MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni PT14 chromosome

Total Repeats: 441

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018709	AAAT	2	8	1339	1346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018709	ATTT	3	12	8039	8050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018709	AAAT	2	8	15742	15749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018709	TTTA	2	8	18070	18077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018709	TGAT	2	8	25626	25633	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018709	AAGG	2	8	27970	27977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018709	TTAT	2	8	35888	35895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018709	CCCG	2	8	37021	37028	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_018709	CTAT	2	8	37499	37506	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018709	ATTT	2	8	39373	39380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018709	CAAG	2	8	39522	39529	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018709	TAGC	2	8	40188	40195	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018709	CTTA	2	8	40850	40857	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018709	AAAG	2	8	40921	40928	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018709	AGTA	2	8	40981	40988	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018709	TAAT	2	8	41104	41111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018709	GGAT	2	8	41374	41381	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018709	GGTG	2	8	41459	41466	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018709	TCCC	2	8	41601	41608	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_018709	TCGT	2	8	42149	42156	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018709	ATTT	2	8	43157	43164	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018709	AGGA	2	8	49899	49906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018709	TAAA	2	8	57061	57068	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018709	TAAA	2	8	61915	61922	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018709	TAAA	2	8	67122	67129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018709	TATT	2	8	67359	67366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018709	ATTT	2	8	67400	67407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018709	AGAA	2	8	67487	67494	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018709	AATT	2	8	68982	68989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018709	AAAT	2	8	70637	70644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018709	GTTT	2	8	72301	72308	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018709	TATT	2	8	73924	73931	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018709	ATTT	2	8	80218	80225	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018709	AAAT	2	8	80251	80258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018709	TTTA	2	8	82420	82427	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018709	TTTA	2	8	83725	83732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018709	TAAA	2	8	89321	89328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018709	AATT	2	8	95471	95478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018709	ATTT	2	8	95518	95525	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018709	TAAA	2	8	95527	95534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018709	TAAA	2	8	96348	96355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018709	AGGA	2	8	101155	101162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018709	ATTA	2	8	119141	119148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018709	AAGG	2	8	133457	133464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018709	ATTT	2	8	146309	146316	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018709	ATTA	2	8	146480	146487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018709	CTTT	2	8	151824	151831	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018709	CAAA	2	8	165414	165421	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_018709	TTAA	2	8	165449	165456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018709	AAAT	2	8	165465	165472	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018709	TAAA	2	8	166070	166077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018709	GTAT	2	8	167370	167377	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018709	AATT	2	8	167532	167539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018709	TTTA	2	8	167573	167580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018709	AAGT	2	8	167591	167598	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018709	ATTT	2	8	193451	193458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018709	TTTA	2	8	195848	195855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018709	AAGA	2	8	197280	197287	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018709	TGAT	2	8	205727	205734	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018709	TAAA	2	8	205843	205850	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018709	ATCA	2	8	206488	206495	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018709	CAAG	2	8	207134	207141	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018709	TTTA	2	8	207440	207447	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018709	AAAT	2	8	208497	208504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018709	CAAG	2	8	208820	208827	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_018709	TAAA	2	8	213264	213271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018709	TAAA	2	8	213317	213324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018709	TAAA	2	8	218257	218264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018709	TAAA	2	8	219078	219085	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018709	GGTT	2	8	219165	219172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018709	TTTA	2	8	223925	223932	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018709	ATTA	3	12	224523	224534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018709	TTGA	2	8	228416	228423	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018709	TAAT	2	8	228435	228442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018709	ATTT	2	8	228635	228642	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018709	ATTA	2	8	228722	228729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018709	TAAA	2	8	231557	231564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018709	TTTG	2	8	231590	231597	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018709	GTTT	2	8	245009	245016	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018709	GATT	2	8	245141	245148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018709	AAAT	2	8	254703	254710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018709	CTTT	2	8	264653	264660	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018709	TTAA	2	8	266358	266365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018709	ATTG	2	8	267189	267196	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018709	GCAA	2	8	267284	267291	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018709	ATCC	2	8	267846	267853	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_018709	ATGA	2	8	272961	272968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018709	AAGT	2	8	272971	272978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018709	AATA	2	8	293709	293716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018709	AAAG	2	8	301622	301629	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018709	TAAA	2	8	302016	302023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018709	TTTA	2	8	302868	302875	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018709	TAAA	2	8	313931	313938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018709	ATTT	2	8	315159	315166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018709	TAAA	2	8	323891	323898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018709	ATAA	2	8	325673	325680	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018709	ATTA	2	8	325712	325719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018709	TTTA	2	8	325749	325756	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018709	TAAA	2	8	330587	330594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018709	TATT	2	8	339131	339138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018709	TTTA	2	8	371375	371382	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018709	TAAA	2	8	380587	380594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018709	AAGG	2	8	383215	383222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018709	TTTA	2	8	383650	383657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018709	ATTA	2	8	386859	386866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018709	TTTA	2	8	386901	386908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018709	AAGT	2	8	388229	388236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018709	AATT	2	8	388243	388250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018709	AATT	2	8	388277	388284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018709	CTAT	2	8	393868	393875	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018709	ATTT	2	8	395742	395749	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018709	CAAG	2	8	395898	395905	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_018709	TAGC	2	8	396564	396571	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_018709	CTTA	2	8	397226	397233	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018709	AAAG	2	8	397297	397304	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018709	AGTA	2	8	397357	397364	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018709	TAAT	2	8	397480	397487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018709	GGAT	2	8	397750	397757	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018709	GGTG	2	8	397835	397842	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018709	TCCC	2	8	397977	397984	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
121	NC_018709	TCGT	2	8	398525	398532	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_018709	GAAA	2	8	399269	399276	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018709	TTAC	2	8	399505	399512	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_018709	GATA	2	8	403576	403583	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018709	TTAA	2	8	404772	404779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018709	TTAA	2	8	404793	404800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018709	ATTT	2	8	404889	404896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018709	ATCT	2	8	404907	404914	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_018709	GTTT	2	8	404995	405002	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018709	TTAA	2	8	412014	412021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018709	AATT	2	8	412083	412090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018709	TTGA	2	8	412686	412693	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018709	AACT	2	8	413042	413049	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_018709	GATT	2	8	413179	413186	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018709	CAAG	2	8	413207	413214	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_018709	TTTG	2	8	413338	413345	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018709	ATTT	2	8	413366	413373	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018709	GAAG	2	8	414143	414150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018709	ATAA	2	8	414248	414255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018709	AAAT	2	8	418136	418143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018709	ATTT	2	8	433692	433699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018709	ATTT	2	8	434132	434139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018709	ATTT	2	8	451018	451025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018709	AAAT	2	8	451612	451619	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018709	GTAA	2	8	456918	456925	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018709	AAAG	2	8	456960	456967	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018709	TCAT	2	8	457363	457370	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_018709	TAAA	2	8	469297	469304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018709	TTTA	2	8	477006	477013	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018709	CTTT	2	8	477407	477414	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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152	NC_018709	GCTA	2	8	485759	485766	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.