MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidovorax sp. KKS102 chromosome

Total Repeats: 628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018708	CGGCC	2	10	245	254	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_018708	AAGGG	2	10	21789	21798	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018708	TCGCA	2	10	30515	30524	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_018708	CGCAA	2	10	37543	37552	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_018708	TTGCC	2	10	55649	55658	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_018708	CCGCC	2	10	55668	55677	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
7	NC_018708	CCTCT	2	10	78465	78474	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_018708	GGCGC	2	10	84660	84669	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_018708	GGGAT	2	10	91074	91083	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018708	TGCGC	2	10	93467	93476	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_018708	GCGGT	2	10	94440	94449	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018708	TGCGG	2	10	97851	97860	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018708	CGGGC	2	10	98096	98105	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_018708	CGCTG	2	10	98775	98784	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_018708	CAGGG	2	10	99987	99996	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018708	CCTTT	2	10	102693	102702	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_018708	CTGCG	2	10	103826	103835	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_018708	ACACC	2	10	114508	114517	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_018708	GGCAA	2	10	126852	126861	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018708	CACGC	2	10	135068	135077	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_018708	GAAGC	2	10	143298	143307	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018708	TTGCA	2	10	143328	143337	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018708	CGGGG	2	10	145453	145462	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018708	CTCTG	2	10	150905	150914	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_018708	TGCGG	2	10	163411	163420	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018708	CCCGG	2	10	165092	165101	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_018708	CGCTG	2	10	173929	173938	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_018708	TTGCA	2	10	178735	178744	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018708	TCACC	2	10	190615	190624	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
30	NC_018708	GACTT	2	10	197110	197119	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018708	GCCCG	2	10	200462	200471	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_018708	CTGGG	2	10	218966	218975	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018708	CGGTG	2	10	231358	231367	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018708	TAAGT	2	10	243425	243434	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018708	ACAAG	2	10	246743	246752	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018708	CCTGT	2	10	247379	247388	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_018708	GCGCA	2	10	259790	259799	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_018708	GAAAA	2	10	267935	267944	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018708	AGCGC	2	10	279742	279751	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_018708	AGCGC	2	10	280333	280342	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_018708	CGCAG	2	10	298375	298384	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_018708	AACGC	2	10	301872	301881	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_018708	CATCC	2	10	303069	303078	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
44	NC_018708	TGAAT	2	10	325742	325751	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018708	GGGGC	2	10	349242	349251	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018708	TGTGC	2	10	357734	357743	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018708	GGGGC	2	10	362340	362349	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018708	GGCCA	2	10	378373	378382	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_018708	CCTGA	2	10	379047	379056	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_018708	GGCCG	2	10	379151	379160	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51	NC_018708	CCCGG	2	10	391903	391912	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_018708	AAGTA	2	10	396005	396014	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018708	TTTGT	2	10	399574	399583	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018708	CCCCA	2	10	409611	409620	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
55	NC_018708	CGGAC	2	10	416053	416062	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_018708	CTTTT	2	10	419799	419808	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018708	TTCAA	2	10	426941	426950	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_018708	TCGCG	2	10	427048	427057	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_018708	AGGCC	2	10	438587	438596	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_018708	ATGCA	2	10	460287	460296	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018708	GGTAG	2	10	460597	460606	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018708	GGGTC	2	10	476838	476847	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018708	GCGCT	2	10	488193	488202	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_018708	CGGGA	2	10	488211	488220	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_018708	GCCGC	2	10	499043	499052	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
66	NC_018708	GAACA	3	15	501862	501876	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018708	CATCC	2	10	516695	516704	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
68	NC_018708	GGGGC	2	10	525347	525356	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
69	NC_018708	GGTCC	2	10	532193	532202	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_018708	GTGGA	2	10	571347	571356	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018708	GAGAA	2	10	571448	571457	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018708	TCTTG	2	10	582045	582054	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018708	CATCC	2	10	594373	594382	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
74	NC_018708	AATTG	2	10	606491	606500	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018708	GAGCA	2	10	606540	606549	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018708	CCCGG	2	10	610336	610345	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
77	NC_018708	ACACC	2	10	615899	615908	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
78	NC_018708	GCGGG	2	10	624392	624401	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018708	CGGTG	2	10	626000	626009	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_018708	TTGAT	2	10	626122	626131	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018708	ATTGA	2	10	629934	629943	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018708	GAGTG	2	10	640365	640374	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018708	TTCGT	2	10	647109	647118	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018708	TGTCG	2	10	655344	655353	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_018708	CTTTT	2	10	682698	682707	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018708	ACGCC	2	10	684718	684727	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
87	NC_018708	TGGCC	2	10	686870	686879	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NC_018708	ACGGC	2	10	689902	689911	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_018708	TGCGC	2	10	697455	697464	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_018708	CGCCC	2	10	698400	698409	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
91	NC_018708	TTTTC	2	10	702498	702507	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018708	AACCC	2	10	719356	719365	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_018708	TGCGC	2	10	726738	726747	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_018708	AGCGC	2	10	726945	726954	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_018708	GCAGG	2	10	727017	727026	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018708	GATCG	2	10	738219	738228	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_018708	GCTGG	2	10	743304	743313	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
98	NC_018708	CGCAG	2	10	750168	750177	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_018708	CATCC	2	10	754094	754103	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
100	NC_018708	GATTG	2	10	766601	766610	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018708	GTTGG	2	10	786481	786490	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018708	CGCTG	2	10	792046	792055	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_018708	TGCAA	2	10	793050	793059	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_018708	GTGAG	2	10	794919	794928	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018708	GCACG	2	10	800512	800521	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_018708	GGGGC	2	10	803852	803861	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
107	NC_018708	TGGTG	2	10	835413	835422	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018708	TTTCG	2	10	856295	856304	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018708	CAAGG	2	10	857571	857580	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_018708	CGCTG	2	10	863436	863445	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_018708	GCTGG	2	10	864656	864665	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_018708	GCACA	2	10	871414	871423	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_018708	AAGAC	2	10	878352	878361	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018708	GGCCT	2	10	883797	883806	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_018708	GGGAC	2	10	884717	884726	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_018708	CTGCG	2	10	890544	890553	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_018708	CCGCC	2	10	890630	890639	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
118	NC_018708	GGCCT	2	10	890706	890715	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_018708	CGAAG	2	10	890913	890922	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018708	CGCAG	2	10	892719	892728	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_018708	AATTA	2	10	893569	893578	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018708	ATTTC	2	10	899610	899619	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018708	GTGCC	2	10	917012	917021	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_018708	GCCGC	2	10	926474	926483	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
125	NC_018708	AAAAG	2	10	933511	933520	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018708	GGCGG	2	10	933549	933558	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018708	TCGCT	2	10	933740	933749	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_018708	CCGCC	2	10	946392	946401	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
129	NC_018708	GTGGC	2	10	954718	954727	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018708	GGCCT	2	10	955009	955018	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_018708	TTATT	2	10	955805	955814	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018708	TCGGA	2	10	958432	958441	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_018708	GGCTT	2	10	967469	967478	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018708	CGCAA	2	10	977277	977286	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_018708	CGCTG	2	10	988415	988424	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_018708	CAGCG	2	10	991820	991829	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
137	NC_018708	ACTTC	2	10	995980	995989	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_018708	TGAAT	2	10	1009633	1009642	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018708	GCGCC	2	10	1010672	1010681	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
140	NC_018708	CAAAA	2	10	1013938	1013947	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_018708	GCTTG	2	10	1018703	1018712	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_018708	CCCCA	2	10	1032488	1032497	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
143	NC_018708	TCGGA	2	10	1041956	1041965	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_018708	CTGGG	2	10	1042180	1042189	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
145	NC_018708	GGGTG	2	10	1070016	1070025	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018708	GTCCT	2	10	1093684	1093693	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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282	NC_018708	TGTGC	2	10	2043762	2043771	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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285	NC_018708	AGGCA	2	10	2089428	2089437	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
286	NC_018708	GGGCG	2	10	2089474	2089483	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
287	NC_018708	GCCGC	2	10	2097018	2097027	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
288	NC_018708	TTTTG	2	10	2109140	2109149	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
289	NC_018708	TGGCG	2	10	2148113	2148122	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
290	NC_018708	AAGGC	2	10	2172449	2172458	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
291	NC_018708	GAAGG	2	10	2177120	2177129	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
292	NC_018708	CCAGG	2	10	2217167	2217176	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
293	NC_018708	TATTT	2	10	2217279	2217288	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_018708	CTTTT	2	10	2224350	2224359	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
295	NC_018708	GCTGC	2	10	2224834	2224843	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
296	NC_018708	GCCAT	2	10	2229112	2229121	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
297	NC_018708	CGCAT	2	10	2232441	2232450	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
298	NC_018708	TGCCG	2	10	2264238	2264247	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
299	NC_018708	CAATC	2	10	2280769	2280778	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
300	NC_018708	TGCGC	2	10	2282100	2282109	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
301	NC_018708	AGCGC	2	10	2282314	2282323	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
302	NC_018708	CGCTG	2	10	2300159	2300168	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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304	NC_018708	GGGAT	2	10	2314235	2314244	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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313	NC_018708	TGTGG	2	10	2408451	2408460	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_018708	GCCGG	2	10	3189875	3189884	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
401	NC_018708	CAGAC	2	10	3213278	3213287	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
402	NC_018708	CGCCC	2	10	3236070	3236079	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
403	NC_018708	CCCGC	2	10	3237828	3237837	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
404	NC_018708	ACCGC	2	10	3238856	3238865	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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407	NC_018708	GGGAT	2	10	3248128	3248137	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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409	NC_018708	GCGCT	2	10	3271684	3271693	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
410	NC_018708	AGCAT	2	10	3271733	3271742	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
411	NC_018708	GCGAT	2	10	3288206	3288215	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
412	NC_018708	GGGGC	2	10	3289165	3289174	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
413	NC_018708	CGCAG	2	10	3292236	3292245	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
414	NC_018708	CCCAA	2	10	3319164	3319173	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
415	NC_018708	TGCAG	2	10	3321978	3321987	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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419	NC_018708	GCCGG	2	10	3361053	3361062	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
420	NC_018708	CAGGC	2	10	3361200	3361209	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
421	NC_018708	CATCG	2	10	3368686	3368695	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
422	NC_018708	TCTGT	2	10	3386957	3386966	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
423	NC_018708	CACAT	2	10	3419997	3420006	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
424	NC_018708	GGCTT	2	10	3439823	3439832	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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443	NC_018708	TGCCG	2	10	3563463	3563472	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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446	NC_018708	GCCCT	2	10	3572623	3572632	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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460	NC_018708	CGCAT	2	10	3658305	3658314	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
461	NC_018708	CCCTG	2	10	3660561	3660570	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
462	NC_018708	CCGTT	2	10	3665972	3665981	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
463	NC_018708	GTTGC	2	10	3683497	3683506	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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469	NC_018708	GGATT	2	10	3753051	3753060	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
470	NC_018708	CCCTG	2	10	3759865	3759874	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
471	NC_018708	CGTGC	2	10	3765012	3765021	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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474	NC_018708	CGGCC	2	10	3772453	3772462	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
475	NC_018708	TGCGC	2	10	3781115	3781124	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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488	NC_018708	TCGCT	2	10	3878809	3878818	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
489	NC_018708	CGCTG	2	10	3878912	3878921	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
490	NC_018708	AGTTC	2	10	3888745	3888754	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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495	NC_018708	CCCAT	2	10	3965501	3965510	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
496	NC_018708	CGCGC	2	10	3981232	3981241	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
497	NC_018708	CGCGC	2	10	3983217	3983226	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
498	NC_018708	TCCTT	2	10	3992105	3992114	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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500	NC_018708	CACCG	2	10	3995905	3995914	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

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