MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Cycloclasticus sp. P1 chromosome

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018697	TAAAAA	2	12	6260	6271	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018697	ATCAAA	2	12	97437	97448	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018697	AGCATT	2	12	115676	115687	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018697	GACAAA	2	12	144112	144123	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018697	TCAGCT	2	12	212239	212250	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018697	TGAAAT	2	12	263777	263788	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018697	TTTGAT	2	12	265174	265185	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018697	AATAAA	2	12	383990	384001	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018697	TATAAC	2	12	389177	389188	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018697	GGCAGC	2	12	447454	447465	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018697	AAAATG	2	12	482452	482463	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018697	ATATTA	2	12	485153	485164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018697	AGCATT	2	12	554292	554303	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018697	AATTTT	2	12	610944	610955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018697	AGTGGT	2	12	637136	637147	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018697	AAGCTT	2	12	692001	692012	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018697	ATTTAA	2	12	795339	795350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018697	AGAGTA	2	12	806209	806220	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018697	CGTTAT	2	12	842333	842344	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018697	TATGAC	2	12	865136	865147	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018697	GATAAC	2	12	905403	905414	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018697	TAATGA	2	12	987998	988009	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018697	TACTAA	2	12	992590	992601	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018697	AATTTA	2	12	1023530	1023541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018697	CTTTAT	2	12	1226513	1226524	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018697	TAAAAT	2	12	1229440	1229451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018697	TACAAA	2	12	1281040	1281051	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018697	TTTGAA	2	12	1349192	1349203	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018697	TCGGAG	2	12	1351664	1351675	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018697	GCAATC	2	12	1371815	1371826	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018697	CCCATT	2	12	1373084	1373095	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018697	GTACTT	2	12	1409401	1409412	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018697	TCTATT	2	12	1416945	1416956	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018697	ATTTAG	2	12	1549496	1549507	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018697	TGCCTT	2	12	1588172	1588183	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018697	GTTTTA	2	12	1589117	1589128	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018697	ATCATT	2	12	1702203	1702214	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018697	AAGGCG	2	12	1949930	1949941	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018697	TAAAAC	2	12	1953212	1953223	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_018697	AATAAA	2	12	1983750	1983761	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018697	TCAGCG	2	12	2019265	2019276	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018697	TACACC	2	12	2026782	2026793	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018697	TTAACT	2	12	2042948	2042959	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018697	ACTTTA	2	12	2055047	2055058	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018697	TTTTTA	2	12	2056870	2056881	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018697	TTAACT	2	12	2070750	2070761	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018697	CGAAGG	2	12	2110596	2110607	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018697	TCATAT	2	12	2217233	2217244	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018697	TTTTAT	2	12	2309540	2309551	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018697	ATTAAA	2	12	2338256	2338267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.