MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018700	CGCAGG	2	12	37742	37753	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018700	GACAGG	2	12	82609	82620	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018700	CAAAAA	2	12	166233	166244	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018700	GACGAA	2	12	186466	186477	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018700	CGGCTT	2	12	319536	319547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018700	GACAAG	2	12	341100	341111	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018700	AACAAA	2	12	384751	384762	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018700	GAAGCG	2	12	465004	465015	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018700	CGTCGG	2	12	484491	484502	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018700	CCGAAC	2	12	504196	504207	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018700	GGCCGC	2	12	513187	513198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018700	AAATAT	2	12	624600	624611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018700	CGATAG	2	12	628951	628962	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018700	TATAGG	2	12	642496	642507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018700	TCAACG	2	12	643595	643606	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018700	GTTAGA	2	12	651077	651088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018700	CTGGCT	2	12	678553	678564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018700	GCTTGC	2	12	719481	719492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018700	TTCGGC	2	12	722170	722181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018700	GTTTAC	2	12	725235	725246	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018700	CTTCCC	2	12	729747	729758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_018700	GAATCG	2	12	741889	741900	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018700	GCGCGT	2	12	802040	802051	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018700	GTCCCG	2	12	833468	833479	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018700	CTCCAG	2	12	844135	844146	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018700	TTTCCG	2	12	877774	877785	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018700	GTGCCG	2	12	887931	887942	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018700	GCGGGG	2	12	951459	951470	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018700	CGGCGC	2	12	972262	972273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018700	GACGCG	2	12	1104159	1104170	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018700	CGTTCA	2	12	1114355	1114366	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018700	CAGGAA	2	12	1120199	1120210	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018700	AAGTAG	2	12	1134625	1134636	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018700	TGCCGG	2	12	1172301	1172312	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018700	CCGGCC	2	12	1175882	1175893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_018700	CGGCCG	2	12	1233673	1233684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018700	CGAATG	2	12	1241049	1241060	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018700	TTTCCT	2	12	1245808	1245819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018700	AGACGG	2	12	1297131	1297142	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_018700	CAAATT	2	12	1324892	1324903	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018700	CGTTGA	2	12	1372015	1372026	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018700	GATGAG	2	12	1374992	1375003	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018700	AGGCTG	2	12	1393207	1393218	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018700	GGTGCT	2	12	1393255	1393266	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018700	ACCGAA	2	12	1431167	1431178	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018700	GCACCG	2	12	1468319	1468330	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018700	ATCGTG	2	12	1475620	1475631	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018700	GTAGCA	2	12	1495074	1495085	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018700	GGTCAT	2	12	1564028	1564039	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018700	CGGTCT	2	12	1565101	1565112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018700	CTGTCG	2	12	1619139	1619150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018700	TTTGCG	2	12	1701099	1701110	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018700	CGGTGC	2	12	1701822	1701833	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018700	AGACCG	2	12	1701863	1701874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018700	ATGCCG	2	12	1736381	1736392	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018700	AGAAGG	2	12	1788009	1788020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018700	ATTTGC	2	12	1834795	1834806	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018700	CAAATG	2	12	1836644	1836655	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018700	CGCCAG	2	12	1837732	1837743	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018700	AAAGCG	2	12	1838092	1838103	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018700	CTTTTC	2	12	1853225	1853236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018700	TCTCGA	2	12	1853995	1854006	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018700	AAGACA	2	12	1866505	1866516	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_018700	CGGGAT	2	12	1896128	1896139	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_018700	CAAGGC	2	12	1904429	1904440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018700	TTAATT	2	12	1923761	1923772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018700	CCGCGT	2	12	1954826	1954837	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018700	GCCTCC	2	12	1968955	1968966	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_018700	CATTGG	2	12	1982601	1982612	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_018700	GTAACT	2	12	2001584	2001595	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_018700	GGGCTG	2	12	2010504	2010515	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_018700	CCGGTT	2	12	2036710	2036721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018700	CGGCCG	2	12	2106609	2106620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018700	GAGGCC	2	12	2162116	2162127	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018700	TTTGCT	2	12	2190400	2190411	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018700	TGATTC	2	12	2244066	2244077	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018700	GGACGA	2	12	2252586	2252597	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018700	GCGATG	2	12	2281501	2281512	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018700	ATCTCC	2	12	2291881	2291892	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018700	AAATGA	2	12	2387455	2387466	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018700	GCGCTC	2	12	2394344	2394355	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018700	ACGATC	2	12	2394629	2394640	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018700	GCGGCC	2	12	2423249	2423260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018700	TCGCCC	2	12	2436326	2436337	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_018700	GGCTGC	2	12	2516056	2516067	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018700	CCGGAT	2	12	2525710	2525721	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018700	GAGAAA	2	12	2528888	2528899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018700	TTTCTC	2	12	2530767	2530778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018700	GAATAA	2	12	2541531	2541542	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018700	GACCGA	2	12	2543875	2543886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018700	ACGTAA	2	12	2569616	2569627	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018700	AGCGGC	2	12	2614245	2614256	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018700	AGAGCG	2	12	2636367	2636378	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018700	GTCTAG	2	12	2658311	2658322	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_018700	TCATGT	2	12	2752110	2752121	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018700	ACATGA	2	12	2752145	2752156	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_018700	GAAGCG	2	12	2769050	2769061	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018700	GCGTTC	2	12	2774348	2774359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018700	ATTCCC	2	12	2823884	2823895	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018700	GATTGA	2	12	2847243	2847254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018700	GAAAAG	2	12	2849290	2849301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018700	CAAGCG	2	12	2898612	2898623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018700	TATGTG	2	12	2925449	2925460	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018700	CCGGAT	2	12	2926705	2926716	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018700	GAGAAA	2	12	2929849	2929860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018700	TTTCTC	2	12	2931729	2931740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018700	CCGAGT	2	12	2954615	2954626	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018700	ACGTAA	2	12	3036125	3036136	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_018700	CATGTT	2	12	3093537	3093548	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_018700	CAGCCC	2	12	3145016	3145027	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_018700	GGGGCC	2	12	3175659	3175670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018700	GAATCG	2	12	3176505	3176516	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_018700	GCATAT	2	12	3187934	3187945	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_018700	CCTCTC	2	12	3203504	3203515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_018700	TTTGCG	2	12	3244528	3244539	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_018700	CTCGGT	2	12	3251018	3251029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018700	CAAATA	2	12	3263052	3263063	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_018700	AGTGTC	2	12	3289042	3289053	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_018700	TCCCGC	2	12	3334204	3334215	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_018700	CGTTTC	2	12	3357559	3357570	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018700	AGAGAA	2	12	3364317	3364328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018700	TTTCTC	2	12	3366197	3366208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018700	ATCCGG	2	12	3369341	3369352	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018700	CAAAAG	2	12	3400428	3400439	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_018700	TATTTT	2	12	3412499	3412510	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018700	GCGCGA	2	12	3439783	3439794	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018700	AGCCGC	2	12	3456315	3456326	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018700	CAGCGG	2	12	3488289	3488300	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018700	CGCGCT	2	12	3530432	3530443	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_018700	CTGCCC	2	12	3531542	3531553	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_018700	ATGGTG	2	12	3602631	3602642	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018700	TCGACT	2	12	3629577	3629588	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018700	CGGGAA	2	12	3646831	3646842	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_018700	GGATAT	2	12	3653621	3653632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.