MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cycloclasticus sp. P1 chromosome

Total Repeats: 1528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018697	AAAAT	2	10	200	209	80 %	20 %	0 %	0 %	407715265
2	NC_018697	ACAAA	2	10	1029	1038	80 %	0 %	0 %	20 %	407715265
3	NC_018697	AAAAT	2	10	2037	2046	80 %	20 %	0 %	0 %	407715266
4	NC_018697	AGCAA	2	10	5008	5017	60 %	0 %	20 %	20 %	407715268
5	NC_018697	CCCAA	2	10	5638	5647	40 %	0 %	0 %	60 %	407715268
6	NC_018697	AAATT	2	10	6186	6195	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018697	TTTTA	2	10	6577	6586	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018697	CAGTA	2	10	8343	8352	40 %	20 %	20 %	20 %	407715270
9	NC_018697	TTTGG	2	10	11214	11223	0 %	60 %	40 %	0 %	407715272
10	NC_018697	TGTTA	2	10	13396	13405	20 %	60 %	20 %	0 %	407715274
11	NC_018697	GCAAC	2	10	23361	23370	40 %	0 %	20 %	40 %	407715287
12	NC_018697	GTTAA	2	10	24012	24021	40 %	40 %	20 %	0 %	407715287
13	NC_018697	CGCAT	2	10	24804	24813	20 %	20 %	20 %	40 %	407715289
14	NC_018697	GGTGA	2	10	25465	25474	20 %	20 %	60 %	0 %	407715289
15	NC_018697	ATTAA	2	10	27266	27275	60 %	40 %	0 %	0 %	407715290
16	NC_018697	TAATG	2	10	27355	27364	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018697	TAAAA	2	10	27983	27992	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018697	GTAAT	2	10	31688	31697	40 %	40 %	20 %	0 %	407715295
19	NC_018697	AAGAA	2	10	32401	32410	80 %	0 %	20 %	0 %	407715296
20	NC_018697	TAATG	2	10	33022	33031	40 %	40 %	20 %	0 %	407715296
21	NC_018697	AATAA	2	10	33961	33970	80 %	20 %	0 %	0 %	407715298
22	NC_018697	ATTAA	2	10	38264	38273	60 %	40 %	0 %	0 %	407715302
23	NC_018697	GTGCT	2	10	40655	40664	0 %	40 %	40 %	20 %	407715304
24	NC_018697	GCCAT	2	10	43807	43816	20 %	20 %	20 %	40 %	407715307
25	NC_018697	GTTTA	2	10	45513	45522	20 %	60 %	20 %	0 %	407715310
26	NC_018697	AAAAT	2	10	46760	46769	80 %	20 %	0 %	0 %	407715310
27	NC_018697	GCAAG	2	10	49391	49400	40 %	0 %	40 %	20 %	407715313
28	NC_018697	GCTGT	2	10	53654	53663	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018697	ATTAA	2	10	55952	55961	60 %	40 %	0 %	0 %	407715318
30	NC_018697	AGCAA	2	10	56738	56747	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018697	TAGAT	2	10	57347	57356	40 %	40 %	20 %	0 %	407715320
32	NC_018697	TGATG	2	10	57389	57398	20 %	40 %	40 %	0 %	407715320
33	NC_018697	AACAA	2	10	57500	57509	80 %	0 %	0 %	20 %	407715320
34	NC_018697	GTTGG	2	10	60349	60358	0 %	40 %	60 %	0 %	407715322
35	NC_018697	AGGCG	2	10	60953	60962	20 %	0 %	60 %	20 %	407715323
36	NC_018697	CCTTG	2	10	62634	62643	0 %	40 %	20 %	40 %	407715324
37	NC_018697	TTTGA	2	10	65192	65201	20 %	60 %	20 %	0 %	407715324
38	NC_018697	AGCAC	2	10	65830	65839	40 %	0 %	20 %	40 %	407715324
39	NC_018697	AAGGT	2	10	66926	66935	40 %	20 %	40 %	0 %	407715325
40	NC_018697	AATAA	2	10	70589	70598	80 %	20 %	0 %	0 %	407715328
41	NC_018697	CTGAG	2	10	70644	70653	20 %	20 %	40 %	20 %	407715328
42	NC_018697	TTAAA	2	10	75113	75122	60 %	40 %	0 %	0 %	407715332
43	NC_018697	GATAT	2	10	78043	78052	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018697	GGCGC	2	10	78274	78283	0 %	0 %	60 %	40 %	407715336
45	NC_018697	AGCAG	2	10	78679	78688	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018697	TTCGA	2	10	79631	79640	20 %	40 %	20 %	20 %	407715337
47	NC_018697	TCTTG	2	10	79995	80004	0 %	60 %	20 %	20 %	407715338
48	NC_018697	AGGTG	2	10	83973	83982	20 %	20 %	60 %	0 %	407715342
49	NC_018697	TAATT	2	10	85155	85164	40 %	60 %	0 %	0 %	407715342
50	NC_018697	TTAAA	2	10	86091	86100	60 %	40 %	0 %	0 %	407715344
51	NC_018697	GAACA	2	10	88824	88833	60 %	0 %	20 %	20 %	407715346
52	NC_018697	GCTTA	2	10	89146	89155	20 %	40 %	20 %	20 %	407715346
53	NC_018697	TGGCG	2	10	90535	90544	0 %	20 %	60 %	20 %	407715347
54	NC_018697	AGTTT	2	10	90618	90627	20 %	60 %	20 %	0 %	407715347
55	NC_018697	AAAAG	2	10	91057	91066	80 %	0 %	20 %	0 %	407715347
56	NC_018697	GTTAA	2	10	94062	94071	40 %	40 %	20 %	0 %	407715351
57	NC_018697	GTTTT	2	10	98479	98488	0 %	80 %	20 %	0 %	407715353
58	NC_018697	CATAA	2	10	98591	98600	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018697	GGTTT	2	10	99376	99385	0 %	60 %	40 %	0 %	407715355
60	NC_018697	AGAAC	2	10	100497	100506	60 %	0 %	20 %	20 %	407715357
61	NC_018697	TAAAA	2	10	105888	105897	80 %	20 %	0 %	0 %	407715364
62	NC_018697	TCGGT	2	10	107376	107385	0 %	40 %	40 %	20 %	407715365
63	NC_018697	AAATG	2	10	108655	108664	60 %	20 %	20 %	0 %	407715366
64	NC_018697	AAATT	2	10	109947	109956	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018697	GCATG	2	10	115533	115542	20 %	20 %	40 %	20 %	407715369
66	NC_018697	TTCAA	2	10	117873	117882	40 %	40 %	0 %	20 %	407715372
67	NC_018697	GTTTT	2	10	118560	118569	0 %	80 %	20 %	0 %	407715373
68	NC_018697	GGCTG	2	10	119949	119958	0 %	20 %	60 %	20 %	407715374
69	NC_018697	ACGAT	2	10	120781	120790	40 %	20 %	20 %	20 %	407715375
70	NC_018697	ATAAA	2	10	124059	124068	80 %	20 %	0 %	0 %	407715378
71	NC_018697	GACAA	2	10	125358	125367	60 %	0 %	20 %	20 %	407715379
72	NC_018697	ACGGC	2	10	127275	127284	20 %	0 %	40 %	40 %	407715382
73	NC_018697	ATTGT	2	10	127649	127658	20 %	60 %	20 %	0 %	407715382
74	NC_018697	TGAAA	2	10	129093	129102	60 %	20 %	20 %	0 %	407715384
75	NC_018697	GTTAA	2	10	129461	129470	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018697	CATGT	2	10	132697	132706	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018697	GTTTT	2	10	137291	137300	0 %	80 %	20 %	0 %	407715393
78	NC_018697	GAACA	2	10	138918	138927	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018697	TTGAT	2	10	144281	144290	20 %	60 %	20 %	0 %	407715402
80	NC_018697	AGGTG	2	10	144809	144818	20 %	20 %	60 %	0 %	407715403
81	NC_018697	GCAAA	2	10	145242	145251	60 %	0 %	20 %	20 %	407715403
82	NC_018697	TGGTT	2	10	146990	146999	0 %	60 %	40 %	0 %	407715406
83	NC_018697	TGAAT	2	10	150203	150212	40 %	40 %	20 %	0 %	407715411
84	NC_018697	AGCAA	2	10	151166	151175	60 %	0 %	20 %	20 %	407715412
85	NC_018697	AAGCC	2	10	152277	152286	40 %	0 %	20 %	40 %	407715414
86	NC_018697	AAAGC	2	10	153602	153611	60 %	0 %	20 %	20 %	407715416
87	NC_018697	TTCAT	2	10	153797	153806	20 %	60 %	0 %	20 %	407715416
88	NC_018697	GCTTT	2	10	155414	155423	0 %	60 %	20 %	20 %	407715417
89	NC_018697	AATAA	2	10	156394	156403	80 %	20 %	0 %	0 %	407715418
90	NC_018697	ATAAA	2	10	157756	157765	80 %	20 %	0 %	0 %	407715420
91	NC_018697	GGCGA	2	10	160661	160670	20 %	0 %	60 %	20 %	407715421
92	NC_018697	TTACA	2	10	162215	162224	40 %	40 %	0 %	20 %	407715424
93	NC_018697	CATTG	2	10	164972	164981	20 %	40 %	20 %	20 %	407715426
94	NC_018697	ATTTA	2	10	167199	167208	40 %	60 %	0 %	0 %	407715429
95	NC_018697	TCGGC	2	10	171023	171032	0 %	20 %	40 %	40 %	407715435
96	NC_018697	CGATA	2	10	177853	177862	40 %	20 %	20 %	20 %	407715441
97	NC_018697	TTGCT	2	10	177879	177888	0 %	60 %	20 %	20 %	407715441
98	NC_018697	TGGTT	2	10	180389	180398	0 %	60 %	40 %	0 %	407715444
99	NC_018697	TGTTA	2	10	180410	180419	20 %	60 %	20 %	0 %	407715444
100	NC_018697	GCGGT	2	10	181367	181376	0 %	20 %	60 %	20 %	407715445
101	NC_018697	GGTTT	2	10	181686	181695	0 %	60 %	40 %	0 %	407715445
102	NC_018697	GGTGT	2	10	184630	184639	0 %	40 %	60 %	0 %	407715447
103	NC_018697	AACAC	2	10	185825	185834	60 %	0 %	0 %	40 %	407715448
104	NC_018697	AATTA	2	10	187081	187090	60 %	40 %	0 %	0 %	407715450
105	NC_018697	GCCAA	2	10	188216	188225	40 %	0 %	20 %	40 %	407715451
106	NC_018697	AATTA	2	10	191953	191962	60 %	40 %	0 %	0 %	407715455
107	NC_018697	GCCAG	2	10	194034	194043	20 %	0 %	40 %	40 %	407715456
108	NC_018697	CGTAA	2	10	195074	195083	40 %	20 %	20 %	20 %	407715457
109	NC_018697	TTACG	2	10	199110	199119	20 %	40 %	20 %	20 %	407715462
110	NC_018697	TCCCC	2	10	200522	200531	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
111	NC_018697	CAAGC	2	10	201222	201231	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_018697	GCGAA	2	10	203582	203591	40 %	0 %	40 %	20 %	407715466
113	NC_018697	ATGGA	2	10	203873	203882	40 %	20 %	40 %	0 %	407715466
114	NC_018697	TTATT	2	10	204548	204557	20 %	80 %	0 %	0 %	407715467
115	NC_018697	TTTAT	2	10	204937	204946	20 %	80 %	0 %	0 %	407715467
116	NC_018697	AATCA	2	10	206835	206844	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018697	CAACA	2	10	211253	211262	60 %	0 %	0 %	40 %	407715474
118	NC_018697	TGATC	2	10	214083	214092	20 %	40 %	20 %	20 %	407715477
119	NC_018697	TGGTT	2	10	215457	215466	0 %	60 %	40 %	0 %	407715478
120	NC_018697	AGTTA	2	10	217408	217417	40 %	40 %	20 %	0 %	407715479
121	NC_018697	ATTAA	2	10	221858	221867	60 %	40 %	0 %	0 %	407715483
122	NC_018697	GTTTA	2	10	224654	224663	20 %	60 %	20 %	0 %	407715487
123	NC_018697	TCGCT	2	10	225107	225116	0 %	40 %	20 %	40 %	407715487
124	NC_018697	TGGCT	2	10	227868	227877	0 %	40 %	40 %	20 %	407715489
125	NC_018697	GTTCA	2	10	228457	228466	20 %	40 %	20 %	20 %	407715489
126	NC_018697	AAAAT	2	10	232956	232965	80 %	20 %	0 %	0 %	407715492
127	NC_018697	AATTA	2	10	233702	233711	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018697	TATTT	2	10	234905	234914	20 %	80 %	0 %	0 %	407715493
129	NC_018697	GTTAA	2	10	236336	236345	40 %	40 %	20 %	0 %	407715495
130	NC_018697	TGAAT	2	10	237897	237906	40 %	40 %	20 %	0 %	407715497
131	NC_018697	AGGGC	2	10	239164	239173	20 %	0 %	60 %	20 %	407715499
132	NC_018697	GTAGG	2	10	240128	240137	20 %	20 %	60 %	0 %	407715499
133	NC_018697	CAATA	2	10	240649	240658	60 %	20 %	0 %	20 %	407715499
134	NC_018697	TTATT	2	10	242410	242419	20 %	80 %	0 %	0 %	407715502
135	NC_018697	GCTTG	2	10	242570	242579	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018697	CTTCG	2	10	244959	244968	0 %	40 %	20 %	40 %	407715505
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150	NC_018697	TTTTG	2	10	265164	265173	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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