MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC54

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018694	AGCAA	2	10	2051	2060	60 %	0 %	20 %	20 %	407708684
2	NC_018694	AAATG	2	10	7212	7221	60 %	20 %	20 %	0 %	407708693
3	NC_018694	ATCTA	2	10	8114	8123	40 %	40 %	0 %	20 %	407708693
4	NC_018694	TAATT	2	10	10309	10318	40 %	60 %	0 %	0 %	407708695
5	NC_018694	TGGTA	2	10	10466	10475	20 %	40 %	40 %	0 %	407708695
6	NC_018694	AGTTT	2	10	10977	10986	20 %	60 %	20 %	0 %	407708695
7	NC_018694	GTTTG	2	10	12569	12578	0 %	60 %	40 %	0 %	407708697
8	NC_018694	AATGC	2	10	13989	13998	40 %	20 %	20 %	20 %	407708699
9	NC_018694	GAAAC	2	10	15531	15540	60 %	0 %	20 %	20 %	407708700
10	NC_018694	CAACA	2	10	16536	16545	60 %	0 %	0 %	40 %	407708701
11	NC_018694	ATTTT	2	10	18862	18871	20 %	80 %	0 %	0 %	407708702
12	NC_018694	TGCAT	2	10	19513	19522	20 %	40 %	20 %	20 %	407708702
13	NC_018694	TGTAT	2	10	20289	20298	20 %	60 %	20 %	0 %	407708702
14	NC_018694	TAATT	2	10	20832	20841	40 %	60 %	0 %	0 %	407708703
15	NC_018694	GAAAA	2	10	21176	21185	80 %	0 %	20 %	0 %	407708703
16	NC_018694	TGGAT	2	10	22490	22499	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018694	AAATT	2	10	24373	24382	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018694	TGATA	2	10	24480	24489	40 %	40 %	20 %	0 %	407708708
19	NC_018694	ATTTG	2	10	26857	26866	20 %	60 %	20 %	0 %	407708712
20	NC_018694	ATTTT	2	10	27334	27343	20 %	80 %	0 %	0 %	407708712
21	NC_018694	TTTAT	2	10	29395	29404	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018694	TAATA	2	10	30448	30457	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018694	AAAAG	2	10	33535	33544	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018694	TTTAT	2	10	33742	33751	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018694	AAAAG	2	10	33803	33812	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018694	TCTTT	2	10	34324	34333	0 %	80 %	0 %	20 %	407708721
27	NC_018694	ATAAA	2	10	35314	35323	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018694	ATAAA	2	10	37300	37309	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018694	ATGTA	2	10	38288	38297	40 %	40 %	20 %	0 %	407708727
30	NC_018694	ACAGA	2	10	39432	39441	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018694	GGAAG	2	10	44292	44301	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018694	ATATG	2	10	44498	44507	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018694	CTGGA	2	10	47752	47761	20 %	20 %	40 %	20 %	407708745
34	NC_018694	TTTTC	2	10	48547	48556	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018694	ATTAC	2	10	50353	50362	40 %	40 %	0 %	20 %	407708748
36	NC_018694	TAAAT	2	10	50515	50524	60 %	40 %	0 %	0 %	407708749
37	NC_018694	GTAAA	2	10	51841	51850	60 %	20 %	20 %	0 %	407708752
38	NC_018694	TATGA	2	10	53153	53162	40 %	40 %	20 %	0 %	407708753
39	NC_018694	TATCG	2	10	54002	54011	20 %	40 %	20 %	20 %	407708753

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.