MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 chromosome

Total Repeats: 1179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018693	ATATT	2	10	704	713	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018693	AAGGG	2	10	2371	2380	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018693	ATATA	2	10	5335	5344	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018693	ATTTT	2	10	5433	5442	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018693	TGTTA	2	10	15102	15111	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018693	TGGAA	2	10	37866	37875	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018693	TAAAA	2	10	43768	43777	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018693	AAATT	2	10	44561	44570	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018693	TCTTT	2	10	58999	59008	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018693	CGAAA	2	10	67634	67643	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018693	CAGCT	2	10	78288	78297	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_018693	AAGAA	2	10	81176	81185	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018693	AACAA	2	10	92446	92455	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_018693	AATGA	2	10	92944	92953	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018693	TTTCG	2	10	95058	95067	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018693	TTATA	2	10	108935	108944	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018693	TTAAT	2	10	109036	109045	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018693	AGAGA	2	10	111933	111942	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018693	AAACG	2	10	112036	112045	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018693	ATTAA	2	10	112221	112230	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018693	TTATT	2	10	151941	151950	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018693	CACTC	2	10	166707	166716	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_018693	GATAA	2	10	178432	178441	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018693	TATAA	2	10	178556	178565	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018693	CTTCA	2	10	184320	184329	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_018693	TTTGT	2	10	185599	185608	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018693	AGAGA	2	10	185903	185912	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018693	TATAT	2	10	186690	186699	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018693	AAGAA	2	10	191091	191100	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018693	ATGAA	2	10	191799	191808	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018693	GTGTA	2	10	194919	194928	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018693	AGTTA	3	15	199640	199654	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018693	ACGAA	2	10	199686	199695	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018693	AAAGA	2	10	201229	201238	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018693	TTTCA	2	10	201272	201281	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018693	ATAAA	2	10	201369	201378	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018693	AAAAG	2	10	201626	201635	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018693	TAATG	2	10	202956	202965	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018693	AAAGA	2	10	203181	203190	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018693	TTATT	2	10	203278	203287	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018693	GAAGT	2	10	204550	204559	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018693	TTTTA	2	10	207303	207312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018693	TCCTA	2	10	207321	207330	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_018693	TAAAA	2	10	213640	213649	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018693	GTGAA	2	10	221827	221836	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018693	AATAA	2	10	222175	222184	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018693	ATATA	2	10	223606	223615	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018693	AAAAT	2	10	236433	236442	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018693	AAGGC	2	10	243588	243597	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018693	AGGAA	2	10	243720	243729	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018693	TATTT	2	10	244343	244352	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018693	TTTTG	2	10	245295	245304	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018693	AAGGA	2	10	250351	250360	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018693	AGTTT	2	10	250597	250606	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018693	AGGAT	2	10	251307	251316	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018693	ATAAA	2	10	256375	256384	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018693	TTATT	2	10	264148	264157	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018693	TTTAT	2	10	264168	264177	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018693	TAAAA	2	10	265498	265507	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018693	TTCCT	2	10	284800	284809	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_018693	GTTTT	2	10	284936	284945	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018693	AAATG	2	10	285169	285178	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018693	TCTTT	2	10	287084	287093	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_018693	TTTTG	2	10	289286	289295	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018693	AGGGA	2	10	293652	293661	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018693	TTTTC	2	10	308369	308378	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018693	TCTTT	2	10	309535	309544	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018693	GTTTC	2	10	309773	309782	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_018693	TAATA	2	10	309837	309846	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018693	AACCG	2	10	318022	318031	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_018693	CGGTT	2	10	318044	318053	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018693	ATACC	2	10	324856	324865	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_018693	ATATC	2	10	327655	327664	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018693	ATGAT	2	10	327734	327743	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018693	AAATC	2	10	334236	334245	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018693	AATAT	2	10	337691	337700	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018693	ATTTT	2	10	339248	339257	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018693	ATTTT	2	10	339306	339315	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018693	ATTTA	2	10	340153	340162	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018693	AAAGA	2	10	350425	350434	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018693	TTTTC	2	10	352500	352509	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018693	TCATA	2	10	362920	362929	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_018693	TGTAC	2	10	365190	365199	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018693	TACTT	2	10	368026	368035	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_018693	AATCA	2	10	372465	372474	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018693	TCGGT	2	10	382922	382931	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_018693	TTATT	2	10	389751	389760	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018693	TAATA	2	10	402913	402922	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018693	CGGTC	2	10	415045	415054	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_018693	AATAT	2	10	434519	434528	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018693	TTTTG	2	10	441566	441575	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018693	TTTCG	2	10	444412	444421	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_018693	ATAAA	2	10	466875	466884	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018693	AATAA	2	10	468435	468444	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018693	TGTAA	2	10	469833	469842	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018693	AGAAA	2	10	469874	469883	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018693	AGGTA	2	10	469884	469893	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018693	TTTAC	2	10	475403	475412	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_018693	AATTT	2	10	475854	475863	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018693	TATAA	2	10	475941	475950	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018693	TCTAT	2	10	478361	478370	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_018693	GTTGT	2	10	482805	482814	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018693	GAAGC	2	10	502041	502050	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_018693	TTTCT	2	10	512184	512193	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_018693	TAAGT	2	10	520106	520115	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018693	AAAAT	2	10	521891	521900	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018693	ATTTT	2	10	536333	536342	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018693	AAAGG	2	10	538317	538326	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018693	GCAAT	2	10	539222	539231	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_018693	TTGTT	2	10	546411	546420	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018693	GTATA	2	10	548882	548891	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018693	ATAAA	2	10	551008	551017	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018693	ATCTT	2	10	553617	553626	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018693	AAAGG	2	10	559788	559797	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018693	ATACA	2	10	559840	559849	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_018693	GTTTT	2	10	562136	562145	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018693	AAAAT	2	10	589619	589628	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018693	AAAAT	2	10	591254	591263	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018693	GTAAA	2	10	595166	595175	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018693	AATAC	2	10	595187	595196	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018693	AAGGG	2	10	605760	605769	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018693	ATAAA	2	10	620019	620028	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018693	TACAT	2	10	627431	627440	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_018693	ATGAA	2	10	627508	627517	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018693	TTTTG	2	10	632897	632906	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018693	TAAGA	2	10	634669	634678	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018693	GTATA	2	10	641911	641920	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018693	AAGAA	2	10	643181	643190	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018693	GAATA	2	10	643210	643219	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018693	GAAAT	2	10	647370	647379	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018693	ATTTA	2	10	653208	653217	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018693	GATTA	2	10	654027	654036	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018693	AAGAA	2	10	657182	657191	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018693	AAAGG	2	10	657819	657828	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018693	AGTTA	2	10	664269	664278	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018693	GTAAG	2	10	668842	668851	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018693	AAATA	2	10	673154	673163	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018693	TATTT	2	10	673185	673194	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018693	AAATA	2	10	673282	673291	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018693	TCTTA	2	10	678107	678116	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_018693	ATAAA	2	10	679211	679220	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018693	ATATG	2	10	683589	683598	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018693	TATTT	2	10	685950	685959	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018693	AACAT	2	10	690899	690908	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_018693	AATGT	2	10	691003	691012	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018693	GTTTT	2	10	691312	691321	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018693	ATTAT	2	10	701057	701066	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018693	CTTTT	2	10	703910	703919	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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