MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41

Total Repeats: 1475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018700	TCCG	2	8	7077	7084	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018700	CCGC	2	8	7178	7185	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_018700	CCGC	2	8	10130	10137	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_018700	GGCT	2	8	11056	11063	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018700	GGCA	2	8	13641	13648	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018700	ATAC	2	8	15784	15791	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018700	CTGC	2	8	24824	24831	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018700	CGAA	2	8	24870	24877	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_018700	GCTT	2	8	24959	24966	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018700	CGGC	2	8	30198	30205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018700	CCGC	2	8	39017	39024	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NC_018700	GATT	2	8	44273	44280	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018700	TGCC	2	8	46006	46013	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018700	CCCG	2	8	46693	46700	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_018700	GGCG	2	8	48218	48225	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018700	CCTG	2	8	49983	49990	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018700	CGGA	2	8	53816	53823	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_018700	GCTC	2	8	58561	58568	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018700	ATGC	2	8	63871	63878	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018700	AGCG	2	8	67162	67169	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018700	GATC	2	8	74757	74764	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018700	GGTA	2	8	82300	82307	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018700	ATTT	2	8	82314	82321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018700	TCGC	2	8	84661	84668	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018700	TCCG	2	8	87143	87150	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018700	GCAC	2	8	88818	88825	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018700	GGAA	2	8	91515	91522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018700	CAAA	2	8	92470	92477	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018700	CGAG	2	8	94282	94289	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018700	GGCC	2	8	95820	95827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018700	GCTC	2	8	96960	96967	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018700	CTCG	2	8	101370	101377	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018700	GCCG	2	8	102881	102888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018700	GGAA	2	8	102931	102938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018700	CGCA	2	8	105210	105217	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018700	GCGA	2	8	105405	105412	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018700	CCGC	2	8	115832	115839	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_018700	CTGC	2	8	118555	118562	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018700	CATC	2	8	122411	122418	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018700	TGCC	2	8	122865	122872	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018700	CGGG	2	8	123763	123770	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018700	CGCT	2	8	125185	125192	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018700	CCGC	2	8	127217	127224	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_018700	CCGA	2	8	128030	128037	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018700	CGGG	2	8	128106	128113	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018700	CGCT	2	8	130451	130458	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018700	ATTT	2	8	130570	130577	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018700	TTGA	2	8	130602	130609	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018700	GCCG	2	8	134634	134641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018700	GGCG	2	8	139295	139302	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018700	TCCC	2	8	141249	141256	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_018700	GCCG	2	8	142862	142869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018700	AGAC	2	8	144191	144198	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018700	GTGC	2	8	148895	148902	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018700	CGCT	2	8	151203	151210	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018700	GCTG	2	8	151360	151367	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018700	TCCC	2	8	157646	157653	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_018700	AGGA	2	8	158513	158520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018700	CGGG	2	8	161474	161481	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018700	GGCG	2	8	162439	162446	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018700	AGCG	2	8	162690	162697	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018700	GTCC	2	8	162700	162707	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018700	CAGC	2	8	171463	171470	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018700	TCCT	2	8	171536	171543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018700	TAAA	2	8	171611	171618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018700	GCGG	2	8	172810	172817	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018700	CCGT	2	8	183676	183683	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018700	CCGC	2	8	183809	183816	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_018700	CCCG	2	8	186434	186441	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_018700	ATAC	2	8	186953	186960	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018700	CCGC	2	8	187001	187008	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_018700	CGGA	2	8	187044	187051	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_018700	GGGA	2	8	197861	197868	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018700	TTGG	2	8	202227	202234	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018700	CGGC	2	8	202239	202246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018700	GCGG	2	8	219880	219887	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018700	GCCA	2	8	220215	220222	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018700	TGGC	2	8	225498	225505	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_018700	ATCC	2	8	235483	235490	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018700	CGGC	2	8	236947	236954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018700	CCGC	2	8	237102	237109	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_018700	GCCG	2	8	239862	239869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018700	CAAC	2	8	243651	243658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018700	TGGC	2	8	245795	245802	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018700	ACGG	2	8	247979	247986	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018700	CATG	2	8	251200	251207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_018700	CGTT	2	8	252102	252109	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018700	CGCT	2	8	252254	252261	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018700	ATGA	2	8	252709	252716	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018700	GGCC	2	8	253502	253509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018700	ATTA	2	8	256174	256181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018700	AAGC	2	8	256633	256640	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_018700	TCAA	2	8	262146	262153	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018700	TGAT	2	8	262198	262205	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018700	CAAG	2	8	270023	270030	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018700	GACG	2	8	270153	270160	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_018700	GGCG	2	8	270163	270170	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_018700	GCAG	2	8	278660	278667	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_018700	GGGA	2	8	278717	278724	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018700	TGCC	2	8	278794	278801	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_018700	CCGG	2	8	278931	278938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_018700	TAAT	2	8	280878	280885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018700	AAGT	2	8	281083	281090	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018700	GGGT	2	8	284641	284648	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018700	CCCG	2	8	285763	285770	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
106	NC_018700	GCGG	2	8	285803	285810	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018700	CCGG	2	8	297135	297142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018700	AATG	2	8	298503	298510	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018700	CTTC	2	8	299891	299898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018700	AACC	2	8	300046	300053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018700	AGCA	2	8	300110	300117	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_018700	CGTT	2	8	301579	301586	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_018700	GGGA	2	8	304169	304176	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018700	TGAA	2	8	304231	304238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018700	CCTT	2	8	304333	304340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018700	GGCG	2	8	310040	310047	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018700	CCGC	2	8	320204	320211	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
118	NC_018700	GGAA	2	8	324795	324802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018700	CGGT	2	8	326327	326334	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018700	GGGC	2	8	326370	326377	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_018700	CGCT	2	8	332102	332109	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_018700	GCGG	2	8	332117	332124	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_018700	GAAG	2	8	339638	339645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018700	GGAT	2	8	340997	341004	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018700	TACA	2	8	344425	344432	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_018700	CCGG	2	8	345350	345357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_018700	GCCG	2	8	345365	345372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018700	GCGG	2	8	354860	354867	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_018700	ACTC	2	8	356775	356782	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_018700	CTGG	2	8	364798	364805	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_018700	TCCG	2	8	364909	364916	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018700	GGAA	2	8	368962	368969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018700	ACTC	2	8	368990	368997	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_018700	TCCG	2	8	370868	370875	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_018700	ATCA	2	8	374570	374577	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_018700	ATCG	2	8	375080	375087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_018700	GTGA	2	8	375165	375172	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018700	GCCG	2	8	375437	375444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_018700	CGCC	2	8	382559	382566	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
140	NC_018700	GCGG	2	8	384361	384368	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_018700	AAGC	2	8	384769	384776	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_018700	AGGT	2	8	390903	390910	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018700	TTGG	2	8	397148	397155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018700	CCGC	2	8	399061	399068	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
145	NC_018700	CGGC	2	8	400481	400488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_018700	CATG	2	8	400692	400699	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_018700	GAGG	2	8	400742	400749	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018700	AACC	2	8	400785	400792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_018700	GAGG	2	8	400857	400864	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018700	GCGG	2	8	403379	403386	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
151	NC_018700	CGAC	2	8	404944	404951	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_018700	CCCT	2	8	409089	409096	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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162	NC_018700	CCGC	2	8	425355	425362	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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443	NC_018700	GATC	3	12	1102783	1102794	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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446	NC_018700	GTGC	2	8	1109711	1109718	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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448	NC_018700	CCGC	2	8	1114328	1114335	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
449	NC_018700	CGAT	2	8	1114803	1114810	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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459	NC_018700	GAGG	2	8	1134746	1134753	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
460	NC_018700	GGCT	2	8	1142822	1142829	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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462	NC_018700	GCCG	2	8	1146466	1146473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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465	NC_018700	CCAG	2	8	1157401	1157408	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
466	NC_018700	TCGG	2	8	1159087	1159094	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
467	NC_018700	AGAT	2	8	1160193	1160200	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_018700	GCTG	2	8	1163018	1163025	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
473	NC_018700	TCGC	2	8	1165961	1165968	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
474	NC_018700	GCCA	2	8	1166985	1166992	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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480	NC_018700	GGGC	2	8	1178122	1178129	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
481	NC_018700	ATCG	2	8	1181313	1181320	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
482	NC_018700	GATT	2	8	1182898	1182905	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
483	NC_018700	TCGG	2	8	1196120	1196127	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
484	NC_018700	CGCT	2	8	1196193	1196200	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
485	NC_018700	CGGG	3	12	1196205	1196216	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
486	NC_018700	ACCG	2	8	1197320	1197327	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
487	NC_018700	GGCC	2	8	1197731	1197738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
488	NC_018700	AATC	2	8	1197802	1197809	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
489	NC_018700	TTTC	2	8	1198320	1198327	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
490	NC_018700	GGGA	2	8	1199419	1199426	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
491	NC_018700	CCGG	2	8	1202190	1202197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
492	NC_018700	ATTG	2	8	1204954	1204961	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
493	NC_018700	GCGG	2	8	1205331	1205338	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
494	NC_018700	GAAG	2	8	1205365	1205372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
495	NC_018700	GATT	2	8	1206684	1206691	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
496	NC_018700	CAAG	2	8	1206978	1206985	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
497	NC_018700	GCCA	2	8	1209584	1209591	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
498	NC_018700	GCGG	2	8	1213396	1213403	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
499	NC_018700	AAGA	2	8	1219532	1219539	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
500	NC_018700	CTGG	2	8	1221347	1221354	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

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