MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Cycloclasticus sp. P1 chromosome

Total Repeats: 686

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018697	AACAAA	2	12	499	510	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	407715265
2	NC_018697	GGTGTG	2	12	4067	4078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407715268
3	NC_018697	TACTAA	2	12	9419	9430	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407715271
4	NC_018697	AATGTG	2	12	13861	13872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715275
5	NC_018697	ACCAAA	2	12	24101	24112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715287
6	NC_018697	TGTTGA	2	12	24305	24316	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407715287
7	NC_018697	TGGTTG	2	12	24714	24725	0 %	50 %	50 %	0 %	407715289
8	NC_018697	AAAGAA	2	12	25967	25978	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407715290
9	NC_018697	CTGAAA	2	12	35480	35491	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407715300
10	NC_018697	GGCTAT	2	12	37841	37852	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407715302
11	NC_018697	TTCAGG	2	12	39667	39678	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407715304
12	NC_018697	TGCCAG	2	12	46185	46196	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407715310
13	NC_018697	TAGCTG	2	12	46480	46491	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407715310
14	NC_018697	TATATT	2	12	48567	48578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715313
15	NC_018697	GCTACC	2	12	51947	51958	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407715315
16	NC_018697	ATTGCT	2	12	54510	54521	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407715316
17	NC_018697	TTTGGT	2	12	65507	65518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715324
18	NC_018697	AACATA	2	12	71078	71089	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407715328
19	NC_018697	AGAGCA	2	12	72901	72912	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407715330
20	NC_018697	CAAGTA	2	12	75395	75406	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407715332
21	NC_018697	ACAGAG	2	12	83560	83571	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407715342
22	NC_018697	TAAATC	2	12	103299	103310	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407715360
23	NC_018697	GCTAAA	2	12	104338	104349	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407715362
24	NC_018697	AAAGAA	2	12	105520	105531	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407715364
25	NC_018697	GAAAGC	2	12	108887	108898	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407715366
26	NC_018697	GAAATG	2	12	109301	109312	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407715366
27	NC_018697	TCAGCA	2	12	110896	110907	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407715367
28	NC_018697	CGTTAT	2	12	110993	111004	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407715367
29	NC_018697	AGGTCG	2	12	113913	113924	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407715368
30	NC_018697	ATTTTA	2	12	115899	115910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715370
31	NC_018697	TTGCTG	2	12	117205	117216	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407715372
32	NC_018697	TTGCCA	2	12	119042	119053	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407715374
33	NC_018697	GTTTTG	2	12	119552	119563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715374
34	NC_018697	ATATTA	2	12	121134	121145	50 %	50 %	0 %	0 %	407715375
35	NC_018697	GAAAAA	2	12	124351	124362	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407715378
36	NC_018697	TAAAAA	2	12	124873	124884	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407715378
37	NC_018697	TAACAT	2	12	125186	125197	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407715379
38	NC_018697	AAGGCT	2	12	126387	126398	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407715380
39	NC_018697	TATTAA	2	12	127974	127985	50 %	50 %	0 %	0 %	407715383
40	NC_018697	AACAGG	2	12	134188	134199	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407715389
41	NC_018697	TCAACA	2	12	134420	134431	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407715389
42	NC_018697	GTCAAT	2	12	134446	134457	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407715389
43	NC_018697	TTTGTT	2	12	136104	136115	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407715390
44	NC_018697	TAAAAA	2	12	136148	136159	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407715390
45	NC_018697	TGCAGG	2	12	140175	140186	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407715397
46	NC_018697	GCACAG	2	12	149773	149784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407715410
47	NC_018697	TGTCAA	2	12	150027	150038	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407715411
48	NC_018697	GAGGGT	2	12	152543	152554	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	407715414
49	NC_018697	CGGTGA	2	12	154992	155003	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407715417
50	NC_018697	GGTGTT	2	12	155537	155548	0 %	50 %	50 %	0 %	407715417
51	NC_018697	AACACC	2	12	156559	156570	50 %	0 %	0 %	50 %	407715419
52	NC_018697	ATGCCG	2	12	162991	163002	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407715425
53	NC_018697	CAGTCT	2	12	164121	164132	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407715426
54	NC_018697	TTGTGC	2	12	165869	165880	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407715428
55	NC_018697	CTTGAA	2	12	168279	168290	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407715430
56	NC_018697	AGGCAG	2	12	169827	169838	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	407715432
57	NC_018697	GAGGCA	2	12	173847	173858	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	407715438
58	NC_018697	ACTTTC	2	12	177261	177272	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407715440
59	NC_018697	ATACCA	2	12	183248	183259	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407715447
60	NC_018697	GTACGC	2	12	183833	183844	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407715447
61	NC_018697	GGCAAA	2	12	194579	194590	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407715456
62	NC_018697	ATTGGT	2	12	197683	197694	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407715462
63	NC_018697	GCTGCC	2	12	210689	210700	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407715473
64	NC_018697	TGATGT	2	12	229277	229288	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407715490
65	NC_018697	ATGTCG	2	12	229558	229569	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407715490
66	NC_018697	TATGGT	2	12	238364	238375	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407715498
67	NC_018697	GAAACA	2	12	240565	240576	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407715499
68	NC_018697	TCTTGA	2	12	241631	241642	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407715500
69	NC_018697	ATAAAG	2	12	243440	243451	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407715504
70	NC_018697	GTGATG	2	12	243512	243523	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407715504
71	NC_018697	TGGCAA	2	12	245261	245272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407715505
72	NC_018697	GCACCT	2	12	248624	248635	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407715510
73	NC_018697	TATTGT	2	12	253854	253865	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407715517
74	NC_018697	AATGTT	2	12	254781	254792	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407715518
75	NC_018697	TGGATT	2	12	257201	257212	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407715521
76	NC_018697	TGCTGG	2	12	266315	266326	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	407715523
77	NC_018697	CTTGTT	2	12	267345	267356	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407715524
78	NC_018697	GGTAGT	2	12	271801	271812	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407715527
79	NC_018697	AATGGC	2	12	271815	271826	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407715527
80	NC_018697	CTGTTT	2	12	271964	271975	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407715527
81	NC_018697	CGGCTC	2	12	278582	278593	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407715532
82	NC_018697	TGATGG	2	12	278607	278618	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407715532
83	NC_018697	GTGATG	2	12	278696	278707	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407715532
84	NC_018697	GTTTTA	2	12	281352	281363	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407715535
85	NC_018697	GCAAGT	2	12	287029	287040	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407715541
86	NC_018697	AATCGT	2	12	289441	289452	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407715543
87	NC_018697	ATGGTG	2	12	290714	290725	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407715543
88	NC_018697	AATATC	2	12	297912	297923	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407715551
89	NC_018697	GTAAAT	2	12	298301	298312	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407715551
90	NC_018697	TAAAAA	2	12	303716	303727	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407715555
91	NC_018697	AAGCCC	2	12	305960	305971	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	407715558
92	NC_018697	ATGGTG	2	12	308195	308206	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407715559
93	NC_018697	AAAGTA	2	12	308512	308523	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407715559
94	NC_018697	TGCAAC	2	12	308954	308965	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407715560
95	NC_018697	AGCTGC	2	12	309011	309022	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407715560
96	NC_018697	TCGTAT	2	12	316074	316085	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407715566
97	NC_018697	TTTTTA	2	12	316681	316692	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407715566
98	NC_018697	ATGAAA	2	12	321759	321770	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407715570
99	NC_018697	AGCCAG	2	12	322474	322485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407715570
100	NC_018697	TGAAGA	2	12	323077	323088	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407715571
101	NC_018697	GATTTT	2	12	328607	328618	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407715577
102	NC_018697	AAAAGG	2	12	332321	332332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715581
103	NC_018697	CTTGTT	2	12	335206	335217	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407715585
104	NC_018697	CAATGG	2	12	335560	335571	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407715585
105	NC_018697	CAAACC	2	12	335680	335691	50 %	0 %	0 %	50 %	407715585
106	NC_018697	TACAGT	2	12	339610	339621	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407715590
107	NC_018697	GTGCCT	2	12	348443	348454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407715598
108	NC_018697	AGATGA	2	12	349054	349065	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407715598
109	NC_018697	CGATAG	2	12	349753	349764	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407715599
110	NC_018697	GTAATG	2	12	352194	352205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715602
111	NC_018697	CAAAAC	2	12	353608	353619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715605
112	NC_018697	TAAATT	2	12	353982	353993	50 %	50 %	0 %	0 %	407715606
113	NC_018697	AAACAA	2	12	364348	364359	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	407715617
114	NC_018697	GCTTTA	2	12	367084	367095	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407715620
115	NC_018697	AATTAA	2	12	367367	367378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715620
116	NC_018697	GTTTAG	2	12	373729	373740	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407715626
117	NC_018697	GCGATG	2	12	374595	374606	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407715626
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232	NC_018697	TGCCAT	2	12	834592	834603	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407716063
233	NC_018697	CAGTTA	2	12	837405	837416	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407716065
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333	NC_018697	TCGGCT	2	12	1187351	1187362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407716377
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337	NC_018697	AGGCGC	2	12	1202943	1202954	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	407716390
338	NC_018697	GAAATG	2	12	1204353	1204364	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407716391
339	NC_018697	TATCAA	2	12	1219745	1219756	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407716405
340	NC_018697	GCAATT	2	12	1223367	1223378	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407716409
341	NC_018697	TCAACG	2	12	1223875	1223886	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407716410
342	NC_018697	ATCGCA	2	12	1228089	1228100	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407716416
343	NC_018697	AAAGGT	2	12	1239619	1239630	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407716426
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447	NC_018697	CATTTT	2	12	1631878	1631889	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407716804
448	NC_018697	GCTCAA	2	12	1633969	1633980	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407716804
449	NC_018697	CCACTG	2	12	1637025	1637036	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407716805
450	NC_018697	CACGCT	2	12	1639532	1639543	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407716808
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452	NC_018697	TACCAA	2	12	1644554	1644565	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407716813
453	NC_018697	TTTTTG	2	12	1650582	1650593	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407716819
454	NC_018697	AGTTTG	2	12	1651320	1651331	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407716819
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456	NC_018697	CTTCCA	2	12	1657424	1657435	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	407716826
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458	NC_018697	CTTGCA	2	12	1668546	1668557	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407716836
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