MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni PT14 chromosome

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018709	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018709	AATTTA	2	12	19355	19366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018709	ATTTAT	2	12	39433	39444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018709	TAAAAT	2	12	96507	96518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018709	AAATAA	2	12	146317	146328	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018709	ATTTTT	2	12	165490	165501	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018709	ATATTA	2	12	172519	172530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018709	AATATT	2	12	172661	172672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018709	GTTTAT	2	12	206372	206383	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018709	AAAATT	2	12	208740	208751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018709	TATTTT	2	12	209015	209026	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018709	TTAATT	2	12	223898	223909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018709	TATATT	2	12	224471	224482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018709	AAAAAT	2	12	225881	225892	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018709	TATATT	2	12	240627	240638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018709	TATAAA	2	12	240765	240776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018709	AAAATT	2	12	268776	268787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018709	TATTTT	2	12	363985	363996	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018709	TGTGTT	2	12	371384	371395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018709	TTTATA	2	12	395810	395821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018709	TTTATT	2	12	399532	399543	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018709	TAAGGA	2	12	413074	413085	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018709	TTTTAT	2	12	448233	448244	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018709	AGTTAG	2	12	450817	450828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018709	AAAAGA	2	12	451430	451441	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018709	ATTTGT	2	12	451529	451540	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018709	ATTTTT	2	12	451795	451806	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018709	AAAAGG	2	12	451876	451887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018709	AATTTA	2	12	477450	477461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018709	GTTTTT	2	12	485949	485960	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018709	AAAATA	2	12	493814	493825	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018709	TTTTAA	2	12	522400	522411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018709	CCTTAT	2	12	527048	527059	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018709	ATATTT	2	12	578032	578043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018709	ATATAA	2	12	587606	587617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018709	TAATAG	2	12	618078	618089	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018709	ATTTAA	2	12	627021	627032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018709	TACAAA	2	12	629225	629236	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018709	TTTATT	2	12	637159	637170	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018709	TAAATT	2	12	637228	637239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018709	ATTTTT	2	12	643409	643420	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018709	TTTTCT	2	12	648343	648354	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018709	TTGCCT	2	12	648958	648969	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018709	ATAATT	2	12	670886	670897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018709	TTAAAT	2	12	690468	690479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018709	TAACTT	2	12	696524	696535	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018709	AATTTA	2	12	697069	697080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018709	TTTATA	2	12	699944	699955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018709	TCTTAT	2	12	703621	703632	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018709	GGGTTG	2	12	703978	703989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018709	GTTTGG	2	12	704160	704171	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018709	AATTAA	2	12	705464	705475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018709	TCAAAA	2	12	705496	705507	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018709	TTAGCT	2	12	705945	705956	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018709	CTTCTA	2	12	705963	705974	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018709	AAATTT	2	12	770412	770423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018709	AATTTT	2	12	783710	783721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018709	ATATTT	2	12	807695	807706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018709	AAATTA	2	12	811488	811499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018709	ACAAAG	2	12	824356	824367	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018709	TTTTTA	2	12	826833	826844	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018709	AATAAA	2	12	873228	873239	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018709	AAAAAT	2	12	873885	873896	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018709	ATCTTA	2	12	902089	902100	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_018709	ATCTTA	2	12	907304	907315	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018709	TATAAA	2	12	907561	907572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018709	ATCTTA	2	12	907587	907598	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018709	ATTTTA	2	12	1029709	1029720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018709	TTAATT	2	12	1128561	1128572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018709	TTAATT	2	12	1156548	1156559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018709	ATTTTT	2	12	1169479	1169490	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018709	TACAAT	2	12	1189195	1189206	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_018709	AATTTT	2	12	1191804	1191815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018709	CTTTAT	2	12	1239799	1239810	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_018709	CAAAAA	2	12	1311831	1311842	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018709	TTAATT	2	12	1321881	1321892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018709	TTTACT	2	12	1325182	1325193	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018709	AAATGA	2	12	1325793	1325804	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018709	AAAGAA	2	12	1325809	1325820	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018709	TATGGA	2	12	1327910	1327921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018709	ACTTGA	2	12	1328258	1328269	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018709	AAAAGA	2	12	1328966	1328977	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018709	ATTATG	2	12	1364557	1364568	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018709	ATCGCC	2	12	1387500	1387511	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018709	TATAAT	2	12	1453212	1453223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018709	TTGCTT	2	12	1453813	1453824	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018709	AAAAAT	2	12	1486276	1486287	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018709	TAAAAA	2	12	1519644	1519655	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018709	ATTTTT	2	12	1577824	1577835	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018709	ATATAA	2	12	1591324	1591335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018709	TAAAAA	2	12	1620764	1620775	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018709	TAAAAT	2	12	1631704	1631715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018709	AAGCCT	2	12	1631808	1631819	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.