MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC54

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018694	AGAT	2	8	290	297	50 %	25 %	25 %	0 %	407708682
2	NC_018694	AAGC	2	8	379	386	50 %	0 %	25 %	25 %	407708682
3	NC_018694	TTTA	2	8	560	567	25 %	75 %	0 %	0 %	407708682
4	NC_018694	ACAA	2	8	1005	1012	75 %	0 %	0 %	25 %	407708683
5	NC_018694	ATTT	2	8	1362	1369	25 %	75 %	0 %	0 %	407708683
6	NC_018694	GAAT	2	8	2024	2031	50 %	25 %	25 %	0 %	407708684
7	NC_018694	AAAC	2	8	2510	2517	75 %	0 %	0 %	25 %	407708684
8	NC_018694	AAAT	2	8	2562	2569	75 %	25 %	0 %	0 %	407708684
9	NC_018694	ATAC	2	8	2783	2790	50 %	25 %	0 %	25 %	407708684
10	NC_018694	GAAA	2	8	3263	3270	75 %	0 %	25 %	0 %	407708685
11	NC_018694	GAAA	2	8	3409	3416	75 %	0 %	25 %	0 %	407708686
12	NC_018694	CTTT	2	8	3443	3450	0 %	75 %	0 %	25 %	407708686
13	NC_018694	ACAA	2	8	3743	3750	75 %	0 %	0 %	25 %	407708686
14	NC_018694	TAGA	2	8	4871	4878	50 %	25 %	25 %	0 %	407708689
15	NC_018694	TCAT	2	8	4958	4965	25 %	50 %	0 %	25 %	407708689
16	NC_018694	ATTA	2	8	5037	5044	50 %	50 %	0 %	0 %	407708690
17	NC_018694	ATTT	2	8	5572	5579	25 %	75 %	0 %	0 %	407708690
18	NC_018694	AAGC	2	8	5854	5861	50 %	0 %	25 %	25 %	407708691
19	NC_018694	AACT	2	8	5870	5877	50 %	25 %	0 %	25 %	407708691
20	NC_018694	ATGG	2	8	6280	6287	25 %	25 %	50 %	0 %	407708692
21	NC_018694	GTAG	2	8	6772	6779	25 %	25 %	50 %	0 %	407708693
22	NC_018694	AAGT	2	8	7010	7017	50 %	25 %	25 %	0 %	407708693
23	NC_018694	TCTT	2	8	7032	7039	0 %	75 %	0 %	25 %	407708693
24	NC_018694	TTTA	2	8	7248	7255	25 %	75 %	0 %	0 %	407708693
25	NC_018694	TGGA	2	8	8391	8398	25 %	25 %	50 %	0 %	407708693
26	NC_018694	TGGA	2	8	8523	8530	25 %	25 %	50 %	0 %	407708693
27	NC_018694	AAAG	2	8	8940	8947	75 %	0 %	25 %	0 %	407708693
28	NC_018694	TAAA	2	8	9275	9282	75 %	25 %	0 %	0 %	407708693
29	NC_018694	AATA	2	8	9729	9736	75 %	25 %	0 %	0 %	407708694
30	NC_018694	AACA	2	8	9934	9941	75 %	0 %	0 %	25 %	407708694
31	NC_018694	GAAT	2	8	10435	10442	50 %	25 %	25 %	0 %	407708695
32	NC_018694	ATTT	2	8	12810	12817	25 %	75 %	0 %	0 %	407708698
33	NC_018694	GAAA	2	8	13276	13283	75 %	0 %	25 %	0 %	407708699
34	NC_018694	AAGT	2	8	13468	13475	50 %	25 %	25 %	0 %	407708699
35	NC_018694	CAAA	2	8	13593	13600	75 %	0 %	0 %	25 %	407708699
36	NC_018694	AGAA	2	8	14220	14227	75 %	0 %	25 %	0 %	407708699
37	NC_018694	AACG	2	8	14442	14449	50 %	0 %	25 %	25 %	407708700
38	NC_018694	AAAG	2	8	14641	14648	75 %	0 %	25 %	0 %	407708700
39	NC_018694	TATT	2	8	15091	15098	25 %	75 %	0 %	0 %	407708700
40	NC_018694	GAAT	2	8	16648	16655	50 %	25 %	25 %	0 %	407708701
41	NC_018694	ATTT	2	8	17088	17095	25 %	75 %	0 %	0 %	407708701
42	NC_018694	AAAT	2	8	17310	17317	75 %	25 %	0 %	0 %	407708701
43	NC_018694	GAAA	2	8	17330	17337	75 %	0 %	25 %	0 %	407708701
44	NC_018694	AAAT	2	8	17557	17564	75 %	25 %	0 %	0 %	407708701
45	NC_018694	AAAT	2	8	17622	17629	75 %	25 %	0 %	0 %	407708701
46	NC_018694	GCAA	2	8	17725	17732	50 %	0 %	25 %	25 %	407708701
47	NC_018694	ATTT	2	8	17901	17908	25 %	75 %	0 %	0 %	407708701
48	NC_018694	TTTG	2	8	17947	17954	0 %	75 %	25 %	0 %	407708701
49	NC_018694	TTAA	2	8	19022	19029	50 %	50 %	0 %	0 %	407708702
50	NC_018694	TAAA	2	8	19569	19576	75 %	25 %	0 %	0 %	407708702
51	NC_018694	AAAG	2	8	19601	19608	75 %	0 %	25 %	0 %	407708702
52	NC_018694	ATAA	2	8	20051	20058	75 %	25 %	0 %	0 %	407708702
53	NC_018694	CTTC	2	8	20195	20202	0 %	50 %	0 %	50 %	407708702
54	NC_018694	ATTT	2	8	20609	20616	25 %	75 %	0 %	0 %	407708702
55	NC_018694	ATTT	2	8	20987	20994	25 %	75 %	0 %	0 %	407708703
56	NC_018694	TTTG	2	8	21251	21258	0 %	75 %	25 %	0 %	407708704
57	NC_018694	TTAC	2	8	21743	21750	25 %	50 %	0 %	25 %	407708704
58	NC_018694	ATTA	2	8	21781	21788	50 %	50 %	0 %	0 %	407708704
59	NC_018694	TAAA	2	8	21989	21996	75 %	25 %	0 %	0 %	407708704
60	NC_018694	TGTA	2	8	22325	22332	25 %	50 %	25 %	0 %	407708704
61	NC_018694	AGAA	2	8	23006	23013	75 %	0 %	25 %	0 %	407708705
62	NC_018694	TTTG	2	8	23416	23423	0 %	75 %	25 %	0 %	407708706
63	NC_018694	AAAG	2	8	23485	23492	75 %	0 %	25 %	0 %	407708706
64	NC_018694	CATT	2	8	24148	24155	25 %	50 %	0 %	25 %	407708707
65	NC_018694	TGAT	2	8	24445	24452	25 %	50 %	25 %	0 %	407708708
66	NC_018694	TAAA	2	8	24464	24471	75 %	25 %	0 %	0 %	407708708
67	NC_018694	AATG	2	8	24523	24530	50 %	25 %	25 %	0 %	407708708
68	NC_018694	AATT	2	8	26603	26610	50 %	50 %	0 %	0 %	407708712
69	NC_018694	ATTC	2	8	26801	26808	25 %	50 %	0 %	25 %	407708712
70	NC_018694	ATGT	2	8	26905	26912	25 %	50 %	25 %	0 %	407708712
71	NC_018694	TCTT	2	8	27791	27798	0 %	75 %	0 %	25 %	407708712
72	NC_018694	CTGT	2	8	28458	28465	0 %	50 %	25 %	25 %	407708713
73	NC_018694	AAGA	2	8	28778	28785	75 %	0 %	25 %	0 %	407708714
74	NC_018694	TACA	2	8	28815	28822	50 %	25 %	0 %	25 %	407708714
75	NC_018694	TTTC	2	8	30813	30820	0 %	75 %	0 %	25 %	407708715
76	NC_018694	GTTT	2	8	30844	30851	0 %	75 %	25 %	0 %	407708715
77	NC_018694	TGAT	2	8	31671	31678	25 %	50 %	25 %	0 %	407708718
78	NC_018694	GTAT	2	8	31868	31875	25 %	50 %	25 %	0 %	407708718
79	NC_018694	TAAC	2	8	32565	32572	50 %	25 %	0 %	25 %	407708719
80	NC_018694	GTTT	2	8	32604	32611	0 %	75 %	25 %	0 %	407708719
81	NC_018694	TCCA	2	8	33077	33084	25 %	25 %	0 %	50 %	407708720
82	NC_018694	TTTG	2	8	34305	34312	0 %	75 %	25 %	0 %	407708721
83	NC_018694	GTTC	2	8	35020	35027	0 %	50 %	25 %	25 %	407708722
84	NC_018694	ATGA	2	8	35841	35848	50 %	25 %	25 %	0 %	407708723
85	NC_018694	GAAA	2	8	36440	36447	75 %	0 %	25 %	0 %	407708723
86	NC_018694	TTTG	2	8	36502	36509	0 %	75 %	25 %	0 %	407708723
87	NC_018694	ATCG	2	8	36738	36745	25 %	25 %	25 %	25 %	407708723
88	NC_018694	AATG	2	8	37331	37338	50 %	25 %	25 %	0 %	407708725
89	NC_018694	CAAG	2	8	37687	37694	50 %	0 %	25 %	25 %	407708726
90	NC_018694	CGTA	2	8	37842	37849	25 %	25 %	25 %	25 %	407708726
91	NC_018694	ATAG	2	8	38249	38256	50 %	25 %	25 %	0 %	407708727
92	NC_018694	TGAC	2	8	38436	38443	25 %	25 %	25 %	25 %	407708728
93	NC_018694	GAAA	2	8	38656	38663	75 %	0 %	25 %	0 %	407708728
94	NC_018694	TGAA	2	8	38793	38800	50 %	25 %	25 %	0 %	407708728
95	NC_018694	GCAA	2	8	39246	39253	50 %	0 %	25 %	25 %	407708729
96	NC_018694	ATGG	2	8	39988	39995	25 %	25 %	50 %	0 %	407708731
97	NC_018694	GAAA	2	8	40239	40246	75 %	0 %	25 %	0 %	407708731
98	NC_018694	TAGA	2	8	41599	41606	50 %	25 %	25 %	0 %	407708734
99	NC_018694	ACAA	2	8	41931	41938	75 %	0 %	0 %	25 %	407708735
100	NC_018694	TTTG	2	8	42154	42161	0 %	75 %	25 %	0 %	407708735
101	NC_018694	AGAA	2	8	42356	42363	75 %	0 %	25 %	0 %	407708736
102	NC_018694	AGTT	2	8	42515	42522	25 %	50 %	25 %	0 %	407708736
103	NC_018694	CGTG	2	8	42685	42692	0 %	25 %	50 %	25 %	407708736
104	NC_018694	GGTT	2	8	43068	43075	0 %	50 %	50 %	0 %	407708737
105	NC_018694	AGGA	2	8	43167	43174	50 %	0 %	50 %	0 %	407708737
106	NC_018694	TGGA	2	8	43275	43282	25 %	25 %	50 %	0 %	407708737
107	NC_018694	TACT	2	8	44039	44046	25 %	50 %	0 %	25 %	407708739
108	NC_018694	AAGA	2	8	44121	44128	75 %	0 %	25 %	0 %	407708739
109	NC_018694	AAAG	2	8	44656	44663	75 %	0 %	25 %	0 %	407708740
110	NC_018694	TGAA	2	8	44687	44694	50 %	25 %	25 %	0 %	407708740
111	NC_018694	AGAA	2	8	45125	45132	75 %	0 %	25 %	0 %	407708741
112	NC_018694	AAGA	2	8	46481	46488	75 %	0 %	25 %	0 %	407708744
113	NC_018694	ATTA	2	8	46557	46564	50 %	50 %	0 %	0 %	407708744
114	NC_018694	GAAA	2	8	46721	46728	75 %	0 %	25 %	0 %	407708744
115	NC_018694	TTTG	2	8	47272	47279	0 %	75 %	25 %	0 %	407708745
116	NC_018694	TAGA	2	8	47544	47551	50 %	25 %	25 %	0 %	407708745
117	NC_018694	AGAA	2	8	47557	47564	75 %	0 %	25 %	0 %	407708745
118	NC_018694	GTGA	2	8	47770	47777	25 %	25 %	50 %	0 %	407708745
119	NC_018694	AATG	2	8	49379	49386	50 %	25 %	25 %	0 %	407708747
120	NC_018694	ATGA	2	8	49431	49438	50 %	25 %	25 %	0 %	407708747
121	NC_018694	GTAT	2	8	49450	49457	25 %	50 %	25 %	0 %	407708747
122	NC_018694	AAAC	2	8	49669	49676	75 %	0 %	0 %	25 %	407708747
123	NC_018694	GAAA	2	8	50034	50041	75 %	0 %	25 %	0 %	407708748
124	NC_018694	ACAA	2	8	50322	50329	75 %	0 %	0 %	25 %	407708748
125	NC_018694	GATA	2	8	50388	50395	50 %	25 %	25 %	0 %	407708748
126	NC_018694	GAAG	2	8	50791	50798	50 %	0 %	50 %	0 %	407708750
127	NC_018694	AAAG	2	8	51043	51050	75 %	0 %	25 %	0 %	407708751
128	NC_018694	TCAT	2	8	51321	51328	25 %	50 %	0 %	25 %	407708751
129	NC_018694	AAGA	2	8	51379	51386	75 %	0 %	25 %	0 %	407708751
130	NC_018694	ATTT	2	8	51916	51923	25 %	75 %	0 %	0 %	407708752
131	NC_018694	AAAG	2	8	51930	51937	75 %	0 %	25 %	0 %	407708752
132	NC_018694	TTGG	2	8	52582	52589	0 %	50 %	50 %	0 %	407708752
133	NC_018694	CAAA	2	8	53089	53096	75 %	0 %	0 %	25 %	407708753
134	NC_018694	TGAT	2	8	53169	53176	25 %	50 %	25 %	0 %	407708753
135	NC_018694	ATTC	2	8	53195	53202	25 %	50 %	0 %	25 %	407708753
136	NC_018694	ACAA	2	8	54037	54044	75 %	0 %	0 %	25 %	407708753

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.