MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Amphibacillus xylanus NBRC 15112

Total Repeats: 2117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_018704	CCATC	2	10	2415628	2415637	20 %	20 %	0 %	60 %	408357643
2002	NC_018704	TTGTT	2	10	2417391	2417400	0 %	80 %	20 %	0 %	408357644
2003	NC_018704	TAATT	2	10	2417711	2417720	40 %	60 %	0 %	0 %	408357644
2004	NC_018704	TAAAA	2	10	2417753	2417762	80 %	20 %	0 %	0 %	408357644
2005	NC_018704	CATAA	2	10	2419718	2419727	60 %	20 %	0 %	20 %	408357646
2006	NC_018704	GATAG	2	10	2420505	2420514	40 %	20 %	40 %	0 %	408357648
2007	NC_018704	AAATT	2	10	2423603	2423612	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_018704	CATTT	2	10	2425448	2425457	20 %	60 %	0 %	20 %	408357651
2009	NC_018704	AAGCA	2	10	2427365	2427374	60 %	0 %	20 %	20 %	408357651
2010	NC_018704	ACAAG	2	10	2428944	2428953	60 %	0 %	20 %	20 %	408357652
2011	NC_018704	TCACC	2	10	2429066	2429075	20 %	20 %	0 %	60 %	408357653
2012	NC_018704	TTAAA	2	10	2430575	2430584	60 %	40 %	0 %	0 %	408357654
2013	NC_018704	AATAA	2	10	2432016	2432025	80 %	20 %	0 %	0 %	408357656
2014	NC_018704	AAACA	2	10	2432886	2432895	80 %	0 %	0 %	20 %	408357657
2015	NC_018704	ATTAT	2	10	2434986	2434995	40 %	60 %	0 %	0 %	408357658
2016	NC_018704	TAATT	2	10	2435314	2435323	40 %	60 %	0 %	0 %	408357659
2017	NC_018704	AATTA	2	10	2436684	2436693	60 %	40 %	0 %	0 %	408357660
2018	NC_018704	AATAC	2	10	2438645	2438654	60 %	20 %	0 %	20 %	408357662
2019	NC_018704	AATAA	2	10	2439281	2439290	80 %	20 %	0 %	0 %	408357662
2020	NC_018704	ATAGG	2	10	2440481	2440490	40 %	20 %	40 %	0 %	408357663
2021	NC_018704	ATACA	2	10	2442251	2442260	60 %	20 %	0 %	20 %	408357663
2022	NC_018704	TGACT	2	10	2444662	2444671	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2023	NC_018704	TTACC	2	10	2445946	2445955	20 %	40 %	0 %	40 %	408357669
2024	NC_018704	TTCAT	2	10	2446353	2446362	20 %	60 %	0 %	20 %	408357669
2025	NC_018704	TCATA	2	10	2447464	2447473	40 %	40 %	0 %	20 %	408357669
2026	NC_018704	AATAT	2	10	2449197	2449206	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2027	NC_018704	TTTTA	2	10	2451652	2451661	20 %	80 %	0 %	0 %	408357673
2028	NC_018704	TGTTT	2	10	2453596	2453605	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2029	NC_018704	ACCAT	2	10	2454673	2454682	40 %	20 %	0 %	40 %	408357675
2030	NC_018704	GTGAT	2	10	2457350	2457359	20 %	40 %	40 %	0 %	408357677
2031	NC_018704	TGGCA	2	10	2457824	2457833	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2032	NC_018704	CAAAT	2	10	2458032	2458041	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2033	NC_018704	TGCAT	2	10	2459996	2460005	20 %	40 %	20 %	20 %	408357681
2034	NC_018704	ATGTC	2	10	2460912	2460921	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2035	NC_018704	TTTTG	2	10	2464293	2464302	0 %	80 %	20 %	0 %	408357685
2036	NC_018704	ACTCA	2	10	2464604	2464613	40 %	20 %	0 %	40 %	408357685
2037	NC_018704	TTCTC	2	10	2464714	2464723	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2038	NC_018704	ACCTA	2	10	2466223	2466232	40 %	20 %	0 %	40 %	408357687
2039	NC_018704	TGTAT	2	10	2468651	2468660	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2040	NC_018704	TTTCC	2	10	2469293	2469302	0 %	60 %	0 %	40 %	408357690
2041	NC_018704	ATTCA	2	10	2469475	2469484	40 %	40 %	0 %	20 %	408357690
2042	NC_018704	GCCAT	2	10	2470508	2470517	20 %	20 %	20 %	40 %	408357691
2043	NC_018704	CAAAA	2	10	2470971	2470980	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2044	NC_018704	AATTT	2	10	2475573	2475582	40 %	60 %	0 %	0 %	408357695
2045	NC_018704	ATTAA	2	10	2476487	2476496	60 %	40 %	0 %	0 %	408357695
2046	NC_018704	TAACA	2	10	2481624	2481633	60 %	20 %	0 %	20 %	408357699
2047	NC_018704	TCATC	2	10	2481947	2481956	20 %	40 %	0 %	40 %	408357699
2048	NC_018704	TTTGA	2	10	2485330	2485339	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2049	NC_018704	ATTTC	2	10	2485557	2485566	20 %	60 %	0 %	20 %	408357702
2050	NC_018704	AGATA	2	10	2486867	2486876	60 %	20 %	20 %	0 %	408357703
2051	NC_018704	GATAA	2	10	2487144	2487153	60 %	20 %	20 %	0 %	408357703
2052	NC_018704	CATAT	2	10	2487740	2487749	40 %	40 %	0 %	20 %	408357703
2053	NC_018704	ACATC	2	10	2489065	2489074	40 %	20 %	0 %	40 %	408357705
2054	NC_018704	TGTTT	2	10	2490652	2490661	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_018704	TAAGA	2	10	2490849	2490858	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2056	NC_018704	ATTTA	2	10	2491003	2491012	40 %	60 %	0 %	0 %	408357707
2057	NC_018704	CTTTA	2	10	2491506	2491515	20 %	60 %	0 %	20 %	408357709
2058	NC_018704	ATCTT	2	10	2492524	2492533	20 %	60 %	0 %	20 %	408357709
2059	NC_018704	TGATC	2	10	2493908	2493917	20 %	40 %	20 %	20 %	408357709
2060	NC_018704	CAAAT	2	10	2494210	2494219	60 %	20 %	0 %	20 %	408357709
2061	NC_018704	AGATG	2	10	2496442	2496451	40 %	20 %	40 %	0 %	408357711
2062	NC_018704	ATTTT	2	10	2496858	2496867	20 %	80 %	0 %	0 %	408357712
2063	NC_018704	TGTTT	2	10	2497580	2497589	0 %	80 %	20 %	0 %	408357712
2064	NC_018704	CAAGC	2	10	2498001	2498010	40 %	0 %	20 %	40 %	408357712
2065	NC_018704	TAAAT	2	10	2499262	2499271	60 %	40 %	0 %	0 %	408357715
2066	NC_018704	AACTA	2	10	2499946	2499955	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2067	NC_018704	CATTT	2	10	2501179	2501188	20 %	60 %	0 %	20 %	408357718
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2071	NC_018704	ATACT	2	10	2506067	2506076	40 %	40 %	0 %	20 %	408357720
2072	NC_018704	ATTTT	2	10	2506550	2506559	20 %	80 %	0 %	0 %	408357720
2073	NC_018704	TAAAT	2	10	2506623	2506632	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2074	NC_018704	TGATT	2	10	2509579	2509588	20 %	60 %	20 %	0 %	408357724
2075	NC_018704	TGGGA	2	10	2509793	2509802	20 %	20 %	60 %	0 %	408357724
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2077	NC_018704	AAACT	2	10	2511256	2511265	60 %	20 %	0 %	20 %	408357725
2078	NC_018704	TTTTA	2	10	2512610	2512619	20 %	80 %	0 %	0 %	408357726
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2080	NC_018704	ATTTA	2	10	2514913	2514922	40 %	60 %	0 %	0 %	408357728
2081	NC_018704	CATTC	2	10	2515599	2515608	20 %	40 %	0 %	40 %	408357729
2082	NC_018704	CGAAT	2	10	2516305	2516314	40 %	20 %	20 %	20 %	408357729
2083	NC_018704	CAAAT	2	10	2516335	2516344	60 %	20 %	0 %	20 %	408357729
2084	NC_018704	ATTTT	2	10	2517095	2517104	20 %	80 %	0 %	0 %	408357730
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2086	NC_018704	TTTAA	2	10	2517708	2517717	40 %	60 %	0 %	0 %	408357730
2087	NC_018704	AATTA	2	10	2519540	2519549	60 %	40 %	0 %	0 %	408357732
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2090	NC_018704	AAAAG	2	10	2526008	2526017	80 %	0 %	20 %	0 %	408357737
2091	NC_018704	AAAAC	2	10	2526509	2526518	80 %	0 %	0 %	20 %	408357737
2092	NC_018704	GACTG	2	10	2526600	2526609	20 %	20 %	40 %	20 %	408357737
2093	NC_018704	TCGAT	2	10	2531445	2531454	20 %	40 %	20 %	20 %	408357741
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2095	NC_018704	TGTTT	2	10	2535742	2535751	0 %	80 %	20 %	0 %	408357744
2096	NC_018704	ACTTC	2	10	2536214	2536223	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2097	NC_018704	TTAAT	2	10	2536718	2536727	40 %	60 %	0 %	0 %	408357745
2098	NC_018704	CTTCA	2	10	2536760	2536769	20 %	40 %	0 %	40 %	408357745
2099	NC_018704	AAATA	2	10	2539110	2539119	80 %	20 %	0 %	0 %	408357746
2100	NC_018704	AGAAA	2	10	2539709	2539718	80 %	0 %	20 %	0 %	408357746
2101	NC_018704	CAAAA	2	10	2540198	2540207	80 %	0 %	0 %	20 %	408357746
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2103	NC_018704	GCTTT	2	10	2543628	2543637	0 %	60 %	20 %	20 %	408357749
2104	NC_018704	CAACC	2	10	2547296	2547305	40 %	0 %	0 %	60 %	408357752
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2106	NC_018704	TAAAT	2	10	2550968	2550977	60 %	40 %	0 %	0 %	408357755
2107	NC_018704	TAAAA	2	10	2552416	2552425	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2108	NC_018704	TTAAT	2	10	2555111	2555120	40 %	60 %	0 %	0 %	408357757
2109	NC_018704	TTGCT	2	10	2555618	2555627	0 %	60 %	20 %	20 %	408357759
2110	NC_018704	ATTGA	2	10	2555629	2555638	40 %	40 %	20 %	0 %	408357759
2111	NC_018704	TATCA	2	10	2558034	2558043	40 %	40 %	0 %	20 %	408357763
2112	NC_018704	AGATT	2	10	2559400	2559409	40 %	40 %	20 %	0 %	408357764
2113	NC_018704	ATTAA	2	10	2560276	2560285	60 %	40 %	0 %	0 %	408357765
2114	NC_018704	TTATA	2	10	2561613	2561622	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2115	NC_018704	TCATT	2	10	2564601	2564610	20 %	60 %	0 %	20 %	408357769
2116	NC_018704	TATCT	2	10	2569174	2569183	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2117	NC_018704	ATATT	2	10	2569355	2569364	40 %	60 %	0 %	0 %	408357774

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.