MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Cycloclasticus sp. P1 chromosome

Total Repeats: 736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018697	AACAAA	2	12	499	510	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	407715265
2	NC_018697	GGTGTG	2	12	4067	4078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407715268
3	NC_018697	TAAAAA	2	12	6260	6271	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018697	TACTAA	2	12	9419	9430	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407715271
5	NC_018697	AATGTG	2	12	13861	13872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715275
6	NC_018697	ACCAAA	2	12	24101	24112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715287
7	NC_018697	TGTTGA	2	12	24305	24316	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407715287
8	NC_018697	TGGTTG	2	12	24714	24725	0 %	50 %	50 %	0 %	407715289
9	NC_018697	AAAGAA	2	12	25967	25978	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407715290
10	NC_018697	CTGAAA	2	12	35480	35491	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407715300
11	NC_018697	GGCTAT	2	12	37841	37852	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407715302
12	NC_018697	TTCAGG	2	12	39667	39678	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407715304
13	NC_018697	TGCCAG	2	12	46185	46196	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407715310
14	NC_018697	TAGCTG	2	12	46480	46491	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407715310
15	NC_018697	TATATT	2	12	48567	48578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715313
16	NC_018697	GCTACC	2	12	51947	51958	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407715315
17	NC_018697	ATTGCT	2	12	54510	54521	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407715316
18	NC_018697	TTTGGT	2	12	65507	65518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715324
19	NC_018697	AACATA	2	12	71078	71089	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407715328
20	NC_018697	AGAGCA	2	12	72901	72912	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407715330
21	NC_018697	CAAGTA	2	12	75395	75406	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407715332
22	NC_018697	ACAGAG	2	12	83560	83571	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407715342
23	NC_018697	ATCAAA	2	12	97437	97448	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018697	TAAATC	2	12	103299	103310	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407715360
25	NC_018697	GCTAAA	2	12	104338	104349	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407715362
26	NC_018697	AAAGAA	2	12	105520	105531	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407715364
27	NC_018697	GAAAGC	2	12	108887	108898	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407715366
28	NC_018697	GAAATG	2	12	109301	109312	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407715366
29	NC_018697	TCAGCA	2	12	110896	110907	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407715367
30	NC_018697	CGTTAT	2	12	110993	111004	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407715367
31	NC_018697	AGGTCG	2	12	113913	113924	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407715368
32	NC_018697	AGCATT	2	12	115676	115687	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018697	ATTTTA	2	12	115899	115910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715370
34	NC_018697	TTGCTG	2	12	117205	117216	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407715372
35	NC_018697	TTGCCA	2	12	119042	119053	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407715374
36	NC_018697	GTTTTG	2	12	119552	119563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715374
37	NC_018697	ATATTA	2	12	121134	121145	50 %	50 %	0 %	0 %	407715375
38	NC_018697	GAAAAA	2	12	124351	124362	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407715378
39	NC_018697	TAAAAA	2	12	124873	124884	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407715378
40	NC_018697	TAACAT	2	12	125186	125197	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407715379
41	NC_018697	AAGGCT	2	12	126387	126398	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407715380
42	NC_018697	TATTAA	2	12	127974	127985	50 %	50 %	0 %	0 %	407715383
43	NC_018697	AACAGG	2	12	134188	134199	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407715389
44	NC_018697	TCAACA	2	12	134420	134431	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407715389
45	NC_018697	GTCAAT	2	12	134446	134457	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407715389
46	NC_018697	TTTGTT	2	12	136104	136115	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407715390
47	NC_018697	TAAAAA	2	12	136148	136159	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407715390
48	NC_018697	TGCAGG	2	12	140175	140186	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407715397
49	NC_018697	GACAAA	2	12	144112	144123	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018697	GCACAG	2	12	149773	149784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407715410
51	NC_018697	TGTCAA	2	12	150027	150038	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407715411
52	NC_018697	GAGGGT	2	12	152543	152554	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	407715414
53	NC_018697	CGGTGA	2	12	154992	155003	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407715417
54	NC_018697	GGTGTT	2	12	155537	155548	0 %	50 %	50 %	0 %	407715417
55	NC_018697	AACACC	2	12	156559	156570	50 %	0 %	0 %	50 %	407715419
56	NC_018697	ATGCCG	2	12	162991	163002	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407715425
57	NC_018697	CAGTCT	2	12	164121	164132	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407715426
58	NC_018697	TTGTGC	2	12	165869	165880	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407715428
59	NC_018697	CTTGAA	2	12	168279	168290	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407715430
60	NC_018697	AGGCAG	2	12	169827	169838	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	407715432
61	NC_018697	GAGGCA	2	12	173847	173858	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	407715438
62	NC_018697	ACTTTC	2	12	177261	177272	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407715440
63	NC_018697	ATACCA	2	12	183248	183259	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407715447
64	NC_018697	GTACGC	2	12	183833	183844	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407715447
65	NC_018697	GGCAAA	2	12	194579	194590	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407715456
66	NC_018697	ATTGGT	2	12	197683	197694	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407715462
67	NC_018697	GCTGCC	2	12	210689	210700	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407715473
68	NC_018697	TCAGCT	2	12	212239	212250	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018697	TGATGT	2	12	229277	229288	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407715490
70	NC_018697	ATGTCG	2	12	229558	229569	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407715490
71	NC_018697	TATGGT	2	12	238364	238375	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407715498
72	NC_018697	GAAACA	2	12	240565	240576	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407715499
73	NC_018697	TCTTGA	2	12	241631	241642	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407715500
74	NC_018697	ATAAAG	2	12	243440	243451	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407715504
75	NC_018697	GTGATG	2	12	243512	243523	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407715504
76	NC_018697	TGGCAA	2	12	245261	245272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407715505
77	NC_018697	GCACCT	2	12	248624	248635	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407715510
78	NC_018697	TATTGT	2	12	253854	253865	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407715517
79	NC_018697	AATGTT	2	12	254781	254792	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407715518
80	NC_018697	TGGATT	2	12	257201	257212	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407715521
81	NC_018697	TGAAAT	2	12	263777	263788	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018697	TTTGAT	2	12	265174	265185	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018697	TGCTGG	2	12	266315	266326	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	407715523
84	NC_018697	CTTGTT	2	12	267345	267356	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407715524
85	NC_018697	GGTAGT	2	12	271801	271812	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407715527
86	NC_018697	AATGGC	2	12	271815	271826	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407715527
87	NC_018697	CTGTTT	2	12	271964	271975	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407715527
88	NC_018697	CGGCTC	2	12	278582	278593	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407715532
89	NC_018697	TGATGG	2	12	278607	278618	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407715532
90	NC_018697	GTGATG	2	12	278696	278707	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407715532
91	NC_018697	GTTTTA	2	12	281352	281363	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407715535
92	NC_018697	GCAAGT	2	12	287029	287040	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407715541
93	NC_018697	AATCGT	2	12	289441	289452	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407715543
94	NC_018697	ATGGTG	2	12	290714	290725	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407715543
95	NC_018697	AATATC	2	12	297912	297923	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407715551
96	NC_018697	GTAAAT	2	12	298301	298312	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407715551
97	NC_018697	TAAAAA	2	12	303716	303727	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407715555
98	NC_018697	AAGCCC	2	12	305960	305971	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	407715558
99	NC_018697	ATGGTG	2	12	308195	308206	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407715559
100	NC_018697	AAAGTA	2	12	308512	308523	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407715559
101	NC_018697	TGCAAC	2	12	308954	308965	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407715560
102	NC_018697	AGCTGC	2	12	309011	309022	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407715560
103	NC_018697	TCGTAT	2	12	316074	316085	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407715566
104	NC_018697	TTTTTA	2	12	316681	316692	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407715566
105	NC_018697	ATGAAA	2	12	321759	321770	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407715570
106	NC_018697	AGCCAG	2	12	322474	322485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407715570
107	NC_018697	TGAAGA	2	12	323077	323088	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407715571
108	NC_018697	GATTTT	2	12	328607	328618	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407715577
109	NC_018697	AAAAGG	2	12	332321	332332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715581
110	NC_018697	CTTGTT	2	12	335206	335217	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407715585
111	NC_018697	CAATGG	2	12	335560	335571	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407715585
112	NC_018697	CAAACC	2	12	335680	335691	50 %	0 %	0 %	50 %	407715585
113	NC_018697	TACAGT	2	12	339610	339621	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407715590
114	NC_018697	GTGCCT	2	12	348443	348454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407715598
115	NC_018697	AGATGA	2	12	349054	349065	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407715598
116	NC_018697	CGATAG	2	12	349753	349764	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407715599
117	NC_018697	GTAATG	2	12	352194	352205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715602
118	NC_018697	CAAAAC	2	12	353608	353619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715605
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219	NC_018697	AGGTGA	2	12	698633	698644	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	407715936
220	NC_018697	TGATCT	2	12	699617	699628	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407715936
221	NC_018697	TTATAA	2	12	700255	700266	50 %	50 %	0 %	0 %	407715937
222	NC_018697	AGATGA	2	12	707654	707665	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407715942
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224	NC_018697	GCCGGT	2	12	712713	712724	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407715945
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228	NC_018697	TTGATA	2	12	732822	732833	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407715962
229	NC_018697	CTGATG	2	12	760293	760304	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407715987
230	NC_018697	GCTTTA	2	12	761423	761434	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407715990
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345	NC_018697	GAAGCC	2	12	1157293	1157304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407716354
346	NC_018697	CTTTAA	2	12	1167253	1167264	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407716361
347	NC_018697	AAGTCT	2	12	1168452	1168463	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407716362
348	NC_018697	AGTTGC	2	12	1171165	1171176	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407716365
349	NC_018697	ATGAAA	2	12	1172141	1172152	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407716366
350	NC_018697	CGGTTA	2	12	1180792	1180803	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407716373
351	NC_018697	GACTCA	2	12	1181063	1181074	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407716373
352	NC_018697	TCATTA	2	12	1181495	1181506	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407716373
353	NC_018697	TCATTA	2	12	1182166	1182177	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407716374
354	NC_018697	TTGGTT	2	12	1182247	1182258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407716374
355	NC_018697	AACTTA	2	12	1184587	1184598	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407716374
356	NC_018697	GTCGAC	2	12	1186901	1186912	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407716377
357	NC_018697	TCGGCT	2	12	1187351	1187362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407716377
358	NC_018697	GATACC	2	12	1200257	1200268	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407716390
359	NC_018697	AACCGA	2	12	1201882	1201893	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407716390
360	NC_018697	AAGCCA	2	12	1202265	1202276	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407716390
361	NC_018697	AGGCGC	2	12	1202943	1202954	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	407716390
362	NC_018697	GAAATG	2	12	1204353	1204364	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407716391
363	NC_018697	TATCAA	2	12	1219745	1219756	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407716405
364	NC_018697	GCAATT	2	12	1223367	1223378	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407716409
365	NC_018697	TCAACG	2	12	1223875	1223886	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407716410
366	NC_018697	CTTTAT	2	12	1226513	1226524	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
367	NC_018697	ATCGCA	2	12	1228089	1228100	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407716416
368	NC_018697	TAAAAT	2	12	1229440	1229451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
369	NC_018697	AAAGGT	2	12	1239619	1239630	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407716426
370	NC_018697	TCATTA	2	12	1242577	1242588	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407716428
371	NC_018697	AAACAA	2	12	1245992	1246003	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	407716432
372	NC_018697	CCATGA	2	12	1247407	1247418	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407716434
373	NC_018697	CCTCTT	2	12	1248699	1248710	0 %	50 %	0 %	50 %	407716435
374	NC_018697	AAAGCC	2	12	1250135	1250146	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407716437
375	NC_018697	AAAATA	2	12	1254519	1254530	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407716440
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377	NC_018697	CCAAAA	2	12	1264479	1264490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407716451
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380	NC_018697	CGGCTT	2	12	1276659	1276670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407716463
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382	NC_018697	TACAAA	2	12	1281040	1281051	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
383	NC_018697	GCGCAT	2	12	1297136	1297147	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407716481
384	NC_018697	AGGAAT	2	12	1298867	1298878	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407716482
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390	NC_018697	AATGAA	2	12	1317917	1317928	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407716500
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401	NC_018697	TTTGAA	2	12	1349192	1349203	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
402	NC_018697	TCGGAG	2	12	1351664	1351675	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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411	NC_018697	CCCATT	2	12	1373084	1373095	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
412	NC_018697	TATCAA	2	12	1373738	1373749	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407716554
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441	NC_018697	TGCGCC	2	12	1481000	1481011	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407716667
442	NC_018697	GCCATC	2	12	1483188	1483199	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407716669
443	NC_018697	TTAATG	2	12	1484921	1484932	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407716671
444	NC_018697	CTCAAA	2	12	1487671	1487682	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407716675
445	NC_018697	CAACCC	2	12	1487999	1488010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407716675
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449	NC_018697	TTGGTG	2	12	1507659	1507670	0 %	50 %	50 %	0 %	407716688
450	NC_018697	TTTTCA	2	12	1516214	1516225	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407716692
451	NC_018697	TCGATT	2	12	1518459	1518470	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407716695
452	NC_018697	TCCATT	2	12	1518989	1519000	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407716696
453	NC_018697	ACGACA	2	12	1520001	1520012	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407716697
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456	NC_018697	GTTTAG	2	12	1527683	1527694	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407716701
457	NC_018697	AATCAA	2	12	1531659	1531670	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407716706
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