MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMB

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018701	GTTTCG	2	12	11302	11313	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018701	TGGGGC	2	12	28711	28722	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018701	CGAAAC	2	12	29499	29510	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018701	GCTGAA	2	12	77229	77240	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018701	GAAAGG	2	12	135441	135452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018701	CGATTG	2	12	159344	159355	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018701	GCCTGT	2	12	192119	192130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018701	TTGCAC	2	12	199179	199190	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018701	CGGCGC	2	12	228655	228666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018701	GGTGCC	2	12	285663	285674	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018701	TCCGCA	2	12	287525	287536	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018701	AGCTCA	2	12	301025	301036	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018701	CCGCCT	2	12	335462	335473	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_018701	CGGAAG	2	12	353999	354010	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018701	GAGATT	2	12	366301	366312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018701	AGCCAC	2	12	387700	387711	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018701	GTCTCG	2	12	388505	388516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018701	TTCGTC	2	12	394585	394596	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018701	CCGCGA	2	12	397616	397627	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018701	GGAATC	2	12	403375	403386	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018701	GCGCCG	2	12	439130	439141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018701	TGCCTG	2	12	489803	489814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018701	CCGGGA	2	12	504487	504498	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018701	GCCTTC	2	12	675198	675209	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018701	GCCTCC	2	12	777700	777711	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_018701	TTCATT	2	12	828733	828744	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018701	GAGACG	2	12	942743	942754	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018701	CTGCGG	2	12	984468	984479	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018701	GGCTTC	2	12	995782	995793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018701	CCATTC	2	12	1012153	1012164	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018701	CAATCA	2	12	1014320	1014331	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018701	TTTGCT	2	12	1035664	1035675	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018701	GCTGAC	2	12	1043445	1043456	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018701	CCGTTG	2	12	1063724	1063735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018701	ATTGCG	2	12	1092304	1092315	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018701	TAGGGG	2	12	1115222	1115233	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018701	GATCGA	2	12	1129714	1129725	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018701	GATCTC	2	12	1174921	1174932	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018701	TCACGC	2	12	1177823	1177834	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018701	GAAAGG	2	12	1201412	1201423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018701	CCGCTC	2	12	1369376	1369387	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_018701	GGCCCC	2	12	1444339	1444350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_018701	AGGCGA	2	12	1499363	1499374	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018701	GCTTAT	2	12	1552292	1552303	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018701	TAAATT	2	12	1559018	1559029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018701	CACCCT	2	12	1594210	1594221	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.