MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Leuconostoc carnosum JB16 plasmid pKLC4

Total Repeats: 393

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018699	TTC	2	6	656	661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719169
2	NC_018699	GTT	2	6	721	726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719169
3	NC_018699	TTC	3	9	782	790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719169
4	NC_018699	AGT	2	6	864	869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719169
5	NC_018699	AAT	2	6	968	973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719169
6	NC_018699	TGT	2	6	1001	1006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719169
7	NC_018699	TTG	2	6	1028	1033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719169
8	NC_018699	TGG	2	6	1083	1088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407719169
9	NC_018699	TCA	2	6	1131	1136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719169
10	NC_018699	TGT	2	6	1196	1201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719169
11	NC_018699	GTA	2	6	1337	1342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719169
12	NC_018699	ATC	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719169
13	NC_018699	TCA	2	6	1590	1595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719169
14	NC_018699	TCA	2	6	1611	1616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719169
15	NC_018699	CAA	2	6	1708	1713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719169
16	NC_018699	AAT	2	6	1739	1744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719169
17	NC_018699	GTT	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719169
18	NC_018699	AAC	2	6	1826	1831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719169
19	NC_018699	AAT	2	6	1877	1882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719169
20	NC_018699	TCA	2	6	1947	1952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719169
21	NC_018699	TAG	2	6	2032	2037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719169
22	NC_018699	GTA	2	6	2312	2317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719169
23	NC_018699	ATT	2	6	2330	2335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719169
24	NC_018699	CTT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719169
25	NC_018699	TTC	2	6	2685	2690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719170
26	NC_018699	CTT	2	6	2704	2709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719170
27	NC_018699	TTC	3	9	2942	2950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719170
28	NC_018699	TTG	2	6	3022	3027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719170
29	NC_018699	ATC	2	6	3047	3052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719170
30	NC_018699	CTG	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719170
31	NC_018699	TAG	2	6	3125	3130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719170
32	NC_018699	ATC	2	6	3224	3229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719170
33	NC_018699	ACC	2	6	3242	3247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719170
34	NC_018699	TAG	2	6	3346	3351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719171
35	NC_018699	ACC	2	6	3451	3456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719171
36	NC_018699	ACA	2	6	3469	3474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719171
37	NC_018699	GGC	2	6	3722	3727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719172
38	NC_018699	ATC	2	6	3791	3796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719172
39	NC_018699	TAA	4	12	3814	3825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719172
40	NC_018699	AGC	2	6	3887	3892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719172
41	NC_018699	TTG	2	6	4085	4090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719173
42	NC_018699	GTT	2	6	4259	4264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719173
43	NC_018699	ACT	2	6	4445	4450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719173
44	NC_018699	CTT	2	6	4513	4518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719173
45	NC_018699	TCA	2	6	4584	4589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719173
46	NC_018699	AAT	2	6	4592	4597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719173
47	NC_018699	ATC	2	6	4604	4609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719173
48	NC_018699	ATC	2	6	4868	4873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719174
49	NC_018699	GTC	2	6	4912	4917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719174
50	NC_018699	TCT	4	12	5117	5128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719175
51	NC_018699	TCA	2	6	5173	5178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719175
52	NC_018699	ACT	2	6	5202	5207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719175
53	NC_018699	ATT	2	6	5214	5219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719175
54	NC_018699	GTT	2	6	5236	5241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719175
55	NC_018699	ATT	2	6	5304	5309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719175
56	NC_018699	TGG	2	6	5508	5513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407719175
57	NC_018699	TCA	2	6	5527	5532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719175
58	NC_018699	CAA	2	6	5672	5677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719175
59	NC_018699	TTC	2	6	5736	5741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719175
60	NC_018699	TAC	2	6	5762	5767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719175
61	NC_018699	TTC	2	6	5841	5846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719175
62	NC_018699	TCT	2	6	6000	6005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719175
63	NC_018699	GTT	2	6	6016	6021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719175
64	NC_018699	CAA	2	6	6065	6070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719175
65	NC_018699	GTC	2	6	6207	6212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719175
66	NC_018699	GGT	2	6	6730	6735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407719176
67	NC_018699	AGT	2	6	6991	6996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719176
68	NC_018699	CTT	2	6	7059	7064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719176
69	NC_018699	ACA	3	9	7409	7417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719177
70	NC_018699	AAT	2	6	7487	7492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719177
71	NC_018699	AGT	2	6	7578	7583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719177
72	NC_018699	ATG	2	6	7594	7599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719177
73	NC_018699	AAC	2	6	7650	7655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719177
74	NC_018699	TCA	2	6	7719	7724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719178
75	NC_018699	GAA	2	6	7755	7760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719178
76	NC_018699	CTA	2	6	7842	7847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719178
77	NC_018699	TGA	2	6	7880	7885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719178
78	NC_018699	TTG	2	6	8010	8015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719179
79	NC_018699	CAA	2	6	8025	8030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719179
80	NC_018699	TTA	2	6	8102	8107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719179
81	NC_018699	ACT	2	6	8195	8200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719179
82	NC_018699	TTA	2	6	8207	8212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719179
83	NC_018699	GTT	2	6	8402	8407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719179
84	NC_018699	ATT	2	6	8428	8433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719179
85	NC_018699	CTT	2	6	8457	8462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719179
86	NC_018699	AAT	2	6	8555	8560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719179
87	NC_018699	AGT	2	6	8665	8670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719180
88	NC_018699	AAT	2	6	8794	8799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719180
89	NC_018699	TCA	2	6	8800	8805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719180
90	NC_018699	CTT	2	6	8993	8998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719181
91	NC_018699	AGT	2	6	9038	9043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719181
92	NC_018699	TAT	2	6	9095	9100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719181
93	NC_018699	TCT	2	6	9126	9131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719181
94	NC_018699	TAT	2	6	9329	9334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719181
95	NC_018699	GAA	2	6	9421	9426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719181
96	NC_018699	TAT	2	6	9539	9544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719181
97	NC_018699	TAA	2	6	9729	9734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719181
98	NC_018699	ATA	2	6	9791	9796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719181
99	NC_018699	TCA	2	6	9808	9813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719181
100	NC_018699	AAC	2	6	9889	9894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719181
101	NC_018699	TCT	2	6	10009	10014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719181
102	NC_018699	TGT	2	6	10671	10676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719182
103	NC_018699	ATT	2	6	10892	10897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719183
104	NC_018699	CTC	2	6	11018	11023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407719183
105	NC_018699	ATC	2	6	11046	11051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719183
106	NC_018699	TCA	2	6	11086	11091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719183
107	NC_018699	ATT	2	6	11106	11111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719183
108	NC_018699	CAA	2	6	11145	11150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719183
109	NC_018699	GTT	2	6	11216	11221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719183
110	NC_018699	AAT	2	6	11289	11294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719184
111	NC_018699	TAC	2	6	11428	11433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719184
112	NC_018699	TGT	2	6	11573	11578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719185
113	NC_018699	TAC	2	6	11715	11720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719185
114	NC_018699	TAT	2	6	11741	11746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719185
115	NC_018699	TAA	2	6	12018	12023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719185
116	NC_018699	TTG	2	6	12028	12033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719185
117	NC_018699	TTA	2	6	12052	12057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719185
118	NC_018699	AAT	2	6	12084	12089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719185
119	NC_018699	TAA	2	6	12110	12115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719185
120	NC_018699	TGG	2	6	12202	12207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407719185
121	NC_018699	TGT	2	6	12273	12278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719185
122	NC_018699	ATT	2	6	12313	12318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719185
123	NC_018699	ATT	2	6	12910	12915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719186
124	NC_018699	ATC	2	6	13026	13031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719186
125	NC_018699	ATT	2	6	13105	13110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719186
126	NC_018699	CTT	2	6	13592	13597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719187
127	NC_018699	ATA	2	6	13658	13663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719187
128	NC_018699	ATT	2	6	13712	13717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719187
129	NC_018699	AAG	2	6	13772	13777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719187
130	NC_018699	GGT	2	6	13823	13828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407719187
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.