MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Leuconostoc carnosum JB16 plasmid pKLC2

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018698	ATTT	2	8	1633	1640	25 %	75 %	0 %	0 %	407719129
2	NC_018698	AAAG	2	8	1749	1756	75 %	0 %	25 %	0 %	407719129
3	NC_018698	TAAA	2	8	1897	1904	75 %	25 %	0 %	0 %	407719129
4	NC_018698	TCAA	2	8	2366	2373	50 %	25 %	0 %	25 %	407719130
5	NC_018698	ATAG	2	8	3100	3107	50 %	25 %	25 %	0 %	407719131
6	NC_018698	TAAA	3	12	3256	3267	75 %	25 %	0 %	0 %	407719131
7	NC_018698	CTGG	2	8	3803	3810	0 %	25 %	50 %	25 %	407719132
8	NC_018698	GTAT	2	8	3856	3863	25 %	50 %	25 %	0 %	407719132
9	NC_018698	ACGC	2	8	4050	4057	25 %	0 %	25 %	50 %	407719132
10	NC_018698	GTTT	2	8	4541	4548	0 %	75 %	25 %	0 %	407719133
11	NC_018698	TGCC	2	8	5263	5270	0 %	25 %	25 %	50 %	407719134
12	NC_018698	AGAA	2	8	5443	5450	75 %	0 %	25 %	0 %	407719134
13	NC_018698	CAAA	2	8	5596	5603	75 %	0 %	0 %	25 %	407719134
14	NC_018698	ATTT	2	8	6631	6638	25 %	75 %	0 %	0 %	407719135
15	NC_018698	ATAA	2	8	6697	6704	75 %	25 %	0 %	0 %	407719135
16	NC_018698	CAAA	2	8	7542	7549	75 %	0 %	0 %	25 %	407719135
17	NC_018698	GATT	2	8	7715	7722	25 %	50 %	25 %	0 %	407719135
18	NC_018698	AATA	2	8	8368	8375	75 %	25 %	0 %	0 %	407719136
19	NC_018698	TAAT	2	8	8759	8766	50 %	50 %	0 %	0 %	407719137
20	NC_018698	ATTA	2	8	10778	10785	50 %	50 %	0 %	0 %	407719139
21	NC_018698	GTCA	2	8	11154	11161	25 %	25 %	25 %	25 %	407719140
22	NC_018698	TTCA	2	8	11972	11979	25 %	50 %	0 %	25 %	407719142
23	NC_018698	TTGG	2	8	12044	12051	0 %	50 %	50 %	0 %	407719142
24	NC_018698	GATT	2	8	12352	12359	25 %	50 %	25 %	0 %	407719143
25	NC_018698	CGTC	2	8	13596	13603	0 %	25 %	25 %	50 %	407719145
26	NC_018698	AATT	2	8	14099	14106	50 %	50 %	0 %	0 %	407719146
27	NC_018698	CGAT	2	8	14594	14601	25 %	25 %	25 %	25 %	407719147
28	NC_018698	CGAA	2	8	15186	15193	50 %	0 %	25 %	25 %	407719148
29	NC_018698	GGCT	2	8	15874	15881	0 %	25 %	50 %	25 %	407719149
30	NC_018698	CGTG	2	8	15977	15984	0 %	25 %	50 %	25 %	407719149
31	NC_018698	ACCA	2	8	16007	16014	50 %	0 %	0 %	50 %	407719149
32	NC_018698	AGTC	2	8	16040	16047	25 %	25 %	25 %	25 %	407719149
33	NC_018698	GTGA	2	8	16527	16534	25 %	25 %	50 %	0 %	407719150
34	NC_018698	CTTA	2	8	16917	16924	25 %	50 %	0 %	25 %	407719150
35	NC_018698	CAAG	2	8	16938	16945	50 %	0 %	25 %	25 %	407719150
36	NC_018698	AATG	2	8	18042	18049	50 %	25 %	25 %	0 %	407719152
37	NC_018698	TGAT	2	8	18081	18088	25 %	50 %	25 %	0 %	407719152
38	NC_018698	ATTT	2	8	18277	18284	25 %	75 %	0 %	0 %	407719152
39	NC_018698	ATTG	2	8	18728	18735	25 %	50 %	25 %	0 %	407719153
40	NC_018698	GTTT	2	8	19277	19284	0 %	75 %	25 %	0 %	407719154
41	NC_018698	TAAT	2	8	19730	19737	50 %	50 %	0 %	0 %	407719155
42	NC_018698	CCTT	2	8	20293	20300	0 %	50 %	0 %	50 %	407719156
43	NC_018698	GTTT	2	8	20443	20450	0 %	75 %	25 %	0 %	407719156
44	NC_018698	TACC	2	8	20867	20874	25 %	25 %	0 %	50 %	407719157
45	NC_018698	TGCT	2	8	20961	20968	0 %	50 %	25 %	25 %	407719157
46	NC_018698	TTCT	2	8	21191	21198	0 %	75 %	0 %	25 %	407719157
47	NC_018698	ATTT	2	8	21362	21369	25 %	75 %	0 %	0 %	407719157
48	NC_018698	TAAA	2	8	21557	21564	75 %	25 %	0 %	0 %	407719157
49	NC_018698	TCTT	2	8	21895	21902	0 %	75 %	0 %	25 %	407719157
50	NC_018698	TACT	2	8	22241	22248	25 %	50 %	0 %	25 %	407719157
51	NC_018698	AGCC	2	8	22620	22627	25 %	0 %	25 %	50 %	407719158
52	NC_018698	ATTT	2	8	24190	24197	25 %	75 %	0 %	0 %	407719161
53	NC_018698	CAAA	2	8	25800	25807	75 %	0 %	0 %	25 %	407719163
54	NC_018698	TGCC	2	8	26055	26062	0 %	25 %	25 %	50 %	407719163
55	NC_018698	GTTC	2	8	26321	26328	0 %	50 %	25 %	25 %	407719163
56	NC_018698	TTTC	2	8	26391	26398	0 %	75 %	0 %	25 %	407719163
57	NC_018698	TAAC	2	8	26637	26644	50 %	25 %	0 %	25 %	407719163
58	NC_018698	CCAT	2	8	27466	27473	25 %	25 %	0 %	50 %	407719164
59	NC_018698	TTCA	2	8	28613	28620	25 %	50 %	0 %	25 %	407719166

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.