MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acinetobacter baumannii TYTH-1 chromosome

Total Repeats: 1439

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018706	CTTTTT	2	12	1552	1563	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407930688
2	NC_018706	TTTAAA	2	12	6338	6349	50 %	50 %	0 %	0 %	407930693
3	NC_018706	CGCCTT	2	12	13420	13431	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	407930699
4	NC_018706	CACATG	2	12	15591	15602	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407930700
5	NC_018706	AATTTA	2	12	22720	22731	50 %	50 %	0 %	0 %	407930708
6	NC_018706	TAGATG	2	12	25252	25263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407930712
7	NC_018706	CAAGGT	2	12	26619	26630	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407930713
8	NC_018706	ATTGAT	2	12	26661	26672	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407930713
9	NC_018706	AAAAAG	2	12	26691	26702	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407930713
10	NC_018706	TCAGGT	2	12	28035	28046	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407930713
11	NC_018706	ATCAAT	2	12	31050	31061	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407930715
12	NC_018706	ATACCC	2	12	35998	36009	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	407930717
13	NC_018706	CTGAAC	2	12	42801	42812	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407930721
14	NC_018706	TGATAT	2	12	53542	53553	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407930731
15	NC_018706	TTAAAT	2	12	54738	54749	50 %	50 %	0 %	0 %	407930733
16	NC_018706	TGCTTG	2	12	56599	56610	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407930734
17	NC_018706	CTGCCG	2	12	60091	60102	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407930739
18	NC_018706	CTAAAT	2	12	60709	60720	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407930739
19	NC_018706	ACGTCC	2	12	62166	62177	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407930741
20	NC_018706	TGCATG	2	12	63090	63101	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407930741
21	NC_018706	TTTCAT	2	12	65790	65801	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407930744
22	NC_018706	AGCTGG	2	12	71428	71439	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407930748
23	NC_018706	TCATCT	2	12	77491	77502	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407930753
24	NC_018706	GCACCT	2	12	78310	78321	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407930753
25	NC_018706	ACCGCC	2	12	78456	78467	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	407930753
26	NC_018706	AACTTA	2	12	87568	87579	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407930761
27	NC_018706	CTAAAG	2	12	93513	93524	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407930768
28	NC_018706	TTTGGC	2	12	94145	94156	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407930769
29	NC_018706	CCTAAA	2	12	97142	97153	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407930771
30	NC_018706	TTAAAG	2	12	97542	97553	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407930771
31	NC_018706	TTTGCC	2	12	98856	98867	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407930773
32	NC_018706	AATGGA	2	12	103875	103886	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407930778
33	NC_018706	TGTTTT	2	12	104060	104071	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407930779
34	NC_018706	TCATGA	2	12	106433	106444	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407930780
35	NC_018706	TTTATA	2	12	112432	112443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407930786
36	NC_018706	AAATTT	2	12	115829	115840	50 %	50 %	0 %	0 %	407930791
37	NC_018706	TTTTAT	2	12	117477	117488	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407930793
38	NC_018706	AGAACT	2	12	117501	117512	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407930793
39	NC_018706	TTTAAA	2	12	120233	120244	50 %	50 %	0 %	0 %	407930794
40	NC_018706	CTTGCT	2	12	121292	121303	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407930795
41	NC_018706	TTGTGC	2	12	121896	121907	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407930795
42	NC_018706	CAACTT	2	12	129042	129053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407930802
43	NC_018706	ACCATT	2	12	135240	135251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407930807
44	NC_018706	AAAATC	2	12	143218	143229	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407930815
45	NC_018706	CGCGGT	2	12	143244	143255	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407930815
46	NC_018706	AAGCTA	2	12	144096	144107	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407930816
47	NC_018706	CTATCG	2	12	145695	145706	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407930817
48	NC_018706	TTGGTG	2	12	146006	146017	0 %	50 %	50 %	0 %	407930817
49	NC_018706	ACTTTG	2	12	146431	146442	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407930818
50	NC_018706	TTGAAG	2	12	149188	149199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407930822
51	NC_018706	TCTGCC	2	12	153610	153621	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	407930826
52	NC_018706	GTATTT	2	12	155131	155142	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407930826
53	NC_018706	TAAAAA	2	12	162856	162867	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407930832
54	NC_018706	CATCTT	2	12	166368	166379	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407930835
55	NC_018706	AAAGGT	2	12	166381	166392	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407930835
56	NC_018706	TAAAGC	2	12	167198	167209	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407930836
57	NC_018706	AGCCAT	2	12	168545	168556	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407930837
58	NC_018706	AACCGA	2	12	168655	168666	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407930837
59	NC_018706	TTGAAG	2	12	171733	171744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407930840
60	NC_018706	GGTCAT	2	12	177518	177529	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407930845
61	NC_018706	TTGCAA	2	12	179390	179401	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407930847
62	NC_018706	ATCTTC	2	12	185498	185509	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407930854
63	NC_018706	TTTTCT	2	12	187589	187600	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407930858
64	NC_018706	ATGAAC	2	12	188370	188381	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407930858
65	NC_018706	CCTGTT	2	12	190884	190895	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407930862
66	NC_018706	CAACCA	2	12	192677	192688	50 %	0 %	0 %	50 %	407930864
67	NC_018706	ATTGGC	2	12	194850	194861	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407930867
68	NC_018706	GGTGCA	2	12	195466	195477	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407930867
69	NC_018706	GGAAAA	2	12	196381	196392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407930868
70	NC_018706	CTCACC	2	12	196893	196904	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	407930869
71	NC_018706	GCATGA	2	12	199657	199668	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407930872
72	NC_018706	TGCGGT	2	12	201530	201541	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	407930873
73	NC_018706	CAATAC	2	12	202227	202238	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407930873
74	NC_018706	TTTTGC	2	12	202442	202453	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407930873
75	NC_018706	TGAAGA	2	12	207519	207530	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407930876
76	NC_018706	TGACTT	2	12	210839	210850	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407930879
77	NC_018706	CATGAT	2	12	218530	218541	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407930884
78	NC_018706	GATCAT	2	12	218719	218730	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407930884
79	NC_018706	ACACCA	2	12	219016	219027	50 %	0 %	0 %	50 %	407930885
80	NC_018706	GTAGCA	2	12	220373	220384	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407930886
81	NC_018706	TATGGT	2	12	222114	222125	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407930888
82	NC_018706	AAAGTA	2	12	222355	222366	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407930889
83	NC_018706	GCTAAT	2	12	225717	225728	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407930891
84	NC_018706	ACATCT	2	12	229977	229988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407930894
85	NC_018706	AAAAGC	2	12	232874	232885	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407930897
86	NC_018706	TTTATT	2	12	235649	235660	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407930900
87	NC_018706	TCACCA	6	36	246391	246426	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	407930912
88	NC_018706	CTTCAA	2	12	248264	248275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407930915
89	NC_018706	AAGTAT	2	12	249936	249947	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407930917
90	NC_018706	TGAAAA	2	12	254131	254142	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407930921
91	NC_018706	CCGTAA	2	12	254545	254556	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407930921
92	NC_018706	CCGATG	2	12	254730	254741	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407930921
93	NC_018706	TGCTTA	2	12	259797	259808	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407930925
94	NC_018706	TGCTTA	2	12	261060	261071	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407930926
95	NC_018706	TGTGGT	2	12	263225	263236	0 %	50 %	50 %	0 %	407930928
96	NC_018706	CTCCAC	2	12	264501	264512	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	407930930
97	NC_018706	TTGCTT	2	12	274328	274339	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407930934
98	NC_018706	GTACAG	2	12	275049	275060	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407930935
99	NC_018706	CTTCAG	2	12	277405	277416	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407930936
100	NC_018706	CCATTT	2	12	281208	281219	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407930940
101	NC_018706	CGTTGT	2	12	282310	282321	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407930941
102	NC_018706	CTCAAG	2	12	286331	286342	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407930945
103	NC_018706	TAGGGT	2	12	287761	287772	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407930946
104	NC_018706	CACCAG	2	12	290486	290497	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	407930949
105	NC_018706	TAATTT	2	12	294673	294684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407930955
106	NC_018706	AGGCCA	2	12	297018	297029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407930957
107	NC_018706	TAAGTT	2	12	297577	297588	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407930957
108	NC_018706	CAGGTG	2	12	298434	298445	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407930958
109	NC_018706	AGCCGA	2	12	299347	299358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407930958
110	NC_018706	ATAACT	2	12	304445	304456	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407930963
111	NC_018706	CTTTTT	2	12	306207	306218	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407930965
112	NC_018706	AAAGTT	2	12	306859	306870	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407930965
113	NC_018706	AAGATT	2	12	307392	307403	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407930965
114	NC_018706	ATAGTA	2	12	318073	318084	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407930977
115	NC_018706	AATGTA	2	12	320154	320165	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407930979
116	NC_018706	GTTATT	2	12	320445	320456	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407930979
117	NC_018706	GGTGAA	2	12	320616	320627	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	407930979
118	NC_018706	TAGTTT	2	12	321139	321150	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407930980
119	NC_018706	TGCAAT	2	12	323225	323236	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407930982
120	NC_018706	ATCAAG	2	12	323639	323650	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407930983
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122	NC_018706	TGGCTC	2	12	332499	332510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407930988
123	NC_018706	CGATTG	2	12	332715	332726	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407930988
124	NC_018706	GATGAA	2	12	333576	333587	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407930989
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228	NC_018706	GCTCAT	2	12	606930	606941	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407931250
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230	NC_018706	CAAGCA	2	12	616707	616718	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407931259
231	NC_018706	TTGATT	2	12	617872	617883	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407931260
232	NC_018706	CAAAAG	2	12	624545	624556	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407931268
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342	NC_018706	TGAATT	2	12	933105	933116	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407931544
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344	NC_018706	TTTTTC	2	12	948783	948794	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407931557
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446	NC_018706	TGATGG	2	12	1184948	1184959	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407931763
447	NC_018706	ATGAAA	2	12	1188674	1188685	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407931767
448	NC_018706	AGAAAA	2	12	1189078	1189089	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407931767
449	NC_018706	GTTCCA	2	12	1190821	1190832	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407931770
450	NC_018706	CCTAGA	2	12	1193593	1193604	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407931773
451	NC_018706	TTGCTG	2	12	1196673	1196684	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407931775
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453	NC_018706	GCTTTG	2	12	1198111	1198122	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407931775
454	NC_018706	TTGATT	2	12	1199409	1199420	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407931776
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