MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Amphibacillus xylanus NBRC 15112

Total Repeats: 1089

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018704	GAAGCC	2	12	755	766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408355364
2	NC_018704	AAAATA	2	12	2875	2886	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	408355365
3	NC_018704	TTTTTG	2	12	4169	4180	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	408355367
4	NC_018704	CAATTC	2	12	4200	4211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408355367
5	NC_018704	CTGATG	2	12	6606	6617	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408355369
6	NC_018704	CAAGCT	2	12	8406	8417	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408355370
7	NC_018704	GAAAAT	2	12	8523	8534	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	408355370
8	NC_018704	GGTTGA	2	12	9787	9798	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	408355371
9	NC_018704	AATAGA	2	12	10894	10905	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018704	CAGGTA	2	12	14584	14595	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	408355374
11	NC_018704	AAATTA	2	12	19921	19932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408355378
12	NC_018704	TTGTTT	2	12	27623	27634	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	408355386
13	NC_018704	TCAGGT	2	12	29270	29281	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408355388
14	NC_018704	AACTAT	2	12	32342	32353	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408355391
15	NC_018704	GGTAAA	2	12	37651	37662	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	408355397
16	NC_018704	AGGCTA	2	12	46335	46346	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	408355406
17	NC_018704	TAAAGA	2	12	56169	56180	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	408355418
18	NC_018704	TCGTAT	2	12	57217	57228	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408355419
19	NC_018704	GTTGCT	2	12	60413	60424	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	408355421
20	NC_018704	TAGCAT	2	12	63154	63165	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408355423
21	NC_018704	TGATTG	2	12	63730	63741	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	408355423
22	NC_018704	CAAGGG	2	12	67246	67257	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	408355429
23	NC_018704	ATTGCT	2	12	69021	69032	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408355431
24	NC_018704	CAAGAA	2	12	85835	85846	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408355445
25	NC_018704	GGCAAC	2	12	86998	87009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408355447
26	NC_018704	TTGATT	2	12	87174	87185	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	408355447
27	NC_018704	TAAAGT	2	12	90926	90937	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408355451
28	NC_018704	GGAAAA	2	12	92063	92074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408355454
29	NC_018704	TAGGTA	2	12	93246	93257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408355454
30	NC_018704	AAAGCG	2	12	98629	98640	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018704	AAAGCG	2	12	104851	104862	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018704	GATATT	2	12	105468	105479	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408355455
33	NC_018704	AGTCAA	2	12	107038	107049	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018704	TTTAAT	2	12	107719	107730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408355458
35	NC_018704	CATTAA	2	12	108658	108669	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408355459
36	NC_018704	GAGAAG	2	12	109305	109316	50 %	0 %	50 %	0 %	408355460
37	NC_018704	ATTGCG	2	12	119394	119405	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408355467
38	NC_018704	TTGACC	2	12	119648	119659	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408355468
39	NC_018704	AAAAGA	2	12	119799	119810	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	408355468
40	NC_018704	GGAAGC	2	12	121755	121766	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	408355472
41	NC_018704	AGAAGC	2	12	123075	123086	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	408355474
42	NC_018704	CAAGAG	2	12	135035	135046	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	408355483
43	NC_018704	AATTAC	2	12	135052	135063	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408355483
44	NC_018704	AAACTG	2	12	135216	135227	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	408355483
45	NC_018704	TGAAAC	2	12	137292	137303	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	408355484
46	NC_018704	TTTCAA	2	12	142260	142271	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408355492
47	NC_018704	TAAAGT	2	12	144150	144161	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408355497
48	NC_018704	AAAGGT	2	12	146158	146169	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	408355501
49	NC_018704	TCTTAA	2	12	151994	152005	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408355513
50	NC_018704	AAGGTG	2	12	152062	152073	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	408355513
51	NC_018704	AAAAAG	2	12	152488	152499	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	408355513
52	NC_018704	AAGCTA	2	12	152842	152853	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	408355514
53	NC_018704	AACCAT	2	12	158923	158934	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	408355521
54	NC_018704	AATGGA	2	12	159521	159532	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018704	AAGTAA	2	12	160743	160754	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	408355524
56	NC_018704	AAATGA	2	12	161170	161181	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	408355524
57	NC_018704	TGAAGA	2	12	165039	165050	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	408355526
58	NC_018704	AAAGAA	2	12	165789	165800	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	408355526
59	NC_018704	AATGGA	2	12	167218	167229	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	408355526
60	NC_018704	GAAGCA	2	12	167326	167337	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	408355526
61	NC_018704	AAGGAG	2	12	167896	167907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018704	GACGTG	2	12	171835	171846	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	408355530
63	NC_018704	CAAGAA	2	12	172946	172957	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408355532
64	NC_018704	TCCAGA	2	12	173416	173427	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408355532
65	NC_018704	TGAAAT	2	12	173725	173736	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408355532
66	NC_018704	TGATGC	2	12	175345	175356	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408355533
67	NC_018704	TTTATC	2	12	179183	179194	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	408355538
68	NC_018704	TCATTA	2	12	179511	179522	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408355538
69	NC_018704	GTTGAA	2	12	181207	181218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408355540
70	NC_018704	TAATAT	2	12	182323	182334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018704	TAATTA	2	12	183267	183278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018704	TGAGTG	2	12	191836	191847	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018704	GATGAA	2	12	194593	194604	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	408355554
74	NC_018704	AAACAG	2	12	195843	195854	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408355555
75	NC_018704	AACAGA	2	12	195874	195885	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408355555
76	NC_018704	TAAAAA	2	12	196400	196411	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	408355556
77	NC_018704	TTAAAA	2	12	198034	198045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408355559
78	NC_018704	AATAGA	2	12	202573	202584	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	408355566
79	NC_018704	TACAAT	2	12	204571	204582	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408355570
80	NC_018704	GGTTGA	2	12	205408	205419	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	408355572
81	NC_018704	AACAAG	2	12	215122	215133	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408355585
82	NC_018704	TTTAGA	2	12	217259	217270	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408355586
83	NC_018704	CATTTG	2	12	223298	223309	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408355592
84	NC_018704	GCAAGC	2	12	224113	224124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408355593
85	NC_018704	TAAATT	2	12	225373	225384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018704	AGTGCA	2	12	225810	225821	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	408355595
87	NC_018704	TTGAAT	2	12	226244	226255	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408355596
88	NC_018704	TATAGA	2	12	227695	227706	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408355598
89	NC_018704	TTGCTG	2	12	230542	230553	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	408355600
90	NC_018704	ATTTTA	2	12	233221	233232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018704	ACAAGA	2	12	236130	236141	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408355603
92	NC_018704	TGATGG	2	12	236481	236492	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	408355603
93	NC_018704	TTATCT	2	12	236546	236557	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	408355603
94	NC_018704	AGTATC	2	12	240637	240648	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408355607
95	NC_018704	TTCAAT	2	12	242757	242768	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408355610
96	NC_018704	TGATAT	2	12	243895	243906	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408355611
97	NC_018704	ATTAAT	2	12	244199	244210	50 %	50 %	0 %	0 %	408355611
98	NC_018704	AATTTA	2	12	245429	245440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018704	GATATT	2	12	246297	246308	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018704	ATAGAT	2	12	254841	254852	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408355624
101	NC_018704	CATATA	2	12	259807	259818	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408355627
102	NC_018704	TTTAAA	2	12	263683	263694	50 %	50 %	0 %	0 %	408355631
103	NC_018704	CAAGCT	2	12	265981	265992	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018704	AGATAG	2	12	266149	266160	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018704	AGTTAG	2	12	273823	273834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408355639
106	NC_018704	CACTTT	2	12	277496	277507	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	408355642
107	NC_018704	CTTTTC	2	12	279665	279676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408355644
108	NC_018704	ACTAGA	2	12	280373	280384	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_018704	TGAAGA	2	12	282331	282342	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	408355646
110	NC_018704	ATTAGC	2	12	286633	286644	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408355650
111	NC_018704	AAAGAA	2	12	290650	290661	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	408355654
112	NC_018704	TAATCT	2	12	293435	293446	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_018704	CAAATT	2	12	295462	295473	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408355658
114	NC_018704	ATTAAT	2	12	296636	296647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018704	AGCTGG	2	12	297433	297444	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	408355659
116	NC_018704	TGGACG	2	12	305775	305786	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	408355666
117	NC_018704	CCGTGA	2	12	305901	305912	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	408355666
118	NC_018704	ATTTAT	2	12	309069	309080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018704	TTTTCT	2	12	312946	312957	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	408355674
120	NC_018704	TGCTTC	2	12	317961	317972	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	408355679
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123	NC_018704	TACTAT	2	12	325787	325798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408355686
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227	NC_018704	ATTTGA	2	12	610896	610907	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408355956
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229	NC_018704	TCACTT	2	12	611910	611921	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
230	NC_018704	TCCTCA	2	12	615463	615474	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	408355961
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235	NC_018704	CCAATT	2	12	625993	626004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408355971
236	NC_018704	AAAATT	2	12	627256	627267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
237	NC_018704	ACCTGC	2	12	628016	628027	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	408355973
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243	NC_018704	TCAGCT	2	12	645224	645235	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408355986
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260	NC_018704	AAAAGA	2	12	693616	693627	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	408356031
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347	NC_018704	AGTTAT	2	12	877572	877583	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
348	NC_018704	TTTTTC	2	12	878211	878222	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	408356198
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351	NC_018704	ATTTTT	2	12	893223	893234	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
352	NC_018704	TATCGG	2	12	893534	893545	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408356217
353	NC_018704	GAAAAA	2	12	894612	894623	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	408356217
354	NC_018704	TGATAG	2	12	894730	894741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
355	NC_018704	CCATCT	2	12	894806	894817	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	408356218
356	NC_018704	GCAAAA	2	12	899405	899416	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408356221
357	NC_018704	TTTTAC	2	12	900758	900769	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	408356222
358	NC_018704	ACTTGT	2	12	902380	902391	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408356225
359	NC_018704	CTAATC	2	12	903578	903589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408356226
360	NC_018704	CCAATT	2	12	906922	906933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408356228
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362	NC_018704	AAAAAT	2	12	914286	914297	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	408356229
363	NC_018704	TCAATC	2	12	915586	915597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408356230
364	NC_018704	AAATGA	2	12	916177	916188	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	408356232
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367	NC_018704	TGAATA	2	12	926878	926889	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
368	NC_018704	ATTGGC	2	12	933353	933364	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408356253
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370	NC_018704	ATCAAG	2	12	938227	938238	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	408356259
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372	NC_018704	ATTCCA	2	12	946644	946655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408356265
373	NC_018704	CTGTAA	2	12	952280	952291	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
374	NC_018704	CACCAA	2	12	952459	952470	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
375	NC_018704	CTTTAT	2	12	952665	952676	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	408356270
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377	NC_018704	TACCTG	2	12	958193	958204	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408356272
378	NC_018704	TATTTT	2	12	960679	960690	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
379	NC_018704	ATTACA	2	12	965468	965479	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408356278
380	NC_018704	TTCATT	2	12	965937	965948	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	408356278
381	NC_018704	ATTGAA	2	12	967088	967099	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408356280
382	NC_018704	TATCAA	2	12	967373	967384	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408356280
383	NC_018704	TCAGGA	2	12	968436	968447	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	408356282
384	NC_018704	TAAGTG	2	12	971183	971194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408356285
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390	NC_018704	GGTATT	2	12	988032	988043	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	408356299
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392	NC_018704	TTAACA	2	12	990772	990783	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408356301
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420	NC_018704	TATCTT	2	12	1073063	1073074	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	408356384
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447	NC_018704	ATGAAA	3	18	1131065	1131082	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
448	NC_018704	TAAATA	2	12	1131608	1131619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_018704	TGAAGC	2	12	1133787	1133798	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	408356445
450	NC_018704	AGAACG	2	12	1135464	1135475	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	408356448
451	NC_018704	CTTGTT	2	12	1139872	1139883	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	408356453
452	NC_018704	AAAGTC	2	12	1151691	1151702	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
453	NC_018704	TGATAT	2	12	1153249	1153260	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408356465
454	NC_018704	TTAAAG	2	12	1154784	1154795	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
455	NC_018704	AAAAGC	2	12	1155175	1155186	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408356468
456	NC_018704	GAAGCT	2	12	1157890	1157901	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	408356470
457	NC_018704	AAAGCT	2	12	1159436	1159447	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	408356473
458	NC_018704	AATTAG	2	12	1162477	1162488	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408356475
459	NC_018704	CAAATC	2	12	1163137	1163148	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	408356475
460	NC_018704	TTTTAA	2	12	1164441	1164452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408356477
461	NC_018704	TGCTGA	2	12	1167971	1167982	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408356480
462	NC_018704	TATTGA	2	12	1168310	1168321	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408356480
463	NC_018704	CTTTCA	2	12	1168488	1168499	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	408356480
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465	NC_018704	TAGAAG	2	12	1170229	1170240	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	408356482
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