MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 chromosome

Total Repeats: 2040

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018693	TCATAT	2	12	5269	5280	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407703240
2	NC_018693	ACCGTC	2	12	7427	7438	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407703243
3	NC_018693	AAGTTA	2	12	7818	7829	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407703243
4	NC_018693	AAGAAA	2	12	8874	8885	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407703244
5	NC_018693	CGTGAG	2	12	9189	9200	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407703245
6	NC_018693	GGCGCA	2	12	11884	11895	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	407703249
7	NC_018693	TTCAGG	2	12	19472	19483	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407703256
8	NC_018693	AGAAAT	2	12	22981	22992	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703260
9	NC_018693	TTGTGT	2	12	27390	27401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407703265
10	NC_018693	CATTTA	2	12	29096	29107	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407703266
11	NC_018693	ACCGCA	2	12	33888	33899	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	407703273
12	NC_018693	ATGATA	2	12	42878	42889	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407703281
13	NC_018693	TAAATA	2	12	43658	43669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407703282
14	NC_018693	GAGTGC	2	12	44130	44141	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407703283
15	NC_018693	ACAGAA	2	12	45537	45548	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407703284
16	NC_018693	CATGAA	2	12	47149	47160	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407703286
17	NC_018693	AATAAG	2	12	49170	49181	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703289
18	NC_018693	ATTTTC	2	12	51309	51320	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407703293
19	NC_018693	AGCAAG	2	12	52252	52263	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407703294
20	NC_018693	TTATGT	2	12	64112	64123	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407703305
21	NC_018693	GAACAT	2	12	66939	66950	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407703308
22	NC_018693	ACCAGA	2	12	69662	69673	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407703310
23	NC_018693	AAAGGA	2	12	77025	77036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407703320
24	NC_018693	AAAAAG	2	12	82999	83010	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407703327
25	NC_018693	ACAGCT	2	12	85464	85475	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407703330
26	NC_018693	TCATTA	2	12	87067	87078	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407703331
27	NC_018693	GATTGT	2	12	87260	87271	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407703331
28	NC_018693	AAATGA	2	12	91985	91996	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703336
29	NC_018693	AATATT	2	12	95749	95760	50 %	50 %	0 %	0 %	407703343
30	NC_018693	GAATTT	2	12	96317	96328	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407703344
31	NC_018693	TAATTA	2	12	97945	97956	50 %	50 %	0 %	0 %	407703346
32	NC_018693	ATTACA	2	12	97993	98004	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407703346
33	NC_018693	ATTTTC	2	12	99745	99756	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407703348
34	NC_018693	GCCAAA	2	12	103162	103173	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407703353
35	NC_018693	AAAGAG	2	12	103927	103938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407703354
36	NC_018693	GCAATG	2	12	105793	105804	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407703356
37	NC_018693	AGGGGT	2	12	106209	106220	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	407703356
38	NC_018693	TAGTCT	2	12	106475	106486	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407703356
39	NC_018693	TATGAG	2	12	110203	110214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703360
40	NC_018693	ATAAAG	2	12	110279	110290	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703360
41	NC_018693	GCGATG	2	12	117169	117180	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407703366
42	NC_018693	TTTAAA	2	12	118092	118103	50 %	50 %	0 %	0 %	407703366
43	NC_018693	ATTTTA	2	12	118849	118860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703366
44	NC_018693	ACAGAG	2	12	118885	118896	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407703366
45	NC_018693	AGATAA	2	12	119796	119807	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703367
46	NC_018693	AAAATT	2	12	120016	120027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407703367
47	NC_018693	TTTTAT	2	12	124714	124725	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407703373
48	NC_018693	CTGTAT	2	12	125047	125058	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407703373
49	NC_018693	AAGTGG	2	12	125624	125635	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	407703374
50	NC_018693	TATACA	2	12	125770	125781	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407703374
51	NC_018693	ACAAAA	2	12	127265	127276	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	407703376
52	NC_018693	TCGGCA	2	12	129082	129093	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407703377
53	NC_018693	CTTCTA	2	12	130820	130831	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407703378
54	NC_018693	AGTAAA	2	12	133579	133590	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703380
55	NC_018693	ACAAGT	2	12	136345	136356	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407703380
56	NC_018693	ACAAGT	2	12	136885	136896	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407703380
57	NC_018693	ACAAGT	2	12	137428	137439	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407703380
58	NC_018693	CATCGT	2	12	140779	140790	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407703382
59	NC_018693	ATTTTA	2	12	143617	143628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703384
60	NC_018693	TGTTAT	2	12	143691	143702	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407703384
61	NC_018693	ACAATT	2	12	151603	151614	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407703394
62	NC_018693	GTTTAA	2	12	158045	158056	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407703399
63	NC_018693	GTAAAA	2	12	163543	163554	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703404
64	NC_018693	AAATAC	2	12	164064	164075	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407703405
65	NC_018693	TTATCT	2	12	165027	165038	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407703407
66	NC_018693	TAGATG	2	12	168995	169006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703412
67	NC_018693	GTAGAA	2	12	170057	170068	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407703413
68	NC_018693	AAAATA	2	12	174424	174435	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407703416
69	NC_018693	TTTTCC	2	12	179381	179392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407703420
70	NC_018693	ACGAAT	2	12	179538	179549	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407703420
71	NC_018693	TGCGTT	2	12	180712	180723	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407703421
72	NC_018693	GTTAAT	2	12	184997	185008	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407703425
73	NC_018693	CGGAAG	2	12	192090	192101	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	407703435
74	NC_018693	TACAGG	2	12	192514	192525	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407703435
75	NC_018693	ATAAAG	2	12	198611	198622	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703439
76	NC_018693	CGAGGC	2	12	213977	213988	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	407703457
77	NC_018693	CTTTAG	2	12	218450	218461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407703463
78	NC_018693	GGTTTA	2	12	225878	225889	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407703472
79	NC_018693	ATACCA	2	12	230377	230388	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407703477
80	NC_018693	ATTAAA	2	12	234124	234135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407703482
81	NC_018693	TAGAAA	2	12	237184	237195	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703488
82	NC_018693	CATTTT	2	12	237257	237268	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407703488
83	NC_018693	GGAGAA	2	12	239855	239866	50 %	0 %	50 %	0 %	407703491
84	NC_018693	AACGAA	2	12	241676	241687	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407703491
85	NC_018693	AATGAA	2	12	242423	242434	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703492
86	NC_018693	GTGGAA	2	12	266450	266461	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	407703516
87	NC_018693	ATTAAA	2	12	269639	269650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407703519
88	NC_018693	AAAATT	2	12	271937	271948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407703524
89	NC_018693	AAACAA	2	12	277903	277914	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	407703529
90	NC_018693	AAAAGA	2	12	278135	278146	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407703529
91	NC_018693	AGATAA	2	12	281585	281596	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703529
92	NC_018693	AGATAA	2	12	281864	281875	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703529
93	NC_018693	GTAGAA	2	12	284235	284246	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407703529
94	NC_018693	CAGAGA	2	12	285933	285944	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407703530
95	NC_018693	TTAACT	2	12	288813	288824	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407703534
96	NC_018693	GAGATT	2	12	288941	288952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703534
97	NC_018693	AGTATG	2	12	299025	299036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703542
98	NC_018693	AATGCA	2	12	299390	299401	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407703542
99	NC_018693	ATGCAG	2	12	301097	301108	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407703545
100	NC_018693	AGAAAA	2	12	305017	305028	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407703548
101	NC_018693	TTCTTT	2	12	308399	308410	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407703550
102	NC_018693	AGGTAC	2	12	310162	310173	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407703555
103	NC_018693	TCCATT	2	12	312674	312685	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407703558
104	NC_018693	AAACTT	2	12	313853	313864	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407703560
105	NC_018693	TTTATC	2	12	318694	318705	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407703566
106	NC_018693	TGTGTT	2	12	324762	324773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407703572
107	NC_018693	ATTTTG	2	12	325552	325563	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407703573
108	NC_018693	TTTCAT	2	12	327961	327972	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407703575
109	NC_018693	TGTACA	2	12	328063	328074	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407703575
110	NC_018693	CAGATG	2	12	336560	336571	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407703584
111	NC_018693	CTTATT	2	12	340598	340609	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407703590
112	NC_018693	TTATTT	2	12	341940	341951	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407703591
113	NC_018693	TTCATA	2	12	345910	345921	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407703593
114	NC_018693	TTCGGT	2	12	348875	348886	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407703594
115	NC_018693	AAAATG	2	12	348953	348964	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407703594
116	NC_018693	TGATCT	2	12	350505	350516	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407703596
117	NC_018693	CATTAT	2	12	355786	355797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407703606
118	NC_018693	TTTTAT	2	12	356082	356093	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407703607
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343	NC_018693	ATGACG	2	12	956823	956834	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407704249
344	NC_018693	GGGATT	2	12	958696	958707	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407704251
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