MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Amphibacillus xylanus NBRC 15112

Total Repeats: 953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018704	GAAGCC	2	12	755	766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408355364
2	NC_018704	AAAATA	2	12	2875	2886	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	408355365
3	NC_018704	TTTTTG	2	12	4169	4180	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	408355367
4	NC_018704	CAATTC	2	12	4200	4211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408355367
5	NC_018704	CTGATG	2	12	6606	6617	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408355369
6	NC_018704	CAAGCT	2	12	8406	8417	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408355370
7	NC_018704	GAAAAT	2	12	8523	8534	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	408355370
8	NC_018704	GGTTGA	2	12	9787	9798	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	408355371
9	NC_018704	CAGGTA	2	12	14584	14595	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	408355374
10	NC_018704	AAATTA	2	12	19921	19932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408355378
11	NC_018704	TTGTTT	2	12	27623	27634	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	408355386
12	NC_018704	TCAGGT	2	12	29270	29281	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408355388
13	NC_018704	AACTAT	2	12	32342	32353	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408355391
14	NC_018704	GGTAAA	2	12	37651	37662	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	408355397
15	NC_018704	AGGCTA	2	12	46335	46346	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	408355406
16	NC_018704	TAAAGA	2	12	56169	56180	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	408355418
17	NC_018704	TCGTAT	2	12	57217	57228	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408355419
18	NC_018704	GTTGCT	2	12	60413	60424	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	408355421
19	NC_018704	TAGCAT	2	12	63154	63165	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408355423
20	NC_018704	TGATTG	2	12	63730	63741	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	408355423
21	NC_018704	CAAGGG	2	12	67246	67257	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	408355429
22	NC_018704	ATTGCT	2	12	69021	69032	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408355431
23	NC_018704	CAAGAA	2	12	85835	85846	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408355445
24	NC_018704	GGCAAC	2	12	86998	87009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408355447
25	NC_018704	TTGATT	2	12	87174	87185	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	408355447
26	NC_018704	TAAAGT	2	12	90926	90937	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408355451
27	NC_018704	GGAAAA	2	12	92063	92074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408355454
28	NC_018704	TAGGTA	2	12	93246	93257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408355454
29	NC_018704	GATATT	2	12	105468	105479	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408355455
30	NC_018704	TTTAAT	2	12	107719	107730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408355458
31	NC_018704	CATTAA	2	12	108658	108669	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408355459
32	NC_018704	GAGAAG	2	12	109305	109316	50 %	0 %	50 %	0 %	408355460
33	NC_018704	ATTGCG	2	12	119394	119405	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408355467
34	NC_018704	TTGACC	2	12	119648	119659	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408355468
35	NC_018704	AAAAGA	2	12	119799	119810	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	408355468
36	NC_018704	GGAAGC	2	12	121755	121766	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	408355472
37	NC_018704	AGAAGC	2	12	123075	123086	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	408355474
38	NC_018704	CAAGAG	2	12	135035	135046	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	408355483
39	NC_018704	AATTAC	2	12	135052	135063	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408355483
40	NC_018704	AAACTG	2	12	135216	135227	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	408355483
41	NC_018704	TGAAAC	2	12	137292	137303	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	408355484
42	NC_018704	TTTCAA	2	12	142260	142271	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408355492
43	NC_018704	TAAAGT	2	12	144150	144161	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408355497
44	NC_018704	AAAGGT	2	12	146158	146169	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	408355501
45	NC_018704	TCTTAA	2	12	151994	152005	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408355513
46	NC_018704	AAGGTG	2	12	152062	152073	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	408355513
47	NC_018704	AAAAAG	2	12	152488	152499	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	408355513
48	NC_018704	AAGCTA	2	12	152842	152853	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	408355514
49	NC_018704	AACCAT	2	12	158923	158934	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	408355521
50	NC_018704	AAGTAA	2	12	160743	160754	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	408355524
51	NC_018704	AAATGA	2	12	161170	161181	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	408355524
52	NC_018704	TGAAGA	2	12	165039	165050	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	408355526
53	NC_018704	AAAGAA	2	12	165789	165800	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	408355526
54	NC_018704	AATGGA	2	12	167218	167229	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	408355526
55	NC_018704	GAAGCA	2	12	167326	167337	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	408355526
56	NC_018704	GACGTG	2	12	171835	171846	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	408355530
57	NC_018704	CAAGAA	2	12	172946	172957	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408355532
58	NC_018704	TCCAGA	2	12	173416	173427	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408355532
59	NC_018704	TGAAAT	2	12	173725	173736	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408355532
60	NC_018704	TGATGC	2	12	175345	175356	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408355533
61	NC_018704	TTTATC	2	12	179183	179194	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	408355538
62	NC_018704	TCATTA	2	12	179511	179522	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408355538
63	NC_018704	GTTGAA	2	12	181207	181218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408355540
64	NC_018704	GATGAA	2	12	194593	194604	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	408355554
65	NC_018704	AAACAG	2	12	195843	195854	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408355555
66	NC_018704	AACAGA	2	12	195874	195885	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408355555
67	NC_018704	TAAAAA	2	12	196400	196411	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	408355556
68	NC_018704	TTAAAA	2	12	198034	198045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408355559
69	NC_018704	AATAGA	2	12	202573	202584	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	408355566
70	NC_018704	TACAAT	2	12	204571	204582	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408355570
71	NC_018704	GGTTGA	2	12	205408	205419	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	408355572
72	NC_018704	AACAAG	2	12	215122	215133	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408355585
73	NC_018704	TTTAGA	2	12	217259	217270	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408355586
74	NC_018704	CATTTG	2	12	223298	223309	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408355592
75	NC_018704	GCAAGC	2	12	224113	224124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408355593
76	NC_018704	AGTGCA	2	12	225810	225821	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	408355595
77	NC_018704	TTGAAT	2	12	226244	226255	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408355596
78	NC_018704	TATAGA	2	12	227695	227706	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408355598
79	NC_018704	TTGCTG	2	12	230542	230553	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	408355600
80	NC_018704	ACAAGA	2	12	236130	236141	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408355603
81	NC_018704	TGATGG	2	12	236481	236492	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	408355603
82	NC_018704	TTATCT	2	12	236546	236557	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	408355603
83	NC_018704	AGTATC	2	12	240637	240648	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408355607
84	NC_018704	TTCAAT	2	12	242757	242768	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408355610
85	NC_018704	TGATAT	2	12	243895	243906	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408355611
86	NC_018704	ATTAAT	2	12	244199	244210	50 %	50 %	0 %	0 %	408355611
87	NC_018704	ATAGAT	2	12	254841	254852	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408355624
88	NC_018704	CATATA	2	12	259807	259818	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408355627
89	NC_018704	TTTAAA	2	12	263683	263694	50 %	50 %	0 %	0 %	408355631
90	NC_018704	AGTTAG	2	12	273823	273834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408355639
91	NC_018704	CACTTT	2	12	277496	277507	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	408355642
92	NC_018704	CTTTTC	2	12	279665	279676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408355644
93	NC_018704	TGAAGA	2	12	282331	282342	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	408355646
94	NC_018704	ATTAGC	2	12	286633	286644	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408355650
95	NC_018704	AAAGAA	2	12	290650	290661	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	408355654
96	NC_018704	CAAATT	2	12	295462	295473	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408355658
97	NC_018704	AGCTGG	2	12	297433	297444	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	408355659
98	NC_018704	TGGACG	2	12	305775	305786	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	408355666
99	NC_018704	CCGTGA	2	12	305901	305912	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	408355666
100	NC_018704	TTTTCT	2	12	312946	312957	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	408355674
101	NC_018704	TGCTTC	2	12	317961	317972	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	408355679
102	NC_018704	TCAAAA	2	12	321943	321954	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408355683
103	NC_018704	TGAACG	2	12	323696	323707	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	408355685
104	NC_018704	TACTAT	2	12	325787	325798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408355686
105	NC_018704	AATGAG	2	12	326403	326414	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	408355686
106	NC_018704	TTTTAG	2	12	328321	328332	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	408355688
107	NC_018704	CATCGT	2	12	329667	329678	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408355690
108	NC_018704	ATCCAA	2	12	334105	334116	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	408355695
109	NC_018704	CCAAAT	2	12	343302	343313	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	408355704
110	NC_018704	AATCGG	2	12	343567	343578	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	408355705
111	NC_018704	TGCAAT	2	12	344928	344939	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408355706
112	NC_018704	AAATAG	2	12	346705	346716	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	408355708
113	NC_018704	AAGTCA	2	12	349044	349055	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	408355711
114	NC_018704	AAAAGA	2	12	357505	357516	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	408355721
115	NC_018704	TTTTAG	2	12	367580	367591	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	408355726
116	NC_018704	TAATCA	2	12	368551	368562	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408355727
117	NC_018704	AAAATC	2	12	369669	369680	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408355727
118	NC_018704	GGTTAT	2	12	370509	370520	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	408355728
119	NC_018704	ATCCGA	2	12	370748	370759	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408355728
120	NC_018704	TTTTCG	2	12	374861	374872	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	408355734
121	NC_018704	AGATCA	2	12	379907	379918	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	408355741
122	NC_018704	GAACGT	2	12	386474	386485	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	408355747
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137	NC_018704	GGTGTT	2	12	434332	434343	0 %	50 %	50 %	0 %	408355787
138	NC_018704	CTGCTC	2	12	434441	434452	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	408355787
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214	NC_018704	AGCTGA	2	12	649782	649793	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	408355992
215	NC_018704	TTAAAA	2	12	677432	677443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408356016
216	NC_018704	CCGATC	2	12	682155	682166	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	408356019
217	NC_018704	ACTCGA	2	12	684014	684025	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408356023
218	NC_018704	TACAGC	2	12	684098	684109	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408356023
219	NC_018704	ACCAAT	2	12	687639	687650	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	408356027
220	NC_018704	AACACC	2	12	687849	687860	50 %	0 %	0 %	50 %	408356027
221	NC_018704	AAACAG	2	12	688586	688597	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408356028
222	NC_018704	GACTCA	2	12	689591	689602	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408356028
223	NC_018704	AAAAGA	2	12	693616	693627	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	408356031
224	NC_018704	ATATTG	2	12	694492	694503	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408356032
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226	NC_018704	AGATGA	2	12	697160	697171	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	408356035
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228	NC_018704	AAGAAA	2	12	698719	698730	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	408356036
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230	NC_018704	AACAGG	2	12	708466	708477	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	408356041
231	NC_018704	ATTGAA	2	12	709133	709144	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408356041
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235	NC_018704	TAATGG	2	12	720083	720094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408356050
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337	NC_018704	TTAACA	2	12	990772	990783	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408356301
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341	NC_018704	CAAAAA	2	12	1003986	1003997	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	408356314
342	NC_018704	AATGAA	2	12	1005125	1005136	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	408356317
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344	NC_018704	AGTTGC	2	12	1015929	1015940	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408356328
345	NC_018704	TCACGA	2	12	1029881	1029892	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408356341
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452	NC_018704	TGAAAT	2	12	1280010	1280021	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408356600
453	NC_018704	CAAGAC	2	12	1285502	1285513	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	408356606
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