %	408400862
90	NC_018712	AAAAC	2	10	141310	141319	80 %	0 %	0 %	20 %	408400863
91	NC_018712	TTTTC	2	10	142204	142213	0 %	80 %	0 %	20 %	408400864
92	NC_018712	TAGCA	2	10	143326	143335	40 %	20 %	20 %	20 %	408400865
93	NC_018712	ATCAA	2	10	143697	143706	60 %	20 %	0 %	20 %	408400865
94	NC_018712	ATCAC	2	10	143757	143766	40 %	20 %	0 %	40 %	408400865
95	NC_018712	TTACT	2	10	144949	144958	20 %	60 %	0 %	20 %	408400867
96	NC_018712	ATTGA	2	10	145518	145527	40 %	40 %	20 %	0 %	408400867
97	NC_018712	TACAA	2	10	146976	146985	60 %	20 %	0 %	20 %	408400867
98	NC_018712	AAATC	2	10	147413	147422	60 %	20 %	0 %	20 %	408400867
99	NC_018712	GGCGG	2	10	147836	147845	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
100	NC_018712	ATCTA	2	10	150878	150887	40 %	40 %	0 %	20 %	408400870
101	NC_018712	GGTAA	2	10	152412	152421	40 %	20 %	40 %	0 %	408400870
102	NC_018712	ATAAA	2	10	152839	152848	80 %	20 %	0 %	0 %	408400870
103	NC_018712	GCTTG	2	10	156315	156324	0 %	40 %	40 %	20 %	408400873
104	NC_018712	AATCC	2	10	156475	156484	40 %	20 %	0 %	40 %	408400873
105	NC_018712	AAAAT	2	10	157862	157871	80 %	20 %	0 %	0 %	408400874
106	NC_018712	AAAGA	2	10	159284	159293	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018712	GTACG	2	10	160511	160520	20 %	20 %	40 %	20 %	408400876
108	NC_018712	TTTTG	2	10	162059	162068	0 %	80 %	20 %	0 %	408400877
109	NC_018712	CTTTT	2	10	163338	163347	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_018712	CAATG	2	10	164661	164670	40 %	20 %	20 %	20 %	408400880
111	NC_018712	GATTG	2	10	165761	165770	20 %	40 %	40 %	0 %	408400882
112	NC_018712	TTGGT	2	10	166472	166481	0 %	60 %	40 %	0 %	408400883
113	NC_018712	CTCTT	2	10	166840	166849	0 %	60 %	0 %	40 %	408400883
114	NC_018712	GACAT	2	10	169047	169056	40 %	20 %	20 %	20 %	408400884
115	NC_018712	AACTT	2	10	172083	172092	40 %	40 %	0 %	20 %	408400887
116	NC_018712	TTGTC	2	10	172537	172546	0 %	60 %	20 %	20 %	408400888
117	NC_018712	AGCAG	2	10	173144	173153	40 %	0 %	40 %	20 %	408400889
118	NC_018712	AAGCC	2	10	174489	174498	40 %	0 %	20 %	40 %	408400890
119	NC_018712	ACCAT	2	10	179091	179100	40 %	20 %	0 %	40 %	408400894
120	NC_018712	TTGTC	2	10	179925	179934	0 %	60 %	20 %	20 %	408400895
121	NC_018712	GAAAA	2	10	180030	180039	80 %	0 %	20 %	0 %	408400895
122	NC_018712	TGTTT	2	10	181598	181607	0 %	80 %	20 %	0 %	408400896
123	NC_018712	CCAAT	2	10	181637	181646	40 %	20 %	0 %	40 %	408400896
124	NC_018712	TTTAT	2	10	184304	184313	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018712	TCATG	2	10	185278	185287	20 %	40 %	20 %	20 %	408400899
126	NC_018712	GCTTG	2	10	185666	185675	0 %	40 %	40 %	20 %	408400900
127	NC_018712	AGTAT	2	10	186074	186083	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018712	ACTTG	2	10	186214	186223	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_018712	TTGGT	2	10	186727	186736	0 %	60 %	40 %	0 %	408400901
130	NC_018712	TTTAC	2	10	188535	188544	20 %	60 %	0 %	20 %	408400902
131	NC_018712	AGATA	2	10	188671	188680	60 %	20 %	20 %	0 %	408400902
132	NC_018712	TAAGT	2	10	189658	189667	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018712	AAGTA	2	10	189800	189809	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018712	TTGCT	2	10	190074	190083	0 %	60 %	20 %	20 %	408400903
135	NC_018712	CAAAT	2	10	190556	190565	60 %	20 %	0 %	20 %	408400903
136	NC_018712	ATTTT	2	10	190711	190720	20 %	80 %	0 %	0 %	408400904
137	NC_018712	GCTGC	2	10	192147	192156	0 %	20 %	40 %	40 %	408400905
138	NC_018712	GAGCT	2	10	193834	193843	20 %	20 %	40 %	20 %	408400907
139	NC_018712	GAGCA	2	10	197316	197325	40 %	0 %	40 %	20 %	408400910
140	NC_018712	CCGCT	2	10	197602	197611	0 %	20 %	20 %	60 %	408400910
141	NC_018712	TTAAG	2	10	198904	198913	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018712	TGCTA	2	10	199447	199456	20 %	40 %	20 %	20 %	408400912
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151	NC_018712	TGAAG	2	10	206274	206283	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018712	CCTTT	2	10	208339	208348	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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155	NC_018712	AAGTT	2	10	214603	214612	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018712	AGTTG	2	10	215208	215217	20 %	40 %	40 %	0 %	408400924
157	NC_018712	TTTGG	2	10	215353	215362	0 %	60 %	40 %	0 %	408400924
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161	NC_018712	ACCAG	2	10	222553	222562	40 %	0 %	20 %	40 %	408400927
162	NC_018712	GCTGT	2	10	222747	222756	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
163	NC_018712	CTGAC	2	10	223636	223645	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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195	NC_018712	GACTT	2	10	273402	273411	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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235	NC_018712	TGAAA	2	10	319303	319312	60 %	20 %	20 %	0 %	408401014
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261	NC_018712	TTGAC	2	10	349954	349963	20 %	40 %	20 %	20 %	408401040
262	NC_018712	CAAAA	2	10	352283	352292	80 %	0 %	0 %	20 %	408401041
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264	NC_018712	ACACA	2	10	353771	353780	60 %	0 %	0 %	40 %	408401042
265	NC_018712	TACAA	2	10	356255	356264	60 %	20 %	0 %	20 %	408401044
266	NC_018712	TCGTG	2	10	360170	360179	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
267	NC_018712	GTTAA	2	10	360931	360940	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
268	NC_018712	GGGAG	2	10	361450	361459	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
269	NC_018712	AGGGA	2	10	363661	363670	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
270	NC_018712	AAAAG	2	10	364350	364359	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
271	NC_018712	AAGCG	2	10	364739	364748	40 %	0 %	40 %	20 %	408401046
272	NC_018712	TTGAA	2	10	366134	366143	40 %	40 %	20 %	0 %	408401049
273	NC_018712	GATGA	2	10	366349	366358	40 %	20 %	40 %	0 %	408401049
274	NC_018712	TATCA	2	10	366689	366698	40 %	40 %	0 %	20 %	408401049
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283	NC_018712	ATAGA	2	10	380014	380023	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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388	NC_018712	ACTTT	2	10	516163	516172	20 %	60 %	0 %	20 %	408401198
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392	NC_018712	TGCTC	2	10	519615	519624	0 %	40 %	20 %	40 %	408401200
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400	NC_018712	GTAAT	2	10	527978	527987	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
401	NC_018712	AAAGG	2	10	528541	528550	60 %	0 %	40 %	0 %	408401208
402	NC_018712	TCAAA	2	10	532508	532517	60 %	20 %	0 %	20 %	408401212
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405	NC_018712	ACTTG	2	10	536789	536798	20 %	40 %	20 %	20 %	408401215
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