MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Alcanivorax dieselolei B5 chromosome

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018691	ATTTGG	2	12	44179	44190	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018691	TCATAA	2	12	126159	126170	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018691	CTGTAT	2	12	204420	204431	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018691	GCACCT	2	12	204709	204720	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018691	AAAATG	2	12	205097	205108	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018691	TGGTTT	2	12	232874	232885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018691	GGGCAA	2	12	232910	232921	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018691	AACAAA	2	12	241277	241288	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018691	TTCCCT	2	12	320322	320333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018691	GACAGG	2	12	324897	324908	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018691	GACACA	2	12	325091	325102	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018691	TTCTGT	2	12	335205	335216	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018691	AAATGG	2	12	347855	347866	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018691	AGGGGA	2	12	400299	400310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018691	GATGCC	2	12	401542	401553	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018691	ATGAAA	2	12	426088	426099	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018691	GGAAAG	2	12	450369	450380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018691	GGGAAG	2	12	557391	557402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018691	CGGCGC	2	12	566145	566156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018691	CATGGC	2	12	748472	748483	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018691	GAAAGG	2	12	751050	751061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018691	ACCGGA	2	12	765649	765660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018691	TATGTT	2	12	767501	767512	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018691	CGCCGG	2	12	784438	784449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018691	ATCGCC	2	12	798285	798296	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018691	GTGCCT	2	12	911424	911435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018691	CGTTGT	2	12	916395	916406	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018691	CAATGC	2	12	919050	919061	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018691	AGAGGA	2	12	919476	919487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018691	GTTTTT	2	12	968286	968297	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018691	GCGTGA	2	12	1098563	1098574	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018691	ATAACG	2	12	1114228	1114239	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018691	CGGTCA	2	12	1157106	1157117	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018691	AATGTG	2	12	1168834	1168845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018691	TTTTTG	2	12	1327036	1327047	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018691	GGTGTG	2	12	1486674	1486685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018691	ACGGAT	2	12	1572324	1572335	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018691	ATTCTT	2	12	1586648	1586659	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018691	GCCCTG	2	12	1624411	1624422	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018691	GTTAGG	2	12	1632589	1632600	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018691	TGTTTT	2	12	1647593	1647604	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018691	CCGGGG	2	12	1669899	1669910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018691	AAAAAC	2	12	1685780	1685791	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018691	TGTTTT	2	12	1705917	1705928	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018691	ACAAAA	2	12	1827204	1827215	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018691	ACCGCC	2	12	1855945	1855956	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_018691	GGTCTC	2	12	1861476	1861487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018691	GAAGGA	2	12	1861589	1861600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018691	GATGCC	2	12	1884125	1884136	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018691	GGGGTG	2	12	1896239	1896250	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018691	TCGGAA	2	12	1911958	1911969	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018691	CAGATC	2	12	1941344	1941355	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018691	ACCCAG	2	12	1941695	1941706	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018691	GGAACC	2	12	1960809	1960820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018691	TGCTTT	2	12	1993055	1993066	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018691	TCTTTT	2	12	2003744	2003755	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018691	TGTTTT	2	12	2026794	2026805	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018691	GTTTTT	2	12	2037660	2037671	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018691	AAAAAC	2	12	2056859	2056870	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018691	AAAAAC	2	12	2075413	2075424	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018691	TCCCAC	2	12	2129880	2129891	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_018691	GAGCAG	2	12	2161293	2161304	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018691	CACCGG	2	12	2180073	2180084	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018691	TGATGG	2	12	2198258	2198269	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018691	GTGAAA	2	12	2287979	2287990	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018691	TAAAGC	2	12	2305865	2305876	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_018691	GAGGGT	2	12	2328414	2328425	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018691	GGGGTA	2	12	2328726	2328737	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018691	AAAAAT	2	12	2331402	2331413	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018691	GAGCGT	2	12	2339308	2339319	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_018691	CGTGTT	2	12	2339332	2339343	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_018691	GGCAAG	2	12	2374553	2374564	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_018691	CGGGGC	2	12	2386262	2386273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018691	CATGGT	2	12	2431286	2431297	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_018691	CATTAT	2	12	2505513	2505524	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018691	TCCCGC	2	12	2535795	2535806	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_018691	GCCGGG	2	12	2577257	2577268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018691	CGATTT	2	12	2651103	2651114	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018691	CCGCGT	2	12	2667328	2667339	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018691	TTTACG	2	12	2681049	2681060	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_018691	GTTAAC	2	12	2696773	2696784	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018691	AGCCAC	2	12	2743946	2743957	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018691	ATAACA	2	12	2847472	2847483	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018691	TCTTTT	2	12	2857346	2857357	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018691	CCGCAC	2	12	2872084	2872095	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_018691	CTTTTT	2	12	2875602	2875613	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018691	CAGAAA	2	12	2900111	2900122	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_018691	CTGGCG	2	12	2923041	2923052	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018691	CGCCAG	2	12	2928229	2928240	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018691	AACCGG	2	12	3036372	3036383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018691	TCAGGG	2	12	3044358	3044369	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018691	GGCAGG	2	12	3056526	3056537	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018691	GTTAAC	2	12	3076952	3076963	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018691	CTTTCA	2	12	3108060	3108071	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018691	CCTGTT	2	12	3132998	3133009	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018691	GTTATT	2	12	3165984	3165995	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018691	CCAGCG	2	12	3182428	3182439	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018691	CTCTCC	2	12	3211825	3211836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_018691	ACGGCG	2	12	3241259	3241270	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018691	AGCCTG	2	12	3262283	3262294	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018691	GCCTTT	2	12	3272641	3272652	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018691	AACAAT	2	12	3351407	3351418	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_018691	CCCATG	2	12	3401576	3401587	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_018691	ATGGCA	2	12	3411933	3411944	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_018691	GACCCA	2	12	3539851	3539862	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018691	CATTAC	2	12	3563809	3563820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018691	GCGCCA	2	12	3573466	3573477	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018691	CCTTCC	2	12	3603692	3603703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_018691	GCGCTG	2	12	3608394	3608405	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018691	ACCCCA	2	12	3684195	3684206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_018691	TGTATT	2	12	3688023	3688034	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018691	TGCCCC	2	12	3733282	3733293	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_018691	TACCGA	2	12	3798672	3798683	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018691	ATGGGC	2	12	3828333	3828344	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018691	CCGGGG	2	12	3843977	3843988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018691	CCTCTC	2	12	3858992	3859003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_018691	TGTTTT	2	12	3896835	3896846	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018691	CGACAA	2	12	3909352	3909363	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018691	CCCGGA	2	12	3919257	3919268	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018691	TCCTTG	2	12	3981502	3981513	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018691	TTTGTT	2	12	4090071	4090082	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018691	TGCGGT	2	12	4091876	4091887	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_018691	CGATTT	2	12	4095886	4095897	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_018691	GTCAGT	2	12	4098975	4098986	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_018691	CGTTAT	2	12	4162913	4162924	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_018691	CAGCGC	2	12	4175200	4175211	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_018691	GCTCAA	2	12	4180040	4180051	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018691	CTTTCC	2	12	4184375	4184386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_018691	CGATTT	2	12	4229916	4229927	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_018691	GTCAGT	2	12	4233295	4233306	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_018691	CAAAGG	2	12	4259223	4259234	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_018691	TTAGAA	2	12	4259421	4259432	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018691	ACAGCC	2	12	4272531	4272542	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
134	NC_018691	TGACGT	2	12	4314525	4314536	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_018691	GCCCCG	2	12	4319672	4319683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_018691	ATCATT	2	12	4516688	4516699	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_018691	CGGTGC	2	12	4603366	4603377	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018691	GGCGCT	2	12	4614460	4614471	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018691	CTGTAG	2	12	4624439	4624450	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_018691	CGGGAC	2	12	4649326	4649337	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018691	GACCCG	2	12	4714603	4714614	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
142	NC_018691	CGGCAC	2	12	4736777	4736788	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018691	TGTTTT	2	12	4741738	4741749	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018691	GATGCC	2	12	4745967	4745978	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_018691	TGTTTG	2	12	4776636	4776647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018691	GGATAT	2	12	4794301	4794312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018691	GCCACC	2	12	4887354	4887365	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_018691	CCGGAA	2	12	4925474	4925485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.