MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMB

Total Repeats: 1003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018701	GCGTG	2	10	5976	5985	0 %	20 %	60 %	20 %	407722714
2	NC_018701	GGCTC	2	10	6082	6091	0 %	20 %	40 %	40 %	407722714
3	NC_018701	TGCCG	2	10	7683	7692	0 %	20 %	40 %	40 %	407722716
4	NC_018701	GCGCC	2	10	9092	9101	0 %	0 %	40 %	60 %	407722717
5	NC_018701	CTAGA	2	10	9607	9616	40 %	20 %	20 %	20 %	407722717
6	NC_018701	GGCGT	2	10	10674	10683	0 %	20 %	60 %	20 %	407722718
7	NC_018701	CAAGC	2	10	10823	10832	40 %	0 %	20 %	40 %	407722718
8	NC_018701	GCGCC	2	10	11185	11194	0 %	0 %	40 %	60 %	407722718
9	NC_018701	CCGAG	2	10	17516	17525	20 %	0 %	40 %	40 %	407722724
10	NC_018701	CTCGA	2	10	17985	17994	20 %	20 %	20 %	40 %	407722725
11	NC_018701	GGATG	2	10	19118	19127	20 %	20 %	60 %	0 %	407722726
12	NC_018701	CGCAG	2	10	19931	19940	20 %	0 %	40 %	40 %	407722727
13	NC_018701	GCCGA	2	10	20440	20449	20 %	0 %	40 %	40 %	407722727
14	NC_018701	GCCGG	2	10	22318	22327	0 %	0 %	60 %	40 %	407722729
15	NC_018701	TGACG	2	10	25440	25449	20 %	20 %	40 %	20 %	407722731
16	NC_018701	GCCAG	2	10	26046	26055	20 %	0 %	40 %	40 %	407722731
17	NC_018701	GCTCG	2	10	29888	29897	0 %	20 %	40 %	40 %	407722734
18	NC_018701	GCCCT	2	10	31287	31296	0 %	20 %	20 %	60 %	407722734
19	NC_018701	CGATC	2	10	33215	33224	20 %	20 %	20 %	40 %	407722736
20	NC_018701	TCGCC	2	10	40525	40534	0 %	20 %	20 %	60 %	407722742
21	NC_018701	CGGCC	2	10	42115	42124	0 %	0 %	40 %	60 %	407722742
22	NC_018701	GAAAA	2	10	42723	42732	80 %	0 %	20 %	0 %	407722743
23	NC_018701	TCCGG	2	10	43078	43087	0 %	20 %	40 %	40 %	407722743
24	NC_018701	CGGCG	2	10	44599	44608	0 %	0 %	60 %	40 %	407722744
25	NC_018701	TGTCA	2	10	44650	44659	20 %	40 %	20 %	20 %	407722744
26	NC_018701	CGCGG	2	10	44996	45005	0 %	0 %	60 %	40 %	407722745
27	NC_018701	TTCGC	2	10	45504	45513	0 %	40 %	20 %	40 %	407722745
28	NC_018701	ACGAA	2	10	48158	48167	60 %	0 %	20 %	20 %	407722747
29	NC_018701	CCGGT	2	10	48316	48325	0 %	20 %	40 %	40 %	407722747
30	NC_018701	GGCGA	2	10	54754	54763	20 %	0 %	60 %	20 %	407722753
31	NC_018701	GCAGG	2	10	57314	57323	20 %	0 %	60 %	20 %	407722755
32	NC_018701	GGATG	2	10	59784	59793	20 %	20 %	60 %	0 %	407722758
33	NC_018701	CGGGT	2	10	63155	63164	0 %	20 %	60 %	20 %	407722761
34	NC_018701	CTCGA	2	10	64475	64484	20 %	20 %	20 %	40 %	407722762
35	NC_018701	AACAC	2	10	68992	69001	60 %	0 %	0 %	40 %	407722765
36	NC_018701	CGGCG	2	10	73917	73926	0 %	0 %	60 %	40 %	407722769
37	NC_018701	CGGAG	2	10	75918	75927	20 %	0 %	60 %	20 %	407722772
38	NC_018701	GGCCG	2	10	78721	78730	0 %	0 %	60 %	40 %	407722774
39	NC_018701	GGCGG	2	10	81918	81927	0 %	0 %	80 %	20 %	407722777
40	NC_018701	GTGGC	2	10	83352	83361	0 %	20 %	60 %	20 %	407722779
41	NC_018701	TGCGC	2	10	85669	85678	0 %	20 %	40 %	40 %	407722780
42	NC_018701	TGCCG	2	10	88828	88837	0 %	20 %	40 %	40 %	407722784
43	NC_018701	GGGAC	2	10	91891	91900	20 %	0 %	60 %	20 %	407722786
44	NC_018701	GATCG	2	10	92712	92721	20 %	20 %	40 %	20 %	407722788
45	NC_018701	GAAAT	2	10	94118	94127	60 %	20 %	20 %	0 %	407722790
46	NC_018701	TGTCG	2	10	95255	95264	0 %	40 %	40 %	20 %	407722791
47	NC_018701	GATGC	2	10	96707	96716	20 %	20 %	40 %	20 %	407722793
48	NC_018701	CGGAG	2	10	97291	97300	20 %	0 %	60 %	20 %	407722793
49	NC_018701	AGGGC	2	10	97723	97732	20 %	0 %	60 %	20 %	407722793
50	NC_018701	TGCCG	2	10	100722	100731	0 %	20 %	40 %	40 %	407722796
51	NC_018701	GGCCC	2	10	105949	105958	0 %	0 %	40 %	60 %	407722802
52	NC_018701	TCGGC	2	10	106582	106591	0 %	20 %	40 %	40 %	407722802
53	NC_018701	GGCGA	2	10	108384	108393	20 %	0 %	60 %	20 %	407722803
54	NC_018701	TCGCC	2	10	108650	108659	0 %	20 %	20 %	60 %	407722803
55	NC_018701	AGATC	2	10	114668	114677	40 %	20 %	20 %	20 %	407722807
56	NC_018701	TCGTC	2	10	116846	116855	0 %	40 %	20 %	40 %	407722808
57	NC_018701	CGCGC	2	10	118644	118653	0 %	0 %	40 %	60 %	407722808
58	NC_018701	AGCGC	2	10	118880	118889	20 %	0 %	40 %	40 %	407722808
59	NC_018701	TCAGC	2	10	119274	119283	20 %	20 %	20 %	40 %	407722809
60	NC_018701	GGCGA	2	10	119344	119353	20 %	0 %	60 %	20 %	407722809
61	NC_018701	TCGGC	2	10	121423	121432	0 %	20 %	40 %	40 %	407722812
62	NC_018701	GGCGA	2	10	122305	122314	20 %	0 %	60 %	20 %	407722813
63	NC_018701	GCTCG	2	10	122949	122958	0 %	20 %	40 %	40 %	407722813
64	NC_018701	CCTTG	2	10	127845	127854	0 %	40 %	20 %	40 %	407722818
65	NC_018701	GCCGC	2	10	130744	130753	0 %	0 %	40 %	60 %	407722821
66	NC_018701	GCCGC	2	10	131592	131601	0 %	0 %	40 %	60 %	407722821
67	NC_018701	ACGCG	2	10	132139	132148	20 %	0 %	40 %	40 %	407722821
68	NC_018701	GAAAG	2	10	134442	134451	60 %	0 %	40 %	0 %	407722824
69	NC_018701	GCCGG	2	10	135614	135623	0 %	0 %	60 %	40 %	407722825
70	NC_018701	TCGCC	2	10	140242	140251	0 %	20 %	20 %	60 %	407722830
71	NC_018701	AAGCG	2	10	140897	140906	40 %	0 %	40 %	20 %	407722830
72	NC_018701	CATCG	2	10	142851	142860	20 %	20 %	20 %	40 %	407722832
73	NC_018701	TACGC	2	10	143874	143883	20 %	20 %	20 %	40 %	407722833
74	NC_018701	CGGCG	2	10	143928	143937	0 %	0 %	60 %	40 %	407722833
75	NC_018701	GCTCG	2	10	144153	144162	0 %	20 %	40 %	40 %	407722833
76	NC_018701	GGAAC	2	10	145203	145212	40 %	0 %	40 %	20 %	407722834
77	NC_018701	GCTCG	2	10	145841	145850	0 %	20 %	40 %	40 %	407722834
78	NC_018701	TCGCC	2	10	148178	148187	0 %	20 %	20 %	60 %	407722836
79	NC_018701	CGCGC	2	10	148782	148791	0 %	0 %	40 %	60 %	407722837
80	NC_018701	TTCCA	2	10	150295	150304	20 %	40 %	0 %	40 %	407722839
81	NC_018701	CCGCG	2	10	152014	152023	0 %	0 %	40 %	60 %	407722841
82	NC_018701	GCGTC	2	10	157074	157083	0 %	20 %	40 %	40 %	407722844
83	NC_018701	TCGGC	2	10	157705	157714	0 %	20 %	40 %	40 %	407722845
84	NC_018701	TCCGG	2	10	158573	158582	0 %	20 %	40 %	40 %	407722846
85	NC_018701	CGAGG	2	10	158794	158803	20 %	0 %	60 %	20 %	407722846
86	NC_018701	CGATG	2	10	158979	158988	20 %	20 %	40 %	20 %	407722846
87	NC_018701	ACGGC	2	10	162507	162516	20 %	0 %	40 %	40 %	407722849
88	NC_018701	CGCGT	2	10	162646	162655	0 %	20 %	40 %	40 %	407722850
89	NC_018701	CGGCG	2	10	165773	165782	0 %	0 %	60 %	40 %	407722852
90	NC_018701	TCAGG	2	10	166881	166890	20 %	20 %	40 %	20 %	407722853
91	NC_018701	ACCGC	2	10	166994	167003	20 %	0 %	20 %	60 %	407722853
92	NC_018701	TGTAT	2	10	168243	168252	20 %	60 %	20 %	0 %	407722853
93	NC_018701	GGGTC	2	10	168579	168588	0 %	20 %	60 %	20 %	407722853
94	NC_018701	TTGCG	2	10	168693	168702	0 %	40 %	40 %	20 %	407722853
95	NC_018701	CGTTG	2	10	169483	169492	0 %	40 %	40 %	20 %	407722853
96	NC_018701	GCCGG	2	10	169880	169889	0 %	0 %	60 %	40 %	407722854
97	NC_018701	GTGCG	2	10	171073	171082	0 %	20 %	60 %	20 %	407722855
98	NC_018701	TCCTG	2	10	174273	174282	0 %	40 %	20 %	40 %	407722859
99	NC_018701	GCCCG	2	10	175114	175123	0 %	0 %	40 %	60 %	407722859
100	NC_018701	AGACG	2	10	180123	180132	40 %	0 %	40 %	20 %	407722864
101	NC_018701	CGGCT	2	10	184333	184342	0 %	20 %	40 %	40 %	407722869
102	NC_018701	CCGGT	2	10	187743	187752	0 %	20 %	40 %	40 %	407722871
103	NC_018701	GGCGC	2	10	188187	188196	0 %	0 %	60 %	40 %	407722871
104	NC_018701	CGATC	2	10	191939	191948	20 %	20 %	20 %	40 %	407722873
105	NC_018701	GCCCA	2	10	192800	192809	20 %	0 %	20 %	60 %	407722874
106	NC_018701	AAGGG	2	10	194191	194200	40 %	0 %	60 %	0 %	407722875
107	NC_018701	GCCCG	2	10	195119	195128	0 %	0 %	40 %	60 %	407722876
108	NC_018701	GCGCG	2	10	196227	196236	0 %	0 %	60 %	40 %	407722878
109	NC_018701	GCGAC	2	10	196968	196977	20 %	0 %	40 %	40 %	407722878
110	NC_018701	ACCTC	2	10	208242	208251	20 %	20 %	0 %	60 %	407722890
111	NC_018701	CGGCG	2	10	209058	209067	0 %	0 %	60 %	40 %	407722891
112	NC_018701	GCGAT	2	10	209120	209129	20 %	20 %	40 %	20 %	407722891
113	NC_018701	ATCCG	2	10	209156	209165	20 %	20 %	20 %	40 %	407722891
114	NC_018701	CGGCG	2	10	209764	209773	0 %	0 %	60 %	40 %	407722891
115	NC_018701	TCTTG	2	10	211097	211106	0 %	60 %	20 %	20 %	407722892
116	NC_018701	CGCTG	2	10	215359	215368	0 %	20 %	40 %	40 %	407722896
117	NC_018701	GGGGC	2	10	215475	215484	0 %	0 %	80 %	20 %	407722896
118	NC_018701	CAGAA	2	10	215978	215987	60 %	0 %	20 %	20 %	407722896
119	NC_018701	TGCGC	2	10	216334	216343	0 %	20 %	40 %	40 %	407722897
120	NC_018701	AGCGC	2	10	217985	217994	20 %	0 %	40 %	40 %	407722899
121	NC_018701	GATCA	2	10	224484	224493	40 %	20 %	20 %	20 %	407722905
122	NC_018701	AGGGA	2	10	224966	224975	40 %	0 %	60 %	0 %	407722906
123	NC_018701	CGGCG	2	10	225411	225420	0 %	0 %	60 %	40 %	407722907
124	NC_018701	GATGT	2	10	226343	226352	20 %	40 %	40 %	0 %	407722907
125	NC_018701	CAGTG	2	10	227366	227375	20 %	20 %	40 %	20 %	407722908
126	NC_018701	GGCCG	2	10	228206	228215	0 %	0 %	60 %	40 %	407722909
127	NC_018701	AGCGC	2	10	229063	229072	20 %	0 %	40 %	40 %	407722910
128	NC_018701	TGCGA	2	10	229866	229875	20 %	20 %	40 %	20 %	407722910
129	NC_018701	GTCGC	2	10	230061	230070	0 %	20 %	40 %	40 %	407722910
130	NC_018701	GAGCG	2	10	234393	234402	20 %	0 %	60 %	20 %	407722915
131	NC_018701	GCATG	2	10	235612	235621	20 %	20 %	40 %	20 %	407722916
132	NC_018701	GGCCG	2	10	236769	236778	0 %	0 %	60 %	40 %	407722916
133	NC_018701	GCGCC	2	10	239841	239850	0 %	0 %	40 %	60 %	407722919
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257	NC_018701	CATTG	2	10	453562	453571	20 %	40 %	20 %	20 %	407723140
258	NC_018701	TCTTG	2	10	459855	459864	0 %	60 %	20 %	20 %	407723146
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262	NC_018701	GGCAT	2	10	467160	467169	20 %	20 %	40 %	20 %	407723152
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