MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Leuconostoc carnosum JB16 plasmid pKLC2

Total Repeats: 273

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018698	GGT	2	6	1407	1412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407719129
2	NC_018698	ACT	2	6	1422	1427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719129
3	NC_018698	TGA	2	6	1604	1609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719129
4	NC_018698	ATT	2	6	1623	1628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719129
5	NC_018698	GAA	2	6	1665	1670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719129
6	NC_018698	ATT	4	12	1764	1775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719129
7	NC_018698	CCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719129
8	NC_018698	TGA	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719129
9	NC_018698	CAA	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719129
10	NC_018698	TAG	2	6	2271	2276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719130
11	NC_018698	TAA	2	6	2349	2354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719130
12	NC_018698	ATT	2	6	2466	2471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719130
13	NC_018698	CTT	2	6	3036	3041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719131
14	NC_018698	CTT	2	6	3051	3056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719131
15	NC_018698	TAT	2	6	3156	3161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719131
16	NC_018698	AAT	3	9	3166	3174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719131
17	NC_018698	ATG	2	6	3280	3285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719131
18	NC_018698	CAC	2	6	3303	3308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719131
19	NC_018698	GCC	2	6	3389	3394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719131
20	NC_018698	ATT	2	6	3458	3463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719131
21	NC_018698	ACG	2	6	3729	3734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719132
22	NC_018698	TAT	2	6	3736	3741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719132
23	NC_018698	GTT	2	6	3755	3760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719132
24	NC_018698	CAA	2	6	3819	3824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719132
25	NC_018698	AAG	2	6	3910	3915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719132
26	NC_018698	TAA	2	6	3925	3930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719132
27	NC_018698	AAG	2	6	3939	3944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719132
28	NC_018698	ACA	2	6	3958	3963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719132
29	NC_018698	CAA	2	6	4010	4015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719132
30	NC_018698	GAT	2	6	4073	4078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719132
31	NC_018698	GCT	2	6	4097	4102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719132
32	NC_018698	ATG	2	6	4112	4117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719132
33	NC_018698	GTC	2	6	4181	4186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719132
34	NC_018698	TTA	2	6	4328	4333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719132
35	NC_018698	ATT	2	6	4386	4391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719133
36	NC_018698	ATT	2	6	4422	4427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719133
37	NC_018698	AAT	2	6	4470	4475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719133
38	NC_018698	GTC	2	6	4479	4484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719133
39	NC_018698	ATG	2	6	4630	4635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719133
40	NC_018698	AAC	2	6	4654	4659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719133
41	NC_018698	TGA	2	6	4702	4707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719133
42	NC_018698	ATG	2	6	4711	4716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719133
43	NC_018698	ATC	2	6	4790	4795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719133
44	NC_018698	TGG	2	6	4814	4819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407719133
45	NC_018698	TAC	2	6	4846	4851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719133
46	NC_018698	AAT	2	6	4943	4948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719133
47	NC_018698	CTA	2	6	5146	5151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719134
48	NC_018698	TTG	2	6	5152	5157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719134
49	NC_018698	CAA	2	6	5170	5175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719134
50	NC_018698	ATC	2	6	5195	5200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719134
51	NC_018698	AAT	2	6	5201	5206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719134
52	NC_018698	TGA	2	6	5210	5215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719134
53	NC_018698	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719134
54	NC_018698	CAA	2	6	5329	5334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719134
55	NC_018698	AGT	2	6	5505	5510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719134
56	NC_018698	CTA	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719134
57	NC_018698	GCC	2	6	5625	5630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719134
58	NC_018698	GTA	3	9	5791	5799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719134
59	NC_018698	CAA	2	6	5983	5988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719134
60	NC_018698	ATT	2	6	6069	6074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719134
61	NC_018698	GTT	2	6	6640	6645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719135
62	NC_018698	TCT	2	6	6757	6762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719135
63	NC_018698	TCT	2	6	6815	6820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719135
64	NC_018698	ACC	2	6	6826	6831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719135
65	NC_018698	GGA	2	6	6862	6867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407719135
66	NC_018698	TAA	2	6	6907	6912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719135
67	NC_018698	ACT	2	6	6947	6952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719135
68	NC_018698	CTA	2	6	6960	6965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719135
69	NC_018698	AAT	2	6	7024	7029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719135
70	NC_018698	GAT	2	6	7252	7257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719135
71	NC_018698	CTT	2	6	7278	7283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719135
72	NC_018698	ATT	2	6	7300	7305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719135
73	NC_018698	CAA	2	6	7474	7479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719135
74	NC_018698	TCC	2	6	7628	7633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407719135
75	NC_018698	CAC	2	6	7692	7697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719135
76	NC_018698	ATG	2	6	7740	7745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719135
77	NC_018698	ACC	2	6	7857	7862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719135
78	NC_018698	AAT	2	6	7883	7888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719135
79	NC_018698	AAC	2	6	8080	8085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719135
80	NC_018698	ATA	2	6	8118	8123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719135
81	NC_018698	TCA	2	6	8451	8456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719136
82	NC_018698	GTC	2	6	8468	8473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719136
83	NC_018698	GCC	2	6	8476	8481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719136
84	NC_018698	AAT	3	9	8497	8505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719136
85	NC_018698	ATA	2	6	8535	8540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719136
86	NC_018698	AAT	2	6	8560	8565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719136
87	NC_018698	CAG	2	6	8649	8654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719136
88	NC_018698	AAC	2	6	8730	8735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719137
89	NC_018698	ATA	2	6	8773	8778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719137
90	NC_018698	TGT	2	6	8835	8840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719137
91	NC_018698	GAA	2	6	8931	8936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719137
92	NC_018698	TGA	2	6	8951	8956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719137
93	NC_018698	CTA	2	6	8957	8962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719137
94	NC_018698	ACT	2	6	8973	8978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719137
95	NC_018698	TAG	2	6	9003	9008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719137
96	NC_018698	TAC	2	6	9042	9047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719137
97	NC_018698	CAG	2	6	9060	9065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719137
98	NC_018698	TGA	2	6	9454	9459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719138
99	NC_018698	CAA	2	6	9495	9500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719138
100	NC_018698	ATT	2	6	9613	9618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719138
101	NC_018698	ACA	2	6	9621	9626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719138
102	NC_018698	TGA	2	6	10452	10457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719139
103	NC_018698	AAG	2	6	10634	10639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719139
104	NC_018698	CAG	2	6	10715	10720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719139
105	NC_018698	AAG	2	6	11055	11060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719140
106	NC_018698	GGA	2	6	11209	11214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407719140
107	NC_018698	TCG	2	6	11482	11487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719141
108	NC_018698	TGC	2	6	11491	11496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719141
109	NC_018698	ATC	2	6	11828	11833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719142
110	NC_018698	GAA	2	6	11992	11997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719142
111	NC_018698	AGC	2	6	12036	12041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719142
112	NC_018698	GAG	2	6	12360	12365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407719143
113	NC_018698	ACC	2	6	12473	12478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719143
114	NC_018698	ATA	2	6	12582	12587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719143
115	NC_018698	ACT	2	6	12595	12600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719143
116	NC_018698	TAC	3	9	12610	12618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719143
117	NC_018698	CCT	2	6	12639	12644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407719143
118	NC_018698	AAT	2	6	12646	12651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719143
119	NC_018698	CTT	2	6	12750	12755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719143
120	NC_018698	TTA	2	6	13009	13014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719144
121	NC_018698	ATA	2	6	13049	13054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719144
122	NC_018698	CCA	2	6	13072	13077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719144
123	NC_018698	AAT	2	6	13110	13115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719144
124	NC_018698	CTC	2	6	13138	13143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407719144
125	NC_018698	CAT	2	6	13276	13281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719144
126	NC_018698	AAT	2	6	13328	13333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719144
127	NC_018698	CTG	2	6	13408	13413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719144
128	NC_018698	ATC	2	6	13418	13423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719144
129	NC_018698	AAT	2	6	13424	13429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719144
130	NC_018698	TTA	2	6	13498	13503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719145
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.