MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMB

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018701	GGGGC	2	10	9985	9994	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018701	GTAAT	2	10	15370	15379	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018701	GTTGC	2	10	18651	18660	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018701	GAGGG	2	10	28528	28537	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018701	GGTCG	2	10	28886	28895	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_018701	TCCAC	2	10	32825	32834	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
7	NC_018701	CGTGC	2	10	50080	50089	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_018701	TGCCG	2	10	60977	60986	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_018701	GCCGA	2	10	77218	77227	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_018701	CTGCC	2	10	87265	87274	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_018701	GGCCG	2	10	102777	102786	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_018701	CGGCG	2	10	107420	107429	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_018701	CGGTC	2	10	107462	107471	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_018701	TGCAG	2	10	120670	120679	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018701	TTGCG	2	10	120728	120737	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018701	TTCCT	2	10	134289	134298	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_018701	GGGGA	2	10	135918	135927	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018701	AGCCG	2	10	142507	142516	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_018701	CAAAG	2	10	154389	154398	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018701	GGGCA	2	10	202696	202705	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_018701	CAGCC	2	10	203322	203331	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_018701	CTGCC	2	10	209963	209972	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_018701	GGCAG	2	10	210123	210132	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018701	TTGAA	2	10	224659	224668	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018701	AGCAC	2	10	250415	250424	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_018701	GTCGA	2	10	294834	294843	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_018701	GCGCG	2	10	301110	301119	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_018701	GAGCA	2	10	307856	307865	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018701	AGCGG	2	10	319024	319033	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_018701	TCCCG	2	10	329169	329178	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_018701	CGACC	2	10	332970	332979	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_018701	AGTGA	2	10	333206	333215	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018701	GGAGG	2	10	338764	338773	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018701	TTGCA	2	10	344661	344670	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018701	GGCCG	2	10	348463	348472	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_018701	CGTTG	2	10	359038	359047	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018701	GCAGC	2	10	366393	366402	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_018701	CCCAT	2	10	387406	387415	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_018701	CAGAT	2	10	387608	387617	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018701	GCTGC	2	10	387824	387833	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_018701	CGAGG	2	10	390224	390233	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018701	GGATC	2	10	393011	393020	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018701	TGCAA	2	10	427399	427408	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018701	CGACC	2	10	431011	431020	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_018701	ACAAA	2	10	446510	446519	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018701	GGTCG	2	10	450746	450755	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018701	GTTTT	2	10	474864	474873	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018701	GCCGG	2	10	477519	477528	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
49	NC_018701	CTGCC	2	10	480750	480759	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
50	NC_018701	GGCAG	2	10	482071	482080	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018701	CGGGA	2	10	486709	486718	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018701	CCGCA	2	10	489863	489872	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
53	NC_018701	CGACC	2	10	497184	497193	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
54	NC_018701	GGGAG	2	10	516338	516347	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018701	CGCGG	2	10	551593	551602	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
56	NC_018701	ATCAG	2	10	551774	551783	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018701	CCGGC	2	10	558099	558108	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_018701	AAAAC	2	10	570692	570701	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018701	TCGGA	2	10	576605	576614	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018701	GAAAC	2	10	576621	576630	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018701	GTGCG	2	10	592879	592888	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018701	CCTTG	2	10	607669	607678	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_018701	CCCCG	2	10	612379	612388	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
64	NC_018701	TCCGG	2	10	613009	613018	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_018701	GAGCG	2	10	617381	617390	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018701	GGGCA	2	10	619401	619410	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018701	GAGCG	2	10	629092	629101	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018701	CGCCC	2	10	631674	631683	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
69	NC_018701	AAATC	2	10	655506	655515	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_018701	TCCGG	2	10	676873	676882	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_018701	GGTCG	2	10	693693	693702	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018701	ATGGC	3	15	695336	695350	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018701	GACGT	2	10	722519	722528	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018701	GGGCG	2	10	722617	722626	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
75	NC_018701	TTTTA	2	10	740597	740606	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018701	GCCCT	2	10	741444	741453	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_018701	AGAGC	2	10	757041	757050	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018701	ATTTG	2	10	784241	784250	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018701	CGACC	2	10	801429	801438	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_018701	AGTGA	2	10	805921	805930	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018701	TGCGG	2	10	813173	813182	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018701	CGCAT	2	10	828786	828795	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_018701	GCCGC	2	10	834408	834417	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
84	NC_018701	GGCGG	2	10	860212	860221	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
85	NC_018701	GCAAG	2	10	872013	872022	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018701	AAAAT	2	10	889043	889052	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018701	CTTCG	2	10	894681	894690	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_018701	TCCCG	2	10	897529	897538	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
89	NC_018701	CCCCT	2	10	901097	901106	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
90	NC_018701	TTTCA	2	10	901303	901312	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_018701	TACCG	2	10	917910	917919	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_018701	ATCTA	2	10	917994	918003	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_018701	TTGCG	2	10	919338	919347	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_018701	CGGGT	2	10	935048	935057	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_018701	TGCGG	2	10	935167	935176	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018701	CGGCC	2	10	978024	978033	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
97	NC_018701	GCGGA	2	10	982211	982220	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
98	NC_018701	CGCCC	2	10	984934	984943	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
99	NC_018701	GTCCC	2	10	993272	993281	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
100	NC_018701	TGCAG	2	10	997289	997298	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_018701	CGGTG	2	10	998939	998948	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
102	NC_018701	CAAAA	2	10	999420	999429	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_018701	TGCGC	2	10	999598	999607	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_018701	CCGTT	2	10	1001318	1001327	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_018701	GCCGG	2	10	1003606	1003615	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
106	NC_018701	GCCGC	2	10	1006846	1006855	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
107	NC_018701	GTTGG	2	10	1012878	1012887	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018701	CTAAC	2	10	1013152	1013161	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_018701	ATCGC	2	10	1013707	1013716	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_018701	GATCG	2	10	1013933	1013942	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_018701	CCCGG	2	10	1016360	1016369	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
112	NC_018701	GTTGA	2	10	1037706	1037715	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018701	CGAAC	2	10	1039189	1039198	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_018701	CGGCG	2	10	1043565	1043574	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
115	NC_018701	AGCAG	2	10	1047034	1047043	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_018701	CCGAT	2	10	1051435	1051444	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_018701	ACAAA	2	10	1052173	1052182	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_018701	TTGGT	2	10	1059931	1059940	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018701	CTTGT	2	10	1065833	1065842	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018701	ACCTT	2	10	1075178	1075187	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_018701	GCCGC	2	10	1083766	1083775	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
122	NC_018701	GCGAC	2	10	1084025	1084034	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_018701	AGGGA	2	10	1087162	1087171	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018701	CGCCA	2	10	1089194	1089203	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
125	NC_018701	TCACC	2	10	1089249	1089258	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
126	NC_018701	GACGC	2	10	1105140	1105149	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_018701	GATCA	2	10	1109316	1109325	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_018701	GCATC	2	10	1114142	1114151	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_018701	TCGCT	2	10	1116850	1116859	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_018701	TCCCT	2	10	1118631	1118640	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
131	NC_018701	CCTGC	2	10	1132556	1132565	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
132	NC_018701	GCTAT	2	10	1133867	1133876	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_018701	ACGGC	2	10	1143361	1143370	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_018701	GTCCC	2	10	1150759	1150768	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_018701	AAATC	2	10	1156166	1156175	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018701	TCTGG	2	10	1165585	1165594	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_018701	CGCGC	2	10	1165944	1165953	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
138	NC_018701	CCTTG	2	10	1167022	1167031	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_018701	ACGGC	2	10	1173892	1173901	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_018701	GAAAG	2	10	1175888	1175897	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018701	CAACA	2	10	1178821	1178830	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_018701	AGCCT	2	10	1182323	1182332	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_018701	GAGCT	2	10	1191021	1191030	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_018701	CTTCC	2	10	1198658	1198667	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
145	NC_018701	CGACG	2	10	1223356	1223365	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
146	NC_018701	ACTCC	2	10	1226659	1226668	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
147	NC_018701	CGATT	2	10	1257898	1257907	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_018701	TTCCG	2	10	1269198	1269207	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_018701	AAACG	2	10	1273742	1273751	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_018701	CGCCA	2	10	1277354	1277363	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
151	NC_018701	GAAAG	2	10	1289529	1289538	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018701	CTGCC	2	10	1292064	1292073	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
153	NC_018701	TAGAG	2	10	1297386	1297395	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_018701	GGGAG	2	10	1341182	1341191	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018701	TGTTA	2	10	1346443	1346452	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018701	CGGGG	2	10	1347436	1347445	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
158	NC_018701	GACAG	2	10	1369255	1369264	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
159	NC_018701	AAATA	2	10	1383411	1383420	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018701	GGTCG	2	10	1389953	1389962	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
161	NC_018701	GCCGG	2	10	1392004	1392013	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
162	NC_018701	TTTGC	2	10	1413054	1413063	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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164	NC_018701	GAAAA	2	10	1432603	1432612	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
165	NC_018701	CGATC	3	15	1444324	1444338	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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167	NC_018701	CTTTC	2	10	1457734	1457743	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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173	NC_018701	ACACT	2	10	1544609	1544618	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
174	NC_018701	GCCTC	2	10	1558673	1558682	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
175	NC_018701	CCGCG	2	10	1560934	1560943	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
176	NC_018701	GCACG	2	10	1576973	1576982	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
177	NC_018701	CTGCC	2	10	1577028	1577037	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
178	NC_018701	GGCAG	2	10	1577212	1577221	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
179	NC_018701	AGATT	2	10	1582895	1582904	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_018701	TCCCC	2	10	1591954	1591963	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
182	NC_018701	TTGCG	2	10	1600185	1600194	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
183	NC_018701	TTTCC	2	10	1604605	1604614	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
184	NC_018701	GCGCC	2	10	1611781	1611790	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
185	NC_018701	GGCGC	2	10	1625236	1625245	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
186	NC_018701	CGCCA	2	10	1628448	1628457	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
187	NC_018701	GTGCC	2	10	1647167	1647176	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
188	NC_018701	CGACC	2	10	1651213	1651222	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.