MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alcanivorax dieselolei B5 chromosome

Total Repeats: 3038

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018691	CGGAT	2	10	4855782	4855791	20 %	20 %	40 %	20 %	407698201
3002	NC_018691	CCTCA	2	10	4856107	4856116	20 %	20 %	0 %	60 %	407698202
3003	NC_018691	GCCCA	2	10	4856331	4856340	20 %	0 %	20 %	60 %	407698202
3004	NC_018691	ACGTC	2	10	4857017	4857026	20 %	20 %	20 %	40 %	407698203
3005	NC_018691	CACGC	2	10	4858623	4858632	20 %	0 %	20 %	60 %	407698204
3006	NC_018691	TGGCG	2	10	4860572	4860581	0 %	20 %	60 %	20 %	407698205
3007	NC_018691	GCCCA	2	10	4863215	4863224	20 %	0 %	20 %	60 %	407698207
3008	NC_018691	TGGCC	2	10	4864630	4864639	0 %	20 %	40 %	40 %	407698208
3009	NC_018691	GGAAG	2	10	4865032	4865041	40 %	0 %	60 %	0 %	407698208
3010	NC_018691	TTCCA	2	10	4865442	4865451	20 %	40 %	0 %	40 %	407698209
3011	NC_018691	ACCTG	2	10	4866004	4866013	20 %	20 %	20 %	40 %	407698210
3012	NC_018691	GCACC	2	10	4873869	4873878	20 %	0 %	20 %	60 %	407698216
3013	NC_018691	GGCAC	2	10	4874310	4874319	20 %	0 %	40 %	40 %	407698216
3014	NC_018691	TTGAT	2	10	4875691	4875700	20 %	60 %	20 %	0 %	407698217
3015	NC_018691	CGCCA	2	10	4876966	4876975	20 %	0 %	20 %	60 %	407698218
3016	NC_018691	AATCC	2	10	4879087	4879096	40 %	20 %	0 %	40 %	407698221
3017	NC_018691	CGCGA	2	10	4880856	4880865	20 %	0 %	40 %	40 %	407698222
3018	NC_018691	ACATG	2	10	4882623	4882632	40 %	20 %	20 %	20 %	407698224
3019	NC_018691	GCGTC	2	10	4883014	4883023	0 %	20 %	40 %	40 %	407698225
3020	NC_018691	TTCAC	2	10	4893797	4893806	20 %	40 %	0 %	40 %	407698233
3021	NC_018691	GGTCA	2	10	4893958	4893967	20 %	20 %	40 %	20 %	407698233
3022	NC_018691	TGGCC	2	10	4895758	4895767	0 %	20 %	40 %	40 %	407698235
3023	NC_018691	CGCTC	2	10	4897050	4897059	0 %	20 %	20 %	60 %	407698238
3024	NC_018691	GGCAG	2	10	4899633	4899642	20 %	0 %	60 %	20 %	407698241
3025	NC_018691	CGGCG	2	10	4900835	4900844	0 %	0 %	60 %	40 %	407698242
3026	NC_018691	GAAAA	2	10	4905769	4905778	80 %	0 %	20 %	0 %	407698245
3027	NC_018691	CGGAT	2	10	4908078	4908087	20 %	20 %	40 %	20 %	407698247
3028	NC_018691	CACCG	2	10	4909196	4909205	20 %	0 %	20 %	60 %	407698247
3029	NC_018691	AGGTC	2	10	4909324	4909333	20 %	20 %	40 %	20 %	407698247
3030	NC_018691	CAAGG	2	10	4910060	4910069	40 %	0 %	40 %	20 %	407698247
3031	NC_018691	AAAAG	2	10	4910072	4910081	80 %	0 %	20 %	0 %	407698247
3032	NC_018691	TGCCC	2	10	4911085	4911094	0 %	20 %	20 %	60 %	407698248
3033	NC_018691	AATCC	2	10	4914452	4914461	40 %	20 %	0 %	40 %	407698252
3034	NC_018691	TGTTC	2	10	4916223	4916232	0 %	60 %	20 %	20 %	407698253
3035	NC_018691	TGATC	2	10	4920326	4920335	20 %	40 %	20 %	20 %	407698255
3036	NC_018691	AGCAA	2	10	4923690	4923699	60 %	0 %	20 %	20 %	407698258
3037	NC_018691	CCGGG	2	10	4925131	4925140	0 %	0 %	60 %	40 %	407698259
3038	NC_018691	GTCGG	2	10	4927054	4927063	0 %	20 %	60 %	20 %	407698260

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.