MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC54

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018694	TGAAGG	2	12	2301	2312	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	407708684
2	NC_018694	ACAGGT	2	12	2488	2499	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407708684
3	NC_018694	AGAAAA	2	12	5585	5596	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407708690
4	NC_018694	TAAAGG	2	12	7449	7460	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407708693
5	NC_018694	TAGCTT	3	18	8555	8572	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407708693
6	NC_018694	AGGAGT	2	12	10220	10231	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	407708694
7	NC_018694	CAGTAG	2	12	11232	11243	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407708695
8	NC_018694	TGGGAT	2	12	11465	11476	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407708695
9	NC_018694	AACCAG	2	12	18684	18695	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407708702
10	NC_018694	ATTTAC	2	12	19309	19320	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407708702
11	NC_018694	TTTCTT	2	12	21018	21029	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407708703
12	NC_018694	ACAGTT	2	12	21856	21867	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407708704
13	NC_018694	AAACCA	2	12	21868	21879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407708704
14	NC_018694	CGTTTT	2	12	23905	23916	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407708707
15	NC_018694	ATCAAT	2	12	27405	27416	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407708712
16	NC_018694	TGCTTC	2	12	32530	32541	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407708719
17	NC_018694	AAAAGA	2	12	38980	38991	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407708728
18	NC_018694	TGATTT	2	12	40206	40217	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407708731
19	NC_018694	AGCACA	2	12	43176	43187	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407708737
20	NC_018694	TATAGA	2	12	43258	43269	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407708737
21	NC_018694	GATATT	2	12	47414	47425	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407708745
22	NC_018694	CTAATA	2	12	51588	51599	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407708751

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.