MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Amphibacillus xylanus NBRC 15112

Total Repeats: 450

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018704	GTATT	2	10	10880	10889	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018704	ACTTT	2	10	23338	23347	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018704	GATTT	2	10	23937	23946	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018704	ATTAG	2	10	27944	27953	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018704	AAATT	2	10	34237	34246	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018704	CTCCG	2	10	47547	47556	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_018704	ACAAA	2	10	47607	47616	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018704	GAATG	2	10	47922	47931	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018704	AATTA	2	10	50464	50473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018704	TGAAT	2	10	61507	61516	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018704	AAAGA	2	10	61527	61536	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018704	TCCTC	2	10	72298	72307	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_018704	TTATT	2	10	93468	93477	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018704	ATATA	2	10	93597	93606	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018704	TCGTG	2	10	94832	94841	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018704	ATCAA	2	10	95629	95638	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018704	GGGAG	2	10	96234	96243	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018704	AATAT	2	10	98779	98788	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018704	TACCG	2	10	99466	99475	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_018704	TCGTG	2	10	100959	100968	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_018704	ATCAA	2	10	101851	101860	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018704	GGGAG	2	10	102456	102465	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018704	GATAA	2	10	114554	114563	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018704	GAACA	2	10	123741	123750	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018704	TAATT	2	10	125499	125508	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018704	AAGGA	2	10	134293	134302	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018704	TTTTC	2	10	162093	162102	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018704	ATAGA	2	10	162423	162432	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018704	TAAAG	2	10	170241	170250	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018704	AGCTA	2	10	170547	170556	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018704	ATTTA	2	10	176835	176844	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018704	AGTAA	2	10	179783	179792	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018704	TCGTG	2	10	184893	184902	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018704	ATCAA	2	10	185913	185922	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018704	GGGAG	2	10	186518	186527	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018704	AATAA	2	10	223620	223629	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018704	TTATT	2	10	233269	233278	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018704	TATGA	2	10	233635	233644	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018704	TTTAA	2	10	241548	241557	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018704	TCATT	2	10	243620	243629	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018704	TATAT	2	10	249228	249237	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018704	TAAAA	2	10	257216	257225	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018704	ATTAA	2	10	263942	263951	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018704	CAAAA	2	10	285186	285195	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018704	AATTA	2	10	288929	288938	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018704	AATTA	2	10	312824	312833	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018704	ATATA	2	10	338574	338583	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018704	ACTTC	2	10	342201	342210	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_018704	TAAAT	2	10	342390	342399	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018704	CTATT	2	10	343477	343486	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018704	AGCTT	2	10	343920	343929	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018704	TAGTG	2	10	343959	343968	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018704	TTAAA	2	10	348694	348703	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018704	TAATT	2	10	351434	351443	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018704	TCGTG	2	10	359926	359935	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018704	ATCAA	2	10	360818	360827	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018704	GGGAG	2	10	361423	361432	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018704	ATAAA	2	10	368142	368151	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018704	ATTTG	2	10	375307	375316	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018704	TTAAT	2	10	378950	378959	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018704	TCTTT	2	10	388949	388958	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018704	TATAG	2	10	391291	391300	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018704	TTAAT	2	10	415022	415031	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018704	TATTT	2	10	422753	422762	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018704	TTTAG	2	10	428858	428867	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018704	GAAAG	2	10	434950	434959	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018704	CATAT	2	10	438555	438564	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018704	AATTA	2	10	448395	448404	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018704	GTGAT	2	10	451193	451202	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018704	ATGAT	2	10	468092	468101	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018704	GTAGT	2	10	480357	480366	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018704	AATGA	2	10	483367	483376	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018704	CAAAT	2	10	493813	493822	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018704	TTTAT	2	10	499080	499089	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018704	GTTGA	2	10	499147	499156	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018704	TGAAC	2	10	499229	499238	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018704	CTTTA	2	10	500671	500680	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018704	GTTCA	2	10	505811	505820	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018704	ACTAA	2	10	506718	506727	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_018704	TAAAT	2	10	517618	517627	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018704	GATAA	2	10	524785	524794	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018704	TTATC	2	10	529045	529054	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_018704	TAAAA	2	10	541814	541823	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018704	AATTG	2	10	544507	544516	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018704	CAAAA	2	10	546610	546619	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018704	TATAT	2	10	546663	546672	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018704	TAATT	2	10	548824	548833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018704	TTAAA	2	10	548849	548858	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018704	GTTTT	2	10	554610	554619	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018704	CCTCA	2	10	556473	556482	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
91	NC_018704	TGAAA	2	10	560681	560690	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018704	GATAG	2	10	564163	564172	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018704	GACAA	2	10	564919	564928	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_018704	AAAGA	2	10	567282	567291	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018704	ATTTA	2	10	567363	567372	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018704	TAATT	2	10	570449	570458	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018704	AGAAC	2	10	572088	572097	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_018704	TGAAA	2	10	578747	578756	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018704	TTTCT	2	10	583134	583143	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_018704	ACTTC	2	10	595150	595159	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_018704	TATAA	2	10	595677	595686	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018704	TTATT	2	10	601827	601836	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018704	ATTTT	2	10	606709	606718	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018704	AAACC	2	10	619714	619723	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_018704	AAATG	2	10	641887	641896	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018704	CTAAA	2	10	641935	641944	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_018704	GCATG	2	10	642201	642210	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_018704	TGTCT	2	10	643376	643385	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018704	CTTAT	2	10	645674	645683	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_018704	TAACT	2	10	652983	652992	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_018704	AAATT	2	10	653057	653066	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018704	GTGCT	2	10	653504	653513	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_018704	TATAA	2	10	655184	655193	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018704	ATTTT	2	10	655317	655326	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018704	TCGTG	2	10	657327	657336	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_018704	ATCAA	2	10	658219	658228	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018704	GGGAG	2	10	658824	658833	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018704	ATTTT	2	10	662255	662264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018704	TTATT	2	10	665996	666005	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018704	CTTTT	2	10	666375	666384	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018704	GATTT	2	10	669731	669740	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018704	TAGAA	2	10	669768	669777	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018704	TCATG	2	10	674620	674629	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_018704	TATAC	2	10	686286	686295	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018704	AGTAA	2	10	686970	686979	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018704	AAATC	2	10	701671	701680	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018704	TATAA	2	10	714077	714086	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018704	AATTC	2	10	722092	722101	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_018704	ATCTG	2	10	730800	730809	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018704	TTATT	2	10	735094	735103	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018704	TTTAT	2	10	746034	746043	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018704	TTTAT	2	10	748677	748686	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018704	AAATT	2	10	752579	752588	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018704	ATTTC	2	10	762138	762147	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_018704	AAAAT	2	10	762211	762220	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018704	TGGAA	2	10	779731	779740	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018704	AAGGT	2	10	781288	781297	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018704	GTATT	2	10	786648	786657	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018704	GATGA	2	10	787076	787085	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018704	TAATG	2	10	793084	793093	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018704	ATAAC	2	10	793103	793112	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_018704	ATGAG	2	10	818832	818841	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018704	GTGTA	2	10	835278	835287	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018704	ATTTA	2	10	835844	835853	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018704	ATATA	2	10	840494	840503	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018704	TATAC	2	10	844062	844071	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_018704	GCAAA	2	10	845938	845947	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_018704	AGGAG	2	10	849696	849705	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_018704	AACAC	2	10	866579	866588	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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167	NC_018704	GGGAG	2	10	910995	911004	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_018704	ATTTA	2	10	964074	964083	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_018704	GTTCT	2	10	1652392	1652401	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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427	NC_018704	ACTTA	2	10	2377003	2377012	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
428	NC_018704	TCAAA	2	10	2399049	2399058	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
429	NC_018704	ACATG	2	10	2400214	2400223	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
430	NC_018704	CTTTA	2	10	2406822	2406831	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
431	NC_018704	AAATT	2	10	2423603	2423612	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_018704	TGACT	2	10	2444662	2444671	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
433	NC_018704	AATAT	2	10	2449197	2449206	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_018704	TGTTT	2	10	2453596	2453605	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
435	NC_018704	TGGCA	2	10	2457824	2457833	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
436	NC_018704	CAAAT	2	10	2458032	2458041	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
437	NC_018704	ATGTC	2	10	2460912	2460921	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
438	NC_018704	TTCTC	2	10	2464714	2464723	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
439	NC_018704	TGTAT	2	10	2468651	2468660	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
440	NC_018704	CAAAA	2	10	2470971	2470980	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
441	NC_018704	TTTGA	2	10	2485330	2485339	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
442	NC_018704	TGTTT	2	10	2490652	2490661	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
443	NC_018704	TAAGA	2	10	2490849	2490858	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
444	NC_018704	AACTA	2	10	2499946	2499955	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
445	NC_018704	TAAAT	2	10	2506623	2506632	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_018704	TGTCT	2	10	2522077	2522086	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
447	NC_018704	ACTTC	2	10	2536214	2536223	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
448	NC_018704	TAAAA	2	10	2552416	2552425	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_018704	TTATA	2	10	2561613	2561622	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_018704	TATCT	2	10	2569174	2569183	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.