MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 chromosome

Total Repeats: 3767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018693	ATTTA	2	10	4709	4718	40 %	60 %	0 %	0 %	407703240
2	NC_018693	GAAAT	2	10	5910	5919	60 %	20 %	20 %	0 %	407703241
3	NC_018693	TCGAA	2	10	7165	7174	40 %	20 %	20 %	20 %	407703242
4	NC_018693	ATTGT	2	10	7989	7998	20 %	60 %	20 %	0 %	407703243
5	NC_018693	AGAAA	2	10	8042	8051	80 %	0 %	20 %	0 %	407703243
6	NC_018693	AAACA	2	10	8993	9002	80 %	0 %	0 %	20 %	407703244
7	NC_018693	CTTTT	2	10	14221	14230	0 %	80 %	0 %	20 %	407703251
8	NC_018693	AATGG	2	10	16222	16231	40 %	20 %	40 %	0 %	407703254
9	NC_018693	ATTTC	2	10	18297	18306	20 %	60 %	0 %	20 %	407703255
10	NC_018693	CGTTC	2	10	19024	19033	0 %	40 %	20 %	40 %	407703255
11	NC_018693	ATTTT	2	10	20259	20268	20 %	80 %	0 %	0 %	407703257
12	NC_018693	GAAAT	2	10	22551	22560	60 %	20 %	20 %	0 %	407703259
13	NC_018693	GGTTG	2	10	23416	23425	0 %	40 %	60 %	0 %	407703260
14	NC_018693	TCTTT	2	10	24099	24108	0 %	80 %	0 %	20 %	407703262
15	NC_018693	AAGGA	2	10	26751	26760	60 %	0 %	40 %	0 %	407703264
16	NC_018693	ATATT	2	10	38234	38243	40 %	60 %	0 %	0 %	407703277
17	NC_018693	GAAAA	2	10	40096	40105	80 %	0 %	20 %	0 %	407703279
18	NC_018693	GGGCT	2	10	40335	40344	0 %	20 %	60 %	20 %	407703279
19	NC_018693	ATGAA	2	10	41207	41216	60 %	20 %	20 %	0 %	407703280
20	NC_018693	TTACG	2	10	45058	45067	20 %	40 %	20 %	20 %	407703284
21	NC_018693	AAGGA	2	10	49294	49303	60 %	0 %	40 %	0 %	407703289
22	NC_018693	AGGGA	2	10	49402	49411	40 %	0 %	60 %	0 %	407703290
23	NC_018693	TTAGG	2	10	49433	49442	20 %	40 %	40 %	0 %	407703290
24	NC_018693	TGATA	2	10	50941	50950	40 %	40 %	20 %	0 %	407703292
25	NC_018693	ATGTT	2	10	51457	51466	20 %	60 %	20 %	0 %	407703293
26	NC_018693	AGAAT	2	10	52845	52854	60 %	20 %	20 %	0 %	407703294
27	NC_018693	GAGAA	2	10	54098	54107	60 %	0 %	40 %	0 %	407703295
28	NC_018693	CATTT	2	10	54573	54582	20 %	60 %	0 %	20 %	407703296
29	NC_018693	CGTTA	2	10	55059	55068	20 %	40 %	20 %	20 %	407703296
30	NC_018693	ATTCC	2	10	57205	57214	20 %	40 %	0 %	40 %	407703299
31	NC_018693	TGTAA	2	10	57670	57679	40 %	40 %	20 %	0 %	407703300
32	NC_018693	CGGTG	2	10	57827	57836	0 %	20 %	60 %	20 %	407703300
33	NC_018693	AATAA	2	10	57944	57953	80 %	20 %	0 %	0 %	407703300
34	NC_018693	TCATT	2	10	59767	59776	20 %	60 %	0 %	20 %	407703301
35	NC_018693	AATCG	2	10	60620	60629	40 %	20 %	20 %	20 %	407703302
36	NC_018693	AAAAG	2	10	61684	61693	80 %	0 %	20 %	0 %	407703302
37	NC_018693	ATTCC	2	10	63409	63418	20 %	40 %	0 %	40 %	407703305
38	NC_018693	AGGAG	2	10	64473	64482	40 %	0 %	60 %	0 %	407703305
39	NC_018693	ATTTT	2	10	68726	68735	20 %	80 %	0 %	0 %	407703309
40	NC_018693	TTTCA	2	10	70414	70423	20 %	60 %	0 %	20 %	407703311
41	NC_018693	ATTAT	2	10	71165	71174	40 %	60 %	0 %	0 %	407703312
42	NC_018693	GTAAT	2	10	74141	74150	40 %	40 %	20 %	0 %	407703315
43	NC_018693	ATAAA	2	10	75636	75645	80 %	20 %	0 %	0 %	407703316
44	NC_018693	TATGG	2	10	76414	76423	20 %	40 %	40 %	0 %	407703318
45	NC_018693	GTATT	2	10	76481	76490	20 %	60 %	20 %	0 %	407703319
46	NC_018693	TAAAT	2	10	77160	77169	60 %	40 %	0 %	0 %	407703320
47	NC_018693	GAAGA	2	10	81567	81576	60 %	0 %	40 %	0 %	407703327
48	NC_018693	GGAAT	2	10	81897	81906	40 %	20 %	40 %	0 %	407703327
49	NC_018693	AAATT	2	10	82411	82420	60 %	40 %	0 %	0 %	407703327
50	NC_018693	ACAGC	2	10	84657	84666	40 %	0 %	20 %	40 %	407703330
51	NC_018693	ATGCA	2	10	84953	84962	40 %	20 %	20 %	20 %	407703330
52	NC_018693	GAATG	2	10	85187	85196	40 %	20 %	40 %	0 %	407703330
53	NC_018693	TTATT	2	10	86202	86211	20 %	80 %	0 %	0 %	407703331
54	NC_018693	TTATT	2	10	86671	86680	20 %	80 %	0 %	0 %	407703331
55	NC_018693	AGATG	2	10	88962	88971	40 %	20 %	40 %	0 %	407703334
56	NC_018693	AAAGT	2	10	89944	89953	60 %	20 %	20 %	0 %	407703335
57	NC_018693	GGGCG	2	10	90468	90477	0 %	0 %	80 %	20 %	407703335
58	NC_018693	CGTAA	2	10	90888	90897	40 %	20 %	20 %	20 %	407703335
59	NC_018693	AAATG	2	10	91418	91427	60 %	20 %	20 %	0 %	407703336
60	NC_018693	TTTTC	2	10	94780	94789	0 %	80 %	0 %	20 %	407703341
61	NC_018693	CCATA	2	10	94796	94805	40 %	20 %	0 %	40 %	407703341
62	NC_018693	TATTT	2	10	96778	96787	20 %	80 %	0 %	0 %	407703344
63	NC_018693	AAAAT	2	10	97537	97546	80 %	20 %	0 %	0 %	407703345
64	NC_018693	GCTCA	2	10	101459	101468	20 %	20 %	20 %	40 %	407703351
65	NC_018693	GCAGC	2	10	103229	103238	20 %	0 %	40 %	40 %	407703353
66	NC_018693	ATGTA	2	10	104621	104630	40 %	40 %	20 %	0 %	407703355
67	NC_018693	ATTTT	2	10	104943	104952	20 %	80 %	0 %	0 %	407703356
68	NC_018693	GGTCT	2	10	106953	106962	0 %	40 %	40 %	20 %	407703357
69	NC_018693	GAAGG	2	10	107852	107861	40 %	0 %	60 %	0 %	407703357
70	NC_018693	CATTT	2	10	110641	110650	20 %	60 %	0 %	20 %	407703361
71	NC_018693	GGAAG	2	10	110863	110872	40 %	0 %	60 %	0 %	407703361
72	NC_018693	TAACG	2	10	111304	111313	40 %	20 %	20 %	20 %	407703361
73	NC_018693	TAATA	2	10	111394	111403	60 %	40 %	0 %	0 %	407703361
74	NC_018693	CATAC	2	10	111587	111596	40 %	20 %	0 %	40 %	407703361
75	NC_018693	AAATG	2	10	114780	114789	60 %	20 %	20 %	0 %	407703364
76	NC_018693	TGGAT	2	10	116588	116597	20 %	40 %	40 %	0 %	407703365
77	NC_018693	AAAAT	2	10	118082	118091	80 %	20 %	0 %	0 %	407703366
78	NC_018693	CGAAG	2	10	123218	123227	40 %	0 %	40 %	20 %	407703372
79	NC_018693	TGTAT	2	10	124692	124701	20 %	60 %	20 %	0 %	407703373
80	NC_018693	TTTTA	2	10	125847	125856	20 %	80 %	0 %	0 %	407703374
81	NC_018693	GAATT	2	10	125864	125873	40 %	40 %	20 %	0 %	407703374
82	NC_018693	ACTTA	2	10	125946	125955	40 %	40 %	0 %	20 %	407703374
83	NC_018693	ATATG	2	10	128668	128677	40 %	40 %	20 %	0 %	407703376
84	NC_018693	ACCAA	2	10	128902	128911	60 %	0 %	0 %	40 %	407703376
85	NC_018693	TAAAT	2	10	130711	130720	60 %	40 %	0 %	0 %	407703378
86	NC_018693	GAAAA	2	10	131173	131182	80 %	0 %	20 %	0 %	407703379
87	NC_018693	GAAGA	2	10	131333	131342	60 %	0 %	40 %	0 %	407703379
88	NC_018693	AAATG	2	10	131725	131734	60 %	20 %	20 %	0 %	407703379
89	NC_018693	AGTTC	2	10	133850	133859	20 %	40 %	20 %	20 %	407703380
90	NC_018693	TTAAA	2	10	135348	135357	60 %	40 %	0 %	0 %	407703380
91	NC_018693	AAACG	2	10	135867	135876	60 %	0 %	20 %	20 %	407703380
92	NC_018693	AACAA	2	10	136030	136039	80 %	0 %	0 %	20 %	407703380
93	NC_018693	TTAAA	2	10	136437	136446	60 %	40 %	0 %	0 %	407703380
94	NC_018693	TTAAA	2	10	136977	136986	60 %	40 %	0 %	0 %	407703380
95	NC_018693	AAATA	2	10	137782	137791	80 %	20 %	0 %	0 %	407703380
96	NC_018693	ACAAA	2	10	139489	139498	80 %	0 %	0 %	20 %	407703381
97	NC_018693	TAGTT	2	10	143115	143124	20 %	60 %	20 %	0 %	407703384
98	NC_018693	GCGAA	2	10	148308	148317	40 %	0 %	40 %	20 %	407703390
99	NC_018693	TAATT	2	10	148945	148954	40 %	60 %	0 %	0 %	407703390
100	NC_018693	AAAAT	2	10	150279	150288	80 %	20 %	0 %	0 %	407703392
101	NC_018693	AAAAG	2	10	153628	153637	80 %	0 %	20 %	0 %	407703396
102	NC_018693	ATTTA	2	10	154242	154251	40 %	60 %	0 %	0 %	407703396
103	NC_018693	TTGGC	2	10	157156	157165	0 %	40 %	40 %	20 %	407703398
104	NC_018693	TCGAT	2	10	158090	158099	20 %	40 %	20 %	20 %	407703399
105	NC_018693	CTTAT	2	10	158288	158297	20 %	60 %	0 %	20 %	407703399
106	NC_018693	ACATT	2	10	158689	158698	40 %	40 %	0 %	20 %	407703399
107	NC_018693	AAAAC	2	10	158832	158841	80 %	0 %	0 %	20 %	407703399
108	NC_018693	ATTAC	2	10	160051	160060	40 %	40 %	0 %	20 %	407703400
109	NC_018693	GCAGA	2	10	161415	161424	40 %	0 %	40 %	20 %	407703402
110	NC_018693	AACGA	2	10	161637	161646	60 %	0 %	20 %	20 %	407703402
111	NC_018693	AGAAA	2	10	162409	162418	80 %	0 %	20 %	0 %	407703403
112	NC_018693	TCATT	2	10	164646	164655	20 %	60 %	0 %	20 %	407703406
113	NC_018693	AATTC	2	10	164729	164738	40 %	40 %	0 %	20 %	407703406
114	NC_018693	GAAGT	2	10	168030	168039	40 %	20 %	40 %	0 %	407703411
115	NC_018693	TGTGC	2	10	168814	168823	0 %	40 %	40 %	20 %	407703412
116	NC_018693	ATTCC	2	10	170074	170083	20 %	40 %	0 %	40 %	407703413
117	NC_018693	GAAAA	2	10	172669	172678	80 %	0 %	20 %	0 %	407703414
118	NC_018693	AGGAA	2	10	172802	172811	60 %	0 %	40 %	0 %	407703414
119	NC_018693	ACAAG	2	10	174204	174213	60 %	0 %	20 %	20 %	407703416
120	NC_018693	AAGCA	2	10	174279	174288	60 %	0 %	20 %	20 %	407703416
121	NC_018693	GTTAA	2	10	175931	175940	40 %	40 %	20 %	0 %	407703418
122	NC_018693	GAAAA	2	10	176199	176208	80 %	0 %	20 %	0 %	407703418
123	NC_018693	AATAG	2	10	177368	177377	60 %	20 %	20 %	0 %	407703418
124	NC_018693	AAAAC	2	10	178886	178895	80 %	0 %	0 %	20 %	407703419
125	NC_018693	TTTGA	2	10	180548	180557	20 %	60 %	20 %	0 %	407703421
126	NC_018693	ATAAA	2	10	182694	182703	80 %	20 %	0 %	0 %	407703423
127	NC_018693	TTGTA	2	10	182794	182803	20 %	60 %	20 %	0 %	407703423
128	NC_018693	AAAAG	2	10	185267	185276	80 %	0 %	20 %	0 %	407703425
129	NC_018693	ATTTC	2	10	185403	185412	20 %	60 %	0 %	20 %	407703425
130	NC_018693	AAACG	2	10	186866	186875	60 %	0 %	20 %	20 %	407703427
131	NC_018693	TATCG	2	10	188162	188171	20 %	40 %	20 %	20 %	407703427
132	NC_018693	GAGCA	2	10	189418	189427	40 %	0 %	40 %	20 %	407703430
133	NC_018693	GATTG	2	10	190073	190082	20 %	40 %	40 %	0 %	407703431
134	NC_018693	CAAAG	2	10	191011	191020	60 %	0 %	20 %	20 %	407703434
135	NC_018693	TGTGA	2	10	194425	194434	20 %	40 %	40 %	0 %	407703436
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