MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis RE378

Total Repeats: 367

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018712	ATATA	2	10	18599	18608	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018712	TCGTG	2	10	20424	20433	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018712	GTTAA	2	10	21185	21194	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018712	GGGAG	2	10	21704	21713	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018712	AGGGA	2	10	23913	23922	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018712	GCTTA	2	10	24285	24294	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018712	TTAAT	2	10	24922	24931	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018712	TAAAA	2	10	26196	26205	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018712	GTTCT	2	10	28133	28142	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018712	ATGAA	2	10	30299	30308	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018712	TCGTT	2	10	44618	44627	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018712	AAAAG	2	10	45215	45224	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018712	ATTGA	2	10	48738	48747	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018712	GTCAA	2	10	63833	63842	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018712	AAGGA	2	10	71163	71172	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018712	AGCAT	2	10	71940	71949	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018712	GTTTC	2	10	78488	78497	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018712	ACTTG	2	10	82568	82577	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018712	TCGTG	2	10	83968	83977	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018712	GTTAA	2	10	84729	84738	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018712	GGGAG	2	10	85248	85257	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018712	AGGGA	2	10	87459	87468	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018712	GCTTA	2	10	87833	87842	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018712	TATAT	2	10	88192	88201	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018712	ATATT	2	10	88812	88821	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018712	TTGGA	2	10	89080	89089	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018712	TCTGC	2	10	91945	91954	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_018712	TGATA	2	10	117781	117790	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018712	ACTAT	2	10	120261	120270	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_018712	ACGTT	2	10	127250	127259	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018712	TTAAG	2	10	135464	135473	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018712	AAATC	2	10	137096	137105	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018712	GGCGG	2	10	147836	147845	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018712	AAAGA	2	10	159284	159293	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018712	CTTTT	2	10	163338	163347	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018712	TTTAT	2	10	184304	184313	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018712	AGTAT	2	10	186074	186083	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018712	ACTTG	2	10	186214	186223	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018712	TAAGT	2	10	189658	189667	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018712	AAGTA	2	10	189800	189809	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018712	TTAAG	2	10	198904	198913	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018712	TGAAG	2	10	206274	206283	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018712	CCTTT	2	10	208339	208348	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_018712	AAGTT	2	10	214603	214612	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018712	GCTGT	2	10	222747	222756	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018712	CTGAC	2	10	223636	223645	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_018712	CTTTT	2	10	234413	234422	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018712	AGTTT	2	10	256380	256389	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018712	ACTTG	2	10	256662	256671	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018712	TAAAA	2	10	271483	271492	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018712	TGCAT	2	10	271894	271903	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018712	CTTCA	2	10	272055	272064	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_018712	GACTT	2	10	273402	273411	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_018712	ATTAT	2	10	273573	273582	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018712	TAAAA	2	10	278910	278919	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018712	AAAGC	2	10	284966	284975	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018712	ATGAA	2	10	285163	285172	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018712	ATGAA	2	10	285914	285923	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018712	TTTCC	2	10	290897	290906	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_018712	GTTTT	2	10	297111	297120	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018712	AGTTA	2	10	297824	297833	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018712	ATCAC	2	10	303741	303750	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_018712	AGTTT	2	10	305697	305706	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018712	TCGTG	2	10	307286	307295	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_018712	GTTAA	2	10	308047	308056	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018712	GGGAG	2	10	308566	308575	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018712	AGGGA	2	10	310777	310786	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018712	AAAAG	2	10	311466	311475	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018712	CTAGT	2	10	317611	317620	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_018712	AAAAC	2	10	317720	317729	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018712	CATAT	2	10	331099	331108	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018712	AATGA	2	10	340796	340805	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018712	TCGTG	2	10	360170	360179	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018712	GTTAA	2	10	360931	360940	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018712	GGGAG	2	10	361450	361459	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018712	AGGGA	2	10	363661	363670	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018712	AAAAG	2	10	364350	364359	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018712	CTAAA	2	10	378983	378992	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018712	ATAGA	2	10	380014	380023	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018712	ATTAT	2	10	385709	385718	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018712	AGGAG	2	10	391677	391686	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018712	ATAGA	2	10	394966	394975	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018712	TGTGT	2	10	399001	399010	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018712	ACTTG	2	10	419872	419881	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_018712	TGCTA	2	10	421004	421013	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018712	CAGGG	2	10	421024	421033	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
87	NC_018712	TATTC	2	10	431266	431275	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_018712	GATTT	2	10	432234	432243	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018712	ACTAA	2	10	436330	436339	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_018712	TGATT	2	10	436358	436367	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018712	GAAAA	2	10	456153	456162	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018712	TAAAA	2	10	456300	456309	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018712	CAAGG	2	10	459894	459903	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_018712	AAGTT	2	10	460099	460108	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018712	TTAGC	2	10	464190	464199	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018712	AGGAT	2	10	475334	475343	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018712	CAAAG	2	10	476319	476328	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_018712	ATGTG	2	10	476484	476493	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018712	TGAGA	2	10	479014	479023	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018712	TTGAT	2	10	479037	479046	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018712	GTTTT	2	10	483717	483726	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018712	TTATA	2	10	484467	484476	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018712	AAATC	2	10	491814	491823	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_018712	AAGGA	2	10	502813	502822	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018712	GATAG	2	10	502847	502856	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018712	ATAAA	2	10	504865	504874	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018712	ACTCT	2	10	505102	505111	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_018712	AAGTA	2	10	505805	505814	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018712	AGAGT	2	10	505921	505930	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018712	AATGT	2	10	506148	506157	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018712	TAGAG	2	10	508375	508384	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018712	TAGGC	2	10	512996	513005	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_018712	GCTTG	2	10	519125	519134	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018712	GTAAT	2	10	527978	527987	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018712	TAAAA	2	10	555510	555519	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018712	TTATT	2	10	561510	561519	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018712	ATAAA	2	10	576152	576161	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018712	TCCTT	2	10	590028	590037	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_018712	TTTCC	2	10	597100	597109	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_018712	AAAAT	2	10	597183	597192	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018712	AGAAA	2	10	597238	597247	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018712	TATAT	2	10	600630	600639	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018712	TATAA	2	10	600814	600823	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018712	ATTGA	2	10	611143	611152	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018712	AAGAG	2	10	611178	611187	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018712	TTATA	2	10	617253	617262	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018712	ATTCA	2	10	623261	623270	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_018712	GGAAT	2	10	626901	626910	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018712	ATAGA	2	10	628632	628641	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018712	TTATT	2	10	647648	647657	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018712	CTAAA	2	10	653191	653200	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_018712	ATAAA	2	10	654467	654476	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018712	TGATA	2	10	667672	667681	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018712	CATCT	2	10	674681	674690	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_018712	CTTAA	2	10	674772	674781	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018712	TTGAG	2	10	679248	679257	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018712	ACTTG	2	10	680741	680750	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_018712	TAAAA	2	10	684310	684319	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018712	AAATC	2	10	685115	685124	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_018712	AACGC	2	10	685220	685229	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_018712	CTTGT	2	10	694309	694318	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_018712	AAGGT	2	10	694902	694911	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018712	TCTTT	2	10	696579	696588	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_018712	GAATA	2	10	720803	720812	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018712	AGGGA	2	10	727272	727281	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018712	TATCT	2	10	729295	729304	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_018712	TATAA	2	10	738030	738039	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018712	CGCTC	2	10	746300	746309	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
149	NC_018712	GAAGG	2	10	751914	751923	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018712	ACTTG	2	10	770743	770752	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_018712	TATGA	2	10	779183	779192	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018712	ACTTG	2	10	788090	788099	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
153	NC_018712	ATTTA	2	10	788957	788966	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018712	GTCTT	2	10	792609	792618	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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156	NC_018712	AAAAG	2	10	796726	796735	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018712	AGAGG	2	10	796849	796858	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018712	TGAAA	2	10	806720	806729	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018712	AGATT	2	10	806730	806739	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_018712	CATTT	2	10	853324	853333	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
163	NC_018712	CCAAG	2	10	856271	856280	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
164	NC_018712	TTGAC	2	10	857052	857061	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
165	NC_018712	TCATG	2	10	857069	857078	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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167	NC_018712	ACTTG	2	10	861158	861167	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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170	NC_018712	TTAAA	2	10	913784	913793	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_018712	TTTCA	2	10	918248	918257	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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184	NC_018712	TATAA	2	10	969673	969682	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_018712	GTCCC	2	10	971308	971317	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
186	NC_018712	AACAG	2	10	976258	976267	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_018712	ATGAT	2	10	1011572	1011581	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_018712	AATAA	2	10	1031778	1031787	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_018712	TTATT	2	10	1039583	1039592	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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364	NC_018712	CAATA	2	10	2146624	2146633	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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366	NC_018712	AAAAG	2	10	2148939	2148948	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.