MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acinetobacter baumannii TYTH-1 chromosome

Total Repeats: 214

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018706	TAATTT	2	12	3284	3295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018706	GTCATG	2	12	3344	3355	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018706	TTCCTG	2	12	5031	5042	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018706	TTTAAA	2	12	5126	5137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018706	ATTTTT	2	12	8082	8093	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018706	TTTATT	2	12	45102	45113	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018706	CTTTTA	2	12	51875	51886	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018706	GTTTTA	2	12	52934	52945	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018706	CAAAAA	2	12	63465	63476	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018706	AAAAAT	2	12	90564	90575	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018706	TGCTTG	2	12	174652	174663	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018706	ATAAAT	2	12	181625	181636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018706	TTTTAT	2	12	185078	185089	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018706	TCTGTA	2	12	192562	192573	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018706	AAAATA	2	12	198132	198143	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018706	TTACGT	2	12	212874	212885	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018706	AGCAAA	2	12	222140	222151	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018706	ATTTTT	2	12	224545	224556	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018706	TAAATT	2	12	228418	228429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018706	TTTAAA	2	12	228628	228639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018706	TTTAAA	2	12	228768	228779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018706	ATTCAT	2	12	231475	231486	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018706	TAAATT	2	12	240948	240959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018706	TAAATT	2	12	241125	241136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018706	CAAAAA	2	12	261755	261766	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018706	GAAATC	2	12	271798	271809	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018706	AGAAAA	2	12	286853	286864	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018706	ATAAAA	2	12	289110	289121	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018706	AAAAAG	2	12	293604	293615	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018706	TATTTT	2	12	296739	296750	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018706	GCATTT	2	12	331105	331116	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018706	TCCTGT	2	12	344727	344738	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018706	TCCTGT	2	12	345908	345919	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018706	TCCTGT	2	12	346813	346824	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018706	AATTTA	2	12	352391	352402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018706	AATTTT	2	12	376757	376768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018706	ATTAAA	2	12	377826	377837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018706	TTTATG	2	12	377944	377955	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018706	TAATTA	2	12	378389	378400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018706	TTTCAT	2	12	413421	413432	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018706	ATTGAC	2	12	415627	415638	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018706	AATTTT	2	12	436528	436539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018706	TGCACC	2	12	438293	438304	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018706	TGCCAA	2	12	438908	438919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018706	TACAGA	2	12	441197	441208	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018706	ATTTAT	2	12	452134	452145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018706	ACAAGC	2	12	459106	459117	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018706	GATATT	2	12	515052	515063	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018706	CCACAT	2	12	538543	538554	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018706	GGACGA	2	12	538617	538628	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018706	TCAGAA	2	12	613675	613686	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018706	ATTTTT	2	12	622136	622147	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018706	ATAAAT	2	12	641528	641539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018706	ACTCAA	2	12	650696	650707	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018706	TATAAA	2	12	699194	699205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018706	ATTCAT	2	12	714412	714423	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018706	CGTAAG	2	12	731349	731360	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018706	GTTTTT	2	12	738907	738918	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018706	AATTTT	2	12	750784	750795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018706	TCAAAA	2	12	776090	776101	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018706	TAAATA	2	12	871360	871371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018706	TAAAAT	2	12	872899	872910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018706	GAAATC	2	12	942969	942980	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_018706	TAAAAA	2	12	999343	999354	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018706	TAAAAT	2	12	1013565	1013576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018706	ATTCTT	2	12	1021073	1021084	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_018706	AATTTA	2	12	1042723	1042734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018706	AAAGAA	2	12	1083494	1083505	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018706	AATTTA	2	12	1123192	1123203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018706	AACTAT	2	12	1180454	1180465	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_018706	ACTTTT	2	12	1230672	1230683	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_018706	TATAAT	2	12	1230718	1230729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018706	GTTACT	2	12	1288740	1288751	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_018706	AACGTA	2	12	1288795	1288806	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_018706	TTGATA	2	12	1290454	1290465	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018706	TAAATA	2	12	1335772	1335783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018706	ATATTT	2	12	1335790	1335801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018706	AAAACA	2	12	1357862	1357873	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018706	AGAATT	2	12	1399961	1399972	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018706	TAAAAA	2	12	1409353	1409364	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018706	TTTTAT	2	12	1409385	1409396	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018706	TATTTT	2	12	1413895	1413906	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018706	ATTTTG	2	12	1428517	1428528	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018706	TTTTAA	2	12	1437523	1437534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018706	ATATTT	2	12	1437717	1437728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018706	TAAAAA	2	12	1462660	1462671	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018706	CTTTTT	2	12	1462825	1462836	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_018706	CAATGT	2	12	1488279	1488290	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018706	TTTGTG	2	12	1499073	1499084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018706	TTTTAA	2	12	1573433	1573444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018706	GAAATG	2	12	1584287	1584298	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018706	AGGGCA	2	12	1585035	1585046	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018706	AAATAT	2	12	1585302	1585313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018706	CATTAA	2	12	1609404	1609415	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_018706	GTGATT	2	12	1609671	1609682	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018706	TAAATA	2	12	1629733	1629744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018706	AAAGTG	2	12	1648698	1648709	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018706	TAAAAA	2	12	1668934	1668945	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018706	AAATTG	2	12	1674220	1674231	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018706	GCCTGG	2	12	1677861	1677872	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018706	CAATTA	2	12	1680863	1680874	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_018706	TAAAAA	2	12	1685866	1685877	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018706	TCAATA	2	12	1687863	1687874	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_018706	TACCTT	2	12	1703289	1703300	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018706	TAATCA	2	12	1718313	1718324	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018706	ATTGAG	2	12	1718362	1718373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018706	CATTTG	2	12	1744735	1744746	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_018706	TTATTT	2	12	1759782	1759793	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018706	AAATTT	2	12	1810168	1810179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018706	TAAAAA	2	12	1832356	1832367	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018706	TGTTTT	2	12	1892950	1892961	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018706	TAAAAT	2	12	1913171	1913182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018706	TAAGTG	2	12	1938227	1938238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018706	AGATAA	2	12	1943752	1943763	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018706	TAAAAA	2	12	1944998	1945009	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018706	AAAAAT	2	12	1945154	1945165	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018706	TAAAAA	2	12	1973647	1973658	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018706	ATATAG	2	12	1997025	1997036	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018706	AAATAA	2	12	1997250	1997261	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018706	TAATCA	2	12	2006325	2006336	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_018706	TTATTT	2	12	2015734	2015745	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018706	TTTAAT	2	12	2030372	2030383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018706	CTTGAG	2	12	2031655	2031666	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_018706	ATTTGT	2	12	2053805	2053816	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018706	TAATAT	2	12	2126307	2126318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018706	ATTGTT	2	12	2136959	2136970	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018706	ATTATC	2	12	2154660	2154671	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_018706	GCTAGG	2	12	2170005	2170016	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_018706	AATTTA	2	12	2171978	2171989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018706	AAAAAT	2	12	2203332	2203343	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_018706	AATTTA	2	12	3047685	3047696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018706	TTAATA	2	12	3070303	3070314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.