MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Alcanivorax dieselolei B5 chromosome

Total Repeats: 2718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018691	GGCCAT	2	12	917645	917656	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407694695
502	NC_018691	TGCCGT	2	12	919395	919406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407694697
503	NC_018691	TGACCG	2	12	920173	920184	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407694699
504	NC_018691	CATCGA	2	12	920390	920401	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407694699
505	NC_018691	GTGCCG	2	12	923596	923607	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407694703
506	NC_018691	TTGGCC	2	12	925490	925501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407694705
507	NC_018691	GCCCTT	2	12	925585	925596	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	407694705
508	NC_018691	GTCACC	2	12	932281	932292	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407694712
509	NC_018691	CAACTT	2	12	932979	932990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407694712
510	NC_018691	TGACGC	2	12	933284	933295	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407694712
511	NC_018691	GGCATT	2	12	934118	934129	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407694713
512	NC_018691	GGCGCG	2	12	940516	940527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407694717
513	NC_018691	CTATGT	2	12	940752	940763	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407694718
514	NC_018691	CATGTT	2	12	944291	944302	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407694721
515	NC_018691	TGGGGT	2	12	946297	946308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407694721
516	NC_018691	GGCCCC	2	12	949586	949597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407694725
517	NC_018691	GTTCAT	2	12	950774	950785	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407694727
518	NC_018691	ACCCAG	2	12	954535	954546	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	407694730
519	NC_018691	CGGTCA	2	12	955345	955356	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407694731
520	NC_018691	GGCCTG	2	12	955382	955393	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407694731
521	NC_018691	AACTGG	2	12	956058	956069	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407694731
522	NC_018691	CGTAAA	2	12	956344	956355	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407694731
523	NC_018691	TCTCGT	2	12	960376	960387	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407694735
524	NC_018691	CGTCGC	2	12	961228	961239	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407694736
525	NC_018691	GGGCTG	2	12	963957	963968	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	407694738
526	NC_018691	GCCAGT	2	12	969802	969813	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407694743
527	NC_018691	GCCTCC	2	12	970317	970328	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	407694744
528	NC_018691	TACAGC	2	12	975863	975874	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407694751
529	NC_018691	GGGTCA	2	12	977348	977359	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407694753
530	NC_018691	AACAGC	2	12	977842	977853	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407694753
531	NC_018691	GTCGGC	2	12	980681	980692	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407694756
532	NC_018691	GTTGCC	2	12	984010	984021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407694759
533	NC_018691	AATAGG	2	12	984886	984897	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407694760
534	NC_018691	GTGACG	2	12	988234	988245	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407694764
535	NC_018691	GGGACT	2	12	988976	988987	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407694764
536	NC_018691	CGGCGC	2	12	993904	993915	0 %	0 %	50 %	50 %	407694768
537	NC_018691	GGAACC	2	12	995793	995804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407694770
538	NC_018691	CCGGAG	2	12	995833	995844	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	407694770
539	NC_018691	TGGCCA	2	12	1004332	1004343	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407694779
540	NC_018691	TCACCC	2	12	1007545	1007556	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	407694779
541	NC_018691	AGTGGC	2	12	1009683	1009694	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407694779
542	NC_018691	ACGGGC	2	12	1010202	1010213	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	407694779
543	NC_018691	ACCTGG	2	12	1010533	1010544	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407694779
544	NC_018691	GCCAAC	2	12	1012305	1012316	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	407694779
545	NC_018691	CTTGCC	2	12	1012629	1012640	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	407694779
546	NC_018691	CCCGGG	2	12	1013479	1013490	0 %	0 %	50 %	50 %	407694779
547	NC_018691	CCTGGC	2	12	1014281	1014292	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407694779
548	NC_018691	CGGGAG	2	12	1016099	1016110	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	407694780
549	NC_018691	ACCCGG	2	12	1019332	1019343	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	407694782
550	NC_018691	GAGCTG	2	12	1021464	1021475	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407694784
551	NC_018691	ACCGCC	2	12	1022604	1022615	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	407694784
552	NC_018691	ATCACC	2	12	1026246	1026257	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	407694786
553	NC_018691	CTTCGT	2	12	1026795	1026806	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407694787
554	NC_018691	TACCTG	2	12	1026859	1026870	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407694787
555	NC_018691	ATCGCC	2	12	1027789	1027800	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407694788
556	NC_018691	CGGCAG	2	12	1028526	1028537	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	407694789
557	NC_018691	GACTGG	2	12	1031930	1031941	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407694793
558	NC_018691	CGGCTC	2	12	1034196	1034207	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407694794
559	NC_018691	CCTGGT	2	12	1038526	1038537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407694798
560	NC_018691	ATGGCG	2	12	1038972	1038983	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407694798
561	NC_018691	CCGCCA	2	12	1041975	1041986	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	407694800
562	NC_018691	TCCTTA	2	12	1042409	1042420	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407694800
563	NC_018691	CGGCCT	2	12	1042431	1042442	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407694800
564	NC_018691	CGATCT	2	12	1042650	1042661	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407694800
565	NC_018691	GTCCAG	2	12	1043876	1043887	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407694801
566	NC_018691	CAGGAA	2	12	1044005	1044016	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407694801
567	NC_018691	GCTGAG	2	12	1048374	1048385	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407694807
568	NC_018691	TTCGCC	2	12	1049114	1049125	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	407694808
569	NC_018691	CAGGGC	2	12	1050388	1050399	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	407694809
570	NC_018691	ATGGTG	2	12	1054599	1054610	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407694812
571	NC_018691	GCCCGC	2	12	1056566	1056577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407694814
572	NC_018691	CAGTTG	2	12	1062624	1062635	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407694819
573	NC_018691	CAGACA	2	12	1062837	1062848	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407694819
574	NC_018691	CGCTGG	2	12	1063262	1063273	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407694820
575	NC_018691	CCTGGC	2	12	1064277	1064288	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407694820
576	NC_018691	ATGCCG	2	12	1065707	1065718	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407694821
577	NC_018691	CTGGCC	2	12	1067666	1067677	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407694823
578	NC_018691	CCAGCC	2	12	1071768	1071779	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	407694828
579	NC_018691	ACAGGA	2	12	1071815	1071826	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407694828
580	NC_018691	ATCCTG	2	12	1074480	1074491	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407694830
581	NC_018691	GTTCTG	2	12	1074983	1074994	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407694830
582	NC_018691	ACTCAA	2	12	1075594	1075605	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407694831
583	NC_018691	GACATG	2	12	1080946	1080957	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407694836
584	NC_018691	GTGGGG	2	12	1082171	1082182	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	407694838
585	NC_018691	TCCGGT	2	12	1084785	1084796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407694841
586	NC_018691	ATCCCA	2	12	1085312	1085323	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	407694842
587	NC_018691	GTGGAT	2	12	1085716	1085727	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407694842
588	NC_018691	GCGCCG	2	12	1086535	1086546	0 %	0 %	50 %	50 %	407694843
589	NC_018691	ATCAGG	2	12	1087333	1087344	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407694844
590	NC_018691	CGCTGA	2	12	1091397	1091408	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407694846
591	NC_018691	CACCAG	2	12	1091494	1091505	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	407694846
592	NC_018691	GCGGTG	2	12	1091705	1091716	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	407694846
593	NC_018691	GTCGCC	2	12	1092529	1092540	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407694847
594	NC_018691	TCCAGA	2	12	1097205	1097216	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407694851
595	NC_018691	CACCGC	2	12	1098414	1098425	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	407694852
596	NC_018691	GGGTCA	2	12	1100816	1100827	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407694855
597	NC_018691	GCAACG	2	12	1104189	1104200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407694858
598	NC_018691	GTGCCG	2	12	1107642	1107653	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407694861
599	NC_018691	CGGGCG	2	12	1107966	1107977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407694861
600	NC_018691	ATGGTG	2	12	1113691	1113702	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407694867
601	NC_018691	GCGTCC	2	12	1115506	1115517	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407694868
602	NC_018691	TGATCA	2	12	1115779	1115790	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407694868
603	NC_018691	GCTGAT	2	12	1116224	1116235	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407694869
604	NC_018691	ATCGGC	2	12	1117040	1117051	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407694870
605	NC_018691	GTGGCG	2	12	1117409	1117420	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	407694870
606	NC_018691	CTGGGG	2	12	1117448	1117459	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	407694870
607	NC_018691	GGCGCT	2	12	1117790	1117801	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407694871
608	NC_018691	CCAGCG	2	12	1118117	1118128	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	407694871
609	NC_018691	CGGTGA	2	12	1120774	1120785	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407694872
610	NC_018691	GCACGG	2	12	1126615	1126626	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	407694879
611	NC_018691	CAGCAT	2	12	1127737	1127748	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407694880
612	NC_018691	CAGATT	2	12	1128167	1128178	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407694881
613	NC_018691	CAGTTT	2	12	1130553	1130564	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407694882
614	NC_018691	CGCTGC	2	12	1132224	1132235	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407694883
615	NC_018691	GCTGGC	2	12	1132366	1132377	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407694883
616	NC_018691	GCCACC	2	12	1135672	1135683	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	407694885
617	NC_018691	TGAAGG	2	12	1136471	1136482	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	407694885
618	NC_018691	CGTGAT	2	12	1138946	1138957	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407694888
619	NC_018691	GTGTTC	2	12	1140156	1140167	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407694889
620	NC_018691	CGGTGA	2	12	1142876	1142887	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407694892
621	NC_018691	ACGAGA	2	12	1144305	1144316	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407694894
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623	NC_018691	CGGGGC	2	12	1146811	1146822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407694897
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630	NC_018691	TCCATC	2	12	1165054	1165065	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	407694917
631	NC_018691	TCGGCC	2	12	1165222	1165233	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407694917
632	NC_018691	CAGCGG	2	12	1165789	1165800	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	407694918
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639	NC_018691	CAGTTC	2	12	1174512	1174523	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407694926
640	NC_018691	ACAGCA	2	12	1175123	1175134	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407694927
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645	NC_018691	TCCCGC	2	12	1181857	1181868	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	407694931
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651	NC_018691	TGCCGG	2	12	1188664	1188675	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407694938
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654	NC_018691	TGACCA	2	12	1190706	1190717	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407694940
655	NC_018691	CCACAT	2	12	1194150	1194161	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	407694943
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677	NC_018691	GGCGTG	2	12	1227676	1227687	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	407694980
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681	NC_018691	CGGTGG	2	12	1233450	1233461	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	407694985
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689	NC_018691	CGTCTG	2	12	1239242	1239253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407694988
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699	NC_018691	AGATTG	2	12	1259808	1259819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407695003
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711	NC_018691	CCATCA	2	12	1279569	1279580	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	407695029
712	NC_018691	CTGGCC	2	12	1284668	1284679	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407695033
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714	NC_018691	CTGGTG	2	12	1291669	1291680	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	407695039
715	NC_018691	CTGGAA	2	12	1292647	1292658	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407695039
716	NC_018691	GGAACG	2	12	1293369	1293380	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	407695039
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718	NC_018691	CCCCGG	2	12	1297857	1297868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407695042
719	NC_018691	GGTGGG	2	12	1299991	1300002	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	407695045
720	NC_018691	TGCGGC	2	12	1300007	1300018	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407695045
721	NC_018691	CCCCGG	2	12	1303609	1303620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407695046
722	NC_018691	CTGCGC	2	12	1312360	1312371	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407695054
723	NC_018691	GCGCCA	2	12	1312433	1312444	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	407695054
724	NC_018691	CCGTCA	2	12	1316226	1316237	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407695059
725	NC_018691	CAGTTG	2	12	1321757	1321768	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407695064
726	NC_018691	GTTTGG	2	12	1322487	1322498	0 %	50 %	50 %	0 %	407695065
727	NC_018691	GGCGTG	2	12	1323490	1323501	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	407695066
728	NC_018691	TCGACC	2	12	1325013	1325024	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407695067
729	NC_018691	GTTGCC	2	12	1326908	1326919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407695068
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812	NC_018691	GCCATG	2	12	1495745	1495756	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407695241
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822	NC_018691	CGGCGC	3	18	1513680	1513697	0 %	0 %	50 %	50 %	407695262
823	NC_018691	GGTCAT	2	12	1518091	1518102	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407695265
824	NC_018691	CTGTTG	2	12	1518414	1518425	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407695266
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826	NC_018691	TCCACG	2	12	1526119	1526130	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407695273
827	NC_018691	TGACGG	2	12	1531411	1531422	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407695275
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829	NC_018691	CCCCGG	2	12	1533229	1533240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407695275
830	NC_018691	GGTGAC	2	12	1533353	1533364	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407695275
831	NC_018691	CGCTGG	2	12	1534043	1534054	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407695276
832	NC_018691	GCGCCA	2	12	1534386	1534397	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	407695276
833	NC_018691	CGGCAA	2	12	1535394	1535405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407695276
834	NC_018691	TGGTGA	2	12	1536835	1536846	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407695278
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943	NC_018691	CCGGCG	2	12	1705722	1705733	0 %	0 %	50 %	50 %	407695427
944	NC_018691	ATGGCC	2	12	1708084	1708095	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407695429
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