MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia phenoliruptrix BR3459a chromosome 1

Total Repeats: 206

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018695	GCAGGC	2	12	21145	21156	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018695	TATACA	2	12	23225	23236	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018695	AACAAA	2	12	24234	24245	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018695	AGGGGC	2	12	34590	34601	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018695	ACAAGG	2	12	65546	65557	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018695	CGAATG	2	12	140134	140145	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018695	CCGCTT	2	12	146379	146390	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018695	AGATCG	2	12	201204	201215	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018695	GGCGCG	2	12	251931	251942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018695	AGTAGA	2	12	321834	321845	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018695	GGGCGT	2	12	337137	337148	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018695	AAGAGG	2	12	340126	340137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018695	CGCGGC	2	12	361862	361873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018695	ATTTCG	2	12	416867	416878	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018695	GGACAG	2	12	431621	431632	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018695	CGGGCG	2	12	439746	439757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018695	GTCGCA	2	12	439888	439899	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018695	GCCACT	2	12	451233	451244	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018695	GCCACC	2	12	451245	451256	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_018695	TGGCGT	7	42	460776	460817	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018695	TGGCGA	3	18	460818	460835	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018695	TTTCCA	3	18	460847	460864	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018695	CCGGCA	2	12	462751	462762	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018695	GTAAAA	2	12	466848	466859	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018695	AATCTG	2	12	482908	482919	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018695	GTCCGC	2	12	524971	524982	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018695	CTTGGC	2	12	550187	550198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018695	CCAGCA	2	12	554650	554661	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018695	CGCCTG	2	12	584384	584395	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018695	GCACCC	18	108	584443	584550	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_018695	GCACCT	2	12	584551	584562	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018695	CCGTCT	2	12	584601	584612	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018695	TGAAAT	2	12	673285	673296	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018695	TTTGTT	2	12	691372	691383	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018695	CATCTC	2	12	771178	771189	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018695	ATGCGG	2	12	774113	774124	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018695	TCATAG	2	12	832360	832371	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018695	CATGCT	2	12	848537	848548	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018695	CGGGCG	2	12	852590	852601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018695	AACGGC	2	12	853333	853344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018695	CCGGCA	2	12	855563	855574	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018695	GGCGAA	2	12	858900	858911	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018695	CCGCGA	2	12	859567	859578	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018695	CGAGTC	2	12	860812	860823	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018695	CGCAGA	2	12	861199	861210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018695	CGCTGG	2	12	861403	861414	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018695	GGCGCA	2	12	862883	862894	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018695	GCGTAA	2	12	865244	865255	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018695	CGCCGG	2	12	973343	973354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018695	ACTGCG	2	12	982943	982954	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018695	AAACGG	2	12	991459	991470	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018695	GACGTG	2	12	1001594	1001605	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018695	ATGTGC	2	12	1006258	1006269	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018695	TATCGC	2	12	1023327	1023338	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018695	CGCCCA	2	12	1024095	1024106	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_018695	CCACGA	2	12	1039887	1039898	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018695	CCTTTT	2	12	1069697	1069708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018695	AACGCG	2	12	1073668	1073679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018695	ACCCCC	2	12	1075268	1075279	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
60	NC_018695	GCACGA	2	12	1086939	1086950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018695	GCGGGC	2	12	1102095	1102106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018695	GTGAAG	2	12	1154171	1154182	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018695	GCGATT	2	12	1161308	1161319	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_018695	CTGGCG	2	12	1195009	1195020	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018695	GAGTAG	2	12	1240382	1240393	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018695	CATTCA	2	12	1301923	1301934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018695	GTGCTG	2	12	1341721	1341732	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018695	GCAAGC	2	12	1351318	1351329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018695	AGCCCG	2	12	1355864	1355875	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018695	TAAATG	2	12	1381442	1381453	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018695	CACCGA	2	12	1391619	1391630	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018695	TCGACG	2	12	1393111	1393122	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018695	GCCGCT	2	12	1396911	1396922	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018695	GCGCGG	2	12	1398583	1398594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018695	GTCGAT	2	12	1401150	1401161	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018695	TGAAGG	2	12	1403504	1403515	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018695	GCAGTG	2	12	1405998	1406009	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018695	CGGGCG	2	12	1407494	1407505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018695	ATGCGC	2	12	1407554	1407565	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018695	GAAACG	2	12	1407742	1407753	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_018695	GCCGCA	2	12	1407881	1407892	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018695	AGCGCG	2	12	1440552	1440563	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018695	ACGTCG	2	12	1485720	1485731	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018695	TCGGCA	2	12	1505721	1505732	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018695	ACCCTT	2	12	1535013	1535024	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_018695	AGCGGG	2	12	1554580	1554591	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018695	AAAGAG	2	12	1573917	1573928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018695	CGGCTT	2	12	1577104	1577115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018695	CCGCGG	2	12	1593662	1593673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018695	GATTGC	2	12	1616051	1616062	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018695	CGTGCG	2	12	1619715	1619726	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018695	ACGCGC	2	12	1630452	1630463	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_018695	CCCGCA	2	12	1654348	1654359	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_018695	CGGCCG	2	12	1660331	1660342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018695	TTGAGT	3	18	1661269	1661286	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018695	CCGACG	3	18	1661387	1661404	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_018695	CGCCGG	2	12	1665807	1665818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018695	TGCGCG	2	12	1677159	1677170	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018695	AGCGGT	2	12	1678787	1678798	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018695	AGGGCG	2	12	1697720	1697731	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_018695	AGCGCA	2	12	1722276	1722287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018695	GCGCCG	2	12	1747757	1747768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_018695	GCGACG	2	12	1781682	1781693	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018695	CAACAG	2	12	1787181	1787192	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018695	AAGGCA	3	18	1824101	1824118	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018695	GAAAAC	2	12	1896540	1896551	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018695	CGGCAT	2	12	1899126	1899137	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018695	AGGCGG	2	12	1903325	1903336	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_018695	CGGCTG	2	12	1954706	1954717	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018695	CGGGCG	2	12	1963419	1963430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018695	ACGAAC	2	12	2124091	2124102	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018695	GTTTCG	2	12	2209361	2209372	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_018695	GCCTTT	2	12	2216265	2216276	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018695	CAGAAT	2	12	2254339	2254350	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018695	GCCTAT	2	12	2272051	2272062	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018695	TGCTTA	2	12	2350933	2350944	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_018695	CGCCCC	2	12	2369207	2369218	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
118	NC_018695	CAAGGA	2	12	2373580	2373591	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_018695	CTTGGC	2	12	2435108	2435119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018695	CGGGCT	2	12	2440014	2440025	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018695	GATTGA	2	12	2503824	2503835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018695	CAGACC	2	12	2505056	2505067	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018695	GCACCA	2	12	2550382	2550393	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
124	NC_018695	ACGATC	2	12	2559393	2559404	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018695	GCTCAA	2	12	2564439	2564450	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018695	GCATGA	2	12	2577868	2577879	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_018695	ATCGAC	2	12	2581957	2581968	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018695	GCTGGC	2	12	2651588	2651599	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018695	TGCGCT	2	12	2657927	2657938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018695	GCGCCG	2	12	2662396	2662407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_018695	TTTCCG	2	12	2714849	2714860	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018695	TTTTCG	2	12	2720545	2720556	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_018695	CTGCGG	2	12	2728053	2728064	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018695	GCCCTC	8	48	2738543	2738590	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_018695	CGGATG	2	12	2776292	2776303	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_018695	GCCGCA	3	18	2779710	2779727	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018695	ACCTTG	2	12	2779818	2779829	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018695	CCAAGC	2	12	2867173	2867184	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
139	NC_018695	CAACTG	2	12	2919525	2919536	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018695	TGCCGC	2	12	2931936	2931947	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
141	NC_018695	CCGCAG	2	12	2959599	2959610	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
142	NC_018695	GCAAGG	2	12	2962880	2962891	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_018695	CATTGC	2	12	2999032	2999043	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_018695	GATCGG	2	12	3000366	3000377	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_018695	GCACAT	2	12	3004626	3004637	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_018695	GGCTTC	2	12	3009242	3009253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_018695	TCTTCA	2	12	3011234	3011245	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_018695	AATCTC	2	12	3039573	3039584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_018695	AGAAAA	2	12	3054214	3054225	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018695	CTTTTT	2	12	3060291	3060302	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_018695	CGCGCC	2	12	3060972	3060983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_018695	GCCGCG	2	12	3063580	3063591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_018695	AGTGGG	2	12	3066626	3066637	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018695	CTGCAA	2	12	3081935	3081946	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_018695	AGCGGC	2	12	3110471	3110482	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_018695	CGCCCG	2	12	3194963	3194974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_018695	CTGCGC	2	12	3201161	3201172	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
158	NC_018695	ACGGCC	2	12	3212374	3212385	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
159	NC_018695	GTTGCA	2	12	3240220	3240231	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_018695	GCAGCC	2	12	3240412	3240423	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
161	NC_018695	CGCCCA	2	12	3266316	3266327	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_018695	TTCATT	2	12	3301380	3301391	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_018695	TTTTTG	2	12	3315719	3315730	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
164	NC_018695	ACGCGG	2	12	3337202	3337213	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_018695	TTTTTG	2	12	3338658	3338669	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
166	NC_018695	CCCGCC	2	12	3339463	3339474	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
167	NC_018695	GGCCTC	2	12	3361540	3361551	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
168	NC_018695	GGCGCT	2	12	3374404	3374415	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_018695	ACAGGA	2	12	3374737	3374748	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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172	NC_018695	TCGTCT	2	12	3409229	3409240	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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174	NC_018695	GCGCGG	2	12	3457838	3457849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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177	NC_018695	GCTGCG	2	12	3574645	3574656	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_018695	TCCTGG	2	12	3615043	3615054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_018695	ATTACT	2	12	3675085	3675096	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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182	NC_018695	GGCGCG	2	12	3717780	3717791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_018695	GGCGCC	2	12	3739404	3739415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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206	NC_018695	CTGGCC	2	12	4150116	4150127	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.