MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidovorax sp. KKS102 chromosome

Total Repeats: 172

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018708	TGGCGC	2	12	15159	15170	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018708	GGCATG	2	12	16209	16220	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018708	CACGCG	2	12	24423	24434	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018708	AGGCCC	2	12	29054	29065	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018708	GATCAA	2	12	85015	85026	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018708	TCCGCT	2	12	98012	98023	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018708	CAGGGG	2	12	131816	131827	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018708	GTCTGC	2	12	134288	134299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018708	GGATGG	2	12	150822	150833	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018708	GGTGAA	2	12	237396	237407	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018708	TTTTGT	2	12	239816	239827	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018708	GCGCTG	2	12	279796	279807	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018708	GCAGGG	2	12	313043	313054	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018708	GCCCAG	2	12	391806	391817	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018708	TTTGCA	2	12	425808	425819	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018708	GCATAT	2	12	464771	464782	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018708	GGGCAG	2	12	498966	498977	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018708	AACCGC	2	12	523968	523979	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018708	CTGGGG	2	12	559768	559779	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018708	TTGCCC	2	12	589028	589039	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018708	CATTCG	2	12	596947	596958	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018708	CGCTGG	3	18	606576	606593	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018708	GATCAA	2	12	685415	685426	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018708	CACCGT	2	12	687542	687553	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018708	AACGTG	2	12	688449	688460	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018708	CACAGG	2	12	688592	688603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018708	CACCGG	2	12	690038	690049	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018708	ACCCTG	2	12	690396	690407	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018708	GACGGC	2	12	690540	690551	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018708	TGTTTT	2	12	723659	723670	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018708	GCACCT	2	12	792010	792021	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018708	GCGGGC	2	12	792620	792631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018708	GATCAA	2	12	803028	803039	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018708	GCGATG	2	12	833988	833999	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018708	CCACCG	2	12	838814	838825	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_018708	TGGGGC	2	12	851911	851922	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018708	CATCGA	2	12	864321	864332	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018708	CGCTGG	2	12	909714	909725	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018708	CACCCT	2	12	918037	918048	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_018708	GCCTGG	2	12	922463	922474	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018708	TTGTAG	2	12	944857	944868	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018708	AGTGTC	2	12	954608	954619	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018708	GGCAAA	2	12	955377	955388	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018708	ATGGTG	2	12	955468	955479	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018708	TCACGG	2	12	967429	967440	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018708	TGGGCT	2	12	1004044	1004055	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018708	AGGGCT	2	12	1004056	1004067	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018708	ACGGAG	2	12	1038322	1038333	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018708	TCAACG	2	12	1044337	1044348	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018708	AGCCGC	2	12	1053280	1053291	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_018708	CTAGCG	2	12	1127186	1127197	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018708	GGTGGA	2	12	1144958	1144969	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018708	CAATCA	2	12	1150224	1150235	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018708	GGGGAC	2	12	1152198	1152209	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018708	CGGCCA	2	12	1153255	1153266	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018708	GAGCGC	2	12	1184181	1184192	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018708	TTTTTG	2	12	1205904	1205915	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018708	CACTGC	2	12	1220387	1220398	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018708	CTAGCG	2	12	1226572	1226583	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018708	CGGATG	2	12	1297075	1297086	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018708	GCCCGC	2	12	1301502	1301513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_018708	GATGGA	2	12	1306397	1306408	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018708	CAGCGA	2	12	1307759	1307770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018708	CCAGCG	2	12	1314109	1314120	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018708	GCTTCA	2	12	1342798	1342809	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018708	CATGCT	2	12	1363288	1363299	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018708	GCCGTG	2	12	1363404	1363415	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018708	CCAGGC	2	12	1388219	1388230	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018708	CAGCGC	2	12	1487606	1487617	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018708	CTAGCG	2	12	1516897	1516908	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018708	GCCCTG	2	12	1546451	1546462	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018708	GGTGCT	2	12	1608784	1608795	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_018708	GGTGAC	2	12	1726757	1726768	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_018708	CACGGC	2	12	1739007	1739018	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018708	CGGCAG	2	12	1772103	1772114	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018708	CTGCAC	2	12	1772974	1772985	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018708	GGCGTG	4	24	1776386	1776409	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018708	GCGTTC	2	12	1783661	1783672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018708	CACAAC	2	12	1787297	1787308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018708	TTCCTG	2	12	1881113	1881124	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018708	GCGCAG	2	12	2068790	2068801	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018708	CTGCGC	2	12	2068904	2068915	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018708	TGTAGG	2	12	2069761	2069772	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018708	GCGCAC	2	12	2109089	2109100	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018708	TTTGCG	2	12	2111989	2112000	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018708	TATCAA	2	12	2122341	2122352	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018708	CAGTGC	2	12	2122949	2122960	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018708	GCGCCT	2	12	2132751	2132762	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018708	GGGCCG	2	12	2188066	2188077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018708	GCCACG	2	12	2201507	2201518	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018708	TCGCTG	2	12	2502604	2502615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018708	CTTTCC	2	12	2600868	2600879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_018708	GCAAGA	2	12	2727604	2727615	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018708	CCGAAC	2	12	2739952	2739963	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018708	CGGTGT	2	12	2746994	2747005	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018708	TGCAAA	2	12	2836842	2836853	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_018708	TCAATA	2	12	2841814	2841825	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018708	CGGCAT	2	12	2892799	2892810	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018708	CCAGCG	2	12	2892984	2892995	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018708	CAGCGC	2	12	2923598	2923609	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
101	NC_018708	ATCGGT	2	12	2937709	2937720	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_018708	CAGCAT	2	12	2956140	2956151	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018708	AGCCGC	2	12	2962275	2962286	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_018708	AGGTCA	2	12	2999044	2999055	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_018708	TGCCTC	2	12	3002181	3002192	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018708	GTATCC	2	12	3019579	3019590	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018708	CGAGGC	2	12	3025935	3025946	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018708	ATCAAC	2	12	3026332	3026343	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018708	GTTACC	2	12	3063059	3063070	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018708	TGGTAT	2	12	3073266	3073277	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018708	TGTAGG	2	12	3076292	3076303	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018708	GCGCAG	2	12	3097218	3097229	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018708	CCAGCA	2	12	3097336	3097347	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018708	GCGTTA	2	12	3097617	3097628	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018708	AGCCCT	2	12	3111198	3111209	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018708	GCTGTC	2	12	3186110	3186121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018708	GGTTCG	2	12	3191017	3191028	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_018708	TTGGCC	2	12	3238783	3238794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018708	CTGCGC	2	12	3239043	3239054	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018708	GGACGC	2	12	3255272	3255283	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018708	CGTTGT	2	12	3312747	3312758	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_018708	GTTAAC	2	12	3333372	3333383	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_018708	CTTTGT	2	12	3335053	3335064	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_018708	CTGCGC	2	12	3361188	3361199	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_018708	CGTTGA	2	12	3362830	3362841	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_018708	GCCTCC	2	12	3371384	3371395	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_018708	TGCGTC	2	12	3404788	3404799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018708	GAATTG	2	12	3422098	3422109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018708	GGCAGG	2	12	3445707	3445718	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_018708	CTGCCA	2	12	3455281	3455292	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
131	NC_018708	TGCCCA	2	12	3473510	3473521	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018708	CTGGTG	2	12	3473623	3473634	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_018708	TATAGT	2	12	3490482	3490493	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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135	NC_018708	CGCAGG	2	12	3651770	3651781	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018708	CTAGCG	2	12	3657065	3657076	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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138	NC_018708	CTAACC	2	12	3743989	3744000	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.