MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia phenoliruptrix BR3459a plasmid pSYMBR3459

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018696	GATCAA	2	12	1747	1758	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018696	TGGCCC	2	12	33727	33738	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018696	CGATAG	2	12	43757	43768	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018696	ATCGCA	2	12	62695	62706	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018696	GGGCGC	2	12	83197	83208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018696	GATTGA	2	12	83378	83389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018696	TGGGCG	2	12	85617	85628	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018696	GCATTT	2	12	95106	95117	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018696	GCCCAA	2	12	133732	133743	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018696	AAATCA	2	12	145411	145422	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018696	TCGGCC	2	12	210918	210929	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018696	CCTTGA	2	12	213541	213552	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018696	GCTGCC	2	12	217283	217294	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018696	ATGGGA	2	12	226581	226592	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018696	ACGCAA	2	12	227133	227144	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018696	GCGTCG	2	12	233326	233337	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018696	CTGGAC	2	12	233959	233970	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018696	GCCGTC	2	12	282341	282352	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018696	GATGAA	2	12	287957	287968	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018696	AGATCG	2	12	291800	291811	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018696	CTCGCG	2	12	312354	312365	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018696	ACGTCT	2	12	320461	320472	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018696	GCGACC	2	12	334169	334180	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018696	TTGCCG	2	12	352764	352775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018696	CAATGC	2	12	356788	356799	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018696	GCTCGC	2	12	451834	451845	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018696	GCTACG	2	12	452583	452594	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018696	CTGCCG	2	12	454900	454911	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018696	ACGGTC	2	12	455784	455795	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018696	AAGTCC	2	12	506430	506441	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018696	GCGGAC	2	12	530249	530260	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018696	TAGCGA	2	12	561950	561961	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018696	GAACTA	2	12	575826	575837	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018696	GGCGAA	2	12	576462	576473	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018696	CTCCGC	2	12	587543	587554	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_018696	CCGCGG	2	12	599285	599296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018696	ATCCGC	2	12	607471	607482	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018696	GATGGA	2	12	608384	608395	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018696	CTCAAG	2	12	608550	608561	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018696	ACGCAA	2	12	643828	643839	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018696	TTGCGT	2	12	643896	643907	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018696	GGTACC	2	12	646482	646493	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018696	TCGTAA	2	12	669703	669714	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018696	GACACT	2	12	700585	700596	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018696	GGCGAA	2	12	709013	709024	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018696	GTGCGC	2	12	717431	717442	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018696	TCGGCA	2	12	753760	753771	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018696	ACCGGC	2	12	753853	753864	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.