MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 chromosome

Total Repeats: 2420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018693	TCATAT	2	12	5269	5280	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407703240
2	NC_018693	ACCGTC	2	12	7427	7438	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407703243
3	NC_018693	AAGTTA	2	12	7818	7829	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407703243
4	NC_018693	AAGAAA	2	12	8874	8885	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407703244
5	NC_018693	CGTGAG	2	12	9189	9200	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407703245
6	NC_018693	GGCGCA	2	12	11884	11895	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	407703249
7	NC_018693	TTCAGG	2	12	19472	19483	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407703256
8	NC_018693	AGAAAT	2	12	22981	22992	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703260
9	NC_018693	TTGTGT	2	12	27390	27401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407703265
10	NC_018693	CATTTA	2	12	29096	29107	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407703266
11	NC_018693	ACCGCA	2	12	33888	33899	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	407703273
12	NC_018693	ATCAAT	2	12	38817	38828	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018693	ATGATA	2	12	42878	42889	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407703281
14	NC_018693	TAAATA	2	12	43658	43669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407703282
15	NC_018693	GAGTGC	2	12	44130	44141	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407703283
16	NC_018693	ACAGAA	2	12	45537	45548	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407703284
17	NC_018693	CATGAA	2	12	47149	47160	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407703286
18	NC_018693	AATAAG	2	12	49170	49181	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703289
19	NC_018693	ATTTTC	2	12	51309	51320	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407703293
20	NC_018693	AGCAAG	2	12	52252	52263	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407703294
21	NC_018693	AAACAT	2	12	63146	63157	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018693	TTATGT	2	12	64112	64123	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407703305
23	NC_018693	GAACAT	2	12	66939	66950	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407703308
24	NC_018693	ACCAGA	2	12	69662	69673	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407703310
25	NC_018693	ATGTAA	2	12	71003	71014	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018693	AAAGGA	2	12	77025	77036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407703320
27	NC_018693	AAAAAG	2	12	82999	83010	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407703327
28	NC_018693	ACAGCT	2	12	85464	85475	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407703330
29	NC_018693	TCATTA	2	12	87067	87078	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407703331
30	NC_018693	GATTGT	2	12	87260	87271	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407703331
31	NC_018693	AAATGA	2	12	91985	91996	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703336
32	NC_018693	AATATT	2	12	95749	95760	50 %	50 %	0 %	0 %	407703343
33	NC_018693	GAATTT	2	12	96317	96328	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407703344
34	NC_018693	TAATTA	2	12	97945	97956	50 %	50 %	0 %	0 %	407703346
35	NC_018693	ATTACA	2	12	97993	98004	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407703346
36	NC_018693	ATTTTC	2	12	99745	99756	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407703348
37	NC_018693	GCCAAA	2	12	103162	103173	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407703353
38	NC_018693	AAAGAG	2	12	103927	103938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407703354
39	NC_018693	GCAATG	2	12	105793	105804	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407703356
40	NC_018693	AGGGGT	2	12	106209	106220	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	407703356
41	NC_018693	TAGTCT	2	12	106475	106486	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407703356
42	NC_018693	TATGAG	2	12	110203	110214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703360
43	NC_018693	ATAAAG	2	12	110279	110290	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703360
44	NC_018693	AAATGT	2	12	115277	115288	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018693	GCGATG	2	12	117169	117180	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407703366
46	NC_018693	TTTAAA	2	12	118092	118103	50 %	50 %	0 %	0 %	407703366
47	NC_018693	ATTTTA	2	12	118849	118860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703366
48	NC_018693	ACAGAG	2	12	118885	118896	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407703366
49	NC_018693	AGATAA	2	12	119796	119807	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703367
50	NC_018693	AAAATT	2	12	120016	120027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407703367
51	NC_018693	GTTTTT	2	12	120888	120899	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018693	GGAAAG	3	18	122300	122317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018693	TTTTAT	2	12	124714	124725	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407703373
54	NC_018693	CTGTAT	2	12	125047	125058	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407703373
55	NC_018693	AAGTGG	2	12	125624	125635	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	407703374
56	NC_018693	TATACA	2	12	125770	125781	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407703374
57	NC_018693	ACAAAA	2	12	127265	127276	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	407703376
58	NC_018693	TCGGCA	2	12	129082	129093	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407703377
59	NC_018693	CTTCTA	2	12	130820	130831	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407703378
60	NC_018693	GTATAT	2	12	130966	130977	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018693	AGTAAA	2	12	133579	133590	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703380
62	NC_018693	ACAAGT	2	12	136345	136356	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407703380
63	NC_018693	ACAAGT	2	12	136885	136896	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407703380
64	NC_018693	ACAAGT	2	12	137428	137439	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407703380
65	NC_018693	CATCGT	2	12	140779	140790	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407703382
66	NC_018693	ATTTTA	2	12	143617	143628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703384
67	NC_018693	TGTTAT	2	12	143691	143702	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407703384
68	NC_018693	ACAATT	2	12	151603	151614	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407703394
69	NC_018693	GTTTAA	2	12	158045	158056	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407703399
70	NC_018693	GTAAAA	2	12	163543	163554	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703404
71	NC_018693	AAATAC	2	12	164064	164075	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407703405
72	NC_018693	TTATCT	2	12	165027	165038	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407703407
73	NC_018693	TTTTAT	2	12	166608	166619	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018693	AGATAA	2	12	166905	166916	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018693	TTAATT	2	12	167987	167998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018693	TAGATG	2	12	168995	169006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703412
77	NC_018693	GTAGAA	2	12	170057	170068	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407703413
78	NC_018693	AAAATA	2	12	174424	174435	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407703416
79	NC_018693	TTTTCC	2	12	179381	179392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407703420
80	NC_018693	ACGAAT	2	12	179538	179549	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407703420
81	NC_018693	TGCGTT	2	12	180712	180723	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407703421
82	NC_018693	GTTAAT	2	12	184997	185008	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407703425
83	NC_018693	CGGAAG	2	12	192090	192101	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	407703435
84	NC_018693	TACAGG	2	12	192514	192525	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407703435
85	NC_018693	ATAAAG	2	12	198611	198622	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703439
86	NC_018693	CGAGGC	2	12	213977	213988	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	407703457
87	NC_018693	CTTTAG	2	12	218450	218461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407703463
88	NC_018693	ATCAAA	2	12	223539	223550	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018693	GGTTTA	2	12	225878	225889	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407703472
90	NC_018693	ATACCA	2	12	230377	230388	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407703477
91	NC_018693	TACTTT	2	12	233043	233054	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018693	ATTAAA	2	12	234124	234135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407703482
93	NC_018693	TAGAAA	2	12	237184	237195	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703488
94	NC_018693	CATTTT	2	12	237257	237268	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407703488
95	NC_018693	GGAGAA	2	12	239855	239866	50 %	0 %	50 %	0 %	407703491
96	NC_018693	AACGAA	2	12	241676	241687	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407703491
97	NC_018693	AATGAA	2	12	242423	242434	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703492
98	NC_018693	CTTTTT	2	12	243668	243679	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_018693	CAAGGA	2	12	244469	244480	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018693	GAAATA	2	12	247756	247767	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018693	TCTTTT	2	12	252044	252055	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_018693	GTGGAA	2	12	266450	266461	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	407703516
103	NC_018693	AAATTT	2	12	267219	267230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018693	ATTAAA	2	12	269639	269650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407703519
105	NC_018693	AAAATT	2	12	271937	271948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407703524
106	NC_018693	AAACAA	2	12	277903	277914	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	407703529
107	NC_018693	AAAAGA	2	12	278135	278146	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407703529
108	NC_018693	AGATAA	2	12	281585	281596	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703529
109	NC_018693	AGATAA	2	12	281864	281875	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703529
110	NC_018693	GTAGAA	2	12	284235	284246	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407703529
111	NC_018693	CAGAGA	2	12	285933	285944	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407703530
112	NC_018693	TTAACT	2	12	288813	288824	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407703534
113	NC_018693	GAGATT	2	12	288941	288952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703534
114	NC_018693	AAAGCA	2	12	293635	293646	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018693	AGTATG	2	12	299025	299036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703542
116	NC_018693	AATGCA	2	12	299390	299401	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407703542
117	NC_018693	ATGCAG	2	12	301097	301108	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407703545
118	NC_018693	AGAAAA	2	12	305017	305028	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407703548
119	NC_018693	TTCTTT	2	12	308399	308410	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407703550
120	NC_018693	AGGTAC	2	12	310162	310173	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407703555
121	NC_018693	TAATAT	2	12	311379	311390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018693	TCCATT	2	12	312674	312685	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407703558
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237	NC_018693	TCTTTT	2	12	594314	594325	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
238	NC_018693	CTTGGT	2	12	598348	598359	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407703870
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